RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442309.5

GCFC2-204, Transcript of GC-rich sequence DNA-binding factor 2, humanhuman

TSL 5

Gene GCFC2, Length 642 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCFC2-204ENST00000442309 PRCPP42785 496 aa22.09■■□□□ 1.13
GCFC2-204ENST00000442309 ENPEPQ07075 957 aa22.09■■□□□ 1.13
GCFC2-204ENST00000442309 SIM2Q14190 667 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
GCFC2-204ENST00000442309 CCDC150Q8NCX0 1101 aa22.09■■□□□ 1.13
GCFC2-204ENST00000442309 OVCA2Q8WZ82 227 aa22.09■■□□□ 1.13
GCFC2-204ENST00000442309 JAKMIP2Q96AA8 810 aa22.09■■□□□ 1.13
GCFC2-204ENST00000442309 GMEB2Q9UKD1 530 aa22.09■■□□□ 1.13
GCFC2-204ENST00000442309 DCHS1Q96JQ0 3298 aa22.09■■□□□ 1.13
GCFC2-204ENST00000442309 CETN3O15182 167 aa22.08■■□□□ 1.13
GCFC2-204ENST00000442309 COCHO43405 550 aa22.08■■□□□ 1.13
GCFC2-204ENST00000442309 HRO43593 1189 aa22.08■■□□□ 1.13
GCFC2-204ENST00000442309 ATG13O75143 517 aa22.08■■□□□ 1.13
GCFC2-204ENST00000442309 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
GCFC2-204ENST00000442309 PXNP49023 591 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
GCFC2-204ENST00000442309 INCA1Q0VD86 236 aa22.08■■□□□ 1.13
GCFC2-204ENST00000442309 HECTD3Q5T447 861 aa22.08■■□□□ 1.13
GCFC2-204ENST00000442309 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
GCFC2-204ENST00000442309 KRT39Q6A163 491 aa22.08■■□□□ 1.13
GCFC2-204ENST00000442309 ENGASEQ8NFI3 743 aa22.08■■□□□ 1.13
GCFC2-204ENST00000442309 NT5C1AQ9BXI3 368 aa22.08■■□□□ 1.13
GCFC2-204ENST00000442309 CCSER2Q9H7U1 834 aa22.08■■□□□ 1.13
GCFC2-204ENST00000442309 CYP3A43Q9HB55 503 aa22.08■■□□□ 1.13
GCFC2-204ENST00000442309 SLC8A2Q9UPR5 921 aa22.08■■□□□ 1.13
GCFC2-204ENST00000442309 MYO16Q9Y6X6 1858 aa22.08■■□□□ 1.13
GCFC2-204ENST00000442309 SMC2O95347 1197 aa22.07■■□□□ 1.12
GCFC2-204ENST00000442309 FAM200BP0CF97 657 aa22.07■■□□□ 1.12
GCFC2-204ENST00000442309 GTF2H1P32780 548 aa22.07■■□□□ 1.12
GCFC2-204ENST00000442309 MXI1P50539 228 aa22.07■■□□□ 1.12
GCFC2-204ENST00000442309 RPLP0P6Q8NHW5 317 aa22.07■■□□□ 1.12
GCFC2-204ENST00000442309 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
GCFC2-204ENST00000442309 SEMA4DQ92854 862 aa22.07■■□□□ 1.12
GCFC2-204ENST00000442309 SMARCE1Q969G3 411 aa22.07■■□□□ 1.12
GCFC2-204ENST00000442309 GSDMAQ96QA5 445 aa22.07■■□□□ 1.12
GCFC2-204ENST00000442309 TSG101Q99816 390 aa22.07■■□□□ 1.12
GCFC2-204ENST00000442309 IL37Q9NZH6 218 aa22.07■■□□□ 1.12
GCFC2-204ENST00000442309 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa22.07■■□□□ 1.12
GCFC2-204ENST00000442309 SLC9A3R1O14745 358 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
GCFC2-204ENST00000442309 CYP17A1P05093 508 aa22.06■■□□□ 1.12
GCFC2-204ENST00000442309 FBXO43Q4G163 708 aa22.06■■□□□ 1.12
GCFC2-204ENST00000442309 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
GCFC2-204ENST00000442309 TCERG1LQ5VWI1 586 aa22.06■■□□□ 1.12
GCFC2-204ENST00000442309 WDR5BQ86VZ2 330 aa22.06■■□□□ 1.12
GCFC2-204ENST00000442309 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP22.06■■□□□ 1.12
GCFC2-204ENST00000442309 WHAMMQ8TF30 809 aa22.06■■□□□ 1.12
GCFC2-204ENST00000442309 RMDN1Q96DB5 314 aa22.06■■□□□ 1.12
GCFC2-204ENST00000442309 CYFIP2Q96F07 1278 aa22.06■■□□□ 1.12
GCFC2-204ENST00000442309 HNRNPABQ99729 332 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
GCFC2-204ENST00000442309 NACA2Q9H009 215 aa22.06■■□□□ 1.12
