RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442510.6

PTPRC-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 5,164 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-209ENST00000442510 SLC35B4Q969S0 331 aa5.78□□□□□ -1.48
PTPRC-209ENST00000442510 CCDC120Q96HB5 630 aa5.78□□□□□ -1.48
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PTPRC-209ENST00000442510 FAM96AQ9H5X1 160 aa5.78□□□□□ -1.48
PTPRC-209ENST00000442510 UGT1A7Q9HAW7 530 aa5.78□□□□□ -1.48
PTPRC-209ENST00000442510 UGT1A10Q9HAW8 530 aa5.78□□□□□ -1.48
PTPRC-209ENST00000442510 UGT1A8Q9HAW9 530 aa5.78□□□□□ -1.48
PTPRC-209ENST00000442510 SNX12Q9UMY4 172 aa5.78□□□□□ -1.48
PTPRC-209ENST00000442510 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa5.78□□□□□ -1.48
PTPRC-209ENST00000442510 EXOC1LA0A1B0GW35 172 aa5.78□□□□□ -1.48
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PTPRC-209ENST00000442510 POMZP3Q6PJE2 187 aa5.78□□□□□ -1.48
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PTPRC-209ENST00000442510 ZNF398Q8TD17 642 aa5.78□□□□□ -1.48
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PTPRC-209ENST00000442510 ZNF33BQ06732 778 aa5.78□□□□□ -1.48
PTPRC-209ENST00000442510 MTFR1Q15390 333 aa5.78□□□□□ -1.48
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PTPRC-209ENST00000442510 DMRTB1Q96MA1 342 aa5.78□□□□□ -1.48
PTPRC-209ENST00000442510 RPRD1AQ96P16 312 aaPredicted RBP5.78□□□□□ -1.48
PTPRC-209ENST00000442510 MUC3BQ9H195 1237 aa5.78□□□□□ -1.48
PTPRC-209ENST00000442510 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa5.78□□□□□ -1.48
PTPRC-209ENST00000442510 POGZQ7Z3K3 1410 aa5.78□□□□□ -1.48
PTPRC-209ENST00000442510 WDR19Q8NEZ3 1342 aa5.78□□□□□ -1.48
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PTPRC-209ENST00000442510 A0A1W2PQD8 194 aa5.78□□□□□ -1.48
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PTPRC-209ENST00000442510 NUDT19A8MXV4 375 aa5.78□□□□□ -1.48
PTPRC-209ENST00000442510 hCG_1984214I3L0E3 225 aa5.78□□□□□ -1.48
PTPRC-209ENST00000442510 GNGT2O14610 69 aa5.78□□□□□ -1.48
PTPRC-209ENST00000442510 LCP1P13796 627 aa5.78□□□□□ -1.48
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PTPRC-209ENST00000442510 ZFYVE1Q9HBF4 777 aa5.78□□□□□ -1.48
PTPRC-209ENST00000442510 SAR1AQ9NR31 198 aa5.78□□□□□ -1.48
PTPRC-209ENST00000442510 NSMCE4AQ9NXX6 385 aa5.78□□□□□ -1.48
PTPRC-209ENST00000442510 TAS2R1Q9NYW7 299 aa5.78□□□□□ -1.48
PTPRC-209ENST00000442510 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP5.78□□□□□ -1.48
PTPRC-209ENST00000442510 KLHL3Q9UH77 587 aa5.78□□□□□ -1.48
PTPRC-209ENST00000442510 SH3TC1Q8TE82 1336 aa5.77□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 HEATR9A2RTY3 570 aa5.77□□□□□ -1.49
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