RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000317243.9

ZNF554-201, Transcript of zinc finger protein 554, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ZNF554, Length 2,736 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF554-201ENST00000317243 GPR25O00155 361 aa20.26■□□□□ 0.83
ZNF554-201ENST00000317243 OGTO15294 1046 aa20.26■□□□□ 0.83
ZNF554-201ENST00000317243 IFNB1P01574 187 aa20.26■□□□□ 0.83
ZNF554-201ENST00000317243 CD19P15391 556 aa20.26■□□□□ 0.83
ZNF554-201ENST00000317243 GJA5P36382 358 aa20.26■□□□□ 0.83
ZNF554-201ENST00000317243 DYNLT1P63172 113 aa20.26■□□□□ 0.83
ZNF554-201ENST00000317243 ZRSR2Q15696 482 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
ZNF554-201ENST00000317243 RAB6CQ53S08 254 aa20.26■□□□□ 0.83
ZNF554-201ENST00000317243 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
ZNF554-201ENST00000317243 PRR11Q96HE9 360 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
ZNF554-201ENST00000317243 TUBGCP5Q96RT8 1024 aa20.26■□□□□ 0.83
ZNF554-201ENST00000317243 IMPG2Q9BZV3 1241 aa20.26■□□□□ 0.83
ZNF554-201ENST00000317243 RAB6CQ9H0N0 254 aa20.26■□□□□ 0.83
ZNF554-201ENST00000317243 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
ZNF554-201ENST00000317243 SAR1AQ9NR31 198 aa20.26■□□□□ 0.83
ZNF554-201ENST00000317243 CNTN6Q9UQ52 1028 aa20.26■□□□□ 0.83
ZNF554-201ENST00000317243 GOLGA8RI6L899 631 aa20.25■□□□□ 0.83
ZNF554-201ENST00000317243 C2CD2LO14523 706 aa20.25■□□□□ 0.83
ZNF554-201ENST00000317243 VTNP04004 478 aa20.25■□□□□ 0.83
ZNF554-201ENST00000317243 ZNF286BP0CG31 522 aa20.25■□□□□ 0.83
ZNF554-201ENST00000317243 KRT4P19013 534 aa20.25■□□□□ 0.83
ZNF554-201ENST00000317243 NRLP54845 237 aa20.25■□□□□ 0.83
ZNF554-201ENST00000317243 ZNF699Q32M78 642 aa20.25■□□□□ 0.83
ZNF554-201ENST00000317243 JOSD2Q8TAC2 188 aa20.25■□□□□ 0.83
ZNF554-201ENST00000317243 ZNF75CPQ92670 426 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
ZNF554-201ENST00000317243 DTNBP1Q96EV8 351 aa20.25■□□□□ 0.83
ZNF554-201ENST00000317243 MMP19Q99542 508 aa20.25■□□□□ 0.83
ZNF554-201ENST00000317243 SPATA16Q9BXB7 569 aa20.25■□□□□ 0.83
ZNF554-201ENST00000317243 SYNCQ9H7C4 482 aa20.25■□□□□ 0.83
ZNF554-201ENST00000317243 KANSL3Q9P2N6 904 aa20.25■□□□□ 0.83
ZNF554-201ENST00000317243 STX18Q9P2W9 335 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
ZNF554-201ENST00000317243 ANK1P16157 1881 aa20.25■□□□□ 0.83
ZNF554-201ENST00000317243 A0A0G2JND7 137 aa20.25■□□□□ 0.83
ZNF554-201ENST00000317243 TMEM191BP0C7N4 346 aa20.25■□□□□ 0.83
ZNF554-201ENST00000317243 PLCB3Q01970 1234 aa20.25■□□□□ 0.83
ZNF554-201ENST00000317243 LMNB2Q03252 620 aa20.25■□□□□ 0.83
ZNF554-201ENST00000317243 TRPC3Q13507 836 aa20.25■□□□□ 0.83
ZNF554-201ENST00000317243 THOC5Q13769 683 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
ZNF554-201ENST00000317243 ATF7IP2Q5U623 682 aa20.25■□□□□ 0.83
ZNF554-201ENST00000317243 ZPBP2Q6X784 338 aa20.25■□□□□ 0.83
ZNF554-201ENST00000317243 WDR49Q8IV35 697 aa20.25■□□□□ 0.83
ZNF554-201ENST00000317243 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa20.25■□□□□ 0.83
ZNF554-201ENST00000317243 RIBC1Q8N443 379 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
ZNF554-201ENST00000317243 FAM81BQ96LP2 452 aa20.25■□□□□ 0.83
ZNF554-201ENST00000317243 CYLDQ9NQC7 956 aa20.25■□□□□ 0.83
ZNF554-201ENST00000317243 TMEM191CA6NGB0 347 aa20.24■□□□□ 0.83
ZNF554-201ENST00000317243 SPATA31D3P0C874 917 aa20.24■□□□□ 0.83
ZNF554-201ENST00000317243 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
ZNF554-201ENST00000317243 DUOXA2Q1HG44 320 aa20.24■□□□□ 0.83
ZNF554-201ENST00000317243 IER5Q5VY09 327 aa20.24■□□□□ 0.83
