RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299314.11

GNPTAB-201, Transcript of N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase subunits alpha and beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GNPTAB, Length 5,701 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPTAB-201ENST00000299314 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP24.95■■□□□ 1.59
GNPTAB-201ENST00000299314 ARHGAP17Q68EM7 881 aa24.95■■□□□ 1.59
GNPTAB-201ENST00000299314 STRA8Q7Z7C7 330 aa24.95■■□□□ 1.59
GNPTAB-201ENST00000299314 C2orf81A6NN90 581 aa24.95■■□□□ 1.58
GNPTAB-201ENST00000299314 CCNG2Q16589 344 aa24.95■■□□□ 1.58
GNPTAB-201ENST00000299314 EXD1Q8NHP7 514 aa24.95■■□□□ 1.58
GNPTAB-201ENST00000299314 FAM151AQ8WW52 585 aa24.95■■□□□ 1.58
GNPTAB-201ENST00000299314 FUCA2Q9BTY2 467 aa24.95■■□□□ 1.58
GNPTAB-201ENST00000299314 CYP4F12Q9HCS2 524 aa24.95■■□□□ 1.58
GNPTAB-201ENST00000299314 PIK3CDO00329 1044 aa24.95■■□□□ 1.58
GNPTAB-201ENST00000299314 CYP2C9P11712 490 aa24.95■■□□□ 1.58
GNPTAB-201ENST00000299314 ATP6V0D2Q8N8Y2 350 aa24.95■■□□□ 1.58
GNPTAB-201ENST00000299314 TCF3P15923 654 aa24.95■■□□□ 1.58
GNPTAB-201ENST00000299314 KRR1Q13601 381 aaKnown RBP24.95■■□□□ 1.58
GNPTAB-201ENST00000299314 GPRC5CQ9NQ84 441 aa24.95■■□□□ 1.58
GNPTAB-201ENST00000299314 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP24.95■■□□□ 1.58
GNPTAB-201ENST00000299314 VDRP11473 427 aa24.95■■□□□ 1.58
GNPTAB-201ENST00000299314 C11orf96Q7Z7L8 435 aa24.95■■□□□ 1.58
GNPTAB-201ENST00000299314 SLC20A1Q8WUM9 679 aa24.95■■□□□ 1.58
GNPTAB-201ENST00000299314 SYBUQ9NX95 663 aa24.95■■□□□ 1.58
GNPTAB-201ENST00000299314 PRRG1O14668 218 aa24.94■■□□□ 1.58
GNPTAB-201ENST00000299314 AP5Z1O43299 807 aa24.94■■□□□ 1.58
GNPTAB-201ENST00000299314 PYGMP11217 842 aa24.94■■□□□ 1.58
GNPTAB-201ENST00000299314 TTLL9Q3SXZ7 439 aa24.94■■□□□ 1.58
GNPTAB-201ENST00000299314 PRR5LQ6MZQ0 368 aa24.94■■□□□ 1.58
GNPTAB-201ENST00000299314 FAM172AQ8WUF8 416 aa24.94■■□□□ 1.58
GNPTAB-201ENST00000299314 PROSCO94903 275 aa24.94■■□□□ 1.58
GNPTAB-201ENST00000299314 ANGPT1Q15389 498 aa24.94■■□□□ 1.58
GNPTAB-201ENST00000299314 SLCO1B7G3V0H7 640 aa24.94■■□□□ 1.58
GNPTAB-201ENST00000299314 RIPK2O43353 540 aa24.94■■□□□ 1.58
GNPTAB-201ENST00000299314 ATP6V1B2P21281 511 aa24.94■■□□□ 1.58
GNPTAB-201ENST00000299314 SLC47A2Q86VL8 602 aa24.94■■□□□ 1.58
GNPTAB-201ENST00000299314 MIER2Q8N344 545 aa24.94■■□□□ 1.58
GNPTAB-201ENST00000299314 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP24.94■■□□□ 1.58
GNPTAB-201ENST00000299314 GRK2P25098 689 aa24.94■■□□□ 1.58
GNPTAB-201ENST00000299314 MCL1Q07820 350 aa24.94■■□□□ 1.58
GNPTAB-201ENST00000299314 NAALADL1Q9UQQ1 740 aa24.94■■□□□ 1.58
GNPTAB-201ENST00000299314 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa24.93■■□□□ 1.58
GNPTAB-201ENST00000299314 CPA3P15088 417 aa24.93■■□□□ 1.58
GNPTAB-201ENST00000299314 RRM1P23921 792 aa24.93■■□□□ 1.58
GNPTAB-201ENST00000299314 SLC16A1P53985 500 aa24.93■■□□□ 1.58
GNPTAB-201ENST00000299314 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP24.93■■□□□ 1.58
GNPTAB-201ENST00000299314 CHST13Q8NET6 341 aa24.93■■□□□ 1.58
GNPTAB-201ENST00000299314 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP24.93■■□□□ 1.58
GNPTAB-201ENST00000299314 NTSR2O95665 410 aa24.93■■□□□ 1.58
GNPTAB-201ENST00000299314 PTENP60484 403 aa24.93■■□□□ 1.58
GNPTAB-201ENST00000299314 CBWD1Q9BRT8 395 aa24.93■■□□□ 1.58
GNPTAB-201ENST00000299314 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa24.93■■□□□ 1.58
