RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000437111.1

SHQ1P1-201, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene SHQ1P1, Length 1,544 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1P1-201ENST00000437111 DNAAF5Q86Y56 855 aa6.64□□□□□ -1.35
SHQ1P1-201ENST00000437111 RHPN2Q8IUC4 686 aa6.64□□□□□ -1.35
SHQ1P1-201ENST00000437111 PRELID2Q8N945 189 aa6.64□□□□□ -1.35
SHQ1P1-201ENST00000437111 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
SHQ1P1-201ENST00000437111 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
SHQ1P1-201ENST00000437111 KRT35Q92764 455 aa6.64□□□□□ -1.35
SHQ1P1-201ENST00000437111 PPP2R3CQ969Q6 453 aa6.64□□□□□ -1.35
SHQ1P1-201ENST00000437111 C18orf8Q96DM3 657 aa6.64□□□□□ -1.35
SHQ1P1-201ENST00000437111 PGM2Q96G03 612 aa6.64□□□□□ -1.35
SHQ1P1-201ENST00000437111 SCLT1Q96NL6 688 aa6.64□□□□□ -1.35
SHQ1P1-201ENST00000437111 GPR20Q99678 358 aa6.64□□□□□ -1.35
SHQ1P1-201ENST00000437111 ACO2Q99798 780 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
SHQ1P1-201ENST00000437111 HINFPQ9BQA5 517 aa6.64□□□□□ -1.35
SHQ1P1-201ENST00000437111 CCDC77Q9BR77 488 aa6.64□□□□□ -1.35
SHQ1P1-201ENST00000437111 ADPGKQ9BRR6 497 aa6.64□□□□□ -1.35
SHQ1P1-201ENST00000437111 PI4K2AQ9BTU6 479 aa6.64□□□□□ -1.35
SHQ1P1-201ENST00000437111 KATNAL1Q9BW62 490 aa6.64□□□□□ -1.35
SHQ1P1-201ENST00000437111 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
SHQ1P1-201ENST00000437111 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa6.64□□□□□ -1.35
SHQ1P1-201ENST00000437111 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP6.64□□□□□ -1.35
SHQ1P1-201ENST00000437111 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP6.64□□□□□ -1.35
SHQ1P1-201ENST00000437111 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa6.64□□□□□ -1.35
SHQ1P1-201ENST00000437111 ACACBO00763 2458 aa6.64□□□□□ -1.35
SHQ1P1-201ENST00000437111 BAHCC1Q9P281 2608 aa6.63□□□□□ -1.35
SHQ1P1-201ENST00000437111 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa6.63□□□□□ -1.35
SHQ1P1-201ENST00000437111 RGS16O15492 202 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
SHQ1P1-201ENST00000437111 VNN1O95497 513 aa6.63□□□□□ -1.35
SHQ1P1-201ENST00000437111 AGTP01019 485 aa6.63□□□□□ -1.35
SHQ1P1-201ENST00000437111 KRT7P08729 469 aa6.63□□□□□ -1.35
SHQ1P1-201ENST00000437111 PAEPP09466 180 aa6.63□□□□□ -1.35
SHQ1P1-201ENST00000437111 CTSHP09668 335 aa6.63□□□□□ -1.35
SHQ1P1-201ENST00000437111 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa6.63□□□□□ -1.35
SHQ1P1-201ENST00000437111 MCF2P10911 925 aa6.63□□□□□ -1.35
SHQ1P1-201ENST00000437111 PYGMP11217 842 aa6.63□□□□□ -1.35
SHQ1P1-201ENST00000437111 RARGP13631 454 aa6.63□□□□□ -1.35
SHQ1P1-201ENST00000437111 ATP4AP20648 1035 aa6.63□□□□□ -1.35
SHQ1P1-201ENST00000437111 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
SHQ1P1-201ENST00000437111 MARK3P27448 753 aa6.63□□□□□ -1.35
SHQ1P1-201ENST00000437111 HPDP32754 393 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
SHQ1P1-201ENST00000437111 MDH1P40925 334 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
SHQ1P1-201ENST00000437111 MARCKSL1P49006 195 aa6.63□□□□□ -1.35
SHQ1P1-201ENST00000437111 IRAK1P51617 712 aa6.63□□□□□ -1.35
SHQ1P1-201ENST00000437111 ZNF132P52740 706 aa6.63□□□□□ -1.35
SHQ1P1-201ENST00000437111 CDC42EP1Q00587 391 aa6.63□□□□□ -1.35
SHQ1P1-201ENST00000437111 PLCB4Q15147 1175 aa6.63□□□□□ -1.35
SHQ1P1-201ENST00000437111 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP6.63□□□□□ -1.35
SHQ1P1-201ENST00000437111 STILQ15468 1287 aa6.63□□□□□ -1.35
SHQ1P1-201ENST00000437111 FAM187BQ17R55 369 aa6.63□□□□□ -1.35
