RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000341935.9

CCR6-201, Transcript of C-C motif chemokine receptor 6, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCR6, Length 4,018 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR6-201ENST00000341935 MAGEA9P43362 315 aa6.36□□□□□ -1.39
CCR6-201ENST00000341935 CCNHP51946 323 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
CCR6-201ENST00000341935 BST2Q10589 180 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
CCR6-201ENST00000341935 MESDQ14696 234 aa6.36□□□□□ -1.39
CCR6-201ENST00000341935 PTPROQ16827 1216 aa6.36□□□□□ -1.39
CCR6-201ENST00000341935 C14orf80Q86SX3 495 aa6.36□□□□□ -1.39
CCR6-201ENST00000341935 XYLT1Q86Y38 959 aa6.36□□□□□ -1.39
CCR6-201ENST00000341935 SLC2A14Q8TDB8 520 aa6.36□□□□□ -1.39
CCR6-201ENST00000341935 ERP27Q96DN0 273 aa6.36□□□□□ -1.39
CCR6-201ENST00000341935 OSBPL9Q96SU4 736 aa6.36□□□□□ -1.39
CCR6-201ENST00000341935 HNRNPABQ99729 332 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
CCR6-201ENST00000341935 RTP3Q9BQQ7 232 aa6.36□□□□□ -1.39
CCR6-201ENST00000341935 SYT15Q9BQS2 421 aa6.36□□□□□ -1.39
CCR6-201ENST00000341935 TMEM175Q9BSA9 504 aa6.36□□□□□ -1.39
CCR6-201ENST00000341935 TJP2Q9UDY2 1190 aa6.36□□□□□ -1.39
CCR6-201ENST00000341935 TBK1Q9UHD2 729 aa6.36□□□□□ -1.39
CCR6-201ENST00000341935 ANAPC7Q9UJX3 599 aa6.36□□□□□ -1.39
CCR6-201ENST00000341935 PTPRSQ13332 1948 aa6.36□□□□□ -1.39
CCR6-201ENST00000341935 NRP1O14786 923 aa6.35□□□□□ -1.39
CCR6-201ENST00000341935 UPP2O95045 317 aa6.35□□□□□ -1.39
CCR6-201ENST00000341935 TYMPP19971 482 aa6.35□□□□□ -1.39
CCR6-201ENST00000341935 ELF1P32519 619 aa6.35□□□□□ -1.39
CCR6-201ENST00000341935 BCAT1P54687 386 aa6.35□□□□□ -1.39
CCR6-201ENST00000341935 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
CCR6-201ENST00000341935 RPS6KA1Q15418 735 aa6.35□□□□□ -1.39
CCR6-201ENST00000341935 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa6.35□□□□□ -1.39
CCR6-201ENST00000341935 DNAJC24Q6P3W2 148 aa6.35□□□□□ -1.39
CCR6-201ENST00000341935 LRRC43Q8N309 656 aa6.35□□□□□ -1.39
CCR6-201ENST00000341935 ANKRD52Q8NB46 1076 aa6.35□□□□□ -1.39
CCR6-201ENST00000341935 SLC35F5Q8WV83 523 aa6.35□□□□□ -1.39
CCR6-201ENST00000341935 SNRNP27Q8WVK2 155 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
CCR6-201ENST00000341935 C18orf8Q96DM3 657 aa6.35□□□□□ -1.39
CCR6-201ENST00000341935 HES6Q96HZ4 224 aa6.35□□□□□ -1.39
CCR6-201ENST00000341935 SYNCQ9H7C4 482 aa6.35□□□□□ -1.39
CCR6-201ENST00000341935 CRTAC1Q9NQ79 661 aa6.35□□□□□ -1.39
CCR6-201ENST00000341935 COMMD8Q9NX08 183 aa6.35□□□□□ -1.39
CCR6-201ENST00000341935 HCSTQ9UBK5 93 aa6.35□□□□□ -1.39
CCR6-201ENST00000341935 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
CCR6-201ENST00000341935 ALG6Q9Y672 507 aa6.35□□□□□ -1.39
CCR6-201ENST00000341935 NLRC5Q86WI3 1866 aa6.35□□□□□ -1.39
CCR6-201ENST00000341935 ZNF185O15231 689 aa6.35□□□□□ -1.39
CCR6-201ENST00000341935 TADA2AO75478 443 aa6.35□□□□□ -1.39
CCR6-201ENST00000341935 DGKIO75912 1065 aa6.35□□□□□ -1.39
CCR6-201ENST00000341935 SLU7O95391 586 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
CCR6-201ENST00000341935 GJB6O95452 261 aa6.35□□□□□ -1.39
CCR6-201ENST00000341935 AMHP03971 560 aa6.35□□□□□ -1.39
