RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000395788.3

C6orf48-208, Transcript of chromosome 6 open reading frame 48, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene C6orf48, Length 815 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf48-208ENST00000395788 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa6.37□□□□□ -1.39
C6orf48-208ENST00000395788 CCDC181Q5TID7 509 aa6.37□□□□□ -1.39
C6orf48-208ENST00000395788 LIN9Q5TKA1 542 aa6.37□□□□□ -1.39
C6orf48-208ENST00000395788 ARHGAP17Q68EM7 881 aa6.37□□□□□ -1.39
C6orf48-208ENST00000395788 LCLAT1Q6UWP7 414 aa6.37□□□□□ -1.39
C6orf48-208ENST00000395788 DPH6Q7L8W6 267 aa6.37□□□□□ -1.39
C6orf48-208ENST00000395788 RNF180Q86T96 592 aa6.37□□□□□ -1.39
C6orf48-208ENST00000395788 UNC93AQ86WB7 457 aa6.37□□□□□ -1.39
C6orf48-208ENST00000395788 CRYBG2Q8N1P7 616 aa6.37□□□□□ -1.39
C6orf48-208ENST00000395788 NIPA2Q8N8Q9 360 aa6.37□□□□□ -1.39
C6orf48-208ENST00000395788 EIF1ADQ8N9N8 165 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
C6orf48-208ENST00000395788 C3orf20Q8ND61 904 aa6.37□□□□□ -1.39
C6orf48-208ENST00000395788 GSTCDQ8NEC7 633 aa6.37□□□□□ -1.39
C6orf48-208ENST00000395788 CAGE1Q8TC20 777 aa6.37□□□□□ -1.39
C6orf48-208ENST00000395788 FNIP1Q8TF40 1166 aa6.37□□□□□ -1.39
C6orf48-208ENST00000395788 KRT35Q92764 455 aa6.37□□□□□ -1.39
C6orf48-208ENST00000395788 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
C6orf48-208ENST00000395788 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
C6orf48-208ENST00000395788 UBL7Q96S82 380 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
C6orf48-208ENST00000395788 PSMB7Q99436 277 aa6.37□□□□□ -1.39
C6orf48-208ENST00000395788 RHOXF2Q9BQY4 288 aa6.37□□□□□ -1.39
C6orf48-208ENST00000395788 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa6.37□□□□□ -1.39
C6orf48-208ENST00000395788 GSX2Q9BZM3 304 aa6.37□□□□□ -1.39
C6orf48-208ENST00000395788 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
C6orf48-208ENST00000395788 MRPL47Q9HD33 250 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
C6orf48-208ENST00000395788 GDF3Q9NR23 364 aa6.37□□□□□ -1.39
C6orf48-208ENST00000395788 PARVAQ9NVD7 372 aa6.37□□□□□ -1.39
C6orf48-208ENST00000395788 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa6.37□□□□□ -1.39
C6orf48-208ENST00000395788 EHD2Q9NZN4 543 aa6.37□□□□□ -1.39
C6orf48-208ENST00000395788 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa6.37□□□□□ -1.39
C6orf48-208ENST00000395788 HMGXB4Q9UGU5 601 aa6.37□□□□□ -1.39
C6orf48-208ENST00000395788 CYTH4Q9UIA0 394 aa6.37□□□□□ -1.39
C6orf48-208ENST00000395788 L1RE1Q9UN81 338 aa6.37□□□□□ -1.39
C6orf48-208ENST00000395788 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa6.37□□□□□ -1.39
C6orf48-208ENST00000395788 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP6.37□□□□□ -1.39
C6orf48-208ENST00000395788 GINS2Q9Y248 185 aa6.37□□□□□ -1.39
C6orf48-208ENST00000395788 GIT1Q9Y2X7 761 aa6.37□□□□□ -1.39
C6orf48-208ENST00000395788 NME7Q9Y5B8 376 aa6.37□□□□□ -1.39
C6orf48-208ENST00000395788 SCINQ9Y6U3 715 aa6.37□□□□□ -1.39
C6orf48-208ENST00000395788 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
C6orf48-208ENST00000395788 DBX1A6NMT0 343 aa6.36□□□□□ -1.39
C6orf48-208ENST00000395788 MYO1FO00160 1098 aa6.36□□□□□ -1.39
C6orf48-208ENST00000395788 MAP2K7O14733 419 aa6.36□□□□□ -1.39
C6orf48-208ENST00000395788 TLR3O15455 904 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
C6orf48-208ENST00000395788 CEP104O60308 925 aa6.36□□□□□ -1.39
C6orf48-208ENST00000395788 MICAL2O94851 1124 aa6.36□□□□□ -1.39
C6orf48-208ENST00000395788 CLSTN1O94985 981 aa6.36□□□□□ -1.39
