RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000427193.1

C9orf3-205, Transcript of chromosome 9 open reading frame 3, humanhuman

TSL 3

Gene C9orf3, Length 704 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf3-205ENST00000427193 TIMM10P62072 90 aa6.52□□□□□ -1.37
C9orf3-205ENST00000427193 NHLH1Q02575 133 aa6.52□□□□□ -1.37
C9orf3-205ENST00000427193 STAT4Q14765 748 aa6.52□□□□□ -1.37
C9orf3-205ENST00000427193 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
C9orf3-205ENST00000427193 BMP2KLQ5H9B9 411 aa6.52□□□□□ -1.37
C9orf3-205ENST00000427193 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
C9orf3-205ENST00000427193 LNX2Q8N448 690 aa6.52□□□□□ -1.37
C9orf3-205ENST00000427193 NUP133Q8WUM0 1156 aa6.52□□□□□ -1.37
C9orf3-205ENST00000427193 LPIN2Q92539 896 aa6.52□□□□□ -1.37
C9orf3-205ENST00000427193 PTCD3Q96EY7 689 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
C9orf3-205ENST00000427193 AHCYL2Q96HN2 611 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
C9orf3-205ENST00000427193 PDLIM2Q96JY6 352 aa6.52□□□□□ -1.37
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C9orf3-205ENST00000427193 PNKPQ96T60 521 aa6.52□□□□□ -1.37
C9orf3-205ENST00000427193 AIFM2Q9BRQ8 373 aa6.52□□□□□ -1.37
C9orf3-205ENST00000427193 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
C9orf3-205ENST00000427193 ANKRD2Q9GZV1 360 aa6.52□□□□□ -1.37
C9orf3-205ENST00000427193 UNKLQ9H9P5 680 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
C9orf3-205ENST00000427193 DNAJC28Q9NX36 388 aa6.52□□□□□ -1.37
C9orf3-205ENST00000427193 USP25Q9UHP3 1055 aa6.52□□□□□ -1.37
C9orf3-205ENST00000427193 ACTL7AQ9Y615 435 aa6.52□□□□□ -1.37
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C9orf3-205ENST00000427193 GPR32O75388 356 aa6.51□□□□□ -1.37
C9orf3-205ENST00000427193 ERN1O75460 977 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
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C9orf3-205ENST00000427193 MX1P20591 662 aa6.51□□□□□ -1.37
C9orf3-205ENST00000427193 PCSK1P29120 753 aa6.51□□□□□ -1.37
C9orf3-205ENST00000427193 ADORA1P30542 326 aa6.51□□□□□ -1.37
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C9orf3-205ENST00000427193 MTNR1BP49286 362 aa6.51□□□□□ -1.37
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C9orf3-205ENST00000427193 TMPRSS15P98073 1019 aa6.51□□□□□ -1.37
C9orf3-205ENST00000427193 SEPT2Q15019 361 aa6.51□□□□□ -1.37
C9orf3-205ENST00000427193 ATP2B3Q16720 1220 aa6.51□□□□□ -1.37
C9orf3-205ENST00000427193 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
C9orf3-205ENST00000427193 TICAM2Q86XR7 235 aa6.51□□□□□ -1.37
C9orf3-205ENST00000427193 FITM2Q8N6M3 262 aa6.51□□□□□ -1.37
C9orf3-205ENST00000427193 TBC1D16Q8TBP0 767 aa6.51□□□□□ -1.37
C9orf3-205ENST00000427193 ACTRT2Q8TDY3 377 aa6.51□□□□□ -1.37
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C9orf3-205ENST00000427193 MYOCQ99972 504 aa6.51□□□□□ -1.37
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C9orf3-205ENST00000427193 CNNM1Q9NRU3 951 aa6.51□□□□□ -1.37
C9orf3-205ENST00000427193 ECHDC1Q9NTX5 307 aa6.51□□□□□ -1.37
C9orf3-205ENST00000427193 CCM2LQ9NUG4 571 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
C9orf3-205ENST00000427193 KCTD5Q9NXV2 234 aa6.51□□□□□ -1.37
C9orf3-205ENST00000427193 POLLQ9UGP5 575 aa6.51□□□□□ -1.37
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C9orf3-205ENST00000427193 A0A1B0GUL6 1792 aa6.51□□□□□ -1.37
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C9orf3-205ENST00000427193 TTC22Q5TAA0 569 aa6.5□□□□□ -1.37
C9orf3-205ENST00000427193 AACSQ86V21 672 aa6.5□□□□□ -1.37
C9orf3-205ENST00000427193 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
C9orf3-205ENST00000427193 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa6.5□□□□□ -1.37
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C9orf3-205ENST00000427193 HSD3B2P26439 372 aa6.49□□□□□ -1.37
C9orf3-205ENST00000427193 PHKA1P46020 1223 aa6.49□□□□□ -1.37
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C9orf3-205ENST00000427193 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa6.49□□□□□ -1.37
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C9orf3-205ENST00000427193 TLDC2A0PJX2 215 aa6.48□□□□□ -1.37
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C9orf3-205ENST00000427193 PROP1O75360 226 aa6.48□□□□□ -1.37
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C9orf3-205ENST00000427193 OSMP13725 252 aa6.48□□□□□ -1.37
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C9orf3-205ENST00000427193 MASP1P48740 699 aa6.48□□□□□ -1.37
C9orf3-205ENST00000427193 NOMO3P69849 1222 aa6.48□□□□□ -1.37
C9orf3-205ENST00000427193 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
C9orf3-205ENST00000427193 NOMO2Q5JPE7 1267 aa6.48□□□□□ -1.37
C9orf3-205ENST00000427193 SP5Q6BEB4 398 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
C9orf3-205ENST00000427193 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
C9orf3-205ENST00000427193 CDCA5Q96FF9 252 aa6.48□□□□□ -1.37
C9orf3-205ENST00000427193 GSTO2Q9H4Y5 243 aa6.48□□□□□ -1.37
C9orf3-205ENST00000427193 HMG20BQ9P0W2 317 aa6.48□□□□□ -1.37
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