CCR6-201ENST00000341935 PCSK1P29120 753 aa6.35□□□□□ -1.39
CCR6-201ENST00000341935 TKTP29401 623 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
CCR6-201ENST00000341935 SLC11A1P49279 550 aa6.35□□□□□ -1.39
CCR6-201ENST00000341935 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
CCR6-201ENST00000341935 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
CCR6-201ENST00000341935 CCDC142Q17RM4 750 aa6.35□□□□□ -1.39
CCR6-201ENST00000341935 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa6.35□□□□□ -1.39
CCR6-201ENST00000341935 FEZF2Q8TBJ5 459 aa6.35□□□□□ -1.39
CCR6-201ENST00000341935 ACBD6Q9BR61 282 aa6.35□□□□□ -1.39
CCR6-201ENST00000341935 MED10Q9BTT4 135 aa6.35□□□□□ -1.39
CCR6-201ENST00000341935 SELENOOQ9BVL4 669 aa6.35□□□□□ -1.39
CCR6-201ENST00000341935 COLEC11Q9BWP8 271 aa6.35□□□□□ -1.39
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CCR6-201ENST00000341935 WDR35Q9P2L0 1181 aa6.35□□□□□ -1.39
CCR6-201ENST00000341935 LCMT1Q9UIC8 334 aa6.35□□□□□ -1.39
CCR6-201ENST00000341935 CLDN5O00501 218 aa6.35□□□□□ -1.39
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CCR6-201ENST00000341935 TCP1P17987 556 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
CCR6-201ENST00000341935 COMTP21964 271 aa6.35□□□□□ -1.39
CCR6-201ENST00000341935 RGS7P49802 495 aa6.35□□□□□ -1.39
CCR6-201ENST00000341935 DNA2P51530 1060 aa6.35□□□□□ -1.39
CCR6-201ENST00000341935 TAP1Q03518 808 aa6.35□□□□□ -1.39
CCR6-201ENST00000341935 OVOS1Q6IE37 1185 aa6.35□□□□□ -1.39
CCR6-201ENST00000341935 PMF1Q6P1K2 205 aa6.35□□□□□ -1.39
CCR6-201ENST00000341935 SPATA21Q7Z572 469 aa6.35□□□□□ -1.39
CCR6-201ENST00000341935 RBM12BQ8IXT5 1001 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
CCR6-201ENST00000341935 FUKQ8N0W3 1084 aa6.35□□□□□ -1.39
CCR6-201ENST00000341935 THEM5Q8N1Q8 247 aa6.35□□□□□ -1.39
CCR6-201ENST00000341935 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa6.35□□□□□ -1.39
CCR6-201ENST00000341935 MCRS1Q96EZ8 462 aa6.35□□□□□ -1.39
CCR6-201ENST00000341935 CAPZA3Q96KX2 299 aa6.35□□□□□ -1.39
CCR6-201ENST00000341935 MCEEQ96PE7 176 aa6.35□□□□□ -1.39
CCR6-201ENST00000341935 PSMB7Q99436 277 aa6.35□□□□□ -1.39
CCR6-201ENST00000341935 CARD6Q9BX69 1037 aa6.35□□□□□ -1.39
CCR6-201ENST00000341935 DUSP16Q9BY84 665 aa6.35□□□□□ -1.39
CCR6-201ENST00000341935 IL23AQ9NPF7 189 aa6.35□□□□□ -1.39
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CCR6-201ENST00000341935 ADAM28Q9UKQ2 775 aa6.35□□□□□ -1.39
CCR6-201ENST00000341935 TMEM191CA6NGB0 347 aa6.34□□□□□ -1.39
CCR6-201ENST00000341935 E5RJQ4 531 aa6.34□□□□□ -1.39
CCR6-201ENST00000341935 GOLGA8SH3BPF8 625 aa6.34□□□□□ -1.39
CCR6-201ENST00000341935 PIK3R2O00459 728 aa6.34□□□□□ -1.39
CCR6-201ENST00000341935 EFCAB14O75071 495 aa6.34□□□□□ -1.39
CCR6-201ENST00000341935 CXCR5P32302 372 aa6.34□□□□□ -1.39
CCR6-201ENST00000341935 WDR5P61964 334 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
CCR6-201ENST00000341935 ZBTB17Q13105 803 aa6.34□□□□□ -1.39
CCR6-201ENST00000341935 KRT72Q14CN4 511 aa6.34□□□□□ -1.39
CCR6-201ENST00000341935 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
CCR6-201ENST00000341935 PAQR9Q6ZVX9 377 aa6.34□□□□□ -1.39
CCR6-201ENST00000341935 PEX5LQ8IYB4 626 aa6.34□□□□□ -1.39
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