GNPTAB-201ENST00000299314 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP24.93■■□□□ 1.58
GNPTAB-201ENST00000299314 RPL10AP62906 217 aaKnown RBP24.93■■□□□ 1.58
GNPTAB-201ENST00000299314 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa24.93■■□□□ 1.58
GNPTAB-201ENST00000299314 SYTL2Q9HCH5 934 aa24.93■■□□□ 1.58
GNPTAB-201ENST00000299314 UBQLN1Q9UMX0 589 aaKnown RBP24.93■■□□□ 1.58
GNPTAB-201ENST00000299314 WASHC2DQ5SRD0 308 aa24.93■■□□□ 1.58
GNPTAB-201ENST00000299314 ABCA6Q8N139 1617 aa24.93■■□□□ 1.58
GNPTAB-201ENST00000299314 RGS2P41220 211 aa24.93■■□□□ 1.58
GNPTAB-201ENST00000299314 TRMT5Q32P41 509 aaKnown RBP24.93■■□□□ 1.58
GNPTAB-201ENST00000299314 USP18Q9UMW8 372 aa24.93■■□□□ 1.58
GNPTAB-201ENST00000299314 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP24.92■■□□□ 1.58
GNPTAB-201ENST00000299314 VPS26AO75436 327 aa24.92■■□□□ 1.58
GNPTAB-201ENST00000299314 OR1G1P47890 313 aa24.92■■□□□ 1.58
GNPTAB-201ENST00000299314 SARSP49591 514 aaKnown RBP24.92■■□□□ 1.58
GNPTAB-201ENST00000299314 RAB14P61106 215 aa24.92■■□□□ 1.58
GNPTAB-201ENST00000299314 SLFN11Q7Z7L1 901 aa24.92■■□□□ 1.58
GNPTAB-201ENST00000299314 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP24.92■■□□□ 1.58
GNPTAB-201ENST00000299314 KLHL25Q9H0H3 589 aa24.92■■□□□ 1.58
GNPTAB-201ENST00000299314 CACNA2D1P54289 1103 aa24.92■■□□□ 1.58
GNPTAB-201ENST00000299314 OGTO15294 1046 aa24.92■■□□□ 1.58
GNPTAB-201ENST00000299314 PLEKHA7Q6IQ23 1121 aa24.92■■□□□ 1.58
GNPTAB-201ENST00000299314 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP24.92■■□□□ 1.58
GNPTAB-201ENST00000299314 CGRRF1Q99675 332 aa24.92■■□□□ 1.58
GNPTAB-201ENST00000299314 MAPK1P28482 360 aa24.92■■□□□ 1.58
GNPTAB-201ENST00000299314 RRM2P31350 389 aa24.92■■□□□ 1.58
GNPTAB-201ENST00000299314 CENPAP49450 140 aa24.92■■□□□ 1.58
GNPTAB-201ENST00000299314 ALDH6A1Q02252 535 aaKnown RBP24.92■■□□□ 1.58
GNPTAB-201ENST00000299314 BMPR2Q13873 1038 aa24.92■■□□□ 1.58
GNPTAB-201ENST00000299314 ZBTB49Q6ZSB9 765 aa24.92■■□□□ 1.58
GNPTAB-201ENST00000299314 SEMA4AQ9H3S1 761 aa24.92■■□□□ 1.58
GNPTAB-201ENST00000299314 GPRC5DQ9NZD1 345 aa24.92■■□□□ 1.58
GNPTAB-201ENST00000299314 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa24.92■■□□□ 1.58
GNPTAB-201ENST00000299314 CHI3L1P36222 383 aaPredicted RBP24.91■■□□□ 1.58
GNPTAB-201ENST00000299314 CNTN1Q12860 1018 aa24.91■■□□□ 1.58
GNPTAB-201ENST00000299314 ATP6AP1LQ52LC2 224 aa24.91■■□□□ 1.58
GNPTAB-201ENST00000299314 GLB1LQ6UWU2 654 aa24.91■■□□□ 1.58
GNPTAB-201ENST00000299314 ZBTB7AO95365 584 aa24.91■■□□□ 1.58
GNPTAB-201ENST00000299314 SLC25A27O95847 323 aa24.91■■□□□ 1.58
GNPTAB-201ENST00000299314 SLC2A3P11169 496 aa24.91■■□□□ 1.58
GNPTAB-201ENST00000299314 CAPZA2P47755 286 aa24.91■■□□□ 1.58
GNPTAB-201ENST00000299314 PGS1Q32NB8 556 aa24.91■■□□□ 1.58
GNPTAB-201ENST00000299314 ACOT1Q86TX2 421 aa24.91■■□□□ 1.58
GNPTAB-201ENST00000299314 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP24.91■■□□□ 1.58
GNPTAB-201ENST00000299314 NAT9Q9BTE0 207 aa24.91■■□□□ 1.58
GNPTAB-201ENST00000299314 NBNO60934 754 aa24.91■■□□□ 1.58
GNPTAB-201ENST00000299314 ALOX15P16050 662 aaPredicted RBP24.91■■□□□ 1.58
GNPTAB-201ENST00000299314 RAP1GAPP47736 663 aa24.91■■□□□ 1.58
GNPTAB-201ENST00000299314 MOXD1Q6UVY6 613 aa24.91■■□□□ 1.58
GNPTAB-201ENST00000299314 DEFB107AQ8IZN7 70 aa24.91■■□□□ 1.58
GNPTAB-201ENST00000299314 TMEM79Q9BSE2 394 aa24.91■■□□□ 1.58
GNPTAB-201ENST00000299314 ODC1P11926 461 aa24.91■■□□□ 1.58
GNPTAB-201ENST00000299314 DGKDQ16760 1214 aa24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.1 ms