RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000403441.1

PRAME-204, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 3

Gene PRAME, Length 567 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-204ENST00000403441 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP13.13□□□□□ -0.31
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PRAME-204ENST00000403441 SYKP43405 635 aa13.13□□□□□ -0.31
PRAME-204ENST00000403441 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP13.13□□□□□ -0.31
PRAME-204ENST00000403441 ZXDBP98169 803 aa13.13□□□□□ -0.31
PRAME-204ENST00000403441 DHCR24Q15392 516 aa13.13□□□□□ -0.31
PRAME-204ENST00000403441 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP13.13□□□□□ -0.31
PRAME-204ENST00000403441 KRBA2Q6ZNG9 492 aa13.13□□□□□ -0.31
PRAME-204ENST00000403441 LPCAT2Q7L5N7 544 aa13.13□□□□□ -0.31
PRAME-204ENST00000403441 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa13.13□□□□□ -0.31
PRAME-204ENST00000403441 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa13.13□□□□□ -0.31
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PRAME-204ENST00000403441 ENGASEQ8NFI3 743 aa13.13□□□□□ -0.31
PRAME-204ENST00000403441 OR6B3Q8NGW1 331 aa13.13□□□□□ -0.31
PRAME-204ENST00000403441 PIGKQ92643 395 aa13.13□□□□□ -0.31
PRAME-204ENST00000403441 FNBP1Q96RU3 617 aa13.13□□□□□ -0.31
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PRAME-204ENST00000403441 BLZF1Q9H2G9 400 aa13.13□□□□□ -0.31
PRAME-204ENST00000403441 POLMQ9NP87 494 aaPredicted RBP13.13□□□□□ -0.31
PRAME-204ENST00000403441 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP13.13□□□□□ -0.31
PRAME-204ENST00000403441 TBC1D14Q9P2M4 693 aa13.13□□□□□ -0.31
PRAME-204ENST00000403441 NUP205Q92621 2012 aa13.13□□□□□ -0.31
PRAME-204ENST00000403441 PTPRDP23468 1912 aa13.13□□□□□ -0.31
PRAME-204ENST00000403441 ATP8B3O60423 1300 aa13.13□□□□□ -0.31
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PRAME-204ENST00000403441 TACC1O75410 805 aa13.12□□□□□ -0.31
PRAME-204ENST00000403441 KAT7O95251 611 aa13.12□□□□□ -0.31
PRAME-204ENST00000403441 MBL2P11226 248 aaPredicted RBP13.12□□□□□ -0.31
PRAME-204ENST00000403441 ADH5P11766 374 aa13.12□□□□□ -0.31
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PRAME-204ENST00000403441 CSRP1P21291 193 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
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PRAME-204ENST00000403441 AFMP43652 599 aa13.12□□□□□ -0.31
PRAME-204ENST00000403441 KDSRQ06136 332 aa13.12□□□□□ -0.31
PRAME-204ENST00000403441 DPYDQ12882 1025 aa13.12□□□□□ -0.31
PRAME-204ENST00000403441 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP13.12□□□□□ -0.31
PRAME-204ENST00000403441 LMAN2Q12907 356 aa13.12□□□□□ -0.31
PRAME-204ENST00000403441 FOXC1Q12948 553 aa13.12□□□□□ -0.31
PRAME-204ENST00000403441 TAF10Q12962 218 aa13.12□□□□□ -0.31
PRAME-204ENST00000403441 BYSLQ13895 437 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
PRAME-204ENST00000403441 GAB4Q2WGN9 574 aa13.12□□□□□ -0.31
PRAME-204ENST00000403441 EOGTQ5NDL2 527 aa13.12□□□□□ -0.31
PRAME-204ENST00000403441 UNQ6494/PRO21346Q6UXR6 183 aa13.12□□□□□ -0.31
