RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000433927.1

ELL3-202, Transcript of elongation factor for RNA polymerase II 3, humanhuman

TSL 5

Gene ELL3, Length 792 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELL3-202ENST00000433927 SERTAD1Q9UHV2 236 aa21.54■■□□□ 1.04
ELL3-202ENST00000433927 MYOFQ9NZM1 2061 aa21.54■■□□□ 1.04
ELL3-202ENST00000433927 E2F8A0AVK6 867 aa21.53■■□□□ 1.04
ELL3-202ENST00000433927 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
ELL3-202ENST00000433927 PALM2-AKAP2B1ALY0 433 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
ELL3-202ENST00000433927 ALDH1A2O94788 518 aa21.53■■□□□ 1.04
ELL3-202ENST00000433927 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
ELL3-202ENST00000433927 STK4Q13043 487 aa21.53■■□□□ 1.04
ELL3-202ENST00000433927 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa21.53■■□□□ 1.04
ELL3-202ENST00000433927 HSF5Q4G112 596 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
ELL3-202ENST00000433927 ANO7Q6IWH7 933 aa21.53■■□□□ 1.04
ELL3-202ENST00000433927 RHBDF2Q6PJF5 856 aa21.53■■□□□ 1.04
ELL3-202ENST00000433927 FAM35AQ86V20 835 aa21.53■■□□□ 1.04
ELL3-202ENST00000433927 CCDC33Q8N5R6 958 aa21.53■■□□□ 1.04
ELL3-202ENST00000433927 TMEM174Q8WUU8 243 aa21.53■■□□□ 1.04
ELL3-202ENST00000433927 OTUB2Q96DC9 234 aa21.53■■□□□ 1.04
ELL3-202ENST00000433927 PAGE5Q96GU1 130 aa21.53■■□□□ 1.04
ELL3-202ENST00000433927 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
ELL3-202ENST00000433927 SMOC1Q9H4F8 434 aa21.53■■□□□ 1.04
ELL3-202ENST00000433927 RXFP3Q9NSD7 469 aa21.53■■□□□ 1.04
ELL3-202ENST00000433927 DMAC2Q9NW81 257 aa21.53■■□□□ 1.04
ELL3-202ENST00000433927 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
ELL3-202ENST00000433927 RCOR1Q9UKL0 485 aa21.53■■□□□ 1.04
ELL3-202ENST00000433927 ACACBO00763 2458 aa21.53■■□□□ 1.04
ELL3-202ENST00000433927 MYH10P35580 1976 aa21.52■■□□□ 1.04
ELL3-202ENST00000433927 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
ELL3-202ENST00000433927 COCHO43405 550 aa21.52■■□□□ 1.04
ELL3-202ENST00000433927 KLRC4O43908 158 aa21.52■■□□□ 1.04
ELL3-202ENST00000433927 KAT7O95251 611 aa21.52■■□□□ 1.04
ELL3-202ENST00000433927 CAVIN2O95810 425 aa21.52■■□□□ 1.04
ELL3-202ENST00000433927 RPN1P04843 607 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
ELL3-202ENST00000433927 ADH5P11766 374 aa21.52■■□□□ 1.04
ELL3-202ENST00000433927 SLC6A11P48066 632 aa21.52■■□□□ 1.04
ELL3-202ENST00000433927 CRY1Q16526 586 aa21.52■■□□□ 1.04
ELL3-202ENST00000433927 SNX30Q5VWJ9 437 aa21.52■■□□□ 1.04
ELL3-202ENST00000433927 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa21.52■■□□□ 1.04
ELL3-202ENST00000433927 RASSF3Q86WH2 238 aa21.52■■□□□ 1.04
ELL3-202ENST00000433927 SCAMP5Q8TAC9 235 aa21.52■■□□□ 1.04
ELL3-202ENST00000433927 TPSD1Q9BZJ3 242 aa21.52■■□□□ 1.04
ELL3-202ENST00000433927 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa21.52■■□□□ 1.04
ELL3-202ENST00000433927 THADAQ6YHU6 1953 aa21.52■■□□□ 1.04
ELL3-202ENST00000433927 ABCA7Q8IZY2 2146 aa21.52■■□□□ 1.03
ELL3-202ENST00000433927 BCLAF3A2AJT9 711 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
ELL3-202ENST00000433927 TNFRSF10BO14763 440 aa21.51■■□□□ 1.03
ELL3-202ENST00000433927 TM4SF5O14894 197 aa21.51■■□□□ 1.03
ELL3-202ENST00000433927 AP1G2O75843 785 aa21.51■■□□□ 1.03
ELL3-202ENST00000433927 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
