RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331789.9

ACTB-201, Transcript of actin beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ACTB, Length 1,917 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-201ENST00000331789 ARSEP51690 589 aa18.72■□□□□ 0.59
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ACTB-201ENST00000331789 UBN1Q9NPG3 1134 aa18.7■□□□□ 0.58
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ACTB-201ENST00000331789 PABPC3Q9H361 631 aaKnown RBP18.7■□□□□ 0.58
ACTB-201ENST00000331789 KRT82Q9NSB4 513 aa18.7■□□□□ 0.58
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ACTB-201ENST00000331789 ADCY1Q08828 1119 aa18.69■□□□□ 0.58
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ACTB-201ENST00000331789 SH3TC2Q8TF17 1288 aa18.69■□□□□ 0.58
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ACTB-201ENST00000331789 DEFB106AQ8N104 65 aa18.68■□□□□ 0.58
ACTB-201ENST00000331789 TTC13Q8NBP0 860 aa18.68■□□□□ 0.58
ACTB-201ENST00000331789 KCTD13Q8WZ19 329 aa18.68■□□□□ 0.58
ACTB-201ENST00000331789 MAGEB5Q9BZ81 275 aa18.68■□□□□ 0.58
ACTB-201ENST00000331789 CENPHQ9H3R5 247 aa18.68■□□□□ 0.58
ACTB-201ENST00000331789 DNAJC17Q9NVM6 304 aaKnown RBP18.68■□□□□ 0.58
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