PRAME-204ENST00000403441 C12orf56Q8IXR9 622 aa13.12□□□□□ -0.31
PRAME-204ENST00000403441 ADGRG2Q8IZP9 1017 aa13.12□□□□□ -0.31
PRAME-204ENST00000403441 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP13.12□□□□□ -0.31
PRAME-204ENST00000403441 TXNDC5Q8NBS9 432 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
PRAME-204ENST00000403441 KIAA0895Q8NCT3 520 aa13.12□□□□□ -0.31
PRAME-204ENST00000403441 PDZD8Q8NEN9 1154 aa13.12□□□□□ -0.31
PRAME-204ENST00000403441 OLIG1Q8TAK6 271 aa13.12□□□□□ -0.31
PRAME-204ENST00000403441 CGRRF1Q99675 332 aa13.12□□□□□ -0.31
PRAME-204ENST00000403441 MRPL45Q9BRJ2 306 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
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PRAME-204ENST00000403441 ARHGEF4Q9NR80 690 aa13.12□□□□□ -0.31
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PRAME-204ENST00000403441 GIPC1O14908 333 aa13.11□□□□□ -0.31
PRAME-204ENST00000403441 RHOBTB3O94955 611 aa13.11□□□□□ -0.31
PRAME-204ENST00000403441 CLSTN1O94985 981 aa13.11□□□□□ -0.31
PRAME-204ENST00000403441 ZNF202O95125 648 aa13.11□□□□□ -0.31
PRAME-204ENST00000403441 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP13.11□□□□□ -0.31
PRAME-204ENST00000403441 FAM163BP0C2L3 166 aa13.11□□□□□ -0.31
PRAME-204ENST00000403441 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP13.11□□□□□ -0.31
PRAME-204ENST00000403441 YWHAQP27348 245 aa13.11□□□□□ -0.31
PRAME-204ENST00000403441 TIE1P35590 1138 aa13.11□□□□□ -0.31
PRAME-204ENST00000403441 P2RY2P41231 377 aa13.11□□□□□ -0.31
PRAME-204ENST00000403441 GRIA2P42262 883 aa13.11□□□□□ -0.31
PRAME-204ENST00000403441 CYP2J2P51589 502 aa13.11□□□□□ -0.31
PRAME-204ENST00000403441 IRX4P78413 519 aa13.11□□□□□ -0.31
PRAME-204ENST00000403441 STK4Q13043 487 aa13.11□□□□□ -0.31
PRAME-204ENST00000403441 TRPC3Q13507 836 aa13.11□□□□□ -0.31
PRAME-204ENST00000403441 PSMD6Q15008 389 aa13.11□□□□□ -0.31
PRAME-204ENST00000403441 UAP1L1Q3KQV9 507 aa13.11□□□□□ -0.31
PRAME-204ENST00000403441 WDR72Q3MJ13 1102 aa13.11□□□□□ -0.31
PRAME-204ENST00000403441 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP13.11□□□□□ -0.31
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PRAME-204ENST00000403441 OTUB2Q96DC9 234 aa13.11□□□□□ -0.31
PRAME-204ENST00000403441 NUSAP1Q9BXS6 441 aaKnown RBP13.11□□□□□ -0.31
PRAME-204ENST00000403441 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa13.11□□□□□ -0.31
PRAME-204ENST00000403441 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa13.11□□□□□ -0.31
PRAME-204ENST00000403441 IGF2RP11717 2491 aa13.11□□□□□ -0.31
PRAME-204ENST00000403441 TCRBV21S2A2A0A5A6 115 aa13.1□□□□□ -0.31
PRAME-204ENST00000403441 A8MXQ7 604 aa13.1□□□□□ -0.31
PRAME-204ENST00000403441 SGK1O00141 431 aa13.1□□□□□ -0.31
PRAME-204ENST00000403441 CDX4O14627 284 aaPredicted RBP13.1□□□□□ -0.31
PRAME-204ENST00000403441 PRR29P0C7W0 189 aa13.1□□□□□ -0.31
PRAME-204ENST00000403441 TNFRSF4P43489 277 aa13.1□□□□□ -0.31
PRAME-204ENST00000403441 SLC6A11P48066 632 aa13.1□□□□□ -0.31
PRAME-204ENST00000403441 CACNA2D1P54289 1103 aa13.1□□□□□ -0.31
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