GCFC2-204ENST00000442309 CSNK1G1Q9HCP0 422 aa22.06■■□□□ 1.12
GCFC2-204ENST00000442309 COMMD8Q9NX08 183 aa22.06■■□□□ 1.12
GCFC2-204ENST00000442309 USP18Q9UMW8 372 aa22.06■■□□□ 1.12
GCFC2-204ENST00000442309 TRIM49BA6NDI0 452 aa22.05■■□□□ 1.12
GCFC2-204ENST00000442309 CILPO75339 1184 aa22.05■■□□□ 1.12
GCFC2-204ENST00000442309 CNR2P34972 360 aa22.05■■□□□ 1.12
GCFC2-204ENST00000442309 OPRD1P41143 372 aa22.05■■□□□ 1.12
GCFC2-204ENST00000442309 PGFP49763 221 aa22.05■■□□□ 1.12
GCFC2-204ENST00000442309 DHCR24Q15392 516 aa22.05■■□□□ 1.12
GCFC2-204ENST00000442309 GAB4Q2WGN9 574 aa22.05■■□□□ 1.12
GCFC2-204ENST00000442309 ZNF394Q53GI3 561 aa22.05■■□□□ 1.12
GCFC2-204ENST00000442309 SNX30Q5VWJ9 437 aa22.05■■□□□ 1.12
GCFC2-204ENST00000442309 LAIR1Q6GTX8 287 aa22.05■■□□□ 1.12
GCFC2-204ENST00000442309 CLEC20AQ6ZU45 233 aa22.05■■□□□ 1.12
GCFC2-204ENST00000442309 CEP68Q76N32 757 aa22.05■■□□□ 1.12
GCFC2-204ENST00000442309 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa22.05■■□□□ 1.12
GCFC2-204ENST00000442309 FBXL13Q8NEE6 735 aa22.05■■□□□ 1.12
GCFC2-204ENST00000442309 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
GCFC2-204ENST00000442309 HHIPQ96QV1 700 aa22.05■■□□□ 1.12
GCFC2-204ENST00000442309 FBXO44Q9H4M3 255 aa22.05■■□□□ 1.12
GCFC2-204ENST00000442309 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
GCFC2-204ENST00000442309 MYOFQ9NZM1 2061 aa22.05■■□□□ 1.12
GCFC2-204ENST00000442309 KIAA1549LQ6ZVL6 1849 aa22.04■■□□□ 1.12
GCFC2-204ENST00000442309 FAM92AA1XBS5 289 aa22.04■■□□□ 1.12
GCFC2-204ENST00000442309 STX10O60499 249 aa22.04■■□□□ 1.12
GCFC2-204ENST00000442309 ZDHHC11BP0C7U3 371 aa22.04■■□□□ 1.12
GCFC2-204ENST00000442309 IRF1P10914 325 aa22.04■■□□□ 1.12
GCFC2-204ENST00000442309 HOXA6P31267 233 aa22.04■■□□□ 1.12
GCFC2-204ENST00000442309 PMS1P54277 932 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
GCFC2-204ENST00000442309 SEC13P55735 322 aa22.04■■□□□ 1.12
GCFC2-204ENST00000442309 ANKRD40Q6AI12 368 aa22.04■■□□□ 1.12
GCFC2-204ENST00000442309 ISM2Q6H9L7 571 aa22.04■■□□□ 1.12
GCFC2-204ENST00000442309 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
GCFC2-204ENST00000442309 ADGRG2Q8IZP9 1017 aa22.04■■□□□ 1.12
GCFC2-204ENST00000442309 RAB20Q9NX57 234 aa22.04■■□□□ 1.12
GCFC2-204ENST00000442309 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa22.04■■□□□ 1.12
GCFC2-204ENST00000442309 CYP26A1O43174 497 aa22.03■■□□□ 1.12
GCFC2-204ENST00000442309 TLR5O60602 858 aa22.03■■□□□ 1.12
GCFC2-204ENST00000442309 TUBP50607 506 aa22.03■■□□□ 1.12
GCFC2-204ENST00000442309 SPEM2Q0P670 501 aa22.03■■□□□ 1.12
GCFC2-204ENST00000442309 COBLL1Q53SF7 1204 aa22.03■■□□□ 1.12
GCFC2-204ENST00000442309 KIAA1958Q8N8K9 716 aa22.03■■□□□ 1.12
GCFC2-204ENST00000442309 SPATA20Q8TB22 786 aa22.03■■□□□ 1.12
GCFC2-204ENST00000442309 TIGD1Q96MW7 591 aa22.03■■□□□ 1.12
GCFC2-204ENST00000442309 DNAI2Q9GZS0 605 aa22.03■■□□□ 1.12
GCFC2-204ENST00000442309 PARD6AQ9NPB6 346 aa22.03■■□□□ 1.12
GCFC2-204ENST00000442309 TLR8Q9NR97 1041 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
GCFC2-204ENST00000442309 DNAH14Q0VDD8 3507 aa22.03■■□□□ 1.12
GCFC2-204ENST00000442309 E2F8A0AVK6 867 aa22.02■■□□□ 1.12
GCFC2-204ENST00000442309 HHLA1C9JL84 531 aa22.02■■□□□ 1.12
GCFC2-204ENST00000442309 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
GCFC2-204ENST00000442309 ACO1P21399 889 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.7 ms