RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439720.3

RABGEF1-203, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RABGEF1, Length 3,065 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-203ENST00000439720 CROTQ9UKG9 612 aa8.75□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 FAM32AQ9Y421 112 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 AK5Q9Y6K8 562 aa8.75□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 LINC00854A0A1B0GVQ3 168 aa8.74□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 MATN2O00339 956 aa8.74□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 OXSR1O95747 527 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 CDH2P19022 906 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 FDFT1P37268 417 aa8.74□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 CLCN2P51788 898 aa8.74□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 DNAL1Q4LDG9 190 aa8.74□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 EFHC1Q5JVL4 640 aa8.74□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 ADGRG6Q86SQ4 1221 aa8.74□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 PPM1KQ8N3J5 372 aa8.74□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 SLCO2A1Q92959 643 aa8.74□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 CD101Q93033 1021 aa8.74□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 HEPHQ9BQS7 1158 aa8.74□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 MRPS26Q9BYN8 205 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 PLGRKTQ9HBL7 147 aa8.74□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 IKBKGQ9Y6K9 419 aa8.74□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 TRPA1O75762 1119 aa8.74□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 RAG1P15918 1043 aa8.74□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 BGNP21810 368 aa8.74□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 BPIFB3P59826 476 aa8.74□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 GPC5P78333 572 aa8.74□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 GRM1Q13255 1194 aa8.74□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 TGFBIQ15582 683 aa8.74□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 ADRM1Q16186 407 aa8.74□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 RABGAP1LQ5R372 815 aa8.74□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 TMEM214Q6NUQ4 689 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 AAGABQ6PD74 315 aa8.74□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 C3orf62Q6ZUJ4 267 aa8.74□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 C14orf80Q86SX3 495 aa8.74□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 PRPF39Q86UA1 669 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 CROCCP3Q8IVE0 287 aa8.74□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 SLC7A5P1Q8MH63 180 aa8.74□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 NEDD1Q8NHV4 660 aa8.74□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 AGPAT1Q99943 283 aa8.74□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 HERPUD2Q9BSE4 406 aa8.74□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 GPR88Q9GZN0 384 aa8.74□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 ACAD8Q9UKU7 415 aa8.74□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 KIAA1024Q9UPX6 916 aa8.74□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa8.74□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 COQ6Q9Y2Z9 468 aa8.74□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 CEPT1Q9Y6K0 416 aa8.74□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 FUOMA2VDF0 154 aa8.74□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 E5RJQ4 531 aa8.74□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 C6orf229H3BNL8 230 aa8.74□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 NR3C1P04150 777 aa8.74□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 ABHD2P08910 425 aa8.74□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 PLA2G4BP0C869 781 aa8.74□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 NDUFV2P19404 249 aa8.74□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 SLC25A3Q00325 362 aa8.74□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 MYBPC1Q00872 1141 aa8.74□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 TFAP4Q01664 338 aa8.74□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 HIC1Q14526 733 aa8.74□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 PGBD3Q8N328 593 aa8.74□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 TTC17Q96AE7 1141 aa8.74□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 COX4I2Q96KJ9 171 aa8.74□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 ZDHHC15Q96MV8 337 aa8.74□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 RRAGCQ9HB90 399 aa8.74□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 GPCPD1Q9NPB8 672 aa8.74□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 DCAF16Q9NXF7 216 aa8.74□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 TUBA8Q9NY65 449 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 RRN3Q9NYV6 651 aa8.74□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 TAGLN3Q9UI15 199 aa8.74□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 DTNAQ9Y4J8 743 aa8.74□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 TLL2Q9Y6L7 1015 aa8.74□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 ATRNL1Q5VV63 1379 aa8.74□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 A0A088AWK7 358 aa8.73□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa8.73□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 CAPN14A8MX76 684 aa8.73□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 FOXD2O60548 495 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 USP17L8P0C7I0 530 aa8.73□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 GNA11P29992 359 aa8.73□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 HOXD13P35453 343 aa8.73□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 ALDH18A1P54886 795 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 HADHBP55084 474 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 SNX16P57768 344 aa8.73□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 XIAPP98170 497 aa8.73□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 PDIA2Q13087 525 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP8.73□□□□□ -1.011e-5■□□□□ 8.3
RABGEF1-203ENST00000439720 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 POTEHQ6S545 545 aa8.73□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 AMIGO2Q86SJ2 522 aa8.73□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 PASD1Q8IV76 773 aa8.73□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 MARVELD2Q8N4S9 558 aa8.73□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 VPS50Q96JG6 964 aa8.73□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 MXD3Q9BW11 206 aa8.73□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 HEMGNQ9BXL5 484 aa8.73□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 IKZF4Q9H2S9 585 aa8.73□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 TRPC7Q9HCX4 862 aa8.73□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 SAGE1Q9NXZ1 904 aa8.73□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 HESX1Q9UBX0 185 aa8.73□□□□□ -1.01
RABGEF1-203ENST00000439720 A0A1B0GTW7 788 aa8.73□□□□□ -1.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.5 ms