RNA–Protein interactions for RNA: YOR116C

RPO31, Transcript of RNA polymerase III largest subunit C160, yeast

Gene RPO31, Length 4,383 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RPO31	YOR116C	RPL43B	P0CX26	92 aa		3.08	□□□□□ -1.92
RPO31	YOR116C	YGL149W	P53116	101 aa		3.08	□□□□□ -1.92
RPO31	YOR116C	YNL046W	P53956	172 aa		3.08	□□□□□ -1.92
RPO31	YOR116C	USV1	Q12132	391 aa		3.08	□□□□□ -1.92
RPO31	YOR116C	YAR023C	D6VPM8	179 aa		3.07	□□□□□ -1.92
RPO31	YOR116C	YLR156W	P0CE96	114 aa		3.07	□□□□□ -1.92
RPO31	YOR116C	YLR159W	P0CE97	114 aa		3.07	□□□□□ -1.92
RPO31	YOR116C	YLR161W	P0CE98	114 aa		3.07	□□□□□ -1.92
RPO31	YOR116C	YLR157W-D	P0CE99	70 aa		3.07	□□□□□ -1.92
RPO31	YOR116C	YMR317W	Q04893	1140 aa		3.07	□□□□□ -1.92
RPO31	YOR116C	YOL118C	Q08259	102 aa		3.07	□□□□□ -1.92
RPO31	YOR116C	AQY2	P0CD90	149 aa		3.07	□□□□□ -1.92
RPO31	YOR116C	YHL037C	P38733	133 aa		3.07	□□□□□ -1.92
RPO31	YOR116C	MMS2	P53152	137 aa		3.07	□□□□□ -1.92
RPO31	YOR116C	YLR112W	Q12130	139 aa		3.07	□□□□□ -1.92
RPO31	YOR116C	GAT3	Q07928	141 aa		3.07	□□□□□ -1.92
RPO31	YOR116C	TMA10	Q06177	86 aa		3.07	□□□□□ -1.92
RPO31	YOR116C	FYV5	P25585	152 aa		3.06	□□□□□ -1.92
RPO31	YOR116C	MOT3	P54785	490 aa	Known RBP	3.06	□□□□□ -1.92
RPO31	YOR116C	ATP18	P81450	59 aa		3.06	□□□□□ -1.92
RPO31	YOR116C	COX12	Q01519	83 aa		3.06	□□□□□ -1.92
RPO31	YOR116C	YBR255C-A	Q3E776	120 aa		3.06	□□□□□ -1.92
RPO31	YOR116C	TAO3	P40468	2376 aa		3.06	□□□□□ -1.92
RPO31	YOR116C	YER084W	P40057	128 aa		3.06	□□□□□ -1.92
RPO31	YOR116C	YMR175W-A	Q3E766	64 aa		3.06	□□□□□ -1.92
RPO31	YOR116C	RPS28B	P0C0X0	67 aa	Known RBP	3.06	□□□□□ -1.92
RPO31	YOR116C	CTR2	P38865	189 aa		3.06	□□□□□ -1.92
RPO31	YOR116C	PEX22	P39718	180 aa		3.06	□□□□□ -1.92
RPO31	YOR116C	RPS28A	Q3E7X9	67 aa	Predicted RBP	3.06	□□□□□ -1.92
RPO31	YOR116C	YER039C-A	P0CD97	72 aa		3.05	□□□□□ -1.92
RPO31	YOR116C	BLM10	P43583	2143 aa		3.05	□□□□□ -1.92
RPO31	YOR116C	YCR025C	P25352	136 aa		3.05	□□□□□ -1.92
RPO31	YOR116C	EDC2	P40023	145 aa	Predicted RBP	3.05	□□□□□ -1.92
RPO31	YOR116C	YML122C	Q03207	126 aa		3.05	□□□□□ -1.92
RPO31	YOR116C	API2	Q04413	109 aa		3.05	□□□□□ -1.92
RPO31	YOR116C	FAB1	P34756	2278 aa		3.04	□□□□□ -1.92
RPO31	YOR116C	SPS100	P13130	326 aa		3.04	□□□□□ -1.92
RPO31	YOR116C	BEM2	P39960	2167 aa	Known RBP	3.04	□□□□□ -1.92
RPO31	YOR116C	YHL005C	P38752	130 aa		3.04	□□□□□ -1.92
RPO31	YOR116C	PET8	P38921	284 aa		3.04	□□□□□ -1.92
RPO31	YOR116C	YLL006W-A	Q3E814	58 aa		3.04	□□□□□ -1.92
RPO31	YOR116C	RPL36B	O14455	100 aa	Known RBP	3.04	□□□□□ -1.92
RPO31	YOR116C	RPL36A	P05745	100 aa	Predicted RBP	3.04	□□□□□ -1.92
RPO31	YOR116C	MXR2	P25566	168 aa		3.04	□□□□□ -1.92
RPO31	YOR116C	RPR2	P40571	144 aa		3.04	□□□□□ -1.92
RPO31	YOR116C	CYR1	P08678	2026 aa	Known RBP	3.03	□□□□□ -1.92
RPO31	YOR116C	IMP2	P46972	177 aa		3.03	□□□□□ -1.92
RPO31	YOR116C	YER135C	P40082	130 aa		3.03	□□□□□ -1.92
