RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000422939.1

TRPS1-204, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 2

Gene TRPS1, Length 581 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-204ENST00000422939 FGAP02671 866 aa6.64□□□□□ -1.35
TRPS1-204ENST00000422939 FPR3P25089 353 aa6.64□□□□□ -1.35
TRPS1-204ENST00000422939 PTDSS1P48651 473 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
TRPS1-204ENST00000422939 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
TRPS1-204ENST00000422939 SLC29A2Q14542 456 aa6.64□□□□□ -1.35
TRPS1-204ENST00000422939 TTC8Q8TAM2 541 aa6.64□□□□□ -1.35
TRPS1-204ENST00000422939 RITA1Q96K30 269 aa6.64□□□□□ -1.35
TRPS1-204ENST00000422939 QTRT1Q9BXR0 403 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
TRPS1-204ENST00000422939 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
TRPS1-204ENST00000422939 M0R3H8 397 aa6.63□□□□□ -1.35
TRPS1-204ENST00000422939 CES2O00748 559 aa6.63□□□□□ -1.35
TRPS1-204ENST00000422939 RRP9O43818 475 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
TRPS1-204ENST00000422939 CHRM5P08912 532 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
TRPS1-204ENST00000422939 RENBPP51606 427 aa6.63□□□□□ -1.35
TRPS1-204ENST00000422939 TIRAPP58753 221 aa6.63□□□□□ -1.35
TRPS1-204ENST00000422939 TIAL1Q01085 375 aaKnown RBP eCLIP6.63□□□□□ -1.35
TRPS1-204ENST00000422939 ZNF750Q32MQ0 723 aa6.63□□□□□ -1.35
TRPS1-204ENST00000422939 PAPD7Q5XG87 772 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
TRPS1-204ENST00000422939 ZNF626Q68DY1 528 aa6.63□□□□□ -1.35
TRPS1-204ENST00000422939 ZNF425Q6IV72 752 aa6.63□□□□□ -1.35
TRPS1-204ENST00000422939 YTHDF3Q7Z739 585 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
TRPS1-204ENST00000422939 C14orf80Q86SX3 495 aa6.63□□□□□ -1.35
TRPS1-204ENST00000422939 SESTD1Q86VW0 696 aa6.63□□□□□ -1.35
TRPS1-204ENST00000422939 C8orf58Q8NAV2 365 aa6.63□□□□□ -1.35
TRPS1-204ENST00000422939 CTHRC1Q96CG8 243 aa6.63□□□□□ -1.35
TRPS1-204ENST00000422939 VN1R3Q9BXE9 311 aa6.63□□□□□ -1.35
TRPS1-204ENST00000422939 CHST8Q9H2A9 424 aa6.63□□□□□ -1.35
TRPS1-204ENST00000422939 NRIP3Q9NQ35 241 aa6.63□□□□□ -1.35
TRPS1-204ENST00000422939 PRDM11Q9NQV5 511 aa6.63□□□□□ -1.35
TRPS1-204ENST00000422939 OBP2AQ9NY56 170 aa6.63□□□□□ -1.35
TRPS1-204ENST00000422939 HDAC9Q9UKV0 1011 aa6.63□□□□□ -1.35
TRPS1-204ENST00000422939 TCRBV5S1A1TA0A578 114 aa6.62□□□□□ -1.35
TRPS1-204ENST00000422939 TXNP10599 105 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
TRPS1-204ENST00000422939 PEX2P28328 305 aa6.62□□□□□ -1.35
TRPS1-204ENST00000422939 PSG6Q00889 435 aa6.62□□□□□ -1.35
TRPS1-204ENST00000422939 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
TRPS1-204ENST00000422939 SLC18B1Q6NT16 456 aa6.62□□□□□ -1.35
TRPS1-204ENST00000422939 PPP4R4Q6NUP7 873 aa6.62□□□□□ -1.35
TRPS1-204ENST00000422939 PTCHD4Q6ZW05 846 aa6.62□□□□□ -1.35
TRPS1-204ENST00000422939 BCDIN3DQ7Z5W3 292 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
TRPS1-204ENST00000422939 YAF2Q8IY57 180 aa6.62□□□□□ -1.35
TRPS1-204ENST00000422939 MSLNLQ96KJ4 702 aa6.62□□□□□ -1.35
TRPS1-204ENST00000422939 C5orf34Q96MH7 638 aa6.62□□□□□ -1.35
TRPS1-204ENST00000422939 SH2D3AQ9BRG2 576 aa6.62□□□□□ -1.35
TRPS1-204ENST00000422939 BTBD3Q9Y2F9 522 aa6.62□□□□□ -1.35
TRPS1-204ENST00000422939 UBE2Q2LH0YL09 131 aa6.61□□□□□ -1.35
TRPS1-204ENST00000422939 IL1R1P14778 569 aa6.61□□□□□ -1.35
TRPS1-204ENST00000422939 RPL17P18621 184 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
