RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000328596.10

TNFRSF18-201, Transcript of TNF receptor superfamily member 18, humanhuman

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene TNFRSF18, Length 851 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF18-201ENST00000328596 LMAN1LQ9HAT1 526 aa22.14■■□□□ 1.13
TNFRSF18-201ENST00000328596 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
TNFRSF18-201ENST00000328596 GMIPQ9P107 970 aa22.14■■□□□ 1.13
TNFRSF18-201ENST00000328596 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
TNFRSF18-201ENST00000328596 LEFTY2O00292 366 aa22.13■■□□□ 1.13
TNFRSF18-201ENST00000328596 ZDHHC11BP0C7U3 371 aa22.13■■□□□ 1.13
TNFRSF18-201ENST00000328596 CHRNB1P11230 501 aa22.13■■□□□ 1.13
TNFRSF18-201ENST00000328596 IFNAR2P48551 515 aa22.13■■□□□ 1.13
TNFRSF18-201ENST00000328596 TUBP50607 506 aa22.13■■□□□ 1.13
TNFRSF18-201ENST00000328596 ZXDBP98169 803 aa22.13■■□□□ 1.13
TNFRSF18-201ENST00000328596 KCNH2Q12809 1159 aa22.13■■□□□ 1.13
TNFRSF18-201ENST00000328596 HECTD3Q5T447 861 aa22.13■■□□□ 1.13
TNFRSF18-201ENST00000328596 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
TNFRSF18-201ENST00000328596 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa22.13■■□□□ 1.13
TNFRSF18-201ENST00000328596 JAKMIP2Q96AA8 810 aa22.13■■□□□ 1.13
TNFRSF18-201ENST00000328596 NT5C1BQ96P26 610 aa22.13■■□□□ 1.13
TNFRSF18-201ENST00000328596 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP22.13■■□□□ 1.13
TNFRSF18-201ENST00000328596 CPQQ9Y646 472 aa22.13■■□□□ 1.13
TNFRSF18-201ENST00000328596 WNT6Q9Y6F9 365 aa22.13■■□□□ 1.13
TNFRSF18-201ENST00000328596 HELZP42694 1942 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
TNFRSF18-201ENST00000328596 LAMTOR5O43504 91 aa22.12■■□□□ 1.13
TNFRSF18-201ENST00000328596 AFPP02771 609 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
TNFRSF18-201ENST00000328596 MBL2P11226 248 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
TNFRSF18-201ENST00000328596 NBL1P41271 181 aa22.12■■□□□ 1.13
TNFRSF18-201ENST00000328596 MRE11P49959 708 aa22.12■■□□□ 1.13
TNFRSF18-201ENST00000328596 CCDC183Q5T5S1 534 aa22.12■■□□□ 1.13
TNFRSF18-201ENST00000328596 ARHGAP17Q68EM7 881 aa22.12■■□□□ 1.13
TNFRSF18-201ENST00000328596 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
TNFRSF18-201ENST00000328596 MAML2Q8IZL2 1156 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
TNFRSF18-201ENST00000328596 CPA6Q8N4T0 437 aa22.12■■□□□ 1.13
TNFRSF18-201ENST00000328596 KIAA1958Q8N8K9 716 aa22.12■■□□□ 1.13
TNFRSF18-201ENST00000328596 LMO3Q8TAP4 145 aa22.12■■□□□ 1.13
TNFRSF18-201ENST00000328596 ATP2A3Q93084 1043 aa22.12■■□□□ 1.13
TNFRSF18-201ENST00000328596 MED15Q96RN5 788 aa22.12■■□□□ 1.13
TNFRSF18-201ENST00000328596 IER2Q9BTL4 223 aa22.12■■□□□ 1.13
TNFRSF18-201ENST00000328596 CHRDQ9H2X0 955 aa22.12■■□□□ 1.13
TNFRSF18-201ENST00000328596 SCML2Q9UQR0 700 aa22.12■■□□□ 1.13
TNFRSF18-201ENST00000328596 PATJQ8NI35 1801 aa22.12■■□□□ 1.13
TNFRSF18-201ENST00000328596 COCHO43405 550 aa22.11■■□□□ 1.13
TNFRSF18-201ENST00000328596 ACO1P21399 889 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
TNFRSF18-201ENST00000328596 AMPD2Q01433 879 aa22.11■■□□□ 1.13
TNFRSF18-201ENST00000328596 LRRC32Q14392 662 aa22.11■■□□□ 1.13
TNFRSF18-201ENST00000328596 PON2Q15165 354 aa22.11■■□□□ 1.13
TNFRSF18-201ENST00000328596 EML3Q32P44 896 aa22.11■■□□□ 1.13
TNFRSF18-201ENST00000328596 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP22.11■■□□□ 1.13
TNFRSF18-201ENST00000328596 UBR7Q8N806 425 aa22.11■■□□□ 1.13
