RNA–Protein interactions for RNA: YDR457W

TOM1, Transcript of E3 ubiquitin ligase of the hect-domain class, yeast

Gene TOM1, Length 9,807 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TOM1	YDR457W	YMR122W-A	Q3E842	84 aa		2.17	□□□□□ -2.06
TOM1	YDR457W	MIC10	Q96VH5	97 aa		2.17	□□□□□ -2.06
TOM1	YDR457W	YHR213W	P0CI67	198 aa		2.17	□□□□□ -2.06
TOM1	YDR457W	MRX7	P53869	86 aa		2.17	□□□□□ -2.06
TOM1	YDR457W	COX12	Q01519	83 aa		2.17	□□□□□ -2.06
TOM1	YDR457W	YCR043C	P25361	127 aa		2.17	□□□□□ -2.06
TOM1	YDR457W	YGR018C	P53211	109 aa		2.17	□□□□□ -2.06
TOM1	YDR457W	YDR034C-A	P0C289	58 aa		2.17	□□□□□ -2.06
TOM1	YDR457W	CPR1	P14832	162 aa	Known RBP	2.17	□□□□□ -2.06
TOM1	YDR457W	YDL241W	Q07738	123 aa		2.17	□□□□□ -2.06
TOM1	YDR457W	YMR105W-A	Q8TGS8	64 aa		2.17	□□□□□ -2.06
TOM1	YDR457W	RPS30A	P0CX33	63 aa	Known RBP	2.16	□□□□□ -2.06
TOM1	YDR457W	RPS30B	P0CX34	63 aa	Known RBP	2.16	□□□□□ -2.06
TOM1	YDR457W	YOL085C	Q99345	113 aa		2.16	□□□□□ -2.06
TOM1	YDR457W	YOR034C-A	Q3E735	80 aa		2.16	□□□□□ -2.06
TOM1	YDR457W	MIG3	P39943	394 aa		2.16	□□□□□ -2.06
TOM1	YDR457W	RPL33B	P41056	107 aa	Known RBP	2.16	□□□□□ -2.06
TOM1	YDR457W	YPL278C	Q08990	100 aa		2.16	□□□□□ -2.06
TOM1	YDR457W	YPL038W-A	Q3E7B4	63 aa		2.16	□□□□□ -2.06
TOM1	YDR457W	YMR244W	Q04018	355 aa		2.16	□□□□□ -2.06
TOM1	YDR457W	COX8	P04039	78 aa		2.16	□□□□□ -2.06
TOM1	YDR457W	YGL034C	P53186	121 aa		2.16	□□□□□ -2.06
TOM1	YDR457W	YPR013C	Q12145	317 aa		2.15	□□□□□ -2.07
TOM1	YDR457W	AIR2	Q12476	344 aa	Known RBP	2.15	□□□□□ -2.07
TOM1	YDR457W	YJL009W	P47078	108 aa		2.15	□□□□□ -2.07
TOM1	YDR457W	YCR041W	P37265	110 aa		2.15	□□□□□ -2.07
TOM1	YDR457W	YNL122C	P53921	115 aa	Predicted RBP	2.15	□□□□□ -2.07
TOM1	YDR457W	MGR2	Q02889	113 aa		2.14	□□□□□ -2.07
TOM1	YDR457W	YDR274C	P87283	123 aa		2.14	□□□□□ -2.07
TOM1	YDR457W	LCL1	Q02786	101 aa		2.14	□□□□□ -2.07
TOM1	YDR457W	COX14	P39103	70 aa		2.14	□□□□□ -2.07
TOM1	YDR457W	YMR001C-A	Q8TGS9	76 aa		2.14	□□□□□ -2.07
TOM1	YDR457W	YAR064W	P39563	99 aa		2.14	□□□□□ -2.07
TOM1	YDR457W	YCR025C	P25352	136 aa		2.14	□□□□□ -2.07
TOM1	YDR457W	YAL065C	O13511	128 aa		2.13	□□□□□ -2.07
TOM1	YDR457W	COX23	P38824	151 aa		2.13	□□□□□ -2.07
TOM1	YDR457W	IGD1	P43598	195 aa		2.13	□□□□□ -2.07
TOM1	YDR457W	YOR029W	Q12243	111 aa		2.13	□□□□□ -2.07
TOM1	YDR457W	RPC10	P40422	70 aa		2.13	□□□□□ -2.07
TOM1	YDR457W	YDR182W-A	Q3E796	67 aa		2.13	□□□□□ -2.07
TOM1	YDR457W	MIX17	Q03667	156 aa		2.13	□□□□□ -2.07
TOM1	YDR457W	YBR230W-A	Q3E762	66 aa		2.12	□□□□□ -2.07
TOM1	YDR457W	YBL008W-A	Q3E821	79 aa		2.12	□□□□□ -2.07
TOM1	YDR457W	ATP17	Q06405	101 aa		2.12	□□□□□ -2.07
TOM1	YDR457W	DNF3	Q12674	1656 aa		2.12	□□□□□ -2.07
TOM1	YDR457W	MRP10	O75012	95 aa		2.12	□□□□□ -2.07
TOM1	YDR457W	QCR10	P37299	77 aa		2.12	□□□□□ -2.07
TOM1	YDR457W	RPS28B	P0C0X0	67 aa	Known RBP	2.12	□□□□□ -2.07
TOM1	YDR457W	RPS28A	Q3E7X9	67 aa	Predicted RBP	2.12	□□□□□ -2.07
