RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384354.1

RNU6-171P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 171, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-171P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-171P-201ENST00000384354 MRGPRX1Q96LB2 322 aa5.79□□□□□ -1.48
RNU6-171P-201ENST00000384354 DPEP3Q9H4B8 488 aa5.79□□□□□ -1.48
RNU6-171P-201ENST00000384354 PRORYQ9H606 182 aa5.79□□□□□ -1.48
RNU6-171P-201ENST00000384354 CCSER2Q9H7U1 834 aa5.79□□□□□ -1.48
RNU6-171P-201ENST00000384354 DNMT3LQ9UJW3 386 aa5.79□□□□□ -1.48
RNU6-171P-201ENST00000384354 DSEQ9UL01 958 aa5.79□□□□□ -1.48
RNU6-171P-201ENST00000384354 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP5.79□□□□□ -1.48
RNU6-171P-201ENST00000384354 AGAP1Q9UPQ3 857 aa5.79□□□□□ -1.48
RNU6-171P-201ENST00000384354 C2CD2Q9Y426 696 aa5.79□□□□□ -1.48
RNU6-171P-201ENST00000384354 UBR5O95071 2799 aaPredicted RBP5.79□□□□□ -1.48
RNU6-171P-201ENST00000384354 TEX15Q9BXT5 2789 aa5.78□□□□□ -1.48
RNU6-171P-201ENST00000384354 A0A0A0MRY4 1105 aa5.78□□□□□ -1.48
RNU6-171P-201ENST00000384354 A0A1B0GVT2 93 aa5.78□□□□□ -1.48
RNU6-171P-201ENST00000384354 A0A1W2PQD8 194 aa5.78□□□□□ -1.48
RNU6-171P-201ENST00000384354 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP5.78□□□□□ -1.48
RNU6-171P-201ENST00000384354 PLK4O00444 970 aa5.78□□□□□ -1.48
RNU6-171P-201ENST00000384354 GABRDO14764 452 aa5.78□□□□□ -1.48
RNU6-171P-201ENST00000384354 AP5Z1O43299 807 aa5.78□□□□□ -1.48
RNU6-171P-201ENST00000384354 COCHO43405 550 aa5.78□□□□□ -1.48
RNU6-171P-201ENST00000384354 XPOTO43592 962 aaKnown RBP5.78□□□□□ -1.48
RNU6-171P-201ENST00000384354 TRAK2O60296 914 aa5.78□□□□□ -1.48
RNU6-171P-201ENST00000384354 CILPO75339 1184 aa5.78□□□□□ -1.48
RNU6-171P-201ENST00000384354 PPP1R37O75864 691 aa5.78□□□□□ -1.48
RNU6-171P-201ENST00000384354 ALDH1A2O94788 518 aa5.78□□□□□ -1.48
RNU6-171P-201ENST00000384354 ABL1P00519 1130 aa5.78□□□□□ -1.48
RNU6-171P-201ENST00000384354 PDGFRBP09619 1106 aa5.78□□□□□ -1.48
RNU6-171P-201ENST00000384354 IRF1P10914 325 aa5.78□□□□□ -1.48
RNU6-171P-201ENST00000384354 DDIT3P35638 169 aa5.78□□□□□ -1.48
RNU6-171P-201ENST00000384354 EIF2S3P41091 472 aaKnown RBP5.78□□□□□ -1.48
RNU6-171P-201ENST00000384354 GRIA2P42262 883 aa5.78□□□□□ -1.48
RNU6-171P-201ENST00000384354 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP5.78□□□□□ -1.48
RNU6-171P-201ENST00000384354 AMPD2Q01433 879 aa5.78□□□□□ -1.48
RNU6-171P-201ENST00000384354 TSPY1Q01534 308 aa5.78□□□□□ -1.48
RNU6-171P-201ENST00000384354 TAF10Q12962 218 aa5.78□□□□□ -1.48
RNU6-171P-201ENST00000384354 SV2CQ496J9 727 aa5.78□□□□□ -1.48
RNU6-171P-201ENST00000384354 CFAP221Q4G0U5 840 aa5.78□□□□□ -1.48
RNU6-171P-201ENST00000384354 EOGTQ5NDL2 527 aa5.78□□□□□ -1.48
RNU6-171P-201ENST00000384354 ADALQ6DHV7 355 aa5.78□□□□□ -1.48
RNU6-171P-201ENST00000384354 DHRS13Q6UX07 377 aa5.78□□□□□ -1.48
RNU6-171P-201ENST00000384354 LIMS2Q7Z4I7 341 aa5.78□□□□□ -1.48
RNU6-171P-201ENST00000384354 GLRX5Q86SX6 157 aa5.78□□□□□ -1.48
RNU6-171P-201ENST00000384354 SFR1Q86XK3 245 aa5.78□□□□□ -1.48
RNU6-171P-201ENST00000384354 RGL4Q8IZJ4 473 aa5.78□□□□□ -1.48
RNU6-171P-201ENST00000384354 TERB1Q8NA31 727 aa5.78□□□□□ -1.48
RNU6-171P-201ENST00000384354 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa5.78□□□□□ -1.48
RNU6-171P-201ENST00000384354 OR5B17Q8NGF7 314 aa5.78□□□□□ -1.48
RNU6-171P-201ENST00000384354 C1orf216Q8TAB5 229 aa5.78□□□□□ -1.48
RNU6-171P-201ENST00000384354 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP5.78□□□□□ -1.48
RNU6-171P-201ENST00000384354 SETD7Q8WTS6 366 aaKnown RBP5.78□□□□□ -1.48
