RNA–Protein interactions for RNA: YOR160W

MTR10, Transcript of Nuclear import receptor, yeast

Gene MTR10, Length 2,919 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MTR10	YOR160W	AYT1	Q12226	474 aa		3.12	□□□□□ -1.91
MTR10	YOR160W	URM1	P40554	99 aa	Predicted RBP	3.11	□□□□□ -1.91
MTR10	YOR160W	MRPS8	Q03799	155 aa		3.11	□□□□□ -1.91
MTR10	YOR160W	SMT3	Q12306	101 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
MTR10	YOR160W	YAR023C	D6VPM8	179 aa		3.11	□□□□□ -1.91
MTR10	YOR160W	MSA2	P36157	363 aa		3.11	□□□□□ -1.91
MTR10	YOR160W	YMR254C	Q04838	102 aa		3.11	□□□□□ -1.91
MTR10	YOR160W	YOL118C	Q08259	102 aa		3.11	□□□□□ -1.91
MTR10	YOR160W	ATP15	P21306	62 aa		3.1	□□□□□ -1.91
MTR10	YOR160W	ATP19	P81451	68 aa		3.1	□□□□□ -1.91
MTR10	YOR160W	YOR268C	Q08734	132 aa		3.1	□□□□□ -1.91
MTR10	YOR160W	COX14	P39103	70 aa		3.1	□□□□□ -1.91
MTR10	YOR160W	YLR122C	Q12312	125 aa		3.1	□□□□□ -1.91
MTR10	YOR160W	ERG2	P32352	222 aa		3.09	□□□□□ -1.91
MTR10	YOR160W	PAU12	P53343	120 aa		3.09	□□□□□ -1.91
MTR10	YOR160W	MIX17	Q03667	156 aa		3.09	□□□□□ -1.91
MTR10	YOR160W	CRC1	Q12289	327 aa		3.09	□□□□□ -1.91
MTR10	YOR160W	YMR105W-A	Q8TGS8	64 aa		3.09	□□□□□ -1.91
MTR10	YOR160W	SOD1	P00445	154 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
MTR10	YOR160W	RPL26A	P05743	127 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
MTR10	YOR160W	YFL015C	P43578	164 aa		3.09	□□□□□ -1.91
MTR10	YOR160W	IMP2	P46972	177 aa		3.09	□□□□□ -1.91
MTR10	YOR160W	VPS55	P47111	140 aa		3.09	□□□□□ -1.91
MTR10	YOR160W	YML122C	Q03207	126 aa		3.09	□□□□□ -1.91
MTR10	YOR160W	ROX3	P25046	220 aa		3.09	□□□□□ -1.92
MTR10	YOR160W	FSH2	Q05015	223 aa		3.09	□□□□□ -1.92
MTR10	YOR160W	SOM1	Q05676	74 aa		3.09	□□□□□ -1.92
MTR10	YOR160W	BRP1	P53194	125 aa		3.08	□□□□□ -1.92
MTR10	YOR160W	YPL261C	Q08976	102 aa		3.08	□□□□□ -1.92
MTR10	YOR160W	YAL065C	O13511	128 aa		3.08	□□□□□ -1.92
MTR10	YOR160W	PAU24	P38155	120 aa		3.08	□□□□□ -1.92
MTR10	YOR160W	IRC23	Q08416	157 aa		3.08	□□□□□ -1.92
MTR10	YOR160W	TIM22	Q12328	207 aa		3.08	□□□□□ -1.92
MTR10	YOR160W	YOR314W	Q12506	109 aa		3.08	□□□□□ -1.92
MTR10	YOR160W	ATP20	Q12233	115 aa		3.07	□□□□□ -1.92
MTR10	YOR160W	SPI1	P40092	148 aa		3.07	□□□□□ -1.92
MTR10	YOR160W	RPS22B	Q3E7Y3	130 aa	Known RBP	3.07	□□□□□ -1.92
MTR10	YOR160W	YSY6	P38374	65 aa		3.06	□□□□□ -1.92
MTR10	YOR160W	RPL42A	P0CX27	106 aa	Known RBP	3.06	□□□□□ -1.92
MTR10	YOR160W	RPL42B	P0CX28	106 aa	Known RBP	3.06	□□□□□ -1.92
MTR10	YOR160W	ARC15	P40518	154 aa	RIP-Chip data	3.06	□□□□□ -1.92	not detected
MTR10	YOR160W	RGM1	Q00453	211 aa		3.06	□□□□□ -1.92
MTR10	YOR160W	PPT2	Q12036	173 aa		3.06	□□□□□ -1.92
MTR10	YOR160W	OST5	Q92316	86 aa		3.06	□□□□□ -1.92
MTR10	YOR160W	RRT1	P38192	103 aa		3.06	□□□□□ -1.92
MTR10	YOR160W	YDR246W-A	Q3E763	66 aa		3.06	□□□□□ -1.92
MTR10	YOR160W	FPR2	P32472	135 aa		3.05	□□□□□ -1.92
MTR10	YOR160W	YHR173C	P38864	112 aa		3.05	□□□□□ -1.92
