RNA–Protein interactions for RNA: YPR178W

PRP4, Transcript of Splicing factor, yeastyeast

Gene PRP4, Length 1,398 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PRP4YPR178W COX14P39103 70 aa7.71□□□□□ -1.17
PRP4YPR178W ARC15P40518 154 aaRIP-Chip data7.71□□□□□ -1.17not detected
PRP4YPR178W RPR2P40571 144 aa7.71□□□□□ -1.17
PRP4YPR178W YMR295CQ03559 197 aa7.71□□□□□ -1.17
PRP4YPR178W EMC6Q12431 108 aa7.71□□□□□ -1.17
PRP4YPR178W KRE9P39005 276 aa7.71□□□□□ -1.18
PRP4YPR178W UBC11P52492 156 aa7.71□□□□□ -1.18
PRP4YPR178W RPL2AP0CX45 254 aaKnown RBP7.69□□□□□ -1.18
PRP4YPR178W RPL2BP0CX46 254 aaKnown RBP7.69□□□□□ -1.18
PRP4YPR178W YPL038W-AQ3E7B4 63 aa7.69□□□□□ -1.18
PRP4YPR178W SRL1Q08673 210 aa7.68□□□□□ -1.18
PRP4YPR178W YDR029WQ12111 104 aa7.68□□□□□ -1.18
PRP4YPR178W RPS11AP0CX47 156 aaKnown RBP7.67□□□□□ -1.18
PRP4YPR178W RPS11BP0CX48 156 aaKnown RBP7.67□□□□□ -1.18
PRP4YPR178W KNH1P50112 268 aa7.67□□□□□ -1.18
PRP4YPR178W YLR361C-AQ3E795 98 aa7.67□□□□□ -1.18
PRP4YPR178W TAR1Q8TGM6 124 aa7.67□□□□□ -1.18
PRP4YPR178W YLR236CA0A023PZG4 107 aa7.66□□□□□ -1.18
PRP4YPR178W ALG13P53178 202 aa7.66□□□□□ -1.18
PRP4YPR178W VAM10Q08474 114 aa7.65□□□□□ -1.18
PRP4YPR178W YLL006W-AQ3E814 58 aa7.65□□□□□ -1.18
PRP4YPR178W ECM12O13529 151 aa7.64□□□□□ -1.19
PRP4YPR178W TOM6P33448 61 aa7.64□□□□□ -1.19
PRP4YPR178W YBR219CP38317 127 aa7.64□□□□□ -1.19
PRP4YPR178W YOR034C-AQ3E735 80 aa7.64□□□□□ -1.19
PRP4YPR178W IRA1P18963 3092 aa7.63□□□□□ -1.19
PRP4YPR178W YJR107C-AP0CT86 78 aa7.63□□□□□ -1.19
PRP4YPR178W YPS5P53057 165 aa7.63□□□□□ -1.19
PRP4YPR178W YSY6P38374 65 aa7.62□□□□□ -1.19
PRP4YPR178W YLR415CO13578 112 aa7.6□□□□□ -1.19
PRP4YPR178W YHL018WP38744 120 aaPredicted RBP7.6□□□□□ -1.19
PRP4YPR178W IRC21Q04772 201 aa7.6□□□□□ -1.19
PRP4YPR178W YMR122W-AQ3E842 84 aa7.59□□□□□ -1.19
PRP4YPR178W YBR126W-AQ8TGU7 68 aa7.59□□□□□ -1.19
PRP4YPR178W Q0297Q9ZZV8 51 aa7.59□□□□□ -1.19
PRP4YPR178W HAL1Q01766 294 aa7.58□□□□□ -1.2
PRP4YPR178W YCR041WP37265 110 aa7.57□□□□□ -1.2
PRP4YPR178W ERI1P62651 68 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
PRP4YPR178W ICY1Q04329 127 aa7.55□□□□□ -1.2
PRP4YPR178W YLR285C-AQ3E771 56 aa7.55□□□□□ -1.2
PRP4YPR178W YBR056W-AI2HB52 66 aa7.54□□□□□ -1.2
PRP4YPR178W ATP18P81450 59 aa7.54□□□□□ -1.2
PRP4YPR178W YGR240C-AQ3E786 66 aa7.54□□□□□ -1.2
PRP4YPR178W YAL065CO13511 128 aa7.53□□□□□ -1.2
PRP4YPR178W MPC3P53311 146 aa7.53□□□□□ -1.2
PRP4YPR178W GAT4P40569 121 aa7.52□□□□□ -1.21
PRP4YPR178W YDL241WQ07738 123 aa7.52□□□□□ -1.21
PRP4YPR178W RPL29P05747 59 aaPredicted RBP7.51□□□□□ -1.21
PRP4YPR178W YMR175W-AQ3E766 64 aa7.51□□□□□ -1.21
PRP4YPR178W TOR2P32600 2474 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
PRP4YPR178W YER145C-AA0A023PYF4 145 aa7.5□□□□□ -1.21
