RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000332175.12

PTPRM-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 6,095 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-201ENST00000332175 NT5MQ9NPB1 228 aa23.13■■□□□ 1.29
PTPRM-201ENST00000332175 SETD4Q9NVD3 440 aa23.13■■□□□ 1.29
PTPRM-201ENST00000332175 SCN3BQ9NY72 215 aa23.13■■□□□ 1.29
PTPRM-201ENST00000332175 SNTG2Q9NY99 539 aa23.13■■□□□ 1.29
PTPRM-201ENST00000332175 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa23.13■■□□□ 1.29
PTPRM-201ENST00000332175 TCF3P15923 654 aa23.13■■□□□ 1.29
PTPRM-201ENST00000332175 GPC1P35052 558 aa23.13■■□□□ 1.29
PTPRM-201ENST00000332175 OTUD4Q01804 1114 aaKnown RBP23.13■■□□□ 1.29
PTPRM-201ENST00000332175 TMEM154Q6P9G4 183 aa23.13■■□□□ 1.29
PTPRM-201ENST00000332175 CLEC17AQ6ZS10 378 aa23.13■■□□□ 1.29
PTPRM-201ENST00000332175 PHACTR4Q8IZ21 702 aa23.13■■□□□ 1.29
PTPRM-201ENST00000332175 CIPCQ9C0C6 399 aa23.13■■□□□ 1.29
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PTPRM-201ENST00000332175 STARD7Q9NQZ5 370 aa23.13■■□□□ 1.29
PTPRM-201ENST00000332175 CNTN1Q12860 1018 aa23.13■■□□□ 1.29
PTPRM-201ENST00000332175 TIGD7Q6NT04 549 aaPredicted RBP23.13■■□□□ 1.29
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PTPRM-201ENST00000332175 CPSF4O95639 269 aaKnown RBP23.13■■□□□ 1.29
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PTPRM-201ENST00000332175 RHOAP61586 193 aa23.13■■□□□ 1.29
PTPRM-201ENST00000332175 PHKG1Q16816 387 aa23.13■■□□□ 1.29
PTPRM-201ENST00000332175 TFDP3Q5H9I0 405 aa23.13■■□□□ 1.29
PTPRM-201ENST00000332175 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa23.13■■□□□ 1.29
PTPRM-201ENST00000332175 CKBP12277 381 aa23.12■■□□□ 1.29
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PTPRM-201ENST00000332175 ANGPT1Q15389 498 aa23.12■■□□□ 1.29
PTPRM-201ENST00000332175 ERO1BQ86YB8 467 aa23.12■■□□□ 1.29
PTPRM-201ENST00000332175 P3H2Q8IVL5 708 aa23.12■■□□□ 1.29
PTPRM-201ENST00000332175 EMC1Q8N766 993 aa23.12■■□□□ 1.29
PTPRM-201ENST00000332175 RIN3Q8TB24 985 aa23.12■■□□□ 1.29
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PTPRM-201ENST00000332175 ILKAPQ9H0C8 392 aaPredicted RBP23.12■■□□□ 1.29
PTPRM-201ENST00000332175 BLOC1S6Q9UL45 172 aa23.12■■□□□ 1.29
PTPRM-201ENST00000332175 A0A087X0T9 212 aa23.12■■□□□ 1.29
PTPRM-201ENST00000332175 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP23.12■■□□□ 1.29
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PTPRM-201ENST00000332175 MYO1HQ8N1T3 1032 aa23.12■■□□□ 1.29
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PTPRM-201ENST00000332175 C11orf63Q6NUN7 778 aa23.12■■□□□ 1.29
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PTPRM-201ENST00000332175 MROH8Q9H579 483 aa23.11■■□□□ 1.29
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PTPRM-201ENST00000332175 CYP51A1Q16850 503 aa23.11■■□□□ 1.29
PTPRM-201ENST00000332175 ALFQ53S48 1182 aa23.11■■□□□ 1.29
PTPRM-201ENST00000332175 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP23.11■■□□□ 1.29
PTPRM-201ENST00000332175 GTF2A1LQ9UNN4 478 aa23.11■■□□□ 1.29
PTPRM-201ENST00000332175 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP23.11■■□□□ 1.29
PTPRM-201ENST00000332175 CD302Q8IX05 232 aa23.11■■□□□ 1.29
PTPRM-201ENST00000332175 SLC20A1Q8WUM9 679 aa23.11■■□□□ 1.29
PTPRM-201ENST00000332175 MAGED4Q96JG8 741 aa23.11■■□□□ 1.29
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PTPRM-201ENST00000332175 TSPAN3O60637 253 aa23.11■■□□□ 1.29
PTPRM-201ENST00000332175 SREBF1P36956 1147 aa23.11■■□□□ 1.29
PTPRM-201ENST00000332175 COPAP53621 1224 aa23.11■■□□□ 1.29
PTPRM-201ENST00000332175 PCNX4Q63HM2 1172 aa23.11■■□□□ 1.29
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PTPRM-201ENST00000332175 RUNX1T1Q06455 604 aa23.11■■□□□ 1.29
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PTPRM-201ENST00000332175 TKTL1P51854 596 aa23.1■■□□□ 1.29
PTPRM-201ENST00000332175 HERC6Q8IVU3 1022 aa23.1■■□□□ 1.29
PTPRM-201ENST00000332175 CENPLQ8N0S6 344 aaPredicted RBP23.1■■□□□ 1.29
PTPRM-201ENST00000332175 CEP41Q9BYV8 373 aa23.1■■□□□ 1.29
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