RNA–Protein interactions for RNA: YOL052C-A

DDR2, Transcript of Multi-stress response protein, yeast

Gene DDR2, Length 186 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
DDR2	YOL052C-A	YER181C	P40097	107 aa		7.65	□□□□□ -1.18
DDR2	YOL052C-A	CWP2	P43497	92 aa		7.65	□□□□□ -1.18
DDR2	YOL052C-A	MBF1	O14467	151 aa	Known RBP	7.64	□□□□□ -1.19
DDR2	YOL052C-A	RPL11A	P0C0W9	174 aa	Known RBP	7.64	□□□□□ -1.19
DDR2	YOL052C-A	CDC43	P18898	376 aa		7.64	□□□□□ -1.19
DDR2	YOL052C-A	YNL190W	P53872	204 aa		7.64	□□□□□ -1.19
DDR2	YOL052C-A	VTS1	Q08831	523 aa	Known RBP RIP-Chip data	7.64	□□□□□ -1.19	not detected
DDR2	YOL052C-A	RPL11B	Q3E757	174 aa	Predicted RBP	7.64	□□□□□ -1.19
DDR2	YOL052C-A	PAI3	P01094	68 aa		7.63	□□□□□ -1.19
DDR2	YOL052C-A	YPR170W-B	P0C5R9	85 aa		7.63	□□□□□ -1.19
DDR2	YOL052C-A	YAL064W	P39711	94 aa		7.63	□□□□□ -1.19
DDR2	YOL052C-A	RRT15	Q3E811	62 aa		7.62	□□□□□ -1.19
DDR2	YOL052C-A	YBL081W	P38180	368 aa	Known RBP	7.61	□□□□□ -1.19
DDR2	YOL052C-A	POP7	P38291	140 aa		7.61	□□□□□ -1.19
DDR2	YOL052C-A	UBC11	P52492	156 aa		7.6	□□□□□ -1.19
DDR2	YOL052C-A	YIL102C-A	Q2V2P5	75 aa		7.6	□□□□□ -1.19
DDR2	YOL052C-A	YAR023C	D6VPM8	179 aa		7.59	□□□□□ -1.19
DDR2	YOL052C-A	MID2	P36027	376 aa		7.58	□□□□□ -1.2
DDR2	YOL052C-A	YIA6	P40556	373 aa		7.57	□□□□□ -1.2
DDR2	YOL052C-A	ABF2	Q02486	183 aa		7.57	□□□□□ -1.2
DDR2	YOL052C-A	YLL006W-A	Q3E814	58 aa		7.57	□□□□□ -1.2
DDR2	YOL052C-A	YOR020W-A	Q3E824	90 aa		7.57	□□□□□ -1.2
DDR2	YOL052C-A	NHP2	P32495	156 aa	Predicted RBP	7.56	□□□□□ -1.2
DDR2	YOL052C-A	YHR130C	P38834	111 aa		7.56	□□□□□ -1.2
DDR2	YOL052C-A	LSM6	Q06406	86 aa	Known RBP	7.56	□□□□□ -1.2
DDR2	YOL052C-A	RGM1	Q00453	211 aa		7.55	□□□□□ -1.2
DDR2	YOL052C-A	SMD1	Q02260	146 aa	Predicted RBP	7.55	□□□□□ -1.2
DDR2	YOL052C-A	AQY2	P0CD90	149 aa		7.54	□□□□□ -1.2
DDR2	YOL052C-A	MVB12	P42939	101 aa		7.54	□□□□□ -1.2
DDR2	YOL052C-A	HPA2	Q06592	156 aa		7.54	□□□□□ -1.2
DDR2	YOL052C-A	RPL29	P05747	59 aa	Predicted RBP	7.52	□□□□□ -1.21
DDR2	YOL052C-A	YNL198C	P40166	100 aa		7.52	□□□□□ -1.21
DDR2	YOL052C-A	CPR1	P14832	162 aa	Known RBP	7.51	□□□□□ -1.21
DDR2	YOL052C-A	HYP2	P23301	157 aa	Known RBP	7.51	□□□□□ -1.21
DDR2	YOL052C-A	EOS1	P53938	366 aa		7.51	□□□□□ -1.21
DDR2	YOL052C-A	STF1	P01098	86 aa		7.5	□□□□□ -1.21
DDR2	YOL052C-A	YBL039W-B	P0C268	59 aa		7.5	□□□□□ -1.21
DDR2	YOL052C-A	COX10	P21592	462 aa		7.5	□□□□□ -1.21
DDR2	YOL052C-A	YFL019C	P43576	117 aa		7.5	□□□□□ -1.21
DDR2	YOL052C-A	SNA2	P56508	79 aa		7.5	□□□□□ -1.21
DDR2	YOL052C-A	YPR195C	Q06594	109 aa		7.5	□□□□□ -1.21
DDR2	YOL052C-A	MET32	Q12041	191 aa		7.5	□□□□□ -1.21
DDR2	YOL052C-A	ISU2	Q12056	156 aa		7.49	□□□□□ -1.21
DDR2	YOL052C-A	ANB1	P19211	157 aa		7.47	□□□□□ -1.21
DDR2	YOL052C-A	YDR029W	Q12111	104 aa		7.47	□□□□□ -1.21
DDR2	YOL052C-A	TMA7	Q3E764	64 aa	Known RBP	7.47	□□□□□ -1.21
DDR2	YOL052C-A	MRP10	O75012	95 aa		7.46	□□□□□ -1.22
DDR2	YOL052C-A	AIM19	P40502	157 aa		7.46	□□□□□ -1.22
DDR2	YOL052C-A	KNH1	P50112	268 aa		7.46	□□□□□ -1.22