ZNF554-201ENST00000317243 RGS9BPQ6ZS82 235 aa20.24■□□□□ 0.83
ZNF554-201ENST00000317243 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa20.24■□□□□ 0.83
ZNF554-201ENST00000317243 CDCA5Q96FF9 252 aa20.24■□□□□ 0.83
ZNF554-201ENST00000317243 KLF6Q99612 283 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
ZNF554-201ENST00000317243 MAK16Q9BXY0 300 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
ZNF554-201ENST00000317243 NIF3L1Q9GZT8 377 aa20.24■□□□□ 0.83
ZNF554-201ENST00000317243 CDT1Q9H211 546 aa20.24■□□□□ 0.83
ZNF554-201ENST00000317243 SMYD3Q9H7B4 428 aa20.24■□□□□ 0.83
ZNF554-201ENST00000317243 ZWILCHQ9H900 591 aa20.24■□□□□ 0.83
ZNF554-201ENST00000317243 PREBQ9HCU5 417 aa20.24■□□□□ 0.83
ZNF554-201ENST00000317243 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
ZNF554-201ENST00000317243 SIX4Q9UIU6 781 aa20.24■□□□□ 0.83
ZNF554-201ENST00000317243 KRT1P04264 644 aa20.24■□□□□ 0.83
ZNF554-201ENST00000317243 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
ZNF554-201ENST00000317243 TAF5Q15542 800 aa20.24■□□□□ 0.83
ZNF554-201ENST00000317243 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
ZNF554-201ENST00000317243 PTPN20Q4JDL3 420 aa20.24■□□□□ 0.83
ZNF554-201ENST00000317243 CCDC62Q6P9F0 684 aa20.24■□□□□ 0.83
ZNF554-201ENST00000317243 DCUN1D2Q6PH85 259 aa20.24■□□□□ 0.83
ZNF554-201ENST00000317243 RINLQ6ZS11 566 aa20.24■□□□□ 0.83
ZNF554-201ENST00000317243 SESTD1Q86VW0 696 aa20.24■□□□□ 0.83
ZNF554-201ENST00000317243 PARVAQ9NVD7 372 aa20.24■□□□□ 0.83
ZNF554-201ENST00000317243 HEY2Q9UBP5 337 aa20.24■□□□□ 0.83
ZNF554-201ENST00000317243 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP20.23■□□□□ 0.83
ZNF554-201ENST00000317243 RFC1P35251 1148 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
ZNF554-201ENST00000317243 GAD2Q05329 585 aa20.23■□□□□ 0.83
ZNF554-201ENST00000317243 PDIA2Q13087 525 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
ZNF554-201ENST00000317243 NR1H3Q13133 447 aa20.23■□□□□ 0.83
ZNF554-201ENST00000317243 KCTD2Q14681 263 aa20.23■□□□□ 0.83
ZNF554-201ENST00000317243 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
ZNF554-201ENST00000317243 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
ZNF554-201ENST00000317243 A0A087WZ62 844 aa20.23■□□□□ 0.83
ZNF554-201ENST00000317243 TCRBV5S1A1TA0A578 114 aa20.23■□□□□ 0.83
ZNF554-201ENST00000317243 DNALI1O14645 258 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
ZNF554-201ENST00000317243 HAUS5O94927 633 aa20.23■□□□□ 0.83
ZNF554-201ENST00000317243 ABHD2P08910 425 aa20.23■□□□□ 0.83
ZNF554-201ENST00000317243 AMPD1P23109 780 aa20.23■□□□□ 0.83
ZNF554-201ENST00000317243 ADRA1DP25100 572 aa20.23■□□□□ 0.83
ZNF554-201ENST00000317243 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP20.23■□□□□ 0.83
ZNF554-201ENST00000317243 FYB2Q5VWT5 728 aa20.23■□□□□ 0.83
ZNF554-201ENST00000317243 DNAJC24Q6P3W2 148 aa20.23■□□□□ 0.83
ZNF554-201ENST00000317243 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa20.23■□□□□ 0.83
ZNF554-201ENST00000317243 ARFGAP1Q8N6T3 406 aa20.23■□□□□ 0.83
ZNF554-201ENST00000317243 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
ZNF554-201ENST00000317243 VCX3BQ9H321 246 aa20.23■□□□□ 0.83
ZNF554-201ENST00000317243 PTPRHQ9HD43 1115 aa20.23■□□□□ 0.83
ZNF554-201ENST00000317243 VCX3AQ9NNX9 186 aa20.23■□□□□ 0.83
ZNF554-201ENST00000317243 FBXO6Q9NRD1 293 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
ZNF554-201ENST00000317243 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa20.22■□□□□ 0.83
ZNF554-201ENST00000317243 CD48P09326 243 aa20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.6 ms