RNA–Protein interactions for RNA: YMR178W

YMR178W, Transcript of Protein of unknown function, yeast

Gene YMR178W, Length 825 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YMR178W	YMR178W	TY1B-LR1	Q12088	1755 aa	Known RBP	0.36	□□□□□ -2.35
YMR178W	YMR178W	TY1B-GR2	Q12269	1755 aa		0.36	□□□□□ -2.35
YMR178W	YMR178W	TY1B-OL	Q12273	1755 aa		0.36	□□□□□ -2.35
YMR178W	YMR178W	TY1B-DR3	Q99231	1755 aa		0.36	□□□□□ -2.35
YMR178W	YMR178W	RPA12	P32529	125 aa	Known RBP	0.35	□□□□□ -2.35
YMR178W	YMR178W	SHU1	P38751	150 aa		0.35	□□□□□ -2.35
YMR178W	YMR178W	IMP2	P46972	177 aa		0.35	□□□□□ -2.35
YMR178W	YMR178W	SCP1	Q08873	200 aa		0.35	□□□□□ -2.35
YMR178W	YMR178W	HMRA1	P0CY11	126 aa		0.34	□□□□□ -2.36
YMR178W	YMR178W	YIL086C	P40503	102 aa		0.34	□□□□□ -2.36
YMR178W	YMR178W	EMC5	P40540	141 aa		0.34	□□□□□ -2.36
YMR178W	YMR178W	MSL1	P40567	111 aa	Predicted RBP	0.34	□□□□□ -2.36
YMR178W	YMR178W	ICY1	Q04329	127 aa		0.34	□□□□□ -2.36
YMR178W	YMR178W	YOL118C	Q08259	102 aa		0.34	□□□□□ -2.36
YMR178W	YMR178W	YDR029W	Q12111	104 aa		0.34	□□□□□ -2.36
YMR178W	YMR178W	SRB8	P25648	1427 aa		0.33	□□□□□ -2.36
YMR178W	YMR178W	PAU6	P0CE90	120 aa		0.33	□□□□□ -2.36
YMR178W	YMR178W	PAU18	P0CE91	120 aa		0.33	□□□□□ -2.36
YMR178W	YMR178W	RPS11A	P0CX47	156 aa	Known RBP	0.33	□□□□□ -2.36
YMR178W	YMR178W	RPS11B	P0CX48	156 aa	Known RBP	0.33	□□□□□ -2.36
YMR178W	YMR178W	YBL071C	P38185	102 aa		0.33	□□□□□ -2.36
YMR178W	YMR178W	SNU13	P39990	126 aa	Known RBP	0.33	□□□□□ -2.36
YMR178W	YMR178W	POC4	Q12245	148 aa	Predicted RBP	0.33	□□□□□ -2.36
YMR178W	YMR178W	YCR095W-A	Q3E787	52 aa		0.33	□□□□□ -2.36
YMR178W	YMR178W	TY2B-C	P25384	1770 aa		0.32	□□□□□ -2.36
YMR178W	YMR178W	TY2B-DR1	Q12472	1770 aa		0.32	□□□□□ -2.36
YMR178W	YMR178W	RSM18	P40033	138 aa		0.32	□□□□□ -2.36
YMR178W	YMR178W	MRX7	P53869	86 aa		0.32	□□□□□ -2.36
YMR178W	YMR178W	NHP10	Q03435	203 aa		0.32	□□□□□ -2.36
YMR178W	YMR178W	COX19	Q3E731	98 aa		0.32	□□□□□ -2.36
YMR178W	YMR178W	YPL038W-A	Q3E7B4	63 aa		0.32	□□□□□ -2.36
YMR178W	YMR178W	YNR034W-A	Q3E841	98 aa		0.32	□□□□□ -2.36
YMR178W	YMR178W	DOP1	Q03921	1698 aa		0.32	□□□□□ -2.36
YMR178W	YMR178W	ECM12	O13529	151 aa		0.31	□□□□□ -2.36
YMR178W	YMR178W	MRP17	P28778	131 aa		0.31	□□□□□ -2.36
YMR178W	YMR178W	SPC1	P46965	94 aa		0.31	□□□□□ -2.36
YMR178W	YMR178W	PMD1	P32634	1753 aa		0.31	□□□□□ -2.36
YMR178W	YMR178W	FKS3	Q04952	1785 aa		0.31	□□□□□ -2.36
YMR178W	YMR178W	HKR1	P41809	1802 aa		0.3	□□□□□ -2.36
YMR178W	YMR178W	SRB6	P32570	121 aa		0.3	□□□□□ -2.36
YMR178W	YMR178W	MPC2	P38857	129 aa		0.3	□□□□□ -2.36
YMR178W	YMR178W	COX12	Q01519	83 aa		0.3	□□□□□ -2.36
YMR178W	YMR178W	YKL068W-A	Q3E826	78 aa		0.3	□□□□□ -2.36
YMR178W	YMR178W	PAU8	P0CE92	120 aa		0.29	□□□□□ -2.36
YMR178W	YMR178W	PAU11	P0CE93	120 aa		0.29	□□□□□ -2.36
YMR178W	YMR178W	YCR085W	P25650	117 aa		0.29	□□□□□ -2.36
YMR178W	YMR178W	NHP2	P32495	156 aa	Predicted RBP	0.29	□□□□□ -2.36
YMR178W	YMR178W	PAU13	P38725	120 aa		0.29	□□□□□ -2.36
YMR178W	YMR178W	AIM19	P40502	157 aa		0.29	□□□□□ -2.36
