RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000316881.8

TRIM25-201, Transcript of tripartite motif containing 25, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TRIM25, Length 5,734 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM25-201ENST00000316881 C16orf89Q6UX73 402 aa14.8□□□□□ -0.04
TRIM25-201ENST00000316881 KRT78Q8N1N4 520 aa14.8□□□□□ -0.04
TRIM25-201ENST00000316881 TMA16Q96EY4 203 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
TRIM25-201ENST00000316881 MFSD1Q9H3U5 465 aa14.8□□□□□ -0.04
TRIM25-201ENST00000316881 SNTG2Q9NY99 539 aa14.8□□□□□ -0.04
TRIM25-201ENST00000316881 RRN3Q9NYV6 651 aa14.8□□□□□ -0.04
TRIM25-201ENST00000316881 DRG1Q9Y295 367 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
TRIM25-201ENST00000316881 MYO1GB0I1T2 1018 aa14.8□□□□□ -0.04
TRIM25-201ENST00000316881 CBX4O00257 560 aa14.8□□□□□ -0.04
TRIM25-201ENST00000316881 RAD51CO43502 376 aa14.8□□□□□ -0.04
TRIM25-201ENST00000316881 KLHL2O95198 593 aa14.8□□□□□ -0.04
TRIM25-201ENST00000316881 PGM1P36871 562 aa14.8□□□□□ -0.04
TRIM25-201ENST00000316881 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
TRIM25-201ENST00000316881 DAB2P98082 770 aa14.8□□□□□ -0.04
TRIM25-201ENST00000316881 LRRC8BQ6P9F7 803 aa14.8□□□□□ -0.04
TRIM25-201ENST00000316881 FAM118BQ9BPY3 351 aa14.8□□□□□ -0.04
TRIM25-201ENST00000316881 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
TRIM25-201ENST00000316881 ATXN3LQ9H3M9 355 aa14.8□□□□□ -0.04
TRIM25-201ENST00000316881 EIF3LQ9Y262 564 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
TRIM25-201ENST00000316881 FAM205AQ6ZU69 1335 aa14.8□□□□□ -0.04
TRIM25-201ENST00000316881 PPLO60437 1756 aa14.8□□□□□ -0.04
TRIM25-201ENST00000316881 FAM47E-STBD1D6RA91 191 aa14.8□□□□□ -0.04
TRIM25-201ENST00000316881 F8W810 466 aa14.8□□□□□ -0.04
TRIM25-201ENST00000316881 GUCA1CO95843 209 aa14.8□□□□□ -0.04
TRIM25-201ENST00000316881 IGFBP4P22692 258 aa14.8□□□□□ -0.04
TRIM25-201ENST00000316881 TKTL1P51854 596 aa14.8□□□□□ -0.04
TRIM25-201ENST00000316881 POLE2P56282 527 aa14.8□□□□□ -0.04
TRIM25-201ENST00000316881 LONRF1Q17RB8 773 aa14.8□□□□□ -0.04
TRIM25-201ENST00000316881 FKBP1CQ5VVH2 108 aa14.8□□□□□ -0.04
TRIM25-201ENST00000316881 DSG4Q86SJ6 1040 aa14.8□□□□□ -0.04
TRIM25-201ENST00000316881 PRMT1Q99873 361 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
TRIM25-201ENST00000316881 C17orf80Q9BSJ5 609 aa14.8□□□□□ -0.04
TRIM25-201ENST00000316881 IFRD1O00458 451 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
TRIM25-201ENST00000316881 ENDOD1O94919 500 aa14.8□□□□□ -0.04
TRIM25-201ENST00000316881 LSM8O95777 96 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
TRIM25-201ENST00000316881 ITGA8P53708 1063 aa14.8□□□□□ -0.04
TRIM25-201ENST00000316881 KDSRQ06136 332 aa14.8□□□□□ -0.04
TRIM25-201ENST00000316881 CACHD1Q5VU97 1274 aa14.8□□□□□ -0.04
TRIM25-201ENST00000316881 SETD3Q86TU7 594 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
TRIM25-201ENST00000316881 C4orf33Q8N1A6 199 aa14.8□□□□□ -0.04
TRIM25-201ENST00000316881 MMGT1Q8N4V1 131 aa14.8□□□□□ -0.04
TRIM25-201ENST00000316881 CMTM5Q96DZ9 223 aa14.8□□□□□ -0.04
TRIM25-201ENST00000316881 ADAM33Q9BZ11 813 aa14.8□□□□□ -0.04
TRIM25-201ENST00000316881 ROPN1BQ9BZX4 212 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
TRIM25-201ENST00000316881 ROPN1Q9HAT0 212 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
TRIM25-201ENST00000316881 NCKAP1Q9Y2A7 1128 aa14.8□□□□□ -0.04
TRIM25-201ENST00000316881 ENO3P13929 434 aaPredicted RBP14.79□□□□□ -0.04
TRIM25-201ENST00000316881 TUFMP49411 452 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
