RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000434030.1

SEMA3B-205, Transcript of semaphorin 3B, humanhuman

TSL 3

Gene SEMA3B, Length 1,011 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3B-205ENST00000434030 LILRB5O75023 590 aa23.44■■□□□ 1.34
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SEMA3B-205ENST00000434030 CBWD6Q4V339 395 aa23.44■■□□□ 1.34
SEMA3B-205ENST00000434030 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
SEMA3B-205ENST00000434030 CBWD3Q5JTY5 395 aa23.44■■□□□ 1.34
SEMA3B-205ENST00000434030 CBWD5Q5RIA9 395 aa23.44■■□□□ 1.34
SEMA3B-205ENST00000434030 SNX30Q5VWJ9 437 aa23.44■■□□□ 1.34
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SEMA3B-205ENST00000434030 SUMF1Q8NBK3 374 aa23.44■■□□□ 1.34
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SEMA3B-205ENST00000434030 ZDHHC11BP0C7U3 371 aa23.43■■□□□ 1.34
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SEMA3B-205ENST00000434030 PPP1R2P41236 205 aa23.42■■□□□ 1.34
SEMA3B-205ENST00000434030 NR1H3Q13133 447 aa23.42■■□□□ 1.34
SEMA3B-205ENST00000434030 ZNF394Q53GI3 561 aa23.42■■□□□ 1.34
SEMA3B-205ENST00000434030 HECTD3Q5T447 861 aa23.42■■□□□ 1.34
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SEMA3B-205ENST00000434030 FBXO44Q9H4M3 255 aa23.42■■□□□ 1.34
SEMA3B-205ENST00000434030 C2orf42Q9NWW7 574 aa23.42■■□□□ 1.34
SEMA3B-205ENST00000434030 GMIPQ9P107 970 aa23.42■■□□□ 1.34
SEMA3B-205ENST00000434030 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
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SEMA3B-205ENST00000434030 HHLA1C9JL84 531 aa23.41■■□□□ 1.34
SEMA3B-205ENST00000434030 PAPSS2O95340 614 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
SEMA3B-205ENST00000434030 NFATC1O95644 943 aa23.41■■□□□ 1.34
SEMA3B-205ENST00000434030 EGFP01133 1207 aa23.41■■□□□ 1.34
SEMA3B-205ENST00000434030 MORC3Q14149 939 aa23.41■■□□□ 1.34
SEMA3B-205ENST00000434030 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
SEMA3B-205ENST00000434030 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa23.41■■□□□ 1.34
SEMA3B-205ENST00000434030 SLC35C1Q96A29 364 aa23.41■■□□□ 1.34
SEMA3B-205ENST00000434030 ARID3AQ99856 593 aa23.41■■□□□ 1.34
SEMA3B-205ENST00000434030 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
SEMA3B-205ENST00000434030 P2RY13Q9BPV8 354 aa23.41■■□□□ 1.34
SEMA3B-205ENST00000434030 DNAI2Q9GZS0 605 aa23.41■■□□□ 1.34
SEMA3B-205ENST00000434030 CCSER2Q9H7U1 834 aa23.41■■□□□ 1.34
SEMA3B-205ENST00000434030 CISHQ9NSE2 258 aa23.41■■□□□ 1.34
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SEMA3B-205ENST00000434030 K7ESF4 209 aa23.4■■□□□ 1.34
SEMA3B-205ENST00000434030 DRD1P21728 446 aa23.4■■□□□ 1.34
SEMA3B-205ENST00000434030 PGFP49763 221 aa23.4■■□□□ 1.34
SEMA3B-205ENST00000434030 TUBP50607 506 aa23.4■■□□□ 1.34
SEMA3B-205ENST00000434030 KLHL10Q6JEL2 608 aa23.4■■□□□ 1.34
SEMA3B-205ENST00000434030 PKN3Q6P5Z2 889 aa23.4■■□□□ 1.34
SEMA3B-205ENST00000434030 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa23.4■■□□□ 1.34
SEMA3B-205ENST00000434030 ADGRG2Q8IZP9 1017 aa23.4■■□□□ 1.34
SEMA3B-205ENST00000434030 TTC39CQ8N584 583 aa23.4■■□□□ 1.34
SEMA3B-205ENST00000434030 CD101Q93033 1021 aa23.4■■□□□ 1.34
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SEMA3B-205ENST00000434030 CEP63Q96MT8 703 aa23.4■■□□□ 1.34
SEMA3B-205ENST00000434030 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
SEMA3B-205ENST00000434030 CFAP97Q9P2B7 532 aa23.4■■□□□ 1.34
SEMA3B-205ENST00000434030 OTOGLQ3ZCN5 2332 aa23.39■■□□□ 1.34
SEMA3B-205ENST00000434030 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.34
SEMA3B-205ENST00000434030 BIN1O00499 593 aa23.39■■□□□ 1.33
SEMA3B-205ENST00000434030 RAD23BP54727 409 aa23.39■■□□□ 1.33
SEMA3B-205ENST00000434030 TTI2Q6NXR4 508 aa23.39■■□□□ 1.33
SEMA3B-205ENST00000434030 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP23.39■■□□□ 1.33
SEMA3B-205ENST00000434030 SLC4A11Q8NBS3 891 aa23.39■■□□□ 1.33
SEMA3B-205ENST00000434030 NELFBQ8WX92 580 aa23.39■■□□□ 1.33
SEMA3B-205ENST00000434030 EXOC4Q96A65 974 aa23.39■■□□□ 1.33
SEMA3B-205ENST00000434030 JAKMIP2Q96AA8 810 aa23.39■■□□□ 1.33
SEMA3B-205ENST00000434030 TMEM176AQ96HP8 235 aa23.39■■□□□ 1.33
SEMA3B-205ENST00000434030 DUSP16Q9BY84 665 aa23.39■■□□□ 1.33
SEMA3B-205ENST00000434030 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.33
SEMA3B-205ENST00000434030 PNPLA8Q9NP80 782 aa23.39■■□□□ 1.33
SEMA3B-205ENST00000434030 TLR8Q9NR97 1041 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.33
SEMA3B-205ENST00000434030 SCML2Q9UQR0 700 aa23.39■■□□□ 1.33
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SEMA3B-205ENST00000434030 DMWDQ09019 674 aa23.38■■□□□ 1.33
SEMA3B-205ENST00000434030 EPC1Q9H2F5 836 aa23.38■■□□□ 1.33
SEMA3B-205ENST00000434030 CHMP5Q9NZZ3 219 aa23.38■■□□□ 1.33
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SEMA3B-205ENST00000434030 RNF40O75150 1001 aa23.37■■□□□ 1.33
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SEMA3B-205ENST00000434030 GAB4Q2WGN9 574 aa23.37■■□□□ 1.33
SEMA3B-205ENST00000434030 FBXO43Q4G163 708 aa23.37■■□□□ 1.33
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SEMA3B-205ENST00000434030 RUBCNQ92622 972 aa23.37■■□□□ 1.33
SEMA3B-205ENST00000434030 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP23.37■■□□□ 1.33
SEMA3B-205ENST00000434030 CTNND2Q9UQB3 1225 aa23.37■■□□□ 1.33
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