YMR178W	YMR178W	PAU4	P53427	120 aa		0.29	□□□□□ -2.36
YMR178W	YMR178W	SNA2	P56508	79 aa		0.29	□□□□□ -2.36
YMR178W	YMR178W	PAU10	Q03050	120 aa		0.29	□□□□□ -2.36
YMR178W	YMR178W	PAU9	Q3E770	120 aa		0.29	□□□□□ -2.36
YMR178W	YMR178W	SUS1	Q6WNK7	96 aa		0.29	□□□□□ -2.36
YMR178W	YMR178W	TY2B-LR1	P0C2J3	1770 aa		0.29	□□□□□ -2.36
YMR178W	YMR178W	TY2B-F	P0CX63	1770 aa		0.29	□□□□□ -2.36
YMR178W	YMR178W	TY2B-GR2	P0CX64	1770 aa		0.29	□□□□□ -2.36
YMR178W	YMR178W	TY2B-DR2	Q03494	1770 aa		0.29	□□□□□ -2.36
YMR178W	YMR178W	TY2B-OR1	Q12113	1770 aa		0.29	□□□□□ -2.36
YMR178W	YMR178W	TY2B-B	Q12491	1770 aa		0.29	□□□□□ -2.36
YMR178W	YMR178W	TY2B-OR2	Q12501	1770 aa		0.29	□□□□□ -2.36
YMR178W	YMR178W	MMS22	Q06164	1454 aa		0.29	□□□□□ -2.36
YMR178W	YMR178W	ARO1	P08566	1588 aa	Known RBP	0.28	□□□□□ -2.36
YMR178W	YMR178W	TY2B-DR3	Q07791	1770 aa	Known RBP	0.28	□□□□□ -2.36
YMR178W	YMR178W	YBR292C	P38357	123 aa		0.28	□□□□□ -2.36
YMR178W	YMR178W	CWP2	P43497	92 aa		0.28	□□□□□ -2.36
YMR178W	YMR178W	SIN3	P22579	1536 aa		0.28	□□□□□ -2.37
YMR178W	YMR178W	RRP5	Q05022	1729 aa	Known RBP	0.27	□□□□□ -2.37
YMR178W	YMR178W	YHR214C-D	P0CX93	97 aa		0.27	□□□□□ -2.37
YMR178W	YMR178W	BSC4	P53841	131 aa		0.27	□□□□□ -2.37
YMR178W	YMR178W	YNL190W	P53872	204 aa		0.27	□□□□□ -2.37
YMR178W	YMR178W	YOR343C	Q12484	108 aa		0.27	□□□□□ -2.37
YMR178W	YMR178W	YPR145C-A	Q2V2P0	78 aa		0.27	□□□□□ -2.37
YMR178W	YMR178W	YIL156W-B	Q2V2P4	73 aa		0.27	□□□□□ -2.37
YMR178W	YMR178W	YDR119W-A	Q2V2P9	66 aa		0.27	□□□□□ -2.37
YMR178W	YMR178W	YNL042W-B	Q3E7Z2	85 aa		0.27	□□□□□ -2.37
YMR178W	YMR178W	BPH1	P25356	2167 aa		0.27	□□□□□ -2.37
YMR178W	YMR178W	NUP159	P40477	1460 aa		0.27	□□□□□ -2.37
YMR178W	YMR178W	DNF1	P32660	1571 aa		0.27	□□□□□ -2.37
YMR178W	YMR178W	APC1	P53886	1748 aa		0.27	□□□□□ -2.37
YMR178W	YMR178W	PAU1	P0CE88	120 aa		0.26	□□□□□ -2.37
YMR178W	YMR178W	PAU14	P0CE89	120 aa		0.26	□□□□□ -2.37
YMR178W	YMR178W	PDX3	P38075	228 aa	Known RBP	0.26	□□□□□ -2.37
YMR178W	YMR178W	PAU20	Q08322	120 aa		0.26	□□□□□ -2.37
YMR178W	YMR178W	YGR121W-A	Q3E816	71 aa		0.26	□□□□□ -2.37
YMR178W	YMR178W	YMR122W-A	Q3E842	84 aa		0.26	□□□□□ -2.37
YMR178W	YMR178W	NOP10	Q6Q547	58 aa	Predicted RBP	0.26	□□□□□ -2.37
YMR178W	YMR178W	TCB3	Q03640	1545 aa	Known RBP	0.26	□□□□□ -2.37
YMR178W	YMR178W	RPO21	P04050	1733 aa	Known RBP	0.26	□□□□□ -2.37
YMR178W	YMR178W	YDL022C-A	P0C5L6	82 aa		0.25	□□□□□ -2.37
YMR178W	YMR178W	TOM6	P33448	61 aa		0.25	□□□□□ -2.37
YMR178W	YMR178W	PAU23	Q07987	124 aa		0.25	□□□□□ -2.37
YMR178W	YMR178W	PAU17	Q12370	124 aa		0.25	□□□□□ -2.37
YMR178W	YMR178W	YOR314W	Q12506	109 aa		0.25	□□□□□ -2.37
YMR178W	YMR178W	YBR201C-A	Q2V2Q3	67 aa		0.25	□□□□□ -2.37
YMR178W	YMR178W	YDR381C-A	Q3E6R5	114 aa		0.25	□□□□□ -2.37
YMR178W	YMR178W	MHF2	Q3E829	80 aa		0.25	□□□□□ -2.37
YMR178W	YMR178W	Q0032	Q9ZZX7	96 aa		0.25	□□□□□ -2.37
YMR178W	YMR178W	YAL065C	O13511	128 aa		0.24	□□□□□ -2.37
YMR178W	YMR178W	RPC10	P40422	70 aa		0.24	□□□□□ -2.37

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 46.3 ms