RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000025354.3

Pggt1b-201, Transcript of Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Pggt1b, Length 2,736 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Smg8Q8VE18 991 aa13.2□□□□□ -0.3
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 MiosQ8VE19 875 aa13.2□□□□□ -0.3
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Afg3l1Q920A7 789 aaKnown RBP13.2□□□□□ -0.3
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Hars2Q99KK9 505 aa13.2□□□□□ -0.3
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Pgm1Q9D0F9 562 aa13.2□□□□□ -0.3
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Plxnb3Q9QY40 1902 aa13.2□□□□□ -0.3
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cyp27b1O35084 507 aa13.19□□□□□ -0.3
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 ZfxP17012 799 aa13.19□□□□□ -0.3
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tbxas1P36423 533 aa13.19□□□□□ -0.3
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Has1Q61647 583 aa13.19□□□□□ -0.3
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Sh3rf1Q69ZI1 892 aa13.19□□□□□ -0.3
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Reps2Q80XA6 521 aa13.19□□□□□ -0.3
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Il33Q8BVZ5 266 aa13.19□□□□□ -0.3
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Dclre1bQ8C7W7 541 aa13.19□□□□□ -0.3
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Phtf2Q8CB19 747 aa13.19□□□□□ -0.3
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Amer2Q8CCJ4 672 aa13.19□□□□□ -0.3
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Pcdha10Q91Y20 946 aa13.19□□□□□ -0.3
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rev1Q920Q2 1249 aa13.19□□□□□ -0.3
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tmem81Q9D5K1 259 aa13.19□□□□□ -0.3
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cyp39a1Q9JKJ9 470 aa13.19□□□□□ -0.3
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Slc26a3Q9WVC8 757 aa13.19□□□□□ -0.3
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Dennd4aE9Q8V6 1869 aa13.19□□□□□ -0.3
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Zfp990B1AVN5 605 aa13.19□□□□□ -0.3
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cyp4f40G3UW81 524 aa13.19□□□□□ -0.3
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 EgfP01132 1217 aa13.19□□□□□ -0.3
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 JchainP01592 159 aa13.19□□□□□ -0.3
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 TnfP06804 235 aa13.19□□□□□ -0.3
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Lmo2P25801 158 aa13.19□□□□□ -0.3
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cetn1P41209 172 aa13.19□□□□□ -0.3
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gad2P48320 585 aa13.19□□□□□ -0.3
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Zfyve27Q3TXX3 415 aa13.19□□□□□ -0.3
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Q3UK37 420 aa13.19□□□□□ -0.3
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tars2Q3UQ84 723 aaKnown RBP13.19□□□□□ -0.3
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Armcx2Q6A058 784 aaKnown RBP13.19□□□□□ -0.3
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gpatch2lQ6PE65 482 aa13.19□□□□□ -0.3
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tdpoz4Q6YCH2 370 aa13.19□□□□□ -0.3
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Znf879Q8BI99 563 aa13.19□□□□□ -0.3
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Lrrc8cQ8R502 803 aa13.19□□□□□ -0.3
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Lars2Q8VDC0 902 aa13.19□□□□□ -0.3
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr30Q8VGD8 315 aa13.19□□□□□ -0.3
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Fuca1Q99LJ1 452 aa13.19□□□□□ -0.3
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Piwil1Q9JMB7 862 aa13.19□□□□□ -0.3
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Maged1Q9QYH6 775 aaKnown RBP13.19□□□□□ -0.3
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Clcn2Q9R0A1 908 aa13.19□□□□□ -0.3
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cyp2b13A6H6J2 491 aa13.19□□□□□ -0.3
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm4302E9PX25 294 aa13.19□□□□□ -0.3
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Speer2E9Q9U2 264 aa13.19□□□□□ -0.3
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Chil3O35744 398 aa13.19□□□□□ -0.3
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 St3gal1P54751 337 aa13.19□□□□□ -0.3
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tmprss15P97435 1069 aa13.19□□□□□ -0.3
