RNA–Protein interactions for RNA: YER128W

VFA1, Transcript of Protein that interacts with Vps4p and has a role in vacuolar sorting, yeastyeast

Gene VFA1, Length 612 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VFA1YER128W RPL26BP53221 127 aaKnown RBP2.59□□□□□ -1.99
VFA1YER128W YNR077CP53758 84 aa2.59□□□□□ -1.99
VFA1YER128W LIP1Q03579 150 aa2.59□□□□□ -1.99
VFA1YER128W IRC19Q07843 230 aa2.59□□□□□ -1.99
VFA1YER128W YOR020W-AQ3E824 90 aa2.59□□□□□ -1.99
VFA1YER128W RPS14AP06367 137 aaKnown RBP2.58□□□□□ -2
VFA1YER128W RPS23AP0CX29 145 aaKnown RBP2.58□□□□□ -2
VFA1YER128W RPS23BP0CX30 145 aa2.58□□□□□ -2
VFA1YER128W ERG2P32352 222 aa2.58□□□□□ -2
VFA1YER128W SRX1P36077 127 aa2.58□□□□□ -2
VFA1YER128W MSA2P36157 363 aa2.58□□□□□ -2
VFA1YER128W KRE9P39005 276 aa2.58□□□□□ -2
VFA1YER128W RPS14BP39516 138 aaKnown RBP2.58□□□□□ -2
VFA1YER128W RGM1Q00453 211 aa2.58□□□□□ -2
VFA1YER128W MRPS8Q03799 155 aa2.58□□□□□ -2
VFA1YER128W SOM1Q05676 74 aa2.58□□□□□ -2
VFA1YER128W YOL029CQ08187 201 aa2.58□□□□□ -2
VFA1YER128W VPS68Q12016 184 aa2.58□□□□□ -2
VFA1YER128W YLR285C-AQ3E771 56 aa2.58□□□□□ -2
VFA1YER128W COA3Q3E7B2 85 aa2.58□□□□□ -2
VFA1YER128W YAR023CD6VPM8 179 aa2.57□□□□□ -2
VFA1YER128W ATP15P21306 62 aa2.57□□□□□ -2
VFA1YER128W RRT1P38192 103 aa2.57□□□□□ -2
VFA1YER128W YEL073CP39974 107 aa2.57□□□□□ -2
VFA1YER128W YEL067CP39978 195 aa2.57□□□□□ -2
VFA1YER128W SED1Q01589 338 aa2.57□□□□□ -2
VFA1YER128W YMR122CQ03879 124 aa2.57□□□□□ -2
VFA1YER128W FYV12Q08559 129 aa2.57□□□□□ -2
VFA1YER128W YPR011CQ12251 326 aa2.57□□□□□ -2
VFA1YER128W YDR182W-AQ3E796 67 aa2.57□□□□□ -2
VFA1YER128W YLR156WP0CE96 114 aa2.56□□□□□ -2
VFA1YER128W YLR159WP0CE97 114 aa2.56□□□□□ -2
VFA1YER128W YLR161WP0CE98 114 aa2.56□□□□□ -2
VFA1YER128W YCR041WP37265 110 aa2.56□□□□□ -2
VFA1YER128W TVP23P38962 199 aa2.56□□□□□ -2
VFA1YER128W MIG3P39943 394 aa2.56□□□□□ -2
VFA1YER128W YLR194CQ05777 254 aa2.56□□□□□ -2
VFA1YER128W TMC1Q08422 150 aaPredicted RBP2.56□□□□□ -2
VFA1YER128W PRM7Q12459 698 aa2.56□□□□□ -2
VFA1YER128W YGR035W-AQ45U48 73 aa2.56□□□□□ -2
VFA1YER128W CDC39P25655 2108 aaKnown RBP2.56□□□□□ -2
VFA1YER128W RPL36BO14455 100 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
VFA1YER128W RPL36AP05745 100 aaPredicted RBP2.55□□□□□ -2
VFA1YER128W YBL071CP38185 102 aa2.55□□□□□ -2
VFA1YER128W YPR153WQ06537 140 aa2.55□□□□□ -2
VFA1YER128W YOR192C-CQ3E736 78 aa2.55□□□□□ -2
VFA1YER128W FIG2P25653 1609 aa2.54□□□□□ -2
VFA1YER128W RPR2P40571 144 aa2.54□□□□□ -2
VFA1YER128W YHL037CP38733 133 aa2.53□□□□□ -2
