RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293362.7

PSME3-201, Transcript of proteasome activator subunit 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PSME3, Length 3,144 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME3-201ENST00000293362 ASNSD1Q9NWL6 643 aa10.64□□□□□ -0.71
PSME3-201ENST00000293362 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa10.64□□□□□ -0.71
PSME3-201ENST00000293362 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP10.64□□□□□ -0.71
PSME3-201ENST00000293362 TRPV2Q9Y5S1 764 aa10.64□□□□□ -0.71
PSME3-201ENST00000293362 MYBPHLA2RUH7 354 aa10.63□□□□□ -0.71
PSME3-201ENST00000293362 DCAF8L1A6NGE4 600 aa10.63□□□□□ -0.71
PSME3-201ENST00000293362 ADAMTS4O75173 837 aa10.63□□□□□ -0.71
PSME3-201ENST00000293362 B3GAT3O94766 335 aa10.63□□□□□ -0.71
PSME3-201ENST00000293362 KRT7P08729 469 aa10.63□□□□□ -0.71
PSME3-201ENST00000293362 CACNA2D1P54289 1103 aa10.63□□□□□ -0.71
PSME3-201ENST00000293362 TAP1Q03518 808 aa10.63□□□□□ -0.71
PSME3-201ENST00000293362 PTK6Q13882 451 aa10.63□□□□□ -0.71
PSME3-201ENST00000293362 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa10.63□□□□□ -0.71
PSME3-201ENST00000293362 SPATA18Q8TC71 538 aa10.63□□□□□ -0.71
PSME3-201ENST00000293362 MAIP1Q8WWC4 291 aa10.63□□□□□ -0.71
PSME3-201ENST00000293362 SENP8Q96LD8 212 aa10.63□□□□□ -0.71
PSME3-201ENST00000293362 TMEM30AQ9NV96 361 aa10.63□□□□□ -0.71
PSME3-201ENST00000293362 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
PSME3-201ENST00000293362 WDR35Q9P2L0 1181 aa10.63□□□□□ -0.71
PSME3-201ENST00000293362 TCRBV7S3A2A0A539 114 aa10.63□□□□□ -0.71
PSME3-201ENST00000293362 ITGB1P05556 798 aa10.63□□□□□ -0.71
PSME3-201ENST00000293362 THP07101 528 aa10.63□□□□□ -0.71
PSME3-201ENST00000293362 KLRC2P26717 231 aa10.63□□□□□ -0.71
PSME3-201ENST00000293362 GABRB2P47870 512 aa10.63□□□□□ -0.71
PSME3-201ENST00000293362 SLC6A3Q01959 620 aa10.63□□□□□ -0.71
PSME3-201ENST00000293362 PKDCCQ504Y2 493 aa10.63□□□□□ -0.71
PSME3-201ENST00000293362 ANKRD22Q5VYY1 191 aa10.63□□□□□ -0.71
PSME3-201ENST00000293362 DSTYKQ6XUX3 929 aa10.63□□□□□ -0.71
PSME3-201ENST00000293362 HFE2Q6ZVN8 426 aa10.63□□□□□ -0.71
PSME3-201ENST00000293362 CYP4V2Q6ZWL3 525 aaPredicted RBP10.63□□□□□ -0.71
PSME3-201ENST00000293362 FUKQ8N0W3 1084 aa10.63□□□□□ -0.71
PSME3-201ENST00000293362 GRK7Q8WTQ7 553 aa10.63□□□□□ -0.71
PSME3-201ENST00000293362 CAPNS2Q96L46 248 aa10.63□□□□□ -0.71
PSME3-201ENST00000293362 CNPY3Q9BT09 278 aa10.63□□□□□ -0.71
PSME3-201ENST00000293362 ADAM7Q9H2U9 754 aa10.63□□□□□ -0.71
PSME3-201ENST00000293362 DHX35Q9H5Z1 703 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
PSME3-201ENST00000293362 SAYSD1Q9NPB0 183 aa10.63□□□□□ -0.71
PSME3-201ENST00000293362 KIF3CO14782 793 aa10.62□□□□□ -0.71
PSME3-201ENST00000293362 IGHA2P01877 340 aa10.62□□□□□ -0.71
PSME3-201ENST00000293362 RBP3P10745 1247 aa10.62□□□□□ -0.71
PSME3-201ENST00000293362 AXLP30530 894 aa10.62□□□□□ -0.71
PSME3-201ENST00000293362 NME3Q13232 169 aa10.62□□□□□ -0.71
PSME3-201ENST00000293362 DCAF6Q58WW2 860 aa10.62□□□□□ -0.71
PSME3-201ENST00000293362 PPP1R2P3Q6NXS1 205 aa10.62□□□□□ -0.71
PSME3-201ENST00000293362 RSPH3Q86UC2 560 aa10.62□□□□□ -0.71
PSME3-201ENST00000293362 SERINC5Q86VE9 423 aa10.62□□□□□ -0.71
PSME3-201ENST00000293362 NIPA2Q8N8Q9 360 aa10.62□□□□□ -0.71
PSME3-201ENST00000293362 CCDC89Q8N998 374 aa10.62□□□□□ -0.71
PSME3-201ENST00000293362 MGARPQ8TDB4 240 aa10.62□□□□□ -0.71
PSME3-201ENST00000293362 BCAS4Q8TDM0 211 aa10.62□□□□□ -0.71