TRPS1-204ENST00000422939 BTF3P20290 206 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
TRPS1-204ENST00000422939 ACVR2AP27037 513 aa6.61□□□□□ -1.35
TRPS1-204ENST00000422939 CPT1AP50416 773 aa6.61□□□□□ -1.35
TRPS1-204ENST00000422939 GATMP50440 423 aa6.61□□□□□ -1.35
TRPS1-204ENST00000422939 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
TRPS1-204ENST00000422939 CYB5RLQ6IPT4 315 aa6.61□□□□□ -1.35
TRPS1-204ENST00000422939 SERPINA13PQ6UXR4 307 aa6.61□□□□□ -1.35
TRPS1-204ENST00000422939 GALNT16Q8N428 558 aa6.61□□□□□ -1.35
TRPS1-204ENST00000422939 ADAMTS18Q8TE60 1221 aa6.61□□□□□ -1.35
TRPS1-204ENST00000422939 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
TRPS1-204ENST00000422939 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
TRPS1-204ENST00000422939 FAM83DQ9H4H8 585 aa6.61□□□□□ -1.35
TRPS1-204ENST00000422939 TRIM36Q9NQ86 728 aa6.61□□□□□ -1.35
TRPS1-204ENST00000422939 DKK4Q9UBT3 224 aa6.61□□□□□ -1.35
TRPS1-204ENST00000422939 AQP7P3A6NL99 342 aa6.6□□□□□ -1.35
TRPS1-204ENST00000422939 BTBD19C9JJ37 291 aa6.6□□□□□ -1.35
TRPS1-204ENST00000422939 RAB27BO00194 218 aa6.6□□□□□ -1.35
TRPS1-204ENST00000422939 PIAS2O75928 621 aa6.6□□□□□ -1.35
TRPS1-204ENST00000422939 INMTO95050 263 aa6.6□□□□□ -1.35
TRPS1-204ENST00000422939 PHKG2P15735 406 aa6.6□□□□□ -1.35
TRPS1-204ENST00000422939 TPH1P17752 444 aa6.6□□□□□ -1.35
TRPS1-204ENST00000422939 RHCEP18577 417 aa6.6□□□□□ -1.35
TRPS1-204ENST00000422939 MTHFSP49914 203 aa6.6□□□□□ -1.35
TRPS1-204ENST00000422939 ITGA8P53708 1063 aa6.6□□□□□ -1.35
TRPS1-204ENST00000422939 RHDQ02161 417 aa6.6□□□□□ -1.35
TRPS1-204ENST00000422939 SEMA5AQ13591 1074 aa6.6□□□□□ -1.35
TRPS1-204ENST00000422939 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa6.6□□□□□ -1.35
TRPS1-204ENST00000422939 C4orf46Q504U0 113 aa6.6□□□□□ -1.35
TRPS1-204ENST00000422939 MORN5Q5VZ52 161 aa6.6□□□□□ -1.35
TRPS1-204ENST00000422939 SCARB1Q8WTV0 552 aa6.6□□□□□ -1.35
TRPS1-204ENST00000422939 IPCEF1Q8WWN9 437 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
TRPS1-204ENST00000422939 CCDC17Q96LX7 622 aa6.6□□□□□ -1.35
TRPS1-204ENST00000422939 FYTTD1Q96QD9 318 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
TRPS1-204ENST00000422939 MMS19Q96T76 1030 aa6.6□□□□□ -1.35
TRPS1-204ENST00000422939 ASIC5Q9NY37 505 aa6.6□□□□□ -1.35
TRPS1-204ENST00000422939 MID2Q9UJV3 735 aa6.6□□□□□ -1.35
TRPS1-204ENST00000422939 USP1O94782 785 aa6.59□□□□□ -1.35
TRPS1-204ENST00000422939 CYP2A6P11509 494 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
TRPS1-204ENST00000422939 HGFP14210 728 aa6.59□□□□□ -1.35
TRPS1-204ENST00000422939 CREB1P16220 341 aa6.59□□□□□ -1.35
TRPS1-204ENST00000422939 PGDP52209 483 aa6.59□□□□□ -1.35
TRPS1-204ENST00000422939 LMAN2Q12907 356 aa6.59□□□□□ -1.35
TRPS1-204ENST00000422939 GALEQ14376 348 aa6.59□□□□□ -1.35
TRPS1-204ENST00000422939 FAM187BQ17R55 369 aa6.59□□□□□ -1.35
TRPS1-204ENST00000422939 TMEM63BQ5T3F8 832 aa6.59□□□□□ -1.35
TRPS1-204ENST00000422939 DENND2CQ68D51 928 aa6.59□□□□□ -1.35
TRPS1-204ENST00000422939 C11orf87Q6NUJ2 197 aa6.59□□□□□ -1.35
TRPS1-204ENST00000422939 UNC13DQ70J99 1090 aa6.59□□□□□ -1.35
TRPS1-204ENST00000422939 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
TRPS1-204ENST00000422939 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
TRPS1-204ENST00000422939 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
TRPS1-204ENST00000422939 SNX15Q9NRS6 342 aa6.59□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.1 ms