TOM1	YDR457W	YOL097W-A	Q3E7Y9	61 aa		2.12	□□□□□ -2.07
TOM1	YDR457W	YPR153W	Q06537	140 aa		2.11	□□□□□ -2.07
TOM1	YDR457W	YMR122C	Q03879	124 aa		2.1	□□□□□ -2.07
TOM1	YDR457W	SOM1	Q05676	74 aa		2.1	□□□□□ -2.07
TOM1	YDR457W	RRT15	Q3E811	62 aa		2.1	□□□□□ -2.07
TOM1	YDR457W	SNA4	Q07549	140 aa		2.09	□□□□□ -2.07
TOM1	YDR457W	YHR212W-A	P0CX91	67 aa		2.09	□□□□□ -2.07
TOM1	YDR457W	DOP1	Q03921	1698 aa		2.09	□□□□□ -2.08
TOM1	YDR457W	LCL2	Q08045	131 aa		2.09	□□□□□ -2.08
TOM1	YDR457W	YML054C-A	Q3E809	52 aa		2.09	□□□□□ -2.08
TOM1	YDR457W	YKR045C	P36138	183 aa		2.08	□□□□□ -2.08
TOM1	YDR457W	RPL33A	P05744	107 aa	Known RBP	2.08	□□□□□ -2.08
TOM1	YDR457W	NUP188	P52593	1655 aa	Known RBP	2.08	□□□□□ -2.08
TOM1	YDR457W	NOP10	Q6Q547	58 aa	Predicted RBP	2.08	□□□□□ -2.08
TOM1	YDR457W	URB1	P34241	1764 aa	Known RBP	2.07	□□□□□ -2.08
TOM1	YDR457W	YBR027C	P38220	110 aa		2.07	□□□□□ -2.08
TOM1	YDR457W	BNI1	P41832	1953 aa		2.07	□□□□□ -2.08
TOM1	YDR457W	YOR268C	Q08734	132 aa		2.07	□□□□□ -2.08
TOM1	YDR457W	CHC1	P22137	1653 aa	Known RBP	2.07	□□□□□ -2.08
TOM1	YDR457W	YNR077C	P53758	84 aa		2.07	□□□□□ -2.08
TOM1	YDR457W	TMA10	Q06177	86 aa		2.07	□□□□□ -2.08
TOM1	YDR457W	YER188C-A	P0C0V2	99 aa		2.06	□□□□□ -2.08
TOM1	YDR457W	YDR119W-A	Q2V2P9	66 aa		2.06	□□□□□ -2.08
TOM1	YDR457W	YOR072W-B	Q3E832	53 aa		2.06	□□□□□ -2.08
TOM1	YDR457W	YOL013W-A	P0C272	63 aa	Predicted RBP	2.06	□□□□□ -2.08
TOM1	YDR457W	YOR376W-A	Q3E805	51 aa		2.06	□□□□□ -2.08
TOM1	YDR457W	YML100W-A	Q8TGT0	57 aa		2.05	□□□□□ -2.08
TOM1	YDR457W	RPL29	P05747	59 aa	Predicted RBP	2.05	□□□□□ -2.08
TOM1	YDR457W	YJL027C	P47063	138 aa	Predicted RBP	2.05	□□□□□ -2.08
TOM1	YDR457W	YBL081W	P38180	368 aa	Known RBP	2.05	□□□□□ -2.08
TOM1	YDR457W	EDC1	P53080	175 aa	Predicted RBP	2.05	□□□□□ -2.08
TOM1	YDR457W	YGR121W-A	Q3E816	71 aa		2.05	□□□□□ -2.08
TOM1	YDR457W	YLR162W	Q06235	118 aa		2.05	□□□□□ -2.08
TOM1	YDR457W	SPO14	P36126	1683 aa		2.05	□□□□□ -2.08
TOM1	YDR457W	YDL022C-A	P0C5L6	82 aa		2.05	□□□□□ -2.08
TOM1	YDR457W	YRF1-2	P40105	1681 aa		2.05	□□□□□ -2.08
TOM1	YDR457W	YJL144W	P47009	104 aa		2.05	□□□□□ -2.08
TOM1	YDR457W	YOL014W	Q08110	124 aa		2.05	□□□□□ -2.08
TOM1	YDR457W	NUP192	P47054	1683 aa		2.05	□□□□□ -2.08
TOM1	YDR457W	YHL037C	P38733	133 aa		2.04	□□□□□ -2.08
TOM1	YDR457W	FLO1	P32768	1537 aa		2.04	□□□□□ -2.08
TOM1	YDR457W	WWM1	P43582	211 aa	Known RBP	2.04	□□□□□ -2.08
TOM1	YDR457W	YFL067W	P43537	175 aa		2.04	□□□□□ -2.08
TOM1	YDR457W	YLR307C-A	Q3E825	87 aa		2.04	□□□□□ -2.08
TOM1	YDR457W	YFR009W-A	P0C5M9	85 aa		2.04	□□□□□ -2.08
TOM1	YDR457W	TAR1	Q8TGM6	124 aa		2.03	□□□□□ -2.08
TOM1	YDR457W	MRPS12	P53732	153 aa		2.02	□□□□□ -2.09
TOM1	YDR457W	YIL046W-A	Q3E7Z4	54 aa		2.01	□□□□□ -2.09
TOM1	YDR457W	CMC4	Q3E7A9	73 aa		2.01	□□□□□ -2.09
TOM1	YDR457W	YBL029C-A	Q3E756	94 aa		2.01	□□□□□ -2.09
TOM1	YDR457W	YGL014C-A	P0C5N1	53 aa		2.01	□□□□□ -2.09

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