TNFRSF18-201ENST00000328596 ECT2Q9H8V3 914 aa22.11■■□□□ 1.13
TNFRSF18-201ENST00000328596 TLR8Q9NR97 1041 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
TNFRSF18-201ENST00000328596 SMPD4Q9NXE4 827 aa22.11■■□□□ 1.13
TNFRSF18-201ENST00000328596 PROB1E7EW31 1015 aa22.1■■□□□ 1.13
TNFRSF18-201ENST00000328596 SP9P0CG40 484 aa22.1■■□□□ 1.13
TNFRSF18-201ENST00000328596 KIF11P52732 1056 aa22.1■■□□□ 1.13
TNFRSF18-201ENST00000328596 MTAPQ13126 283 aa22.1■■□□□ 1.13
TNFRSF18-201ENST00000328596 DGKKQ5KSL6 1271 aa22.1■■□□□ 1.13
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TNFRSF18-201ENST00000328596 EHBP1Q8NDI1 1231 aa22.1■■□□□ 1.13
TNFRSF18-201ENST00000328596 LINC00597Q9H2U6 94 aa22.1■■□□□ 1.13
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TNFRSF18-201ENST00000328596 PGFP49763 221 aa22.09■■□□□ 1.13
TNFRSF18-201ENST00000328596 SGO2Q562F6 1265 aa22.09■■□□□ 1.13
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TNFRSF18-201ENST00000328596 ANKRD52Q8NB46 1076 aa22.09■■□□□ 1.13
TNFRSF18-201ENST00000328596 CHFRQ96EP1 664 aa22.09■■□□□ 1.13
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TNFRSF18-201ENST00000328596 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
TNFRSF18-201ENST00000328596 CFAP97Q9P2B7 532 aa22.09■■□□□ 1.13
TNFRSF18-201ENST00000328596 KIAA1257Q9ULG3 409 aa22.09■■□□□ 1.13
TNFRSF18-201ENST00000328596 TRDMT1O14717 391 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
TNFRSF18-201ENST00000328596 CYP26A1O43174 497 aa22.08■■□□□ 1.13
TNFRSF18-201ENST00000328596 TLR5O60602 858 aa22.08■■□□□ 1.13
TNFRSF18-201ENST00000328596 GJA4P35212 333 aa22.08■■□□□ 1.13
TNFRSF18-201ENST00000328596 SLC8A3P57103 927 aa22.08■■□□□ 1.13
TNFRSF18-201ENST00000328596 NR1H3Q13133 447 aa22.08■■□□□ 1.13
TNFRSF18-201ENST00000328596 CCINQ13939 588 aa22.08■■□□□ 1.13
TNFRSF18-201ENST00000328596 KLHL40Q2TBA0 621 aa22.08■■□□□ 1.13
TNFRSF18-201ENST00000328596 ZNF528Q3MIS6 628 aa22.08■■□□□ 1.13
TNFRSF18-201ENST00000328596 DPCR1Q3MIW9 517 aa22.08■■□□□ 1.13
TNFRSF18-201ENST00000328596 CREBRFQ8IUR6 639 aa22.08■■□□□ 1.13
TNFRSF18-201ENST00000328596 KAT5Q92993 513 aa22.08■■□□□ 1.13
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TNFRSF18-201ENST00000328596 NACA2Q9H009 215 aa22.08■■□□□ 1.13
TNFRSF18-201ENST00000328596 CYLDQ9NQC7 956 aa22.08■■□□□ 1.13
TNFRSF18-201ENST00000328596 TMEM63CQ9P1W3 806 aa22.08■■□□□ 1.13
TNFRSF18-201ENST00000328596 DACH1Q9UI36 760 aa22.08■■□□□ 1.13
TNFRSF18-201ENST00000328596 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa22.08■■□□□ 1.13
TNFRSF18-201ENST00000328596 USP3Q9Y6I4 520 aa22.08■■□□□ 1.13
TNFRSF18-201ENST00000328596 SLC9A3R1O14745 358 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
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TNFRSF18-201ENST00000328596 PAEPP09466 180 aa22.07■■□□□ 1.12
TNFRSF18-201ENST00000328596 VDRP11473 427 aa22.07■■□□□ 1.12
TNFRSF18-201ENST00000328596 CD19P15391 556 aa22.07■■□□□ 1.12
TNFRSF18-201ENST00000328596 GCNT1Q02742 428 aa22.07■■□□□ 1.12
TNFRSF18-201ENST00000328596 CSTF1Q05048 431 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
TNFRSF18-201ENST00000328596 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
TNFRSF18-201ENST00000328596 GOLGA7BQ2TAP0 167 aa22.07■■□□□ 1.12
TNFRSF18-201ENST00000328596 TMEM196Q5HYL7 178 aa22.07■■□□□ 1.12
TNFRSF18-201ENST00000328596 TMEM270Q6UE05 265 aa22.07■■□□□ 1.12
TNFRSF18-201ENST00000328596 RRAGAQ7L523 313 aa22.07■■□□□ 1.12
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