TRIM25-201ENST00000316881 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
TRIM25-201ENST00000316881 DNAL1Q4LDG9 190 aa14.79□□□□□ -0.04
TRIM25-201ENST00000316881 GJB7Q6PEY0 223 aa14.79□□□□□ -0.04
TRIM25-201ENST00000316881 RNF112Q9ULX5 631 aa14.79□□□□□ -0.04
TRIM25-201ENST00000316881 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa14.79□□□□□ -0.04
TRIM25-201ENST00000316881 TCP11X1B4DZS4 312 aa14.79□□□□□ -0.04
TRIM25-201ENST00000316881 ENO1P06733 434 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
TRIM25-201ENST00000316881 AP1ARQ63HQ0 302 aa14.79□□□□□ -0.04
TRIM25-201ENST00000316881 CHMP1BQ7LBR1 199 aa14.79□□□□□ -0.04
TRIM25-201ENST00000316881 TMCO5AQ8N6Q1 288 aa14.79□□□□□ -0.04
TRIM25-201ENST00000316881 OR2W6PQ8NHA6 318 aa14.79□□□□□ -0.04
TRIM25-201ENST00000316881 CCT8L2Q96SF2 557 aa14.79□□□□□ -0.04
TRIM25-201ENST00000316881 KCNK16Q96T55 309 aa14.79□□□□□ -0.04
TRIM25-201ENST00000316881 CBWD1Q9BRT8 395 aa14.79□□□□□ -0.04
TRIM25-201ENST00000316881 CNPY3Q9BT09 278 aa14.79□□□□□ -0.04
TRIM25-201ENST00000316881 OSGEPL1Q9H4B0 414 aa14.79□□□□□ -0.04
TRIM25-201ENST00000316881 CAPN10Q9HC96 672 aa14.79□□□□□ -0.04
TRIM25-201ENST00000316881 ARL2BPQ9Y2Y0 163 aa14.79□□□□□ -0.04
TRIM25-201ENST00000316881 RPS6KL1Q9Y6S9 549 aa14.79□□□□□ -0.04
TRIM25-201ENST00000316881 CFAP73A6NFT4 308 aa14.79□□□□□ -0.04
TRIM25-201ENST00000316881 MAPK1P28482 360 aa14.79□□□□□ -0.04
TRIM25-201ENST00000316881 CCR1P32246 355 aa14.79□□□□□ -0.04
TRIM25-201ENST00000316881 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP14.79□□□□□ -0.04
TRIM25-201ENST00000316881 CYP24A1Q07973 514 aa14.79□□□□□ -0.04
TRIM25-201ENST00000316881 GIT2Q14161 759 aa14.79□□□□□ -0.04
TRIM25-201ENST00000316881 IFNEQ86WN2 208 aa14.79□□□□□ -0.04
TRIM25-201ENST00000316881 FAM9CQ8IZT9 166 aa14.79□□□□□ -0.04
TRIM25-201ENST00000316881 ZNF513Q8N8E2 541 aaPredicted RBP14.79□□□□□ -0.04
TRIM25-201ENST00000316881 CCDC3Q9BQI4 270 aa14.79□□□□□ -0.04
TRIM25-201ENST00000316881 TRPC5OSA6NMA1 111 aa14.79□□□□□ -0.04
TRIM25-201ENST00000316881 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP14.79□□□□□ -0.04
TRIM25-201ENST00000316881 FGFR2P21802 821 aa14.79□□□□□ -0.04
TRIM25-201ENST00000316881 PPIL2Q13356 520 aa14.79□□□□□ -0.04
TRIM25-201ENST00000316881 JADE3Q92613 823 aa14.79□□□□□ -0.04
TRIM25-201ENST00000316881 ANKS1AQ92625 1134 aa14.79□□□□□ -0.04
TRIM25-201ENST00000316881 ZIM3Q96PE6 472 aa14.79□□□□□ -0.04
TRIM25-201ENST00000316881 KLC4Q9NSK0 619 aa14.79□□□□□ -0.04
TRIM25-201ENST00000316881 H2AFXP16104 143 aaPredicted RBP14.79□□□□□ -0.04
TRIM25-201ENST00000316881 PRIM2P49643 509 aa14.79□□□□□ -0.04
TRIM25-201ENST00000316881 DDX39BQ13838 428 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
TRIM25-201ENST00000316881 MYBPC2Q14324 1141 aa14.79□□□□□ -0.04
TRIM25-201ENST00000316881 CCDC126Q96EE4 140 aa14.79□□□□□ -0.04
TRIM25-201ENST00000316881 FAM167BQ9BTA0 163 aa14.79□□□□□ -0.04
TRIM25-201ENST00000316881 NAT9Q9BTE0 207 aa14.79□□□□□ -0.04
TRIM25-201ENST00000316881 AP4E1Q9UPM8 1137 aa14.79□□□□□ -0.04
TRIM25-201ENST00000316881 TRIM66O15016 1216 aa14.78□□□□□ -0.04
TRIM25-201ENST00000316881 PLEKP08567 350 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
TRIM25-201ENST00000316881 CXCL8P10145 99 aa14.78□□□□□ -0.04
TRIM25-201ENST00000316881 DEFB115Q30KQ5 88 aa14.78□□□□□ -0.04
TRIM25-201ENST00000316881 CES5AQ6NT32 575 aa14.78□□□□□ -0.04
TRIM25-201ENST00000316881 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa14.78□□□□□ -0.04
TRIM25-201ENST00000316881 RIOX1Q9H6W3 641 aa14.78□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54.5 ms