ELL3-202ENST00000433927 GRIA2P42262 883 aa21.51■■□□□ 1.03
ELL3-202ENST00000433927 TUBP50607 506 aa21.51■■□□□ 1.03
ELL3-202ENST00000433927 SLC5A3P53794 718 aa21.51■■□□□ 1.03
ELL3-202ENST00000433927 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
ELL3-202ENST00000433927 GAD2Q05329 585 aa21.51■■□□□ 1.03
ELL3-202ENST00000433927 KMT5BQ4FZB7 885 aa21.51■■□□□ 1.03
ELL3-202ENST00000433927 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
ELL3-202ENST00000433927 RNF43Q68DV7 783 aa21.51■■□□□ 1.03
ELL3-202ENST00000433927 PAQR9Q6ZVX9 377 aa21.51■■□□□ 1.03
ELL3-202ENST00000433927 TTC30AQ86WT1 665 aa21.51■■□□□ 1.03
ELL3-202ENST00000433927 KIAA0895Q8NCT3 520 aa21.51■■□□□ 1.03
ELL3-202ENST00000433927 TAF4BQ92750 862 aa21.51■■□□□ 1.03
ELL3-202ENST00000433927 NACA2Q9H009 215 aa21.51■■□□□ 1.03
ELL3-202ENST00000433927 ARHGEF4Q9NR80 690 aa21.51■■□□□ 1.03
ELL3-202ENST00000433927 IL37Q9NZH6 218 aa21.51■■□□□ 1.03
ELL3-202ENST00000433927 USP25Q9UHP3 1055 aa21.51■■□□□ 1.03
ELL3-202ENST00000433927 INVSQ9Y283 1065 aa21.51■■□□□ 1.03
ELL3-202ENST00000433927 NUP205Q92621 2012 aa21.51■■□□□ 1.03
ELL3-202ENST00000433927 CACNA1BQ00975 2339 aa21.5■■□□□ 1.03
ELL3-202ENST00000433927 A0A0A0MRY4 1105 aa21.5■■□□□ 1.03
ELL3-202ENST00000433927 PDXKO00764 312 aa21.5■■□□□ 1.03
ELL3-202ENST00000433927 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
ELL3-202ENST00000433927 VNN1O95497 513 aa21.5■■□□□ 1.03
ELL3-202ENST00000433927 NR3C1P04150 777 aa21.5■■□□□ 1.03
ELL3-202ENST00000433927 MYL1P05976 194 aa21.5■■□□□ 1.03
ELL3-202ENST00000433927 TNFRSF4P43489 277 aa21.5■■□□□ 1.03
ELL3-202ENST00000433927 EOGTQ5NDL2 527 aa21.5■■□□□ 1.03
ELL3-202ENST00000433927 BTBD8Q5XKL5 378 aa21.5■■□□□ 1.03
ELL3-202ENST00000433927 PMS2CLQ68D20 193 aa21.5■■□□□ 1.03
ELL3-202ENST00000433927 ACOT1Q86TX2 421 aa21.5■■□□□ 1.03
ELL3-202ENST00000433927 FUKQ8N0W3 1084 aa21.5■■□□□ 1.03
ELL3-202ENST00000433927 ALLCQ8N6M5 410 aa21.5■■□□□ 1.03
ELL3-202ENST00000433927 TMC2Q8TDI7 906 aa21.5■■□□□ 1.03
ELL3-202ENST00000433927 KCTD10Q9H3F6 313 aa21.5■■□□□ 1.03
ELL3-202ENST00000433927 FBXO44Q9H4M3 255 aa21.5■■□□□ 1.03
ELL3-202ENST00000433927 POLMQ9NP87 494 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
ELL3-202ENST00000433927 KRT82Q9NSB4 513 aa21.5■■□□□ 1.03
ELL3-202ENST00000433927 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa21.5■■□□□ 1.03
ELL3-202ENST00000433927 IKBKBO14920 756 aa21.49■■□□□ 1.03
ELL3-202ENST00000433927 KLF8O95600 359 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
ELL3-202ENST00000433927 ZDHHC11BP0C7U3 371 aa21.49■■□□□ 1.03
ELL3-202ENST00000433927 TIE1P35590 1138 aa21.49■■□□□ 1.03
ELL3-202ENST00000433927 ZACNQ401N2 412 aa21.49■■□□□ 1.03
ELL3-202ENST00000433927 LY6G5CQ5SRR4 150 aa21.49■■□□□ 1.03
ELL3-202ENST00000433927 TCEAL6Q6IPX3 200 aa21.49■■□□□ 1.03
ELL3-202ENST00000433927 UNC93AQ86WB7 457 aa21.49■■□□□ 1.03
ELL3-202ENST00000433927 CRYBG2Q8N1P7 616 aa21.49■■□□□ 1.03
ELL3-202ENST00000433927 IL17RCQ8NAC3 791 aa21.49■■□□□ 1.03
ELL3-202ENST00000433927 TXNDC5Q8NBS9 432 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
ELL3-202ENST00000433927 MDGA1Q8NFP4 955 aa21.49■■□□□ 1.03
ELL3-202ENST00000433927 TCEAL3Q969E4 200 aa21.49■■□□□ 1.03
ELL3-202ENST00000433927 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
ELL3-202ENST00000433927 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.1 ms