RNA–Protein interactions for RNA: YKR065C

PAM17, Transcript of Constituent of the TIM23 complex, yeast

Gene PAM17, Length 594 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PAM17	YKR065C	YBR219C	P38317	127 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PAM17	YKR065C	YPL073C	P40323	161 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PAM17	YKR065C	YDL085C-A	Q3E7B7	68 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PAM17	YKR065C	RRT15	Q3E811	62 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PAM17	YKR065C	IGO2	Q9P305	131 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PAM17	YKR065C	YAL065C	O13511	128 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PAM17	YKR065C	RPL18A	P0CX49	186 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PAM17	YKR065C	RPL18B	P0CX50	186 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PAM17	YKR065C	RPF1	P38805	295 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PAM17	YKR065C	YPR195C	Q06594	109 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PAM17	YKR065C	YDL157C	Q12082	118 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PAM17	YKR065C	SCS22	Q6Q595	175 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PAM17	YKR065C	YDR034C-A	P0C289	58 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PAM17	YKR065C	YAL064W	P39711	94 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PAM17	YKR065C	GAT4	P40569	121 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PAM17	YKR065C	YGL041C-B	Q3E750	60 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PAM17	YKR065C	SNA2	P56508	79 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PAM17	YKR065C	ABF2	Q02486	183 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PAM17	YKR065C	YDR029W	Q12111	104 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PAM17	YKR065C	MBF1	O14467	151 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PAM17	YKR065C	SAE3	P89114	91 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PAM17	YKR065C	YML079W	Q03629	201 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PAM17	YKR065C	NAT5	Q08689	176 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PAM17	YKR065C	AQY2	P0CD90	149 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PAM17	YKR065C	OXA1	P39952	402 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PAM17	YKR065C	PAU23	Q07987	124 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PAM17	YKR065C	PAU17	Q12370	124 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PAM17	YKR065C	MDN1	Q12019	4910 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PAM17	YKR065C	CWP2	P43497	92 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PAM17	YKR065C	SMD1	Q02260	146 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PAM17	YKR065C	SCM4	P32564	187 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PAM17	YKR065C	YBL081W	P38180	368 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PAM17	YKR065C	YDL022C-A	P0C5L6	82 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PAM17	YKR065C	CWC27	Q02770	301 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PAM17	YKR065C	STF1	P01098	86 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PAM17	YKR065C	RPL28	P02406	149 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PAM17	YKR065C	YBL039W-B	P0C268	59 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PAM17	YKR065C	UGX2	P32772	223 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PAM17	YKR065C	MVB12	P42939	101 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PAM17	YKR065C	MRPS12	P53732	153 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PAM17	YKR065C	YOR020W-A	Q3E824	90 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PAM17	YKR065C	ECM12	O13529	151 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PAM17	YKR065C	YFL019C	P43576	117 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PAM17	YKR065C	ELC1	Q03071	99 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PAM17	YKR065C	RPL29	P05747	59 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PAM17	YKR065C	GLC8	P41818	229 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PAM17	YKR065C	YNR077C	P53758	84 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PAM17	YKR065C	LCL1	Q02786	101 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PAM17	YKR065C	LCL2	Q08045	131 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PAM17	YKR065C	YLR363W-A	Q3E747	85 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PAM17	YKR065C	Q0032	Q9ZZX7	96 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PAM17	YKR065C	YEL067C	P39978	195 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PAM17	YKR065C	YIA6	P40556	373 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PAM17	YKR065C	YLL006W-A	Q3E814	58 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PAM17	YKR065C	RPL26A	P05743	127 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
PAM17	YKR065C	COX10	P21592	462 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PAM17	YKR065C	RPL26B	P53221	127 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
PAM17	YKR065C	HPA2	Q06592	156 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PAM17	YKR065C	YHR130C	P38834	111 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PAM17	YKR065C	PEX22	P39718	180 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PAM17	YKR065C	YER181C	P40097	107 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PAM17	YKR065C	RGM1	Q00453	211 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PAM17	YKR065C	AIM19	P40502	157 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PAM17	YKR065C	YKL023C-A	Q2V2P3	75 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PAM17	YKR065C	LSO2	Q3E772	92 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
PAM17	YKR065C	UBC4	P15731	148 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PAM17	YKR065C	POP7	P38291	140 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PAM17	YKR065C	YFR057W	P43625	151 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PAM17	YKR065C	YNL190W	P53872	204 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PAM17	YKR065C	YLR307C-A	Q3E825	87 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PAM17	YKR065C	PAI3	P01094	68 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PAM17	YKR065C	YER039C-A	P0CD97	72 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PAM17	YKR065C	SMP1	P38128	452 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PAM17	YKR065C	NHP2	P32495	156 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
PAM17	YKR065C	KNH1	P50112	268 aa		4.78	□□□□□ -1.64
PAM17	YKR065C	YLR296W	Q05898	108 aa		4.78	□□□□□ -1.64
PAM17	YKR065C	YDL012C	Q12489	107 aa		4.78	□□□□□ -1.64
PAM17	YKR065C	MID2	P36027	376 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PAM17	YKR065C	YGL193C	P53097	103 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PAM17	YKR065C	EOS1	P53938	366 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PAM17	YKR065C	ICY1	Q04329	127 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PAM17	YKR065C	IRC21	Q04772	201 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PAM17	YKR065C	LSM6	Q06406	86 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
PAM17	YKR065C	IGD1	P43598	195 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PAM17	YKR065C	YBL112C	Q3E7Y4	105 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PAM17	YKR065C	MRPL24	P36525	258 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
PAM17	YKR065C	MMS2	P53152	137 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PAM17	YKR065C	SFT1	P43682	97 aa		4.72	□□□□□ -1.65
PAM17	YKR065C	YNL042W-B	Q3E7Z2	85 aa		4.72	□□□□□ -1.65
PAM17	YKR065C	SPT4	P32914	102 aa	Predicted RBP	4.71	□□□□□ -1.66
PAM17	YKR065C	YIL102C-A	Q2V2P5	75 aa		4.71	□□□□□ -1.66
PAM17	YKR065C	YLR236C	A0A023PZG4	107 aa		4.7	□□□□□ -1.66
PAM17	YKR065C	FYV5	P25585	152 aa		4.7	□□□□□ -1.66
PAM17	YKR065C	HUR1	P45820	110 aa		4.7	□□□□□ -1.66
PAM17	YKR065C	YJR085C	P47131	105 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
PAM17	YKR065C	YPL257W	Q08974	193 aa		4.7	□□□□□ -1.66
PAM17	YKR065C	YJL127C-B	Q3E828	52 aa		4.69	□□□□□ -1.66
PAM17	YKR065C	DDR2	P89113	61 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PAM17	YKR065C	YBR230W-A	Q3E762	66 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PAM17	YKR065C	YGR121W-A	Q3E816	71 aa		4.67	□□□□□ -1.66

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