PSME3-201ENST00000293362 TRAF3IP1Q8TDR0 691 aaPredicted RBP10.62□□□□□ -0.71
PSME3-201ENST00000293362 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP10.62□□□□□ -0.71
PSME3-201ENST00000293362 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP10.62□□□□□ -0.71
PSME3-201ENST00000293362 NEU2Q9Y3R4 380 aa10.62□□□□□ -0.71
PSME3-201ENST00000293362 ITIH2P19823 946 aa10.62□□□□□ -0.71
PSME3-201ENST00000293362 VCPP55072 806 aaKnown RBP10.62□□□□□ -0.71
PSME3-201ENST00000293362 HDAC4P56524 1084 aa10.62□□□□□ -0.71
PSME3-201ENST00000293362 BCAR1P56945 870 aa10.62□□□□□ -0.71
PSME3-201ENST00000293362 EIF3EP60228 445 aaKnown RBP10.62□□□□□ -0.71
PSME3-201ENST00000293362 BASP1P80723 227 aaKnown RBP10.62□□□□□ -0.71
PSME3-201ENST00000293362 SMAD1Q15797 465 aaKnown RBP10.62□□□□□ -0.71
PSME3-201ENST00000293362 NME8Q8N427 588 aa10.62□□□□□ -0.71
PSME3-201ENST00000293362 CCDC185Q8N715 623 aa10.62□□□□□ -0.71
PSME3-201ENST00000293362 EIF1ADQ8N9N8 165 aaKnown RBP10.62□□□□□ -0.71
PSME3-201ENST00000293362 RSAD2Q8WXG1 361 aa10.62□□□□□ -0.71
PSME3-201ENST00000293362 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP10.62□□□□□ -0.71
PSME3-201ENST00000293362 ZNF560Q96MR9 790 aa10.62□□□□□ -0.71
PSME3-201ENST00000293362 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP10.62□□□□□ -0.71
PSME3-201ENST00000293362 SNRNP25Q9BV90 132 aaKnown RBP10.62□□□□□ -0.71
PSME3-201ENST00000293362 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP10.62□□□□□ -0.71
PSME3-201ENST00000293362 Q9Y3F1 56 aa10.62□□□□□ -0.71
PSME3-201ENST00000293362 H7C0C1 242 aa10.62□□□□□ -0.71
PSME3-201ENST00000293362 RGS16O15492 202 aaPredicted RBP10.62□□□□□ -0.71
PSME3-201ENST00000293362 PEX14O75381 377 aa10.62□□□□□ -0.71
PSME3-201ENST00000293362 RARGP13631 454 aa10.62□□□□□ -0.71
PSME3-201ENST00000293362 KCNE1P15382 129 aa10.62□□□□□ -0.71
PSME3-201ENST00000293362 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP10.62□□□□□ -0.71
PSME3-201ENST00000293362 ATP5OP48047 213 aa10.62□□□□□ -0.71
PSME3-201ENST00000293362 ITGA7Q13683 1181 aa10.62□□□□□ -0.71
PSME3-201ENST00000293362 DPYSL3Q14195 570 aa10.62□□□□□ -0.71
PSME3-201ENST00000293362 OASLQ15646 514 aaKnown RBP10.62□□□□□ -0.71
PSME3-201ENST00000293362 SV2CQ496J9 727 aa10.62□□□□□ -0.71
PSME3-201ENST00000293362 LRRC38Q5VT99 294 aa10.62□□□□□ -0.71
PSME3-201ENST00000293362 RHBDF2Q6PJF5 856 aa10.62□□□□□ -0.71
PSME3-201ENST00000293362 PAQR9Q6ZVX9 377 aa10.62□□□□□ -0.71
PSME3-201ENST00000293362 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa10.62□□□□□ -0.71
PSME3-201ENST00000293362 TMEM110Q86TL2 294 aa10.62□□□□□ -0.71
PSME3-201ENST00000293362 CCDC13Q8IYE1 715 aa10.62□□□□□ -0.71
PSME3-201ENST00000293362 ALLCQ8N6M5 410 aa10.62□□□□□ -0.71
PSME3-201ENST00000293362 ANKRD52Q8NB46 1076 aa10.62□□□□□ -0.71
PSME3-201ENST00000293362 TMEM209Q96SK2 561 aa10.62□□□□□ -0.71
PSME3-201ENST00000293362 SLC4A5Q9BY07 1137 aa10.62□□□□□ -0.71
PSME3-201ENST00000293362 CRTAC1Q9NQ79 661 aa10.62□□□□□ -0.71
PSME3-201ENST00000293362 KRT82Q9NSB4 513 aa10.62□□□□□ -0.71
PSME3-201ENST00000293362 WHRNQ9P202 907 aa10.62□□□□□ -0.71
PSME3-201ENST00000293362 FEZ2Q9UHY8 353 aaPredicted RBP10.62□□□□□ -0.71
PSME3-201ENST00000293362 DERAQ9Y315 318 aa10.62□□□□□ -0.71
PSME3-201ENST00000293362 RASGRF2O14827 1237 aa10.61□□□□□ -0.71
PSME3-201ENST00000293362 CCT5P48643 541 aa10.61□□□□□ -0.71
PSME3-201ENST00000293362 TTC3P53804 2025 aa10.61□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.7 ms