RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000311308.6

TTC9B-201, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 9B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TTC9B, Length 843 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC9B-201ENST00000311308 GAB3Q8WWW8 586 aa21.4■■□□□ 1.02
TTC9B-201ENST00000311308 ELMO3Q96BJ8 720 aa21.4■■□□□ 1.02
TTC9B-201ENST00000311308 RMND1Q9NWS8 449 aa21.4■■□□□ 1.02
TTC9B-201ENST00000311308 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
TTC9B-201ENST00000311308 WDR87Q6ZQQ6 2873 aa21.39■■□□□ 1.02
TTC9B-201ENST00000311308 FAM200BP0CF97 657 aa21.39■■□□□ 1.01
TTC9B-201ENST00000311308 CCDC130P13994 396 aa21.39■■□□□ 1.01
TTC9B-201ENST00000311308 ASPAP45381 313 aa21.39■■□□□ 1.01
TTC9B-201ENST00000311308 GCLMP48507 274 aa21.39■■□□□ 1.01
TTC9B-201ENST00000311308 PXNP49023 591 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.01
TTC9B-201ENST00000311308 SNX30Q5VWJ9 437 aa21.39■■□□□ 1.01
TTC9B-201ENST00000311308 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.01
TTC9B-201ENST00000311308 SPOPLQ6IQ16 392 aa21.39■■□□□ 1.01
TTC9B-201ENST00000311308 ADGRG2Q8IZP9 1017 aa21.39■■□□□ 1.01
TTC9B-201ENST00000311308 SCAMP5Q8TAC9 235 aa21.39■■□□□ 1.01
TTC9B-201ENST00000311308 OTUB2Q96DC9 234 aa21.39■■□□□ 1.01
TTC9B-201ENST00000311308 NT5C1AQ9BXI3 368 aa21.39■■□□□ 1.01
TTC9B-201ENST00000311308 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa21.39■■□□□ 1.01
TTC9B-201ENST00000311308 IL37Q9NZH6 218 aa21.39■■□□□ 1.01
TTC9B-201ENST00000311308 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa21.39■■□□□ 1.01
TTC9B-201ENST00000311308 DCHS1Q96JQ0 3298 aa21.38■■□□□ 1.01
TTC9B-201ENST00000311308 PTPRDP23468 1912 aa21.38■■□□□ 1.01
TTC9B-201ENST00000311308 E2F8A0AVK6 867 aa21.38■■□□□ 1.01
TTC9B-201ENST00000311308 TNFRSF10BO14763 440 aa21.38■■□□□ 1.01
TTC9B-201ENST00000311308 AXIN1O15169 862 aa21.38■■□□□ 1.01
TTC9B-201ENST00000311308 COCHO43405 550 aa21.38■■□□□ 1.01
TTC9B-201ENST00000311308 STX10O60499 249 aa21.38■■□□□ 1.01
TTC9B-201ENST00000311308 APBB3O95704 486 aa21.38■■□□□ 1.01
TTC9B-201ENST00000311308 CYP17A1P05093 508 aa21.38■■□□□ 1.01
TTC9B-201ENST00000311308 TRIM49P0CI25 452 aa21.38■■□□□ 1.01
TTC9B-201ENST00000311308 TRIM49CP0CI26 452 aa21.38■■□□□ 1.01
TTC9B-201ENST00000311308 TGM1P22735 817 aa21.38■■□□□ 1.01
TTC9B-201ENST00000311308 GTF2H1P32780 548 aa21.38■■□□□ 1.01
TTC9B-201ENST00000311308 MAP3K7CLP57077 242 aa21.38■■□□□ 1.01
TTC9B-201ENST00000311308 INCA1Q0VD86 236 aa21.38■■□□□ 1.01
TTC9B-201ENST00000311308 DMC1Q14565 340 aa21.38■■□□□ 1.01
TTC9B-201ENST00000311308 DHCR24Q15392 516 aa21.38■■□□□ 1.01
TTC9B-201ENST00000311308 EDRF1Q3B7T1 1238 aa21.38■■□□□ 1.01
TTC9B-201ENST00000311308 C1orf220Q5T0J3 134 aa21.38■■□□□ 1.01
TTC9B-201ENST00000311308 FAM160A2Q8N612 972 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
TTC9B-201ENST00000311308 LOXL4Q96JB6 756 aa21.38■■□□□ 1.01
TTC9B-201ENST00000311308 HHIPQ96QV1 700 aa21.38■■□□□ 1.01
TTC9B-201ENST00000311308 NIF3L1Q9GZT8 377 aa21.38■■□□□ 1.01
TTC9B-201ENST00000311308 MMRN2Q9H8L6 949 aa21.38■■□□□ 1.01
TTC9B-201ENST00000311308 GDPD2Q9HCC8 539 aa21.38■■□□□ 1.01
TTC9B-201ENST00000311308 TMEM8AQ9HCN3 771 aa21.38■■□□□ 1.01
TTC9B-201ENST00000311308 CSNK1G1Q9HCP0 422 aa21.38■■□□□ 1.01
TTC9B-201ENST00000311308 PARD6AQ9NPB6 346 aa21.38■■□□□ 1.01
TTC9B-201ENST00000311308 TLR8Q9NR97 1041 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