PRP4YPR178W YHR212W-AP0CX91 67 aa7.49□□□□□ -1.21
PRP4YPR178W ERG28P40030 148 aa7.49□□□□□ -1.21
PRP4YPR178W YER039C-AP0CD97 72 aa7.48□□□□□ -1.21
PRP4YPR178W YER187WP40102 141 aa7.48□□□□□ -1.21
PRP4YPR178W RSM19P53733 91 aaPredicted RBP7.48□□□□□ -1.21
PRP4YPR178W YLR156WP0CE96 114 aa7.47□□□□□ -1.21
PRP4YPR178W YLR159WP0CE97 114 aa7.47□□□□□ -1.21
PRP4YPR178W YLR161WP0CE98 114 aa7.47□□□□□ -1.21
PRP4YPR178W RPB9P27999 122 aa7.47□□□□□ -1.21
PRP4YPR178W EDC1P53080 175 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.21
PRP4YPR178W CRC1Q12289 327 aa7.46□□□□□ -1.21
PRP4YPR178W TSC3Q3E790 80 aa7.46□□□□□ -1.21
PRP4YPR178W YCR050CP25630 102 aa7.46□□□□□ -1.22
PRP4YPR178W MVB12P42939 101 aa7.46□□□□□ -1.22
PRP4YPR178W YLR281CQ05863 155 aa7.46□□□□□ -1.22
PRP4YPR178W TRA1P38811 3744 aa7.44□□□□□ -1.22
PRP4YPR178W URA2P07259 2214 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
PRP4YPR178W YFR009W-AP0C5M9 85 aa7.44□□□□□ -1.22
PRP4YPR178W GCN1P33892 2672 aaKnown RBP7.43□□□□□ -1.22
PRP4YPR178W YCR001WP25347 104 aa7.43□□□□□ -1.22
PRP4YPR178W RPC10P40422 70 aa7.43□□□□□ -1.22
PRP4YPR178W RDS3Q06835 107 aaPredicted RBP7.43□□□□□ -1.22
PRP4YPR178W YKL183C-AQ3E765 70 aa7.43□□□□□ -1.22
PRP4YPR178W RTG1P32607 177 aa7.42□□□□□ -1.22
PRP4YPR178W YBR144CP34215 104 aa7.42□□□□□ -1.22
PRP4YPR178W SMD1Q02260 146 aaPredicted RBP7.42□□□□□ -1.22
PRP4YPR178W YDR246W-AQ3E763 66 aa7.42□□□□□ -1.22
PRP4YPR178W YDR274CP87283 123 aa7.41□□□□□ -1.22
PRP4YPR178W RPL11AP0C0W9 174 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
PRP4YPR178W TDA2P40045 126 aa7.4□□□□□ -1.22
PRP4YPR178W RPL38P49167 78 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
PRP4YPR178W SBH1P52870 82 aa7.4□□□□□ -1.22
PRP4YPR178W ATP20Q12233 115 aa7.4□□□□□ -1.22
PRP4YPR178W YPR010C-AA5Z2X5 72 aa7.39□□□□□ -1.23
PRP4YPR178W RPL26AP05743 127 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
PRP4YPR178W AIM4P38305 123 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
PRP4YPR178W YFL019CP43576 117 aa7.39□□□□□ -1.23
PRP4YPR178W RPL26BP53221 127 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
PRP4YPR178W MLF3P32047 452 aa7.38□□□□□ -1.23
PRP4YPR178W YBL039W-BP0C268 59 aa7.37□□□□□ -1.23
PRP4YPR178W AQY2P0CD90 149 aa7.37□□□□□ -1.23
PRP4YPR178W YNL162W-AQ3E7A8 72 aa7.37□□□□□ -1.23
PRP4YPR178W UBC4P15731 148 aa7.36□□□□□ -1.23
PRP4YPR178W RSM18P40033 138 aa7.36□□□□□ -1.23
PRP4YPR178W YMR320WQ04897 101 aa7.36□□□□□ -1.23
PRP4YPR178W YRA2P36036 203 aaKnown RBP RIP-Chip data7.34□□□□□ -1.23not detected
PRP4YPR178W SFT1P43682 97 aa7.34□□□□□ -1.23
PRP4YPR178W RPL11BQ3E757 174 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
PRP4YPR178W FYV5P25585 152 aa7.33□□□□□ -1.24
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