RNA–Protein interactions for RNA: YLL066C

YLL066C, Transcript of Putative Y' element ATP-dependent helicase, yeast

Gene YLL066C, Length 3,618 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YLL066C	YLL066C	YIL059C	P40520	121 aa		5.08	□□□□□ -1.6
YLL066C	YLL066C	HUR1	P45820	110 aa		5.08	□□□□□ -1.6
YLL066C	YLL066C	YPL038W-A	Q3E7B4	63 aa		5.08	□□□□□ -1.6
YLL066C	YLL066C	MRPL24	P36525	258 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
YLL066C	YLL066C	YBR209W	P38311	105 aa		5.07	□□□□□ -1.6
YLL066C	YLL066C	YER135C	P40082	130 aa		5.07	□□□□□ -1.6
YLL066C	YLL066C	SVP26	P38869	228 aa		5.06	□□□□□ -1.6
YLL066C	YLL066C	YFR035C	P43608	114 aa		5.06	□□□□□ -1.6
YLL066C	YLL066C	PPT2	Q12036	173 aa		5.06	□□□□□ -1.6
YLL066C	YLL066C	YOR034C-A	Q3E735	80 aa		5.06	□□□□□ -1.6
YLL066C	YLL066C	YER145C-A	A0A023PYF4	145 aa		5.06	□□□□□ -1.6
YLL066C	YLL066C	RRT13	P40042	185 aa		5.06	□□□□□ -1.6
YLL066C	YLL066C	YNL146C-A	Q3E7Z1	64 aa		5.06	□□□□□ -1.6
YLL066C	YLL066C	YER039C-A	P0CD97	72 aa		5.06	□□□□□ -1.6
YLL066C	YLL066C	QCR8	P08525	94 aa		5.05	□□□□□ -1.6
YLL066C	YLL066C	RAD6	P06104	172 aa		5.05	□□□□□ -1.6
YLL066C	YLL066C	MPC2	P38857	129 aa		5.05	□□□□□ -1.6
YLL066C	YLL066C	RGM1	Q00453	211 aa		5.05	□□□□□ -1.6
YLL066C	YLL066C	ECM12	O13529	151 aa		5.05	□□□□□ -1.6
YLL066C	YLL066C	SHH4	Q06236	168 aa		5.04	□□□□□ -1.6
YLL066C	YLL066C	UBC5	P15732	148 aa		5.04	□□□□□ -1.6
YLL066C	YLL066C	YHL018W	P38744	120 aa	Predicted RBP	5.04	□□□□□ -1.6
YLL066C	YLL066C	SIM1	P40472	476 aa		5.03	□□□□□ -1.6
YLL066C	YLL066C	ARC15	P40518	154 aa	RIP-Chip data	5.03	□□□□□ -1.6	not detected
YLL066C	YLL066C	MIG3	P39943	394 aa		5.03	□□□□□ -1.6
YLL066C	YLL066C	RPL2A	P0CX45	254 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
YLL066C	YLL066C	RPL2B	P0CX46	254 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
YLL066C	YLL066C	TOM6	P33448	61 aa		5.02	□□□□□ -1.61
YLL066C	YLL066C	YNL194C	P40169	301 aa		5.02	□□□□□ -1.61
YLL066C	YLL066C	EMC6	Q12431	108 aa		5.01	□□□□□ -1.61
YLL066C	YLL066C	YMR295C	Q03559	197 aa		5.01	□□□□□ -1.61
YLL066C	YLL066C	YMR244W	Q04018	355 aa		5	□□□□□ -1.61
YLL066C	YLL066C	SPG4	Q04438	115 aa		5	□□□□□ -1.61
YLL066C	YLL066C	YBR219C	P38317	127 aa		4.99	□□□□□ -1.61
YLL066C	YLL066C	YSY6	P38374	65 aa		4.99	□□□□□ -1.61
YLL066C	YLL066C	TOS8	P53147	276 aa		4.99	□□□□□ -1.61
YLL066C	YLL066C	YLR236C	A0A023PZG4	107 aa		4.99	□□□□□ -1.61
YLL066C	YLL066C	UBC11	P52492	156 aa		4.99	□□□□□ -1.61
YLL066C	YLL066C	COX14	P39103	70 aa		4.98	□□□□□ -1.61
YLL066C	YLL066C	MRPS8	Q03799	155 aa		4.98	□□□□□ -1.61
YLL066C	YLL066C	YLR122C	Q12312	125 aa		4.98	□□□□□ -1.61
YLL066C	YLL066C	EDC1	P53080	175 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
YLL066C	YLL066C	RPR2	P40571	144 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YLL066C	YLL066C	YDR246W-A	Q3E763	66 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YLL066C	YLL066C	YCR050C	P25630	102 aa		4.96	□□□□□ -1.61
YLL066C	YLL066C	HAL1	Q01766	294 aa		4.96	□□□□□ -1.61
YLL066C	YLL066C	YLR285C-A	Q3E771	56 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YLL066C	YLL066C	YJR107C-A	P0CT86	78 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YLL066C	YLL066C	IRC21	Q04772	201 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YLL066C	YLL066C	TAR1	Q8TGM6	124 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YLL066C	YLL066C	YER187W	P40102	141 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YLL066C	YLL066C	YLL006W-A	Q3E814	58 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YLL066C	YLL066C	YOR020W-A	Q3E824	90 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YLL066C	YLL066C	HOR7	Q05827	59 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YLL066C	YLL066C	GAT4	P40569	121 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YLL066C	