RNA–Protein interactions for RNA: YDL033C

SLM3, Transcript of tRNA-specific 2-thiouridylase, yeastyeast

Gene SLM3, Length 1,254 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SLM3YDL033C SIM1P40472 476 aa5.99□□□□□ -1.45
SLM3YDL033C YJR146WP47174 117 aa5.99□□□□□ -1.45
SLM3YDL033C RPS28BP0C0X0 67 aaKnown RBP5.98□□□□□ -1.45
SLM3YDL033C YCR050CP25630 102 aa5.98□□□□□ -1.45
SLM3YDL033C SHU1P38751 150 aa5.98□□□□□ -1.45
SLM3YDL033C NCE103P53615 221 aa5.98□□□□□ -1.45
SLM3YDL033C RPS28AQ3E7X9 67 aaPredicted RBP5.98□□□□□ -1.45
SLM3YDL033C YGR035W-AQ45U48 73 aa5.98□□□□□ -1.45
SLM3YDL033C QCR8P08525 94 aa5.97□□□□□ -1.45
SLM3YDL033C RPL16BP26785 198 aaKnown RBP5.97□□□□□ -1.45
SLM3YDL033C YHL018WP38744 120 aaPredicted RBP5.97□□□□□ -1.45
SLM3YDL033C YGR045CP53229 120 aa5.97□□□□□ -1.45
SLM3YDL033C RPL16AP26784 199 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
SLM3YDL033C MSA2P36157 363 aa5.96□□□□□ -1.46
SLM3YDL033C YNL234WP53857 426 aa5.96□□□□□ -1.46
SLM3YDL033C PBP4Q07362 185 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
SLM3YDL033C KTI11Q3E840 82 aa5.96□□□□□ -1.46
SLM3YDL033C YBR200W-AQ3E755 54 aa5.95□□□□□ -1.46
SLM3YDL033C MDN1Q12019 4910 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
SLM3YDL033C YCR041WP37265 110 aa5.94□□□□□ -1.46
SLM3YDL033C SVP26P38869 228 aa5.94□□□□□ -1.46
SLM3YDL033C RRT13P40042 185 aa5.94□□□□□ -1.46
SLM3YDL033C BNA1P47096 177 aa5.94□□□□□ -1.46
SLM3YDL033C YHR022CP38763 256 aa5.93□□□□□ -1.46
SLM3YDL033C YLR042CQ07990 161 aa5.93□□□□□ -1.46
SLM3YDL033C YBR209WP38311 105 aa5.9□□□□□ -1.46
SLM3YDL033C YER187WP40102 141 aa5.9□□□□□ -1.46
SLM3YDL033C RGM1Q00453 211 aa5.9□□□□□ -1.46
SLM3YDL033C CCW12Q12127 133 aa5.9□□□□□ -1.46
SLM3YDL033C YOL085CQ99345 113 aa5.9□□□□□ -1.46
SLM3YDL033C YNL194CP40169 301 aa5.89□□□□□ -1.47
SLM3YDL033C YEL008WP40001 126 aa5.88□□□□□ -1.47
SLM3YDL033C ERG28P40030 148 aa5.88□□□□□ -1.47
SLM3YDL033C ARC15P40518 154 aaRIP-Chip data5.88□□□□□ -1.47not detected
SLM3YDL033C UBC11P52492 156 aa5.88□□□□□ -1.47
SLM3YDL033C YGR025WP53216 100 aa5.88□□□□□ -1.47
SLM3YDL033C PPT2Q12036 173 aa5.88□□□□□ -1.47
SLM3YDL033C YLR285C-AQ3E771 56 aa5.88□□□□□ -1.47
SLM3YDL033C YOR020W-AQ3E824 90 aa5.88□□□□□ -1.47
SLM3YDL033C BET1P22804 142 aa5.87□□□□□ -1.47
SLM3YDL033C KRE9P39005 276 aa5.87□□□□□ -1.47
SLM3YDL033C YML122CQ03207 126 aa5.87□□□□□ -1.47
SLM3YDL033C IRC21Q04772 201 aa5.87□□□□□ -1.47
SLM3YDL033C YJR107C-AP0CT86 78 aa5.86□□□□□ -1.47
SLM3YDL033C YRA2P36036 203 aaKnown RBP RIP-Chip data5.86□□□□□ -1.47not detected
SLM3YDL033C YGL088WP53151 121 aa5.86□□□□□ -1.47
SLM3YDL033C ALG13P53178 202 aa5.86□□□□□ -1.47
SLM3YDL033C YLR412C-AQ3E742 68 aa5.85□□□□□ -1.47