SHQ1P1-201ENST00000437111 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
SHQ1P1-201ENST00000437111 KCTD16Q68DU8 428 aa6.63□□□□□ -1.35
SHQ1P1-201ENST00000437111 PLEKHA7Q6IQ23 1121 aa6.63□□□□□ -1.35
SHQ1P1-201ENST00000437111 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
SHQ1P1-201ENST00000437111 LRRC31Q6UY01 552 aa6.63□□□□□ -1.35
SHQ1P1-201ENST00000437111 GSTA5Q7RTV2 222 aa6.63□□□□□ -1.35
SHQ1P1-201ENST00000437111 SRLQ86TD4 932 aa6.63□□□□□ -1.35
SHQ1P1-201ENST00000437111 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP6.63□□□□□ -1.35
SHQ1P1-201ENST00000437111 HOMEZQ8IX15 550 aa6.63□□□□□ -1.35
SHQ1P1-201ENST00000437111 KIAA2013Q8IYS2 634 aa6.63□□□□□ -1.35
SHQ1P1-201ENST00000437111 RCOR2Q8IZ40 523 aa6.63□□□□□ -1.35
SHQ1P1-201ENST00000437111 KREMEN2Q8NCW0 462 aa6.63□□□□□ -1.35
SHQ1P1-201ENST00000437111 VN1R2Q8NFZ6 395 aa6.63□□□□□ -1.35
SHQ1P1-201ENST00000437111 ATL2Q8NHH9 583 aa6.63□□□□□ -1.35
SHQ1P1-201ENST00000437111 FEZF2Q8TBJ5 459 aa6.63□□□□□ -1.35
SHQ1P1-201ENST00000437111 SPPL3Q8TCT6 385 aa6.63□□□□□ -1.35
SHQ1P1-201ENST00000437111 NLRP7Q8WX94 980 aa6.63□□□□□ -1.35
SHQ1P1-201ENST00000437111 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
SHQ1P1-201ENST00000437111 NLRP4Q96MN2 994 aa6.63□□□□□ -1.35
SHQ1P1-201ENST00000437111 TTC25Q96NG3 672 aa6.63□□□□□ -1.35
SHQ1P1-201ENST00000437111 NCAPGQ9BPX3 1015 aa6.63□□□□□ -1.35
SHQ1P1-201ENST00000437111 ROPN1BQ9BZX4 212 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
SHQ1P1-201ENST00000437111 MTMR12Q9C0I1 747 aa6.63□□□□□ -1.35
SHQ1P1-201ENST00000437111 EPN3Q9H201 632 aa6.63□□□□□ -1.35
SHQ1P1-201ENST00000437111 ASB7Q9H672 318 aa6.63□□□□□ -1.35
SHQ1P1-201ENST00000437111 SYNCQ9H7C4 482 aa6.63□□□□□ -1.35
SHQ1P1-201ENST00000437111 PPCSQ9HAB8 311 aa6.63□□□□□ -1.35
SHQ1P1-201ENST00000437111 ROPN1Q9HAT0 212 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
SHQ1P1-201ENST00000437111 ERVK-5Q9HDB9 667 aa6.63□□□□□ -1.35
SHQ1P1-201ENST00000437111 DLL3Q9NYJ7 618 aa6.63□□□□□ -1.35
SHQ1P1-201ENST00000437111 RSPH14Q9UHP6 348 aa6.63□□□□□ -1.35
SHQ1P1-201ENST00000437111 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
SHQ1P1-201ENST00000437111 PCDHGC3Q9UN70 934 aa6.63□□□□□ -1.35
SHQ1P1-201ENST00000437111 TNFSF13BQ9Y275 285 aa6.63□□□□□ -1.35
SHQ1P1-201ENST00000437111 RRP15Q9Y3B9 282 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
SHQ1P1-201ENST00000437111 KRT1P04264 644 aa6.62□□□□□ -1.35
SHQ1P1-201ENST00000437111 ACO1P21399 889 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
SHQ1P1-201ENST00000437111 PROZP22891 400 aa6.62□□□□□ -1.35
SHQ1P1-201ENST00000437111 MMP8P22894 467 aa6.62□□□□□ -1.35
SHQ1P1-201ENST00000437111 SP100P23497 879 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
SHQ1P1-201ENST00000437111 HOXC8P31273 242 aa6.62□□□□□ -1.35
SHQ1P1-201ENST00000437111 CDH5P33151 784 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
SHQ1P1-201ENST00000437111 LSP1P33241 339 aa6.62□□□□□ -1.35
SHQ1P1-201ENST00000437111 PTPN7P35236 360 aa6.62□□□□□ -1.35
SHQ1P1-201ENST00000437111 PTGIRP43119 386 aa6.62□□□□□ -1.35
SHQ1P1-201ENST00000437111 RPL21P46778 160 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
SHQ1P1-201ENST00000437111 ATP1A2P50993 1020 aa6.62□□□□□ -1.35
SHQ1P1-201ENST00000437111 GSCP56915 257 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
SHQ1P1-201ENST00000437111 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
SHQ1P1-201ENST00000437111 PDCLQ13371 301 aa6.62□□□□□ -1.35
SHQ1P1-201ENST00000437111 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
SHQ1P1-201ENST00000437111 UAP1Q16222 522 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 56.9 ms