TTC9B-201ENST00000311308 SEMA4GQ9NTN9 838 aa21.38■■□□□ 1.01
TTC9B-201ENST00000311308 FAM49BQ9NUQ9 324 aa21.38■■□□□ 1.01
TTC9B-201ENST00000311308 FRYLO94915 3013 aa21.37■■□□□ 1.01
TTC9B-201ENST00000311308 FAM92AA1XBS5 289 aa21.37■■□□□ 1.01
TTC9B-201ENST00000311308 PALM2-AKAP2B1ALY0 433 aaPredicted RBP21.37■■□□□ 1.01
TTC9B-201ENST00000311308 CETN3O15182 167 aa21.37■■□□□ 1.01
TTC9B-201ENST00000311308 EPB41P11171 864 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
TTC9B-201ENST00000311308 EIF2DP41214 584 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
TTC9B-201ENST00000311308 ORC1Q13415 861 aa21.37■■□□□ 1.01
TTC9B-201ENST00000311308 CSRP2Q16527 193 aa21.37■■□□□ 1.01
TTC9B-201ENST00000311308 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP21.37■■□□□ 1.01
TTC9B-201ENST00000311308 KRT39Q6A163 491 aa21.37■■□□□ 1.01
TTC9B-201ENST00000311308 TTC39CQ8N584 583 aa21.37■■□□□ 1.01
TTC9B-201ENST00000311308 C12orf29Q8N999 325 aa21.37■■□□□ 1.01
TTC9B-201ENST00000311308 TAS1R2Q8TE23 839 aa21.37■■□□□ 1.01
TTC9B-201ENST00000311308 SMOQ99835 787 aa21.37■■□□□ 1.01
TTC9B-201ENST00000311308 RTKNQ9BST9 563 aa21.37■■□□□ 1.01
TTC9B-201ENST00000311308 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP21.37■■□□□ 1.01
TTC9B-201ENST00000311308 GMIPQ9P107 970 aa21.37■■□□□ 1.01
TTC9B-201ENST00000311308 HMGXB4Q9UGU5 601 aa21.37■■□□□ 1.01
TTC9B-201ENST00000311308 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
TTC9B-201ENST00000311308 CEP250Q9BV73 2442 aa21.37■■□□□ 1.01
TTC9B-201ENST00000311308 GREB1Q4ZG55 1949 aa21.37■■□□□ 1.01
TTC9B-201ENST00000311308 ANAPC1Q9H1A4 1944 aa21.36■■□□□ 1.01
TTC9B-201ENST00000311308 APODP05090 189 aa21.36■■□□□ 1.01
TTC9B-201ENST00000311308 ZDHHC11BP0C7U3 371 aa21.36■■□□□ 1.01
TTC9B-201ENST00000311308 ADORA2BP29275 332 aa21.36■■□□□ 1.01
TTC9B-201ENST00000311308 OPRD1P41143 372 aa21.36■■□□□ 1.01
TTC9B-201ENST00000311308 NUCB2P80303 420 aa21.36■■□□□ 1.01
TTC9B-201ENST00000311308 PPP3CAQ08209 521 aa21.36■■□□□ 1.01
TTC9B-201ENST00000311308 GOLGA8FQ08AF8 430 aa21.36■■□□□ 1.01
TTC9B-201ENST00000311308 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa21.36■■□□□ 1.01
TTC9B-201ENST00000311308 BTBD8Q5XKL5 378 aa21.36■■□□□ 1.01
TTC9B-201ENST00000311308 NETO1Q8TDF5 533 aa21.36■■□□□ 1.01
TTC9B-201ENST00000311308 CYFIP2Q96F07 1278 aa21.36■■□□□ 1.01
TTC9B-201ENST00000311308 FAXDC2Q96IV6 333 aa21.36■■□□□ 1.01
TTC9B-201ENST00000311308 PNKPQ96T60 521 aa21.36■■□□□ 1.01
TTC9B-201ENST00000311308 HNRNPABQ99729 332 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
TTC9B-201ENST00000311308 TSG101Q99816 390 aa21.36■■□□□ 1.01
TTC9B-201ENST00000311308 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
TTC9B-201ENST00000311308 TLR5O60602 858 aa21.35■■□□□ 1.01
TTC9B-201ENST00000311308 SMC2O95347 1197 aa21.35■■□□□ 1.01
TTC9B-201ENST00000311308 ADH5P11766 374 aa21.35■■□□□ 1.01
TTC9B-201ENST00000311308 MRPS21P82921 87 aaKnown RBP21.35■■□□□ 1.01
TTC9B-201ENST00000311308 GAD2Q05329 585 aa21.35■■□□□ 1.01
TTC9B-201ENST00000311308 ZCWPW2Q504Y3 356 aa21.35■■□□□ 1.01
TTC9B-201ENST00000311308 PRR23CQ6ZRP0 262 aa21.35■■□□□ 1.01
TTC9B-201ENST00000311308 ZMIZ2Q8NF64 920 aa21.35■■□□□ 1.01
TTC9B-201ENST00000311308 TSTD1Q8NFU3 115 aa21.35■■□□□ 1.01
TTC9B-201ENST00000311308 USP33Q8TEY7 942 aa21.35■■□□□ 1.01
TTC9B-201ENST00000311308 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.6 ms