SLM3YDL033C RPL11AP0C0W9 174 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.47
SLM3YDL033C SPG4Q04438 115 aa5.84□□□□□ -1.47
SLM3YDL033C YNL146C-AQ3E7Z1 64 aa5.84□□□□□ -1.47
SLM3YDL033C YLR236CA0A023PZG4 107 aa5.83□□□□□ -1.48
SLM3YDL033C HAL1Q01766 294 aa5.83□□□□□ -1.48
SLM3YDL033C YOR034C-AQ3E735 80 aa5.83□□□□□ -1.48
SLM3YDL033C RPL11BQ3E757 174 aaPredicted RBP5.83□□□□□ -1.48
SLM3YDL033C YOR011W-AQ3E807 68 aa5.83□□□□□ -1.48
SLM3YDL033C YLR156WP0CE96 114 aa5.82□□□□□ -1.48
SLM3YDL033C YLR159WP0CE97 114 aa5.82□□□□□ -1.48
SLM3YDL033C YLR161WP0CE98 114 aa5.82□□□□□ -1.48
SLM3YDL033C AIM4P38305 123 aaPredicted RBP5.82□□□□□ -1.48
SLM3YDL033C RPR2P40571 144 aa5.82□□□□□ -1.48
SLM3YDL033C WWM1P43582 211 aaKnown RBP5.82□□□□□ -1.48
SLM3YDL033C YGR164WP53291 111 aa5.82□□□□□ -1.48
SLM3YDL033C YLR281CQ05863 155 aa5.82□□□□□ -1.48
SLM3YDL033C YLR122CQ12312 125 aa5.82□□□□□ -1.48
SLM3YDL033C YMR175W-AQ3E766 64 aa5.82□□□□□ -1.48
SLM3YDL033C UBC4P15731 148 aa5.81□□□□□ -1.48
SLM3YDL033C YAR029WP39549 74 aa5.81□□□□□ -1.48
SLM3YDL033C ATP20Q12233 115 aa5.81□□□□□ -1.48
SLM3YDL033C YER135CP40082 130 aa5.8□□□□□ -1.48
SLM3YDL033C PMP3P87284 55 aa5.8□□□□□ -1.48
SLM3YDL033C YKL183C-AQ3E765 70 aa5.8□□□□□ -1.48
SLM3YDL033C KSH1Q8TGJ3 72 aa5.8□□□□□ -1.48
SLM3YDL033C MIG3P39943 394 aa5.79□□□□□ -1.48
SLM3YDL033C COX14P39103 70 aa5.78□□□□□ -1.48
SLM3YDL033C ATP18P81450 59 aa5.78□□□□□ -1.48
SLM3YDL033C YMR295CQ03559 197 aa5.78□□□□□ -1.48
SLM3YDL033C YLL006W-AQ3E814 58 aa5.78□□□□□ -1.48
SLM3YDL033C YFR035CP43608 114 aa5.77□□□□□ -1.49
SLM3YDL033C RSM19P53733 91 aaPredicted RBP5.77□□□□□ -1.49
SLM3YDL033C YDR246W-AQ3E763 66 aa5.77□□□□□ -1.49
SLM3YDL033C YMR320WQ04897 101 aa5.76□□□□□ -1.49
SLM3YDL033C HOR7Q05827 59 aa5.76□□□□□ -1.49
SLM3YDL033C MPC3P53311 146 aa5.75□□□□□ -1.49
SLM3YDL033C YPR013CQ12145 317 aa5.75□□□□□ -1.49
SLM3YDL033C TSC3Q3E790 80 aa5.75□□□□□ -1.49
SLM3YDL033C YHR212W-AP0CX91 67 aa5.74□□□□□ -1.49
SLM3YDL033C RPL38P49167 78 aaKnown RBP5.74□□□□□ -1.49
SLM3YDL033C EDC1P53080 175 aaPredicted RBP5.74□□□□□ -1.49
SLM3YDL033C TOS8P53147 276 aa5.74□□□□□ -1.49
SLM3YDL033C VAM10Q08474 114 aa5.74□□□□□ -1.49
SLM3YDL033C YBR144CP34215 104 aa5.73□□□□□ -1.49
SLM3YDL033C TDA2P40045 126 aa5.73□□□□□ -1.49
SLM3YDL033C YMR244WQ04018 355 aa5.73□□□□□ -1.49
SLM3YDL033C YOR314WQ12506 109 aa5.73□□□□□ -1.49
SLM3YDL033C MRPS8Q03799 155 aa5.72□□□□□ -1.49
SLM3YDL033C YAL065CO13511 128 aa5.71□□□□□ -1.5
SLM3YDL033C GAT4P40569 121 aa5.71□□□□□ -1.5
SLM3YDL033C YFL019CP43576 117 aa5.71□□□□□ -1.5
SLM3YDL033C ERI1P62651 68 aaKnown RBP5.71□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 12.3 ms