RPO31	YOR116C	SPI1	P40092	148 aa		3.03	□□□□□ -1.92
RPO31	YOR116C	MGR2	Q02889	113 aa		3.03	□□□□□ -1.92
RPO31	YOR116C	RGM1	Q00453	211 aa		3.03	□□□□□ -1.92
RPO31	YOR116C	AIR2	Q12476	344 aa	Known RBP	3.03	□□□□□ -1.93
RPO31	YOR116C	YGR018C	P53211	109 aa		3.02	□□□□□ -1.93
RPO31	YOR116C	SGF11	Q03067	99 aa		3.02	□□□□□ -1.93
RPO31	YOR116C	BRR2	P32639	2163 aa	Known RBP	3.02	□□□□□ -1.93
RPO31	YOR116C	YCR022C	P25620	114 aa		3.02	□□□□□ -1.93
RPO31	YOR116C	YEL067C	P39978	195 aa		3.02	□□□□□ -1.93
RPO31	YOR116C	YEL008W	P40001	126 aa		3.02	□□□□□ -1.93
RPO31	YOR116C	MVB12	P42939	101 aa		3.02	□□□□□ -1.93
RPO31	YOR116C	YFL015C	P43578	164 aa		3.02	□□□□□ -1.93
RPO31	YOR116C	HOR7	Q05827	59 aa		3.02	□□□□□ -1.93
RPO31	YOR116C	YJL127C-B	Q3E828	52 aa		3.02	□□□□□ -1.93
RPO31	YOR116C	ECM19	Q06011	112 aa		3.01	□□□□□ -1.93
RPO31	YOR116C	DDR48	P18899	430 aa	Known RBP	3.01	□□□□□ -1.93
RPO31	YOR116C	AGA1	P32323	725 aa		3.01	□□□□□ -1.93
RPO31	YOR116C	OLI1	P61829	76 aa		3.01	□□□□□ -1.93
RPO31	YOR116C	RPS11A	P0CX47	156 aa	Known RBP	3	□□□□□ -1.93
RPO31	YOR116C	RPS11B	P0CX48	156 aa	Known RBP	3	□□□□□ -1.93
RPO31	YOR116C	YNL190W	P53872	204 aa		3	□□□□□ -1.93
RPO31	YOR116C	YCL048W-A	Q2V2Q2	79 aa		3	□□□□□ -1.93
RPO31	YOR116C	YNL208W	P40159	199 aa	Known RBP	3	□□□□□ -1.93
RPO31	YOR116C	BSC4	P53841	131 aa		3	□□□□□ -1.93
RPO31	YOR116C	YOL160W	Q08321	113 aa		3	□□□□□ -1.93
RPO31	YOR116C	TMC1	Q08422	150 aa	Predicted RBP	3	□□□□□ -1.93
RPO31	YOR116C	YNL146C-A	Q3E7Z1	64 aa		3	□□□□□ -1.93
RPO31	YOR116C	YPR117W	Q06116	2489 aa		3	□□□□□ -1.93
RPO31	YOR116C	YFR035C	P43608	114 aa		3	□□□□□ -1.93
RPO31	YOR116C	YPS5	P53057	165 aa		3	□□□□□ -1.93
RPO31	YOR116C	YGR240C-A	Q3E786	66 aa		3	□□□□□ -1.93
RPO31	YOR116C	YER145C-A	A0A023PYF4	145 aa		2.99	□□□□□ -1.93
RPO31	YOR116C	YJR146W	P47174	117 aa		2.99	□□□□□ -1.93
RPO31	YOR116C	YBR200W-A	Q3E755	54 aa		2.99	□□□□□ -1.93
RPO31	YOR116C	YKR032W	P36127	104 aa		2.99	□□□□□ -1.93
RPO31	YOR116C	YAL065C	O13511	128 aa		2.99	□□□□□ -1.93
RPO31	YOR116C	YHR213W	P0CI67	198 aa		2.99	□□□□□ -1.93
RPO31	YOR116C	DDR2	P89113	61 aa		2.98	□□□□□ -1.93
RPO31	YOR116C	SED1	Q01589	338 aa		2.98	□□□□□ -1.93
RPO31	YOR116C	YDR182W-A	Q3E796	67 aa		2.98	□□□□□ -1.93
RPO31	YOR116C	YBR219C	P38317	127 aa		2.98	□□□□□ -1.93
RPO31	YOR116C	KRE9	P39005	276 aa		2.98	□□□□□ -1.93
RPO31	YOR116C	LIP1	Q03579	150 aa		2.98	□□□□□ -1.93
RPO31	YOR116C	YBR201C-A	Q2V2Q3	67 aa		2.98	□□□□□ -1.93
RPO31	YOR116C	YGR035W-A	Q45U48	73 aa		2.98	□□□□□ -1.93
RPO31	YOR116C	YDL241W	Q07738	123 aa		2.98	□□□□□ -1.93
RPO31	YOR116C	YMR122W-A	Q3E842	84 aa		2.98	□□□□□ -1.93
RPO31	YOR116C	HOT13	P36078	116 aa		2.97	□□□□□ -1.93
RPO31	YOR116C	YJL133C-A	Q3E7A3	74 aa		2.97	□□□□□ -1.93
RPO31	YOR116C	ICS3	P47034	131 aa		2.97	□□□□□ -1.93
RPO31	YOR116C	YDR119W-A	Q2V2P9	66 aa		2.97	□□□□□ -1.93
RPO31	YOR116C	SPT4	P32914	102 aa	Predicted RBP	2.96	□□□□□ -1.93

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