RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000029180.13

Rprd1b-201, Transcript of Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Rprd1b, Length 4,283 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Tll2Q9WVM6 1012 aa9.31□□□□□ -0.92
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 RptorQ8K4Q0 1335 aa9.3□□□□□ -0.92
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Cacna1aP97445 2368 aa9.3□□□□□ -0.92
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Gm7086A0A1W2P766 342 aa9.3□□□□□ -0.92
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Rap1gds1E9Q912 607 aa9.3□□□□□ -0.92
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Cyp27b1O35084 507 aa9.3□□□□□ -0.92
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 PurbO35295 324 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 GlrbP48168 496 aa9.3□□□□□ -0.92
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Faf1P54731 649 aa9.3□□□□□ -0.92
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Dpcr1Q3TNW5 500 aa9.3□□□□□ -0.92
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Gdpd4Q3TT99 632 aa9.3□□□□□ -0.92
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Kiaa0391Q8JZY4 584 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Pglyrp2Q8VCS0 530 aa9.3□□□□□ -0.92
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Pcdhga11Q91XY8 933 aa9.3□□□□□ -0.92
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Rtfdc1Q99K95 307 aa9.3□□□□□ -0.92
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Trim33Q99PP7 1142 aa9.3□□□□□ -0.92
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 CenpsQ9D084 142 aa9.3□□□□□ -0.92
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Ddx56Q9D0R4 546 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Rexo2Q9D8S4 237 aa9.3□□□□□ -0.92
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Abhd2Q9QXM0 425 aa9.3□□□□□ -0.92
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Pacsin2Q9WVE8 486 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Gm20509G3UZF1 325 aa9.3□□□□□ -0.92
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Cdh16O88338 830 aa9.3□□□□□ -0.92
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Orc4O88708 433 aa9.3□□□□□ -0.92
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Gad1P48318 593 aa9.3□□□□□ -0.92
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Rrp36Q3UFY0 244 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Krt31Q61765 416 aa9.3□□□□□ -0.92
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Birc2Q62210 612 aa9.3□□□□□ -0.92
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Fastkd1Q6DI86 829 aa9.3□□□□□ -0.92
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Znf365Q8BG89 408 aa9.3□□□□□ -0.92
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 B3glctQ8BHT6 489 aa9.3□□□□□ -0.92
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Pkn2Q8BWW9 983 aa9.3□□□□□ -0.92
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Tmem63cQ8CBX0 802 aa9.3□□□□□ -0.92
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Rnf208Q8K0W3 265 aa9.3□□□□□ -0.92
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 OtoaQ8K561 1137 aa9.3□□□□□ -0.92
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Clptm1Q8VBZ3 664 aa9.3□□□□□ -0.92
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 BrdtQ91Y44 956 aa9.3□□□□□ -0.92
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Nuf2Q99P69 463 aa9.3□□□□□ -0.92
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Dppa5aQ9CQS7 118 aa9.3□□□□□ -0.92
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Sesn3Q9CYP7 492 aa9.3□□□□□ -0.92
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Pold3Q9EQ28 462 aa9.3□□□□□ -0.92
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Tacc3Q9JJ11 631 aa9.3□□□□□ -0.92
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Git2Q9JLQ2 708 aa9.3□□□□□ -0.92
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Thsd7bQ6P4U0 1607 aa9.3□□□□□ -0.92
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Patl2A2ARM1 529 aa9.3□□□□□ -0.92
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Sh2d4bA6X942 431 aa9.3□□□□□ -0.92
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Kcnh2O35219 1162 aa9.3□□□□□ -0.92
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Gjd2O54851 321 aa9.3□□□□□ -0.92
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 LxnP70202 222 aa9.3□□□□□ -0.92
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 RilpQ5ND29 369 aa9.3□□□□□ -0.92
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Atp11bQ6DFW5 1175 aa9.3□□□□□ -0.92
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Sec23ipQ6NZC7 998 aa9.3□□□□□ -0.92
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Rccd1Q8BTU7 377 aa9.3□□□□□ -0.92
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Myef2Q8C854 591 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Rpap2Q8VC34 614 aa9.3□□□□□ -0.92
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Snx24Q9CRB0 169 aa9.3□□□□□ -0.92
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 MlklQ9D2Y4 472 aa9.3□□□□□ -0.92
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Slc13a1Q9JHI4 594 aa9.3□□□□□ -0.92
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Sptan1P16546 2472 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 NuggcD3YWJ0 796 aa9.29□□□□□ -0.92
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Prl2c3P04768 224 aa9.29□□□□□ -0.92
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 PpargP37238 505 aa9.29□□□□□ -0.92
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Gdf3Q07104 366 aa9.29□□□□□ -0.92
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Itih2Q61703 946 aa9.29□□□□□ -0.92
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Sh3gl1Q62419 368 aa9.29□□□□□ -0.92
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 N6amt1Q6SKR2 214 aa9.29□□□□□ -0.92
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 WhrnQ80VW5 918 aa9.29□□□□□ -0.92
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 PimregQ8BFY7 231 aa9.29□□□□□ -0.92
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 EtnpplQ8BWU8 499 aa9.29□□□□□ -0.92
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Ago2Q8CJG0 860 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Olfr805Q8VFI4 319 aa9.29□□□□□ -0.92
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 ChiaQ91XA9 473 aa9.29□□□□□ -0.92
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Cntn6Q9JMB8 1028 aa9.29□□□□□ -0.92
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Angptl2Q9R045 493 aa9.29□□□□□ -0.92
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Tjp2Q9Z0U1 1167 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 4921501E09RikA0A0R4J054 908 aa9.29□□□□□ -0.92
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Serpinb3aG3X9V8 387 aa9.29□□□□□ -0.92
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Kbtbd2G3X9X1 623 aa9.29□□□□□ -0.92
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 PrkcbP68404 671 aa9.29□□□□□ -0.92
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Creb1Q01147 341 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 4930430A15RikQ05AC5 485 aa9.29□□□□□ -0.92
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Togaram2Q3TYG6 1002 aa9.29□□□□□ -0.92
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Srebf2Q3U1N2 1130 aa9.29□□□□□ -0.92
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Tfe3Q64092 572 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 GartQ64737 1010 aa9.29□□□□□ -0.92
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Tspyl5Q69ZB3 406 aa9.29□□□□□ -0.92
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Rasa4Q6PFQ7 802 aa9.29□□□□□ -0.92
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Efr3bQ6ZQ18 817 aa9.29□□□□□ -0.92
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 SugctQ7TNE1 436 aa9.29□□□□□ -0.92
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Nrde2Q80XC6 1172 aa9.29□□□□□ -0.92
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Stk32aQ8BGW6 398 aa9.29□□□□□ -0.92
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Kcnv1Q8BZN2 503 aa9.29□□□□□ -0.92
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Klhl11Q8CE33 709 aa9.29□□□□□ -0.92
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 CrygnQ8VHL5 183 aa9.29□□□□□ -0.92
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Tom1l1Q923U0 474 aa9.29□□□□□ -0.92
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Q99KU6 348 aa9.29□□□□□ -0.92
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Kremen1Q99N43 473 aa9.29□□□□□ -0.92
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Npm3Q9CPP0 175 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Ppp1r3gQ9CW07 347 aa9.29□□□□□ -0.92
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Prpf4Q9DAW6 521 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 30 ms