RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000306117.5

KCNS1-201, Transcript of potassium voltage-gated channel modifier subfamily S member 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene KCNS1, Length 4,538 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNS1-201ENST00000306117 MTFR1Q15390 333 aa16.09■□□□□ 0.17
KCNS1-201ENST00000306117 RSBN1Q5VWQ0 802 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
KCNS1-201ENST00000306117 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
KCNS1-201ENST00000306117 OLFML1Q6UWY5 402 aa16.09■□□□□ 0.17
KCNS1-201ENST00000306117 MARK2Q7KZI7 788 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
KCNS1-201ENST00000306117 SV2AQ7L0J3 742 aa16.09■□□□□ 0.17
KCNS1-201ENST00000306117 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
KCNS1-201ENST00000306117 NINJ2Q9NZG7 142 aa16.09■□□□□ 0.17
KCNS1-201ENST00000306117 CAMSAP3Q9P1Y5 1249 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
KCNS1-201ENST00000306117 PROCP04070 461 aa16.09■□□□□ 0.17
KCNS1-201ENST00000306117 ADORA2BP29275 332 aa16.09■□□□□ 0.17
KCNS1-201ENST00000306117 KRT76Q01546 638 aa16.09■□□□□ 0.17
KCNS1-201ENST00000306117 UTS2BQ765I0 119 aa16.09■□□□□ 0.17
KCNS1-201ENST00000306117 CKAP2Q8WWK9 683 aa16.09■□□□□ 0.17
KCNS1-201ENST00000306117 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
KCNS1-201ENST00000306117 MXRA8Q9BRK3 442 aa16.09■□□□□ 0.17
KCNS1-201ENST00000306117 TMEM8AQ9HCN3 771 aa16.09■□□□□ 0.17
KCNS1-201ENST00000306117 LRRC4BQ9NT99 713 aa16.09■□□□□ 0.17
KCNS1-201ENST00000306117 SLC24A2Q9UI40 661 aa16.09■□□□□ 0.17
KCNS1-201ENST00000306117 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa16.09■□□□□ 0.17
KCNS1-201ENST00000306117 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa16.09■□□□□ 0.17
KCNS1-201ENST00000306117 ABCC6O95255 1503 aa16.09■□□□□ 0.17
KCNS1-201ENST00000306117 TGFB1I1O43294 461 aa16.09■□□□□ 0.17
KCNS1-201ENST00000306117 POLBP06746 335 aa16.09■□□□□ 0.17
KCNS1-201ENST00000306117 GTF2H1P32780 548 aa16.09■□□□□ 0.17
KCNS1-201ENST00000306117 AASDHQ4L235 1098 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
KCNS1-201ENST00000306117 E5RI56 91 aa16.08■□□□□ 0.17
KCNS1-201ENST00000306117 ETS1P14921 441 aa16.08■□□□□ 0.17
KCNS1-201ENST00000306117 MAP3K7CLP57077 242 aa16.08■□□□□ 0.17
KCNS1-201ENST00000306117 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.17
KCNS1-201ENST00000306117 TUBGCP3Q96CW5 907 aa16.08■□□□□ 0.17
KCNS1-201ENST00000306117 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.17
KCNS1-201ENST00000306117 PARVBQ9HBI1 364 aa16.08■□□□□ 0.17
KCNS1-201ENST00000306117 SMAPO00193 183 aa16.08■□□□□ 0.16
KCNS1-201ENST00000306117 MEIS2O14770 477 aa16.08■□□□□ 0.16
KCNS1-201ENST00000306117 MT-CO1P00395 513 aa16.08■□□□□ 0.16
KCNS1-201ENST00000306117 ITGADQ13349 1161 aa16.08■□□□□ 0.16
KCNS1-201ENST00000306117 NCOA4Q13772 614 aa16.08■□□□□ 0.16
KCNS1-201ENST00000306117 GTF2H3Q13889 308 aa16.08■□□□□ 0.16
KCNS1-201ENST00000306117 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa16.08■□□□□ 0.16
KCNS1-201ENST00000306117 MASTLQ96GX5 879 aa16.08■□□□□ 0.16
KCNS1-201ENST00000306117 SAR1AQ9NR31 198 aa16.08■□□□□ 0.16
KCNS1-201ENST00000306117 SAE1Q9UBE0 346 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
KCNS1-201ENST00000306117 MYH2Q9UKX2 1941 aa16.08■□□□□ 0.16
KCNS1-201ENST00000306117 LCA5LO95447 670 aa16.08■□□□□ 0.16
KCNS1-201ENST00000306117 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa16.08■□□□□ 0.16
KCNS1-201ENST00000306117 NCALDP61601 193 aa16.08■□□□□ 0.16
KCNS1-201ENST00000306117 UGP2Q16851 508 aa16.08■□□□□ 0.16