C6orf48-208ENST00000395788 PFKMP08237 780 aa6.36□□□□□ -1.39
C6orf48-208ENST00000395788 SETSIPP0DME0 302 aa6.36□□□□□ -1.39
C6orf48-208ENST00000395788 CPB1P15086 417 aa6.36□□□□□ -1.39
C6orf48-208ENST00000395788 GLB1P16278 677 aa6.36□□□□□ -1.39
C6orf48-208ENST00000395788 HSPA6P17066 643 aa6.36□□□□□ -1.39
C6orf48-208ENST00000395788 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
C6orf48-208ENST00000395788 AKAP5P24588 427 aa6.36□□□□□ -1.39
C6orf48-208ENST00000395788 RAB27AP51159 221 aa6.36□□□□□ -1.39
C6orf48-208ENST00000395788 NDST1P52848 882 aa6.36□□□□□ -1.39
C6orf48-208ENST00000395788 TNNC1P63316 161 aa6.36□□□□□ -1.39
C6orf48-208ENST00000395788 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
C6orf48-208ENST00000395788 ITGA7Q13683 1181 aa6.36□□□□□ -1.39
C6orf48-208ENST00000395788 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
C6orf48-208ENST00000395788 LPIN1Q14693 890 aa6.36□□□□□ -1.39
C6orf48-208ENST00000395788 MESDQ14696 234 aa6.36□□□□□ -1.39
C6orf48-208ENST00000395788 ARHGEF6Q15052 776 aa6.36□□□□□ -1.39
C6orf48-208ENST00000395788 PPP2R5EQ16537 467 aa6.36□□□□□ -1.39
C6orf48-208ENST00000395788 PTGISQ16647 500 aa6.36□□□□□ -1.39
C6orf48-208ENST00000395788 CYP1B1Q16678 543 aa6.36□□□□□ -1.39
C6orf48-208ENST00000395788 LONRF2Q1L5Z9 754 aa6.36□□□□□ -1.39
C6orf48-208ENST00000395788 SOWAHAQ2M3V2 549 aa6.36□□□□□ -1.39
C6orf48-208ENST00000395788 PTPN20Q4JDL3 420 aa6.36□□□□□ -1.39
C6orf48-208ENST00000395788 LRRC38Q5VT99 294 aa6.36□□□□□ -1.39
C6orf48-208ENST00000395788 RNF43Q68DV7 783 aa6.36□□□□□ -1.39
C6orf48-208ENST00000395788 DENND1BQ6P3S1 775 aa6.36□□□□□ -1.39
C6orf48-208ENST00000395788 TMCO3Q6UWJ1 677 aa6.36□□□□□ -1.39
C6orf48-208ENST00000395788 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa6.36□□□□□ -1.39
C6orf48-208ENST00000395788 CCNI2Q6ZMN8 369 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
C6orf48-208ENST00000395788 MMS22LQ6ZRQ5 1243 aa6.36□□□□□ -1.39
C6orf48-208ENST00000395788 CPNE8Q86YQ8 564 aa6.36□□□□□ -1.39
C6orf48-208ENST00000395788 PASD1Q8IV76 773 aa6.36□□□□□ -1.39
C6orf48-208ENST00000395788 ARMC10Q8N2F6 343 aa6.36□□□□□ -1.39
C6orf48-208ENST00000395788 TOP6BLQ8N6T0 577 aa6.36□□□□□ -1.39
C6orf48-208ENST00000395788 UBL4BQ8N7F7 174 aa6.36□□□□□ -1.39
C6orf48-208ENST00000395788 C1orf131Q8NDD1 294 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
C6orf48-208ENST00000395788 FEZF2Q8TBJ5 459 aa6.36□□□□□ -1.39
C6orf48-208ENST00000395788 STK32AQ8WU08 396 aa6.36□□□□□ -1.39
C6orf48-208ENST00000395788 HDAC7Q8WUI4 952 aa6.36□□□□□ -1.39
C6orf48-208ENST00000395788 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa6.36□□□□□ -1.39
C6orf48-208ENST00000395788 SEC14L1Q92503 715 aa6.36□□□□□ -1.39
C6orf48-208ENST00000395788 MCRS1Q96EZ8 462 aa6.36□□□□□ -1.39
C6orf48-208ENST00000395788 SUSD3Q96L08 255 aa6.36□□□□□ -1.39
C6orf48-208ENST00000395788 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
C6orf48-208ENST00000395788 ZNF560Q96MR9 790 aa6.36□□□□□ -1.39
C6orf48-208ENST00000395788 NAP1L3Q99457 506 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
C6orf48-208ENST00000395788 MRPL45Q9BRJ2 306 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
C6orf48-208ENST00000395788 C11orf70Q9BRQ4 267 aa6.36□□□□□ -1.39
C6orf48-208ENST00000395788 LRRC1Q9BTT6 524 aa6.36□□□□□ -1.39
C6orf48-208ENST00000395788 NT5C1AQ9BXI3 368 aa6.36□□□□□ -1.39
C6orf48-208ENST00000395788 FUT8Q9BYC5 575 aa6.36□□□□□ -1.39
C6orf48-208ENST00000395788 OSBPL7Q9BZF2 842 aa6.36□□□□□ -1.39
C6orf48-208ENST00000395788 UBXN6Q9BZV1 441 aa6.36□□□□□ -1.39
C6orf48-208ENST00000395788 TRIM7Q9C029 511 aa6.36□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.9 ms