RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000620074.4

UBXN8-209, Transcript of UBX domain protein 8, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene UBXN8, Length 1,058 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN8-209ENST00000620074 USP4Q13107 963 aa11.72□□□□□ -0.53
UBXN8-209ENST00000620074 ORC1Q13