RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000441222.7

USP46-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 46, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP46, Length 7,954 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP46-201ENST00000441222 PIPSLA2A3N6 862 aa6.89□□□□□ -1.31
USP46-201ENST00000441222 KPNA4O00629 521 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
USP46-201ENST00000441222 DNALI1O14645 258 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
USP46-201ENST00000441222 CD3EAPO15446 510 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
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USP46-201ENST00000441222 OR1G1P47890 313 aa6.89□□□□□ -1.31
USP46-201ENST00000441222 MAPKAPK2P49137 400 aa6.89□□□□□ -1.31
USP46-201ENST00000441222 RGS7P49802 495 aa6.89□□□□□ -1.31
USP46-201ENST00000441222 TAF6P49848 677 aa6.89□□□□□ -1.31
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USP46-201ENST00000441222 SCUBE1Q8IWY4 988 aa6.89□□□□□ -1.31
USP46-201ENST00000441222 SETD9Q8NE22 299 aa6.89□□□□□ -1.31
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USP46-201ENST00000441222 SH3BP4Q9P0V3 963 aa6.89□□□□□ -1.31
USP46-201ENST00000441222 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa6.89□□□□□ -1.31
USP46-201ENST00000441222 ZNF862O60290 1169 aa6.89□□□□□ -1.31
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USP46-201ENST00000441222 HERC6Q8IVU3 1022 aa6.89□□□□□ -1.31
USP46-201ENST00000441222 C4orf33Q8N1A6 199 aa6.89□□□□□ -1.31
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USP46-201ENST00000441222 ASZ1Q8WWH4 475 aa6.89□□□□□ -1.31
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USP46-201ENST00000441222 PALM2-AKAP2B1ALY0 433 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
USP46-201ENST00000441222 AKAP5P24588 427 aa6.89□□□□□ -1.31
USP46-201ENST00000441222 NOS3P29474 1203 aa6.89□□□□□ -1.31
USP46-201ENST00000441222 PRDX5P30044 214 aa6.89□□□□□ -1.31
USP46-201ENST00000441222 ALFQ53S48 1182 aa6.89□□□□□ -1.31
USP46-201ENST00000441222 ZNF618Q5T7W0 954 aa6.89□□□□□ -1.31
USP46-201ENST00000441222 CHST13Q8NET6 341 aa6.89□□□□□ -1.31
USP46-201ENST00000441222 RNASE11Q8TAA1 199 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
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USP46-201ENST00000441222 NMRK2Q9NPI5 230 aa6.89□□□□□ -1.31
USP46-201ENST00000441222 PDGFCQ9NRA1 345 aa6.89□□□□□ -1.31
USP46-201ENST00000441222 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP6.89□□□□□ -1.31
USP46-201ENST00000441222 COPG2Q9UBF2 871 aa6.89□□□□□ -1.31
USP46-201ENST00000441222 GTF2A1LQ9UNN4 478 aa6.89□□□□□ -1.31
USP46-201ENST00000441222 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP6.89□□□□□ -1.31
USP46-201ENST00000441222 CLPTM1O96005 669 aa6.89□□□□□ -1.31
USP46-201ENST00000441222 ATP6V1B1P15313 513 aa6.89□□□□□ -1.31
USP46-201ENST00000441222 EPHB2P29323 1055 aa6.89□□□□□ -1.31
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USP46-201ENST00000441222 FLT3P36888 993 aa6.89□□□□□ -1.31
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USP46-201ENST00000441222 GPAT2Q6NUI2 795 aa6.89□□□□□ -1.31
USP46-201ENST00000441222 NEK5Q6P3R8 708 aa6.89□□□□□ -1.31
USP46-201ENST00000441222 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
USP46-201ENST00000441222 MRPS31Q92665 395 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
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USP46-201ENST00000441222 MYH8P13535 1937 aa6.89□□□□□ -1.31
USP46-201ENST00000441222 GUCY1B2O75343 617 aa6.89□□□□□ -1.31
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USP46-201ENST00000441222 KATNA1O75449 491 aa6.89□□□□□ -1.31
USP46-201ENST00000441222 ANXA6P08133 673 aa6.89□□□□□ -1.31
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USP46-201ENST00000441222 A0A088AWK7 358 aa6.89□□□□□ -1.31
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USP46-201ENST00000441222 ANKRD65E5RJM6 399 aa6.89□□□□□ -1.31
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USP46-201ENST00000441222 TDP2O95551 362 aa6.89□□□□□ -1.31
USP46-201ENST00000441222 BCL10O95999 233 aa6.89□□□□□ -1.31
USP46-201ENST00000441222 HLA-DRAP01903 254 aa6.89□□□□□ -1.31
USP46-201ENST00000441222 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
USP46-201ENST00000441222 ZNF10P21506 573 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
USP46-201ENST00000441222 FASP25445 335 aa6.89□□□□□ -1.31
USP46-201ENST00000441222 ITGA8P53708 1063 aa6.89□□□□□ -1.31
USP46-201ENST00000441222 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
USP46-201ENST00000441222 ALG11Q2TAA5 492 aa6.89□□□□□ -1.31
USP46-201ENST00000441222 ATP6AP1LQ52LC2 224 aa6.89□□□□□ -1.31
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