RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000367379.5

PTPRC-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRC, Length 517 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-204ENST00000367379 EPHB2P29323 1055 aa6□□□□□ -1.45
PTPRC-204ENST00000367379 SNAPC2Q13487 334 aa6□□□□□ -1.45
PTPRC-204ENST00000367379 HABP2Q14520 560 aaPredicted RBP6□□□□□ -1.45
PTPRC-204ENST00000367379 ETFDHQ16134 617 aa6□□□□□ -1.45
PTPRC-204ENST00000367379 CEP85Q6P2H3 762 aa6□□□□□ -1.45
PTPRC-204ENST00000367379 SMIM5Q71RC9 77 aa6□□□□□ -1.45
PTPRC-204ENST00000367379 PSD4Q8NDX1 1056 aa6□□□□□ -1.45
PTPRC-204ENST00000367379 FAXDC2Q96IV6 333 aa6□□□□□ -1.45
PTPRC-204ENST00000367379 BRD9Q9H8M2 597 aa6□□□□□ -1.45
PTPRC-204ENST00000367379 MRPS18AQ9NVS2 196 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
PTPRC-204ENST00000367379 SLC5A4Q9NY91 659 aa6□□□□□ -1.45
PTPRC-204ENST00000367379 CFAP20Q9Y6A4 193 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
PTPRC-204ENST00000367379 ATP10DQ9P241 1426 aa5.99□□□□□ -1.45
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PTPRC-204ENST00000367379 JTBO76095 146 aa5.99□□□□□ -1.45
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PTPRC-204ENST00000367379 NHLRC4P0CG21 123 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
PTPRC-204ENST00000367379 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
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PTPRC-204ENST00000367379 BHMT2Q9H2M3 363 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRC-204ENST00000367379 MAN1C1Q9NR34 630 aa5.99□□□□□ -1.45
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PTPRC-204ENST00000367379 KDRP35968 1356 aa5.98□□□□□ -1.45
PTPRC-204ENST00000367379 A0A0G2JLW4 131 aa5.98□□□□□ -1.45
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PTPRC-204ENST00000367379 PPP1R32Q7Z5V6 425 aa5.98□□□□□ -1.45
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PTPRC-204ENST00000367379 ATRIPQ8WXE1 791 aa5.98□□□□□ -1.45
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PTPRC-204ENST00000367379 SERHLQ9NQF3 203 aa5.98□□□□□ -1.45
PTPRC-204ENST00000367379 CFAP97Q9P2B7 532 aa5.98□□□□□ -1.45
PTPRC-204ENST00000367379 SERPINB13Q9UIV8 391 aa5.98□□□□□ -1.45
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PTPRC-204ENST00000367379 MYO1FO00160 1098 aa5.97□□□□□ -1.45
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PTPRC-204ENST00000367379 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP5.97□□□□□ -1.45
PTPRC-204ENST00000367379 ZNF831Q5JPB2 1677 aa5.97□□□□□ -1.45
PTPRC-204ENST00000367379 ADCY9O60503 1353 aa5.96□□□□□ -1.45
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PTPRC-204ENST00000367379 GNAI3P08754 354 aa5.96□□□□□ -1.46
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PTPRC-204ENST00000367379 ZNF135P52742 658 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
PTPRC-204ENST00000367379 GNAI1P63096 354 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRC-204ENST00000367379 KIF22Q14807 665 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRC-204ENST00000367379 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa5.96□□□□□ -1.46
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PTPRC-204ENST00000367379 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP5.96□□□□□ -1.46
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PTPRC-204ENST00000367379 SH3BP4Q9P0V3 963 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRC-204ENST00000367379 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
PTPRC-204ENST00000367379 C10orf71Q711Q0 1435 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRC-204ENST00000367379 KIF7Q2M1P5 1343 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRC-204ENST00000367379 ZNF521Q96K83 1311 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRC-204ENST00000367379 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
PTPRC-204ENST00000367379 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
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