KCNS1-201ENST00000306117 FUT11Q495W5 492 aa16.08■□□□□ 0.16
KCNS1-201ENST00000306117 OTOP1Q7RTM1 612 aa16.08■□□□□ 0.16
KCNS1-201ENST00000306117 TMEM39BQ9GZU3 492 aa16.08■□□□□ 0.16
KCNS1-201ENST00000306117 RSAD1Q9HA92 442 aa16.08■□□□□ 0.16
KCNS1-201ENST00000306117 TSC22D2O75157 780 aa16.07■□□□□ 0.16
KCNS1-201ENST00000306117 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
KCNS1-201ENST00000306117 BLVRAP53004 296 aa16.07■□□□□ 0.16
KCNS1-201ENST00000306117 XRCC4Q13426 336 aa16.07■□□□□ 0.16
KCNS1-201ENST00000306117 RBBP7Q16576 425 aa16.07■□□□□ 0.16
KCNS1-201ENST00000306117 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa16.07■□□□□ 0.16
KCNS1-201ENST00000306117 FLCNQ8NFG4 579 aa16.07■□□□□ 0.16
KCNS1-201ENST00000306117 USP33Q8TEY7 942 aa16.07■□□□□ 0.16
KCNS1-201ENST00000306117 CENPTQ96BT3 561 aa16.07■□□□□ 0.16
KCNS1-201ENST00000306117 MTERF3Q96E29 417 aa16.07■□□□□ 0.16
KCNS1-201ENST00000306117 IFT43Q96FT9 208 aa16.07■□□□□ 0.16
KCNS1-201ENST00000306117 ELMO2Q96JJ3 720 aa16.07■□□□□ 0.16
KCNS1-201ENST00000306117 TAAR1Q96RJ0 339 aa16.07■□□□□ 0.16
KCNS1-201ENST00000306117 VPS33BQ9H267 617 aa16.07■□□□□ 0.16
KCNS1-201ENST00000306117 SRRM3A6NNA2 597 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
KCNS1-201ENST00000306117 RALBP11234 206 aa16.07■□□□□ 0.16
KCNS1-201ENST00000306117 NME5P56597 212 aa16.07■□□□□ 0.16
KCNS1-201ENST00000306117 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
KCNS1-201ENST00000306117 PDPK2PQ6A1A2 396 aa16.07■□□□□ 0.16
KCNS1-201ENST00000306117 CCDC80Q76M96 950 aa16.07■□□□□ 0.16
KCNS1-201ENST00000306117 SLC26A11Q86WA9 606 aa16.07■□□□□ 0.16
KCNS1-201ENST00000306117 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
KCNS1-201ENST00000306117 TMEM245Q9H330 911 aa16.07■□□□□ 0.16
KCNS1-201ENST00000306117 TBX20Q9UMR3 447 aa16.07■□□□□ 0.16
KCNS1-201ENST00000306117 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa16.07■□□□□ 0.16
KCNS1-201ENST00000306117 TPD52L2O43399 206 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
KCNS1-201ENST00000306117 GLRBP48167 497 aa16.07■□□□□ 0.16
KCNS1-201ENST00000306117 ASTE1Q2TB18 679 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
KCNS1-201ENST00000306117 GPAT2Q6NUI2 795 aa16.07■□□□□ 0.16
KCNS1-201ENST00000306117 OTULINQ96BN8 352 aa16.07■□□□□ 0.16
KCNS1-201ENST00000306117 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
KCNS1-201ENST00000306117 RPS6KL1Q9Y6S9 549 aa16.07■□□□□ 0.16
KCNS1-201ENST00000306117 COMMD3-BMI1R4GMX3 469 aa16.07■□□□□ 0.16
KCNS1-201ENST00000306117 C3orf70A6NLC5 250 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
KCNS1-201ENST00000306117 CES2O00748 559 aa16.07■□□□□ 0.16
KCNS1-201ENST00000306117 TM9SF1O15321 606 aa16.07■□□□□ 0.16
KCNS1-201ENST00000306117 GLRA3O75311 464 aa16.07■□□□□ 0.16
KCNS1-201ENST00000306117 BANF1O75531 89 aa16.07■□□□□ 0.16
KCNS1-201ENST00000306117 TRAF2Q12933 501 aa16.07■□□□□ 0.16
KCNS1-201ENST00000306117 KCTD2Q14681 263 aa16.07■□□□□ 0.16
KCNS1-201ENST00000306117 KCNMB3Q9NPA1 279 aa16.07■□□□□ 0.16
KCNS1-201ENST00000306117 ATAD3AQ9NVI7 634 aa16.07■□□□□ 0.16
KCNS1-201ENST00000306117 COG5Q9UP83 839 aa16.07■□□□□ 0.16
KCNS1-201ENST00000306117 TMEM247A6NEH6 219 aa16.06■□□□□ 0.16
KCNS1-201ENST00000306117 KPNA4O00629 521 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
KCNS1-201ENST00000306117 MOCS2O96007 188 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
KCNS1-201ENST00000306117 MRPS22P82650 360 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
KCNS1-201ENST00000306117 CEP78Q5JTW2 689 aa16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.7 ms