VFA1YER128W ARC15P40518 154 aaRIP-Chip data2.53□□□□□ -2not detected
VFA1YER128W IRC21Q04772 201 aa2.53□□□□□ -2
VFA1YER128W YPL278CQ08990 100 aa2.53□□□□□ -2
VFA1YER128W HMRA2P0CY13 119 aa2.52□□□□□ -2.01
VFA1YER128W YIR020CP40575 100 aa2.52□□□□□ -2.01
VFA1YER128W REE1P40893 198 aa2.52□□□□□ -2.01
VFA1YER128W EDC1P53080 175 aaPredicted RBP2.52□□□□□ -2.01
VFA1YER128W YGL149WP53116 101 aa2.52□□□□□ -2.01
VFA1YER128W MGR2Q02889 113 aa2.52□□□□□ -2.01
VFA1YER128W HUG1Q6Q5K6 68 aa2.52□□□□□ -2.01
VFA1YER128W YDL022C-AP0C5L6 82 aa2.51□□□□□ -2.01
VFA1YER128W HSP150P32478 413 aa2.51□□□□□ -2.01
VFA1YER128W SNA2P56508 79 aa2.51□□□□□ -2.01
VFA1YER128W YCR095W-AQ3E787 52 aa2.51□□□□□ -2.01
VFA1YER128W YPR108W-AQ3E7B3 70 aa2.51□□□□□ -2.01
VFA1YER128W NOP10Q6Q547 58 aaPredicted RBP2.51□□□□□ -2.01
VFA1YER128W YER145C-AA0A023PYF4 145 aa2.5□□□□□ -2.01
VFA1YER128W RPS30AP0CX33 63 aaKnown RBP2.5□□□□□ -2.01
VFA1YER128W RPS30BP0CX34 63 aaKnown RBP2.5□□□□□ -2.01
VFA1YER128W YKR032WP36127 104 aa2.5□□□□□ -2.01
VFA1YER128W COX14P39103 70 aa2.5□□□□□ -2.01
VFA1YER128W SPC1P46965 94 aa2.5□□□□□ -2.01
VFA1YER128W TOM7P53507 60 aa2.5□□□□□ -2.01
VFA1YER128W CCW14O13547 238 aa2.49□□□□□ -2.01
VFA1YER128W YJL197C-AP0C5P0 93 aa2.49□□□□□ -2.01
VFA1YER128W SHU1P38751 150 aa2.49□□□□□ -2.01
VFA1YER128W TOS6P48560 102 aa2.49□□□□□ -2.01
VFA1YER128W YMR244WQ04018 355 aa2.49□□□□□ -2.01
VFA1YER128W FIT2Q08906 153 aa2.49□□□□□ -2.01
VFA1YER128W MRPL38P35996 138 aaPredicted RBP2.48□□□□□ -2.01
VFA1YER128W COX23P38824 151 aa2.48□□□□□ -2.01
VFA1YER128W HUA1P40325 198 aa2.48□□□□□ -2.01
VFA1YER128W MRX7P53869 86 aa2.48□□□□□ -2.01
VFA1YER128W DAD4P69851 72 aa2.48□□□□□ -2.01
VFA1YER128W YDR010CQ12426 110 aa2.48□□□□□ -2.01
VFA1YER128W YOL166W-AQ8TGJ1 51 aa2.48□□□□□ -2.01
VFA1YER128W YJR107C-AP0CT86 78 aa2.47□□□□□ -2.01
VFA1YER128W BSC4P53841 131 aa2.47□□□□□ -2.01
VFA1YER128W API2Q04413 109 aa2.47□□□□□ -2.01
VFA1YER128W YDL241WQ07738 123 aa2.47□□□□□ -2.01
VFA1YER128W YIL156W-BQ2V2P4 73 aa2.47□□□□□ -2.01
VFA1YER128W HUB1Q6Q546 73 aa2.47□□□□□ -2.01
VFA1YER128W RTC6O14464 93 aa2.46□□□□□ -2.02
VFA1YER128W POR2P40478 281 aa2.46□□□□□ -2.02
VFA1YER128W MRPS12P53732 153 aa2.46□□□□□ -2.02
VFA1YER128W YNL190WP53872 204 aa2.46□□□□□ -2.02
VFA1YER128W YMR321CQ04898 105 aa2.46□□□□□ -2.02
VFA1YER128W YOR032W-AQ8TGS1 66 aa2.46□□□□□ -2.02
VFA1YER128W YNL208WP40159 199 aaKnown RBP2.45□□□□□ -2.02
VFA1YER128W YOR008C-AQ3E7B9 74 aa2.45□□□□□ -2.02
VFA1YER128W QCR8P08525 94 aa2.44□□□□□ -2.02
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