DDR2	YOL052C-A	YGL041C-B	Q3E750	60 aa		7.46	□□□□□ -1.22
DDR2	YOL052C-A	ARO2	P28777	376 aa	Known RBP	7.45	□□□□□ -1.22
DDR2	YOL052C-A	YPL229W	Q99395	206 aa		7.45	□□□□□ -1.22
DDR2	YOL052C-A	YDR034C-A	P0C289	58 aa		7.43	□□□□□ -1.22
DDR2	YOL052C-A	MRPL24	P36525	258 aa	Predicted RBP	7.43	□□□□□ -1.22
DDR2	YOL052C-A	ICY1	Q04329	127 aa		7.43	□□□□□ -1.22
DDR2	YOL052C-A	IRC21	Q04772	201 aa		7.43	□□□□□ -1.22
DDR2	YOL052C-A	HUR1	P45820	110 aa		7.42	□□□□□ -1.22
DDR2	YOL052C-A	UBC4	P15731	148 aa		7.41	□□□□□ -1.22
DDR2	YOL052C-A	DUT1	P33317	147 aa		7.4	□□□□□ -1.22
DDR2	YOL052C-A	Q0032	Q9ZZX7	96 aa		7.4	□□□□□ -1.22
DDR2	YOL052C-A	ECM12	O13529	151 aa		7.39	□□□□□ -1.23
DDR2	YOL052C-A	RPL26A	P05743	127 aa	Known RBP	7.39	□□□□□ -1.23
DDR2	YOL052C-A	IGD1	P43598	195 aa		7.39	□□□□□ -1.23
DDR2	YOL052C-A	RPL26B	P53221	127 aa	Known RBP	7.39	□□□□□ -1.23
DDR2	YOL052C-A	SMP1	P38128	452 aa		7.38	□□□□□ -1.23
DDR2	YOL052C-A	PEX22	P39718	180 aa		7.38	□□□□□ -1.23
DDR2	YOL052C-A	YNL162W-A	Q3E7A8	72 aa		7.38	□□□□□ -1.23
DDR2	YOL052C-A	YLR236C	A0A023PZG4	107 aa		7.36	□□□□□ -1.23
DDR2	YOL052C-A	YOR034C-A	Q3E735	80 aa		7.35	□□□□□ -1.23
DDR2	YOL052C-A	YLR307C-A	Q3E825	87 aa		7.34	□□□□□ -1.23
DDR2	YOL052C-A	MSA2	P36157	363 aa		7.32	□□□□□ -1.24
DDR2	YOL052C-A	GAT4	P40569	121 aa		7.31	□□□□□ -1.24
DDR2	YOL052C-A	LCL2	Q08045	131 aa		7.31	□□□□□ -1.24
DDR2	YOL052C-A	FYV5	P25585	152 aa		7.29	□□□□□ -1.24
DDR2	YOL052C-A	YGL193C	P53097	103 aa		7.29	□□□□□ -1.24
DDR2	YOL052C-A	YBR230W-A	Q3E762	66 aa		7.28	□□□□□ -1.24
DDR2	YOL052C-A	YNL042W-B	Q3E7Z2	85 aa		7.28	□□□□□ -1.24
DDR2	YOL052C-A	YJL127C-B	Q3E828	52 aa		7.28	□□□□□ -1.24
DDR2	YOL052C-A	DSE2	P38844	325 aa		7.27	□□□□□ -1.25
DDR2	YOL052C-A	YPL257W	Q08974	193 aa		7.26	□□□□□ -1.25
DDR2	YOL052C-A	YER039C-A	P0CD97	72 aa		7.25	□□□□□ -1.25
DDR2	YOL052C-A	SFT1	P43682	97 aa		7.25	□□□□□ -1.25
DDR2	YOL052C-A	MPC3	P53311	146 aa		7.25	□□□□□ -1.25
DDR2	YOL052C-A	YJR107C-A	P0CT86	78 aa		7.23	□□□□□ -1.25
DDR2	YOL052C-A	LCL1	Q02786	101 aa		7.23	□□□□□ -1.25
DDR2	YOL052C-A	SPT4	P32914	102 aa	Predicted RBP	7.22	□□□□□ -1.25
DDR2	YOL052C-A	RPA12	P32529	125 aa	Known RBP	7.21	□□□□□ -1.26
DDR2	YOL052C-A	OST2	P46964	130 aa		7.19	□□□□□ -1.26
DDR2	YOL052C-A	DDR2	P89113	61 aa		7.19	□□□□□ -1.26
DDR2	YOL052C-A	ATX1	P38636	73 aa		7.18	□□□□□ -1.26
DDR2	YOL052C-A	BET1	P22804	142 aa		7.17	□□□□□ -1.26
DDR2	YOL052C-A	TSC3	Q3E790	80 aa		7.17	□□□□□ -1.26
DDR2	YOL052C-A	YLR156W	P0CE96	114 aa		7.16	□□□□□ -1.26
DDR2	YOL052C-A	YLR159W	P0CE97	114 aa		7.16	□□□□□ -1.26
DDR2	YOL052C-A	YLR161W	P0CE98	114 aa		7.16	□□□□□ -1.26
DDR2	YOL052C-A	YCR085W	P25650	117 aa		7.16	□□□□□ -1.26
DDR2	YOL052C-A	PBI2	P0CT04	75 aa	Known RBP	7.13	□□□□□ -1.27
DDR2	YOL052C-A	GIS2	P53849	153 aa	Known RBP RIP-Chip data	7.13	□□□□□ -1.27	not detected
DDR2	YOL052C-A	ATP18	P81450	59 aa		7.13	□□□□□ -1.27
DDR2	YOL052C-A	YGR121W-A	Q3E816	71 aa		7.11	□□□□□ -1.27

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