YLL066C	VAM10	Q08474	114 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YLL066C	YLL066C	YLR156W	P0CE96	114 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YLL066C	YLL066C	YLR159W	P0CE97	114 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YLL066C	YLL066C	YLR161W	P0CE98	114 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YLL066C	YLL066C	YHR212W-A	P0CX91	67 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YLL066C	YLL066C	PMP3	P87284	55 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YLL066C	YLL066C	STF1	P01098	86 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YLL066C	YLL066C	MPC3	P53311	146 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YLL066C	YLL066C	YLR281C	Q05863	155 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YLL066C	YLL066C	YMR175W-A	Q3E766	64 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YLL066C	YLL066C	SBH1	P52870	82 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YLL066C	YLL066C	RTG1	P32607	177 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YLL066C	YLL066C	RPS11A	P0CX47	156 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
YLL066C	YLL066C	RPS11B	P0CX48	156 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
YLL066C	YLL066C	YBR144C	P34215	104 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YLL066C	YLL066C	RPL11A	P0C0W9	174 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
YLL066C	YLL066C	ATP18	P81450	59 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YLL066C	YLL066C	YAR029W	P39549	74 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YLL066C	YLL066C	RPL11B	Q3E757	174 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
YLL066C	YLL066C	YAL065C	O13511	128 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YLL066C	YLL066C	YFR009W-A	P0C5M9	85 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YLL066C	YLL066C	YPS5	P53057	165 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YLL066C	YLL066C	ALG13	P53178	202 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YLL066C	YLL066C	YRA2	P36036	203 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.86	□□□□□ -1.63	not detected
YLL066C	YLL066C	ICY1	Q04329	127 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YLL066C	YLL066C	ATP20	Q12233	115 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YLL066C	YLL066C	RPS28B	P0C0X0	67 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
YLL066C	YLL066C	RPS28A	Q3E7X9	67 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
YLL066C	YLL066C	YBR121C-A	P0C5L4	52 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YLL066C	YLL066C	AIM4	P38305	123 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
YLL066C	YLL066C	ERI1	P62651	68 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
YLL066C	YLL066C	YMR122W-A	Q3E842	84 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YLL066C	YLL066C	BET1	P22804	142 aa		4.84	□□□□□ -1.64
YLL066C	YLL066C	RPL38	P49167	78 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.64
YLL066C	YLL066C	KSH1	Q8TGJ3	72 aa		4.84	□□□□□ -1.64
YLL066C	YLL066C	RSM19	P53733	91 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
YLL066C	YLL066C	TDA8	Q6B2U8	126 aa		4.82	□□□□□ -1.64
YLL066C	YLL066C	UBC4	P15731	148 aa		4.82	□□□□□ -1.64
YLL066C	YLL066C	RSM18	P40033	138 aa		4.82	□□□□□ -1.64
YLL066C	YLL066C	NOP10	Q6Q547	58 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
YLL066C	YLL066C	RPL29	P05747	59 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
YLL066C	YLL066C	ERG28	P40030	148 aa		4.81	□□□□□ -1.64
YLL066C	YLL066C	CRC1	Q12289	327 aa		4.8	□□□□□ -1.64
YLL066C	YLL066C	KTI11	Q3E840	82 aa		4.8	□□□□□ -1.64
YLL066C	YLL066C	YKL183C-A	Q3E765	70 aa		4.79	□□□□□ -1.64

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 48.5 ms