RNU6-171P-201ENST00000384354 KCNN1Q92952 543 aa5.78□□□□□ -1.48
RNU6-171P-201ENST00000384354 BHMTQ93088 406 aa5.78□□□□□ -1.48
RNU6-171P-201ENST00000384354 PCED1BQ96HM7 432 aa5.78□□□□□ -1.48
RNU6-171P-201ENST00000384354 ZNF419Q96HQ0 510 aaPredicted RBP5.78□□□□□ -1.48
RNU6-171P-201ENST00000384354 SYT15Q9BQS2 421 aa5.78□□□□□ -1.48
RNU6-171P-201ENST00000384354 ACBD6Q9BR61 282 aa5.78□□□□□ -1.48
RNU6-171P-201ENST00000384354 MRPL45Q9BRJ2 306 aaKnown RBP5.78□□□□□ -1.48
RNU6-171P-201ENST00000384354 TTLL2Q9BWV7 592 aa5.78□□□□□ -1.48
RNU6-171P-201ENST00000384354 GPR174Q9BXC1 333 aa5.78□□□□□ -1.48
RNU6-171P-201ENST00000384354 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa5.78□□□□□ -1.48
RNU6-171P-201ENST00000384354 MTMR12Q9C0I1 747 aa5.78□□□□□ -1.48
RNU6-171P-201ENST00000384354 MKRN2Q9H000 416 aaKnown RBP5.78□□□□□ -1.48
RNU6-171P-201ENST00000384354 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP5.78□□□□□ -1.48
RNU6-171P-201ENST00000384354 C17orf75Q9HAS0 396 aa5.78□□□□□ -1.48
RNU6-171P-201ENST00000384354 ABCB6Q9NP58 842 aa5.78□□□□□ -1.48
RNU6-171P-201ENST00000384354 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP5.78□□□□□ -1.48
RNU6-171P-201ENST00000384354 GMIPQ9P107 970 aa5.78□□□□□ -1.48
RNU6-171P-201ENST00000384354 DKK4Q9UBT3 224 aa5.78□□□□□ -1.48
RNU6-171P-201ENST00000384354 ZMYM5Q9UJ78 669 aa5.78□□□□□ -1.48
RNU6-171P-201ENST00000384354 DERAQ9Y315 318 aa5.78□□□□□ -1.48
RNU6-171P-201ENST00000384354 SNX9Q9Y5X1 595 aa5.78□□□□□ -1.48
RNU6-171P-201ENST00000384354 RELNP78509 3460 aa5.78□□□□□ -1.48
RNU6-171P-201ENST00000384354 VWA3AA6NCI4 1184 aa5.77□□□□□ -1.49
RNU6-171P-201ENST00000384354 TBC1D3BA6NDS4 549 aa5.77□□□□□ -1.49
RNU6-171P-201ENST00000384354 MDM4O15151 490 aa5.77□□□□□ -1.49
RNU6-171P-201ENST00000384354 ATXN7O15265 892 aaPredicted RBP5.77□□□□□ -1.49
RNU6-171P-201ENST00000384354 TBX18O95935 607 aa5.77□□□□□ -1.49
RNU6-171P-201ENST00000384354 MBL2P11226 248 aaPredicted RBP5.77□□□□□ -1.49
RNU6-171P-201ENST00000384354 NTSR1P30989 418 aa5.77□□□□□ -1.49
RNU6-171P-201ENST00000384354 HOXD12P35452 270 aa5.77□□□□□ -1.49
RNU6-171P-201ENST00000384354 GRIK1P39086 918 aa5.77□□□□□ -1.49
RNU6-171P-201ENST00000384354 EIF2DP41214 584 aaKnown RBP5.77□□□□□ -1.49
RNU6-171P-201ENST00000384354 TNFRSF4P43489 277 aa5.77□□□□□ -1.49
RNU6-171P-201ENST00000384354 ABCG1P45844 678 aa5.77□□□□□ -1.49
RNU6-171P-201ENST00000384354 CSNK1EP49674 416 aaKnown RBP5.77□□□□□ -1.49
RNU6-171P-201ENST00000384354 SMTNP53814 917 aa5.77□□□□□ -1.49
RNU6-171P-201ENST00000384354 RPL10AP62906 217 aaKnown RBP5.77□□□□□ -1.49
RNU6-171P-201ENST00000384354 GTF2BQ00403 316 aa5.77□□□□□ -1.49
RNU6-171P-201ENST00000384354 C19orf57Q0VDD7 668 aa5.77□□□□□ -1.49
RNU6-171P-201ENST00000384354 NR1H3Q13133 447 aa5.77□□□□□ -1.49
RNU6-171P-201ENST00000384354 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP5.77□□□□□ -1.49
RNU6-171P-201ENST00000384354 TRIM29Q14134 588 aa5.77□□□□□ -1.49
RNU6-171P-201ENST00000384354 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP5.77□□□□□ -1.49
RNU6-171P-201ENST00000384354 PTPRNQ16849 979 aa5.77□□□□□ -1.49
RNU6-171P-201ENST00000384354 HLA-BQ31612 363 aa5.77□□□□□ -1.49
RNU6-171P-201ENST00000384354 FUT11Q495W5 492 aa5.77□□□□□ -1.49
RNU6-171P-201ENST00000384354 MDH1BQ5I0G3 518 aa5.77□□□□□ -1.49
RNU6-171P-201ENST00000384354 SPDYCQ5MJ68 293 aa5.77□□□□□ -1.49
RNU6-171P-201ENST00000384354 PRAMEF14Q5SWL7 426 aa5.77□□□□□ -1.49
RNU6-171P-201ENST00000384354 KRT79Q5XKE5 535 aa5.77□□□□□ -1.49
RNU6-171P-201ENST00000384354 KIAA1324Q6UXG2 1013 aaKnown RBP5.77□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.1 ms