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 SPINDOCQ05AH6 381 aa13.19□□□□□ -0.3
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 CpQ61147 1061 aa13.19□□□□□ -0.3
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Sh3gl3Q62421 347 aa13.19□□□□□ -0.3
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 HpseQ6YGZ1 535 aa13.19□□□□□ -0.3
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gprc5aQ8BHL4 356 aa13.19□□□□□ -0.3
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Smtnl2Q8CI12 456 aa13.19□□□□□ -0.3
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Sh2d5Q8JZW5 429 aa13.19□□□□□ -0.3
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Pcyox1Q9CQF9 505 aa13.19□□□□□ -0.3
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 PnkpQ9JLV6 522 aaKnown RBP13.19□□□□□ -0.3
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Arih2Q9Z1K6 492 aa13.19□□□□□ -0.3
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 TrioQ0KL02 3102 aa13.18□□□□□ -0.3
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm42688A0A0R3P9D1 673 aa13.18□□□□□ -0.3
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tldc2A2ACG1 198 aa13.18□□□□□ -0.3
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Zfp882E9Q4R4 555 aa13.18□□□□□ -0.3
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Plekha5E9Q6H8 1269 aa13.18□□□□□ -0.3
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Pdha1P35486 390 aaKnown RBP13.18□□□□□ -0.3
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 PorP37040 678 aa13.18□□□□□ -0.3
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 SftpdP50404 374 aa13.18□□□□□ -0.3
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ccng1P51945 294 aa13.18□□□□□ -0.3
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Kcnn2P58390 839 aa13.18□□□□□ -0.3
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tbc1d10aP58802 500 aa13.18□□□□□ -0.3
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Sash1P59808 1230 aa13.18□□□□□ -0.3
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Yy1Q00899 414 aa13.18□□□□□ -0.3
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 WtipQ7TQJ8 398 aa13.18□□□□□ -0.3
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tmem220Q8BP07 167 aa13.18□□□□□ -0.3
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ccdc142Q8CAI1 738 aa13.18□□□□□ -0.3
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Bclaf1Q8K019 919 aaKnown RBP13.18□□□□□ -0.3
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Defb19Q8K3I8 83 aa13.18□□□□□ -0.3
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Snrnp25Q8VIK1 123 aa13.18□□□□□ -0.3
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tbrg4Q91YM4 630 aaKnown RBP13.18□□□□□ -0.3
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rsc1a1Q9ER99 582 aa13.18□□□□□ -0.3
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Syt5Q9R0N5 386 aa13.18□□□□□ -0.3
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm4756A0A140LIS8 335 aa13.18□□□□□ -0.3
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 AgxtO35423 414 aa13.18□□□□□ -0.3
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Hcls1P49710 486 aaKnown RBP13.18□□□□□ -0.3
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cyp2c37P56654 490 aa13.18□□□□□ -0.3
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Uchl4P58321 233 aa13.18□□□□□ -0.3
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Psmc1P62192 440 aa13.18□□□□□ -0.3
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Nlrc4Q3UP24 1024 aa13.18□□□□□ -0.3
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tmem65Q4VAE3 234 aa13.18□□□□□ -0.3
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Grm6Q5NCH9 871 aa13.18□□□□□ -0.3
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 RilpQ5ND29 369 aa13.18□□□□□ -0.3
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 CybbQ61093 570 aa13.18□□□□□ -0.3
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cyp2c54Q6XVG2 490 aa13.18□□□□□ -0.3
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Camta2Q80Y50 1208 aa13.18□□□□□ -0.3
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Serpina3bQ8BYY9 420 aa13.18□□□□□ -0.3
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 ClmnQ8C5W0 1052 aa13.18□□□□□ -0.3
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tdrd7Q8K1H1 1086 aaKnown RBP13.18□□□□□ -0.3
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cyp2c50Q91X77 490 aa13.18□□□□□ -0.3
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Mfsd5Q921Y4 450 aa13.18□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 32.6 ms