RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000006275.8

TRAPPC6A-201, Transcript of trafficking protein particle complex 6A, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRAPPC6A, Length 805 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6A-201ENST00000006275 RIN3Q8TB24 985 aa20.15■□□□□ 0.82
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TRAPPC6A-201ENST00000006275 MRPS31Q92665 395 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
TRAPPC6A-201ENST00000006275 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
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TRAPPC6A-201ENST00000006275 KIAA1468Q9P260 1216 aa20.15■□□□□ 0.82
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TRAPPC6A-201ENST00000006275 TRIM49CP0CI26 452 aa20.14■□□□□ 0.81
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TRAPPC6A-201ENST00000006275 MMRN2Q9H8L6 949 aa20.13■□□□□ 0.81
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TRAPPC6A-201ENST00000006275 SNX25Q9H3E2 840 aa20.12■□□□□ 0.81
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TRAPPC6A-201ENST00000006275 CTNND2Q9UQB3 1225 aa20.12■□□□□ 0.81
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TRAPPC6A-201ENST00000006275 TRPC7Q9HCX4 862 aa20.11■□□□□ 0.81
TRAPPC6A-201ENST00000006275 GTF3C4Q9UKN8 822 aa20.11■□□□□ 0.81
TRAPPC6A-201ENST00000006275 CDH9Q9ULB4 789 aa20.11■□□□□ 0.81
TRAPPC6A-201ENST00000006275 WNT6Q9Y6F9 365 aa20.11■□□□□ 0.81
TRAPPC6A-201ENST00000006275 AKAP13Q12802 2813 aa20.1■□□□□ 0.81
TRAPPC6A-201ENST00000006275 HYAL3O43820 417 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
TRAPPC6A-201ENST00000006275 PDGFRBP09619 1106 aa20.1■□□□□ 0.81
TRAPPC6A-201ENST00000006275 CSH1P0DML2 217 aa20.1■□□□□ 0.81
TRAPPC6A-201ENST00000006275 CSH2P0DML3 217 aa20.1■□□□□ 0.81
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