MTR10	YOR160W	AIM19	P40502	157 aa		3.05	□□□□□ -1.92
MTR10	YOR160W	YKL065W-A	Q2V2P2	73 aa		3.05	□□□□□ -1.92
MTR10	YOR160W	MPC3	P53311	146 aa		3.05	□□□□□ -1.92
MTR10	YOR160W	YLR162W	Q06235	118 aa		3.05	□□□□□ -1.92
MTR10	YOR160W	YPR053C	Q6Q5F3	151 aa		3.05	□□□□□ -1.92
MTR10	YOR160W	PFY1	P07274	126 aa		3.04	□□□□□ -1.92
MTR10	YOR160W	AUA1	P32450	94 aa		3.04	□□□□□ -1.92
MTR10	YOR160W	LST8	P41318	303 aa		3.04	□□□□□ -1.92
MTR10	YOR160W	YOR381W-A	Q3E804	55 aa		3.04	□□□□□ -1.92
MTR10	YOR160W	YGR121W-A	Q3E816	71 aa		3.04	□□□□□ -1.92
MTR10	YOR160W	YBL059W	P34224	193 aa		3.04	□□□□□ -1.92
MTR10	YOR160W	COX9	P07255	59 aa		3.03	□□□□□ -1.92
MTR10	YOR160W	PAU4	P53427	120 aa		3.03	□□□□□ -1.92
MTR10	YOR160W	PAU1	P0CE88	120 aa		3.03	□□□□□ -1.92
MTR10	YOR160W	PAU14	P0CE89	120 aa		3.03	□□□□□ -1.92
MTR10	YOR160W	PAU6	P0CE90	120 aa		3.03	□□□□□ -1.92
MTR10	YOR160W	PAU18	P0CE91	120 aa		3.03	□□□□□ -1.92
MTR10	YOR160W	PAU8	P0CE92	120 aa		3.03	□□□□□ -1.92
MTR10	YOR160W	PAU11	P0CE93	120 aa		3.03	□□□□□ -1.92
MTR10	YOR160W	PAU13	P38725	120 aa		3.03	□□□□□ -1.92
MTR10	YOR160W	YGL118C	P53132	145 aa		3.03	□□□□□ -1.92
MTR10	YOR160W	PAU10	Q03050	120 aa		3.03	□□□□□ -1.92
MTR10	YOR160W	PAU20	Q08322	120 aa		3.03	□□□□□ -1.92
MTR10	YOR160W	PAU9	Q3E770	120 aa		3.03	□□□□□ -1.92
MTR10	YOR160W	HOR7	Q05827	59 aa		3.03	□□□□□ -1.93
MTR10	YOR160W	YJL197C-A	P0C5P0	93 aa		3.02	□□□□□ -1.93
MTR10	YOR160W	RPS22A	P0C0W1	130 aa	Known RBP	3.01	□□□□□ -1.93
MTR10	YOR160W	YLR146W-A	Q2V2P1	62 aa		3.01	□□□□□ -1.93
MTR10	YOR160W	YER188C-A	P0C0V2	99 aa		3.01	□□□□□ -1.93
MTR10	YOR160W	AIM4	P38305	123 aa	Predicted RBP	3.01	□□□□□ -1.93
MTR10	YOR160W	QCR9	P22289	66 aa		3	□□□□□ -1.93
MTR10	YOR160W	MIG3	P39943	394 aa		3	□□□□□ -1.93
MTR10	YOR160W	YDR114C	Q04597	100 aa		3	□□□□□ -1.93
MTR10	YOR160W	YHR212W-A	P0CX91	67 aa		3	□□□□□ -1.93
MTR10	YOR160W	YBR209W	P38311	105 aa		3	□□□□□ -1.93
MTR10	YOR160W	DCV1	P43595	202 aa		3	□□□□□ -1.93
MTR10	YOR160W	YIL014C-A	Q02598	104 aa		3	□□□□□ -1.93
MTR10	YOR160W	ERI1	P62651	68 aa	Known RBP	2.99	□□□□□ -1.93
MTR10	YOR160W	RPL36B	O14455	100 aa	Known RBP	2.99	□□□□□ -1.93
MTR10	YOR160W	RPL36A	P05745	100 aa	Predicted RBP	2.99	□□□□□ -1.93
MTR10	YOR160W	MPC2	P38857	129 aa		2.98	□□□□□ -1.93
MTR10	YOR160W	MRPL27	P36526	146 aa	Predicted RBP	2.97	□□□□□ -1.93
MTR10	YOR160W	YDL241W	Q07738	123 aa		2.97	□□□□□ -1.93
MTR10	YOR160W	RTC6	O14464	93 aa		2.97	□□□□□ -1.93
MTR10	YOR160W	YEL067C	P39978	195 aa		2.97	□□□□□ -1.93
MTR10	YOR160W	RPR2	P40571	144 aa		2.97	□□□□□ -1.93
MTR10	YOR160W	YMR122C	Q03879	124 aa		2.97	□□□□□ -1.93
MTR10	YOR160W	COA3	Q3E7B2	85 aa		2.97	□□□□□ -1.93
MTR10	YOR160W	CRH1	P53301	507 aa		2.96	□□□□□ -1.93
MTR10	YOR160W	YPR153W	Q06537	140 aa		2.96	□□□□□ -1.93
MTR10	YOR160W	AGA2	P32781	87 aa		2.96	□□□□□ -1.94
MTR10	YOR160W	DSE2	P38844	325 aa		2.96	□□□□□ -1.94

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 84.9 ms