RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635152.1

BRF1-222, Transcript of BRF1, RNA polymerase III transcription initiation factor subunit, human

TSL 2

Gene BRF1, Length 2,876 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BRF1-222	ENST00000635152	VDR	P11473	427 aa		13.69	□□□□□ -0.22
BRF1-222	ENST00000635152	NR1H3	Q13133	447 aa		13.69	□□□□□ -0.22
BRF1-222	ENST00000635152	CCDC142	Q17RM4	750 aa		13.69	□□□□□ -0.22
BRF1-222	ENST00000635152	HHAT	Q5VTY9	493 aa		13.69	□□□□□ -0.22
BRF1-222	ENST00000635152	ECHDC2	Q86YB7	292 aa		13.69	□□□□□ -0.22
BRF1-222	ENST00000635152	TDRP	Q86YL5	185 aa		13.69	□□□□□ -0.22
BRF1-222	ENST00000635152	PDIK1L	Q8N165	341 aa		13.69	□□□□□ -0.22
BRF1-222	ENST00000635152	ATP11C	Q8NB49	1132 aa		13.69	□□□□□ -0.22
BRF1-222	ENST00000635152	TRAF3IP1	Q8TDR0	691 aa	Predicted RBP	13.69	□□□□□ -0.22
BRF1-222	ENST00000635152	TBC1D31	Q96DN5	1066 aa		13.69	□□□□□ -0.22
BRF1-222	ENST00000635152	ACAP3	Q96P50	834 aa		13.69	□□□□□ -0.22
BRF1-222	ENST00000635152	PAFAH2	Q99487	392 aa		13.69	□□□□□ -0.22
BRF1-222	ENST00000635152	MROH8	Q9H579	483 aa		13.69	□□□□□ -0.22
BRF1-222	ENST00000635152	ASB7	Q9H672	318 aa		13.69	□□□□□ -0.22
BRF1-222	ENST00000635152	UBN1	Q9NPG3	1134 aa		13.69	□□□□□ -0.22
BRF1-222	ENST00000635152	PRKAG3	Q9UGI9	489 aa		13.69	□□□□□ -0.22
BRF1-222	ENST00000635152	PHTF1	Q9UMS5	762 aa		13.69	□□□□□ -0.22
BRF1-222	ENST00000635152	CEP350	Q5VT06	3117 aa		13.69	□□□□□ -0.22
BRF1-222	ENST00000635152	C11orf97	A0A1B0GVM6	126 aa	Predicted RBP	13.69	□□□□□ -0.22
BRF1-222	ENST00000635152	ASB14	A6NK59	587 aa		13.69	□□□□□ -0.22
BRF1-222	ENST00000635152		H7C0C1	242 aa		13.69	□□□□□ -0.22
BRF1-222	ENST00000635152	PRPSAP2	O60256	369 aa		13.69	□□□□□ -0.22
BRF1-222	ENST00000635152	GPD1	P21695	349 aa		13.69	□□□□□ -0.22
BRF1-222	ENST00000635152	ATP5O	P48047	213 aa		13.69	□□□□□ -0.22
BRF1-222	ENST00000635152	ZNF143	P52747	638 aa	Predicted RBP	13.69	□□□□□ -0.22
BRF1-222	ENST00000635152	DPYSL3	Q14195	570 aa		13.69	□□□□□ -0.22
BRF1-222	ENST00000635152	ZC3H12A	Q5D1E8	599 aa	Known RBP	13.69	□□□□□ -0.22
BRF1-222	ENST00000635152	ZNF484	Q5JVG2	852 aa		13.69	□□□□□ -0.22
BRF1-222	ENST00000635152	FAXC	Q5TGI0	409 aa		13.69	□□□□□ -0.22
BRF1-222	ENST00000635152	LVRN	Q6Q4G3	990 aa		13.69	□□□□□ -0.22
BRF1-222	ENST00000635152	ACOT1	Q86TX2	421 aa		13.69	□□□□□ -0.22
BRF1-222	ENST00000635152	IGDCC3	Q8IVU1	814 aa		13.69	□□□□□ -0.22
BRF1-222	ENST00000635152	DENND1A	Q8TEH3	1009 aa		13.69	□□□□□ -0.22
BRF1-222	ENST00000635152	KLHL29	Q96CT2	875 aa		13.69	□□□□□ -0.22
BRF1-222	ENST00000635152	LPIN3	Q9BQK8	851 aa		13.69	□□□□□ -0.22
BRF1-222	ENST00000635152	KCNH4	Q9UQ05	1017 aa		13.69	□□□□□ -0.22
BRF1-222	ENST00000635152	STK38L	Q9Y2H1	464 aa		13.69	□□□□□ -0.22
BRF1-222	ENST00000635152	SNX9	Q9Y5X1	595 aa		13.69	□□□□□ -0.22
BRF1-222	ENST00000635152	IGF2BP3	O00425	579 aa	Known RBP eCLIP	13.68	□□□□□ -0.22
BRF1-222	ENST00000635152	PPEF2	O14830	753 aa		13.68	□□□□□ -0.22
BRF1-222	ENST00000635152	PHB	P35232	272 aa		13.68	□□□□□ -0.22
BRF1-222	ENST00000635152	RDX	P35241	583 aa	Known RBP	13.68	□□□□□ -0.22
BRF1-222	ENST00000635152	ROR1	Q01973	937 aa		13.68	□□□□□ -0.22
BRF1-222	ENST00000635152	PPIL2	Q13356	520 aa		13.68	□□□□□ -0.22
BRF1-222	ENST00000635152	LAMC2	Q13753	1193 aa		13.68	□□□□□ -0.22
BRF1-222	ENST00000635152	KRT81	Q14533	505 aa		13.68	□□□□□ -0.22
BRF1-222	ENST00000635152	KIZ	Q2M2Z5	673 aa		13.68	□□□□□ -0.22
BRF1-222	ENST00000635152	GLRA4	Q5JXX5	417 aa		13.68	□□□□□ -0.22
BRF1-222	ENST00000635152	SCUBE3	Q8IX30	993 aa		13.68	□□□□□ -0.22
BRF1-222	ENST00000635152	CCDC33	Q8N5R6	958 aa		13.68	□□□□□ -0.22
BRF1-222	ENST00000635152	LRRC8C	Q8TDW0	803 aa		13.68	□□□□□ -0.22
BRF1-222	ENST00000635152	NT5C1A	Q9BXI3	368 aa		13.68	□□□□□ -0.22
BRF1-222	ENST00000635152	MIS12	Q9H081	205 aa		13.68	□□□□□ -0.22
BRF1-222	ENST00000635152	RSAD1	Q9HA92	442 aa		13.68	□□□□□ -0.22
BRF1-222	ENST00000635152	ALG13	Q9NP73	1137 aa	Known RBP	13.68	□□□□□ -0.22
BRF1-222	ENST00000635152	HES2	Q9Y543	173 aa		13.68	□□□□□ -0.22
BRF1-222	ENST00000635152		A0A0G2JMZ2	1700 aa		13.68	□□□□□ -0.22
BRF1-222	ENST00000635152	C2CD4B	A6NLJ0	364 aa		13.68	□□□□□ -0.22
BRF1-222	ENST00000635152	MGRN1	O60291	552 aa		13.68	□□□□□ -0.22
BRF1-222	ENST00000635152	TSPAN1	O60635	241 aa		13.68	□□□□□ -0.22
BRF1-222	ENST00000635152	FGFR1	P11362	822 aa		13.68	□□□□□ -0.22
BRF1-222	ENST00000635152	ADORA2A	P29274	412 aa		13.68	□□□□□ -0.22
BRF1-222	ENST00000635152	ATIC	P31939	592 aa		13.68	□□□□□ -0.22
BRF1-222	ENST00000635152	GABRB2	P47870	512 aa		13.68	□□□□□ -0.22
BRF1-222	ENST00000635152	RBP5	P82980	135 aa		13.68	□□□□□ -0.22
BRF1-222	ENST00000635152	TAZ	Q16635	292 aa		13.68	□□□□□ -0.22
BRF1-222	ENST00000635152	GOLGA7B	Q2TAP0	167 aa		13.68	□□□□□ -0.22
BRF1-222	ENST00000635152	GALNTL6	Q49A17	601 aa		13.68	□□□□□ -0.22
BRF1-222	ENST00000635152	EFHC2	Q5JST6	749 aa		13.68	□□□□□ -0.22
BRF1-222	ENST00000635152	PPP1R26	Q5T8A7	1209 aa	Predicted RBP	13.68	□□□□□ -0.22
BRF1-222	ENST00000635152	TAPT1	Q6NXT6	567 aa		13.68	□□□□□ -0.22
BRF1-222	ENST00000635152	PMF1	Q6P1K2	205 aa		13.68	□□□□□ -0.22
BRF1-222	ENST00000635152	FASTKD5	Q7L8L6	764 aa	Known RBP	13.68	□□□□□ -0.22
BRF1-222	ENST00000635152	CNPY3	Q9BT09	278 aa		13.68	□□□□□ -0.22
BRF1-222	ENST00000635152	B3GNT5	Q9BYG0	378 aa		13.68	□□□□□ -0.22
BRF1-222	ENST00000635152	NFKBIZ	Q9BYH8	718 aa		13.68	□□□□□ -0.22
BRF1-222	ENST00000635152	CYP3A43	Q9HB55	503 aa		13.68	□□□□□ -0.22
BRF1-222	ENST00000635152	RXFP1	Q9HBX9	757 aa		13.68	□□□□□ -0.22
BRF1-222	ENST00000635152	SLC24A2	Q9UI40	661 aa		13.68	□□□□□ -0.22
BRF1-222	ENST00000635152		H3BRB1	525 aa		13.67	□□□□□ -0.22
BRF1-222	ENST00000635152	PRPF4	O43172	522 aa	Known RBP eCLIP	13.67	□□□□□ -0.22
BRF1-222	ENST00000635152	HCRT	O43612	131 aa		13.67	□□□□□ -0.22
BRF1-222	ENST00000635152	ADRA1D	P25100	572 aa		13.67	□□□□□ -0.22
BRF1-222	ENST00000635152	GJA5	P36382	358 aa		13.67	□□□□□ -0.22
BRF1-222	ENST00000635152	ELK3	P41970	407 aa		13.67	□□□□□ -0.22
BRF1-222	ENST00000635152	MSH2	P43246	934 aa		13.67	□□□□□ -0.22
BRF1-222	ENST00000635152	BNIP1	Q12981	228 aa		13.67	□□□□□ -0.22
BRF1-222	ENST00000635152	SEPT7	Q16181	437 aa	Known RBP	13.67	□□□□□ -0.22
BRF1-222	ENST00000635152	PPP6R3	Q5H9R7	873 aa	Predicted RBP	13.67	□□□□□ -0.22
BRF1-222	ENST00000635152	CYP4V2	Q6ZWL3	525 aa	Predicted RBP	13.67	□□□□□ -0.22
BRF1-222	ENST00000635152	MRPL45	Q9BRJ2	306 aa	Known RBP	13.67	□□□□□ -0.22
BRF1-222	ENST00000635152	FAM49A	Q9H0Q0	323 aa	Predicted RBP	13.67	□□□□□ -0.22
BRF1-222	ENST00000635152	TUT1	Q9H6E5	874 aa	Known RBP	13.67	□□□□□ -0.22
BRF1-222	ENST00000635152	SMG5	Q9UPR3	1016 aa	Known RBP	13.67	□□□□□ -0.22
BRF1-222	ENST00000635152	TYROBP	O43914	113 aa		13.67	□□□□□ -0.22
BRF1-222	ENST00000635152	ATP6V1G2	O95670	118 aa		13.67	□□□□□ -0.22
BRF1-222	ENST00000635152	GBP2	P32456	591 aa	Predicted RBP	13.67	□□□□□ -0.22
BRF1-222	ENST00000635152	FAM187B	Q17R55	369 aa		13.67	□□□□□ -0.22
BRF1-222	ENST00000635152	MTHFD1L	Q6UB35	978 aa		13.67	□□□□□ -0.22
BRF1-222	ENST00000635152	C7orf31	Q8N865	590 aa		13.67	□□□□□ -0.22

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