RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000626236.2

SGMS1-211, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SGMS1, Length 1,013 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-211ENST00000626236 CPA5Q8WXQ8 436 aa8.99□□□□□ -0.97
SGMS1-211ENST00000626236 C8orf48Q96LL4 319 aa8.99□□□□□ -0.97
SGMS1-211ENST00000626236 PPP1R9BQ96SB3 815 aa8.99□□□□□ -0.97
SGMS1-211ENST00000626236 PCDHB18PQ96TA0 734 aa8.99□□□□□ -0.97
SGMS1-211ENST00000626236 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
SGMS1-211ENST00000626236 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa8.99□□□□□ -0.97
SGMS1-211ENST00000626236 ST7Q9NRC1 585 aa8.99□□□□□ -0.97
SGMS1-211ENST00000626236 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa8.99□□□□□ -0.97
SGMS1-211ENST00000626236 DPP7Q9UHL4 492 aa8.99□□□□□ -0.97
SGMS1-211ENST00000626236 CYTH4Q9UIA0 394 aa8.99□□□□□ -0.97
SGMS1-211ENST00000626236 MYO9BQ13459 2157 aa8.99□□□□□ -0.97
SGMS1-211ENST00000626236 C2orf16Q68DN1 1984 aa8.99□□□□□ -0.97
SGMS1-211ENST00000626236 OBSL1O75147 1896 aa8.98□□□□□ -0.97
SGMS1-211ENST00000626236 A0A087X0T9 212 aa8.98□□□□□ -0.97
SGMS1-211ENST00000626236 SOWAHDA6NJG2 315 aa8.98□□□□□ -0.97
SGMS1-211ENST00000626236 LINC01565O15544 149 aa8.98□□□□□ -0.97
SGMS1-211ENST00000626236 LRG1P02750 347 aa8.98□□□□□ -0.97
SGMS1-211ENST00000626236 CYP1A1P04798 512 aaPredicted RBP8.98□□□□□ -0.97
SGMS1-211ENST00000626236 FAM228BP0C875 321 aa8.98□□□□□ -0.97
SGMS1-211ENST00000626236 SRGAP2BP0DMP2 458 aa8.98□□□□□ -0.97
SGMS1-211ENST00000626236 UNGP13051 313 aaPredicted RBP8.98□□□□□ -0.97
SGMS1-211ENST00000626236 LCP1P13796 627 aa8.98□□□□□ -0.97
SGMS1-211ENST00000626236 FOSL2P15408 326 aa8.98□□□□□ -0.97
SGMS1-211ENST00000626236 ATF6P18850 670 aa8.98□□□□□ -0.97
SGMS1-211ENST00000626236 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP8.98□□□□□ -0.97
SGMS1-211ENST00000626236 FECHP22830 423 aa8.98□□□□□ -0.97
SGMS1-211ENST00000626236 CDH5P33151 784 aaPredicted RBP8.98□□□□□ -0.97
SGMS1-211ENST00000626236 NSFP46459 744 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
SGMS1-211ENST00000626236 PLA2G4AP47712 749 aa8.98□□□□□ -0.97
SGMS1-211ENST00000626236 KIF11P52732 1056 aa8.98□□□□□ -0.97
SGMS1-211ENST00000626236 EPHB3P54753 998 aa8.98□□□□□ -0.97
SGMS1-211ENST00000626236 GFPT1Q06210 699 aaPredicted RBP8.98□□□□□ -0.97
SGMS1-211ENST00000626236 PDCLQ13371 301 aa8.98□□□□□ -0.97
SGMS1-211ENST00000626236 PLD1Q13393 1074 aa8.98□□□□□ -0.97
SGMS1-211ENST00000626236 VEPH1Q14D04 833 aa8.98□□□□□ -0.97
SGMS1-211ENST00000626236 SLC18A3Q16572 532 aa8.98□□□□□ -0.97
SGMS1-211ENST00000626236 ASTE1Q2TB18 679 aaPredicted RBP8.98□□□□□ -0.97
SGMS1-211ENST00000626236 PMF1Q6P1K2 205 aa8.98□□□□□ -0.97
SGMS1-211ENST00000626236 EP400NLQ6ZTU2 488 aa8.98□□□□□ -0.97
SGMS1-211ENST00000626236 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa8.98□□□□□ -0.97
SGMS1-211ENST00000626236 PIGZQ86VD9 579 aa8.98□□□□□ -0.97
SGMS1-211ENST00000626236 TMEM139Q8IV31 216 aa8.98□□□□□ -0.97
SGMS1-211ENST00000626236 CCDC112Q8NEF3 446 aa8.98□□□□□ -0.97
SGMS1-211ENST00000626236 VN1R2Q8NFZ6 395 aa8.98□□□□□ -0.97
SGMS1-211ENST00000626236 SLC30A5Q8TAD4 765 aa8.98□□□□□ -0.97
SGMS1-211ENST00000626236 HDAC7Q8WUI4 952 aa8.98□□□□□ -0.97
SGMS1-211ENST00000626236 CASP10Q92851 521 aa8.98□□□□□ -0.97
SGMS1-211ENST00000626236 GUCD1Q96NT3 240 aa8.98□□□□□ -0.97
SGMS1-211ENST00000626236 NOX5Q96PH1 765 aa8.98□□□□□ -0.97
SGMS1-211ENST00000626236 UBXN6Q9BZV1 441 aa8.98□□□□□ -0.97
SGMS1-211ENST00000626236 SYNCQ9H7C4 482 aa8.98□□□□□ -0.97
SGMS1-211ENST00000626236 LRRC4Q9HBW1 653 aa8.98□□□□□ -0.97
SGMS1-211ENST00000626236 SPTLC3Q9NUV7 552 aa8.98□□□□□ -0.97
SGMS1-211ENST00000626236 TAS2R14Q9NYV8 317 aa8.98□□□□□ -0.97
SGMS1-211ENST00000626236 LHX6Q9UPM6 363 aa8.98□□□□□ -0.97
SGMS1-211ENST00000626236 MYO7AQ13402 2215 aa8.98□□□□□ -0.97
SGMS1-211ENST00000626236 SLC38A8A6NNN8 435 aa8.97□□□□□ -0.97
SGMS1-211ENST00000626236 HHLA1C9JL84 531 aa8.97□□□□□ -0.97
SGMS1-211ENST00000626236 E5RJQ4 531 aa8.97□□□□□ -0.97
SGMS1-211ENST00000626236 TNFRSF10BO14763 440 aa8.97□□□□□ -0.97
SGMS1-211ENST00000626236 CCL16O15467 120 aa8.97□□□□□ -0.97
SGMS1-211ENST00000626236 NRDCO43847 1150 aa8.97□□□□□ -0.97
SGMS1-211ENST00000626236 RFPL2O75678 378 aa8.97□□□□□ -0.97
SGMS1-211ENST00000626236 ZMYND10O75800 440 aa8.97□□□□□ -0.97
SGMS1-211ENST00000626236 GLP2RO95838 553 aa8.97□□□□□ -0.97
SGMS1-211ENST00000626236 ERBB2P04626 1255 aa8.97□□□□□ -0.97
SGMS1-211ENST00000626236 CYLC1P35663 651 aaPredicted RBP8.97□□□□□ -0.97
SGMS1-211ENST00000626236 ACADSBP45954 432 aa8.97□□□□□ -0.97
SGMS1-211ENST00000626236 TKTL1P51854 596 aa8.97□□□□□ -0.97
SGMS1-211ENST00000626236 SLC5A3P53794 718 aa8.97□□□□□ -0.97
SGMS1-211ENST00000626236 CENPCQ03188 943 aa8.97□□□□□ -0.97
SGMS1-211ENST00000626236 ADIGQ0VDE8 80 aa8.97□□□□□ -0.97
SGMS1-211ENST00000626236 ADAM15Q13444 863 aa8.97□□□□□ -0.97
SGMS1-211ENST00000626236 MTMR3Q13615 1198 aa8.97□□□□□ -0.97
SGMS1-211ENST00000626236 KCNC3Q14003 757 aa8.97□□□□□ -0.97
SGMS1-211ENST00000626236 MTF1Q14872 753 aa8.97□□□□□ -0.97
SGMS1-211ENST00000626236 TAF12Q16514 161 aa8.97□□□□□ -0.97
SGMS1-211ENST00000626236 PTPN20Q4JDL3 420 aa8.97□□□□□ -0.97
SGMS1-211ENST00000626236 C2CD6Q53TS8 623 aa8.97□□□□□ -0.97
SGMS1-211ENST00000626236 CCDC122Q5T0U0 273 aa8.97□□□□□ -0.97
SGMS1-211ENST00000626236 CYP4A22Q5TCH4 519 aa8.97□□□□□ -0.97
SGMS1-211ENST00000626236 ACAD10Q6JQN1 1059 aa8.97□□□□□ -0.97
SGMS1-211ENST00000626236 RAD9BQ6WBX8 426 aa8.97□□□□□ -0.97
SGMS1-211ENST00000626236 MMS22LQ6ZRQ5 1243 aa8.97□□□□□ -0.97
SGMS1-211ENST00000626236 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa8.97□□□□□ -0.97
SGMS1-211ENST00000626236 ERICH1Q86X53 443 aa8.97□□□□□ -0.97
SGMS1-211ENST00000626236 DNAAF5Q86Y56 855 aa8.97□□□□□ -0.97
SGMS1-211ENST00000626236 CCDC170Q8IYT3 715 aa8.97□□□□□ -0.97
SGMS1-211ENST00000626236 NUP93Q8N1F7 819 aa8.97□□□□□ -0.97
SGMS1-211ENST00000626236 SIX6OS1Q8N1H7 587 aa8.97□□□□□ -0.97
SGMS1-211ENST00000626236 ELMOD1Q8N336 334 aa8.97□□□□□ -0.97
SGMS1-211ENST00000626236 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP8.97□□□□□ -0.97
SGMS1-211ENST00000626236 MSANTD4Q8NCY6 345 aa8.97□□□□□ -0.97
SGMS1-211ENST00000626236 SCAMP5Q8TAC9 235 aa8.97□□□□□ -0.97
SGMS1-211ENST00000626236 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP8.97□□□□□ -0.97
SGMS1-211ENST00000626236 KCTD13Q8WZ19 329 aa8.97□□□□□ -0.97
SGMS1-211ENST00000626236 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa8.97□□□□□ -0.97
SGMS1-211ENST00000626236 SPATA17Q96L03 361 aa8.97□□□□□ -0.97
SGMS1-211ENST00000626236 HSFY1Q96LI6 401 aa8.97□□□□□ -0.97
SGMS1-211ENST00000626236 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP8.97□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.2 ms