RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000004201.7

Col5a3-201, Transcript of Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Col5a3, Length 6,119 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Nipsnap3bQ9CQE1 247 aa14.94□□□□□ -0.02
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Ruvbl2Q9WTM5 463 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
Col5a3-201ENSMUST00000004201 PigrO70570 771 aa14.94□□□□□ -0.02
Col5a3-201ENSMUST00000004201 UmpsP13439 481 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Usp4P35123 962 aa14.94□□□□□ -0.02
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Rps7P62082 194 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Usp39Q3TIX9 564 aa14.94□□□□□ -0.02
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Ankrd27Q3UMR0 1048 aa14.94□□□□□ -0.02
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Fam167aQ6P1G6 215 aa14.94□□□□□ -0.02
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Sel1l3Q80TS8 1137 aa14.94□□□□□ -0.02
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Rmnd5aQ80YQ8 391 aa14.94□□□□□ -0.02
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Ticam2Q8BJQ4 232 aa14.94□□□□□ -0.02
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Pak5Q8C015 719 aa14.94□□□□□ -0.02
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Mrpl1Q99N96 336 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Slc24a3Q99PD7 645 aa14.94□□□□□ -0.02
Col5a3-201ENSMUST00000004201 MkksQ9JI70 570 aa14.94□□□□□ -0.02
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Ism1A2ATD1 454 aa14.94□□□□□ -0.02
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Sptlc1O35704 473 aa14.94□□□□□ -0.02
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Guca1aP43081 202 aa14.94□□□□□ -0.02
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Sult1e1P49891 295 aa14.94□□□□□ -0.02
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Hsd17b4P51660 735 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Gemin4Q6P6L6 1058 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Hspa13Q8BM72 471 aa14.94□□□□□ -0.02
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Mrpl28Q9D1B9 257 aa14.94□□□□□ -0.02
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Nek3Q9R0A5 511 aa14.94□□□□□ -0.02
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Fam205aA2APU8 1308 aa14.94□□□□□ -0.02
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Fcer2P20693 331 aa14.93□□□□□ -0.02
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Nedd8P29595 81 aa14.93□□□□□ -0.02
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Ccnd2P30280 289 aa14.93□□□□□ -0.02
Col5a3-201ENSMUST00000004201 PuraP42669 321 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Tmem35bQ3U0Y2 150 aa14.93□□□□□ -0.02
Col5a3-201ENSMUST00000004201 BC030870Q3V2G4 71 aa14.93□□□□□ -0.02
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Stip1Q60864 543 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Kctd3Q8BFX3 815 aa14.93□□□□□ -0.02
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Mtmr6Q8VE11 617 aa14.93□□□□□ -0.02
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Fam192aQ91WE2 254 aa14.93□□□□□ -0.02
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Fxr2Q9WVR4 673 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Tekt5G5E8A8 557 aa14.93□□□□□ -0.02
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Prl2c3P04768 224 aa14.93□□□□□ -0.02
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Atg9bQ6EBV9 922 aa14.93□□□□□ -0.02
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Tas2r134Q7TQB0 298 aa14.93□□□□□ -0.02
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Slitrk2Q810C0 846 aa14.93□□□□□ -0.02
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Znf473Q8BI67 892 aa14.93□□□□□ -0.02
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Ints5Q8CHT3 1018 aa14.93□□□□□ -0.02
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Trappc12Q8K2L8 797 aa14.93□□□□□ -0.02
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Atpaf2Q91YY4 289 aa14.93□□□□□ -0.02
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Ybx3Q9JKB3 361 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Abhd2Q9QXM0 425 aa14.93□□□□□ -0.02
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Gm13941A2AJ38 245 aa14.93□□□□□ -0.02
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Zcchc7B1AX39 541 aa14.93□□□□□ -0.02
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Galnt4O08832 578 aa14.93□□□□□ -0.02
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Alkbh1P0CB42 389 aa14.93□□□□□ -0.02
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Hat1Q8BY71 416 aa14.93□□□□□ -0.02
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Fam151aQ8QZW3 608 aa14.93□□□□□ -0.02
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Cox18Q8VC74 331 aa14.93□□□□□ -0.02
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Tbrg4Q91YM4 630 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
Col5a3-201ENSMUST00000004201 LactbQ9EP89 551 aa14.93□□□□□ -0.02
Col5a3-201ENSMUST00000004201 B3galt4Q9Z0F0 371 aa14.93□□□□□ -0.02
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Zfyve16Q80U44 1528 aa14.93□□□□□ -0.02
Col5a3-201ENSMUST00000004201 PtprtQ99M80 1454 aa14.93□□□□□ -0.02
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Cap1P40124 474 aa14.93□□□□□ -0.02
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Ephb2P54763 986 aa14.93□□□□□ -0.02
Col5a3-201ENSMUST00000004201 FAM120AQ6A0A9 1112 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Ahcyl1Q80SW1 530 aa14.93□□□□□ -0.02
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Stau2Q8CJ67 570 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Pcdha9Q91Y11 979 aa14.93□□□□□ -0.02
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Serbp1Q9CY58 407 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Cdyl2Q9D5D8 503 aa14.93□□□□□ -0.02
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Prg3Q9JL95 222 aa14.93□□□□□ -0.02
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Ptpn4Q9WU22 926 aa14.93□□□□□ -0.02
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Cdh19E9Q3A7 770 aa14.93□□□□□ -0.02
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Mroh4G3X8W1 983 aa14.93□□□□□ -0.02
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Lrrc47Q505F5 581 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Btbd10Q80X66 475 aa14.93□□□□□ -0.02
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Ptdss1Q99LH2 473 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Pwp1Q99LL5 501 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Txndc12Q9CQU0 170 aa14.93□□□□□ -0.02
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Snx10Q9CWT3 201 aa14.93□□□□□ -0.02
Col5a3-201ENSMUST00000004201 PmpcbQ9CXT8 489 aa14.93□□□□□ -0.02
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Fam227aQ9D3V8 625 aa14.93□□□□□ -0.02
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Gm32742A0A1B0GT42 1604 aa14.92□□□□□ -0.02
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Cd86P42082 309 aa14.92□□□□□ -0.02
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Olfr698Q7TRN4 311 aa14.92□□□□□ -0.02
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Ggt7Q99JP7 662 aa14.92□□□□□ -0.02
Col5a3-201ENSMUST00000004201 MmadhcQ99LS1 296 aa14.92□□□□□ -0.02
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Lyrm1Q9CQB7 122 aa14.92□□□□□ -0.02
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Pcyox1Q9CQF9 505 aa14.92□□□□□ -0.02
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Dennd5bA2RSQ0 1274 aa14.92□□□□□ -0.02
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Ccdc8D3YZV8 685 aa14.92□□□□□ -0.02
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Gm3893E9Q1I1 302 aa14.92□□□□□ -0.02
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Oog1E9Q5G7 496 aa14.92□□□□□ -0.02
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Fgf15O35622 218 aa14.92□□□□□ -0.02
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Cdh16O88338 830 aa14.92□□□□□ -0.02
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Hsd17b1P51656 344 aa14.92□□□□□ -0.02
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Rbm44Q3V089 1013 aa14.92□□□□□ -0.02
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Ifi47Q61635 420 aa14.92□□□□□ -0.02
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Mrps31Q61733 384 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
Col5a3-201ENSMUST00000004201 RetsatQ64FW2 609 aa14.92□□□□□ -0.02
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Atp11bQ6DFW5 1175 aa14.92□□□□□ -0.02
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Mrgprb8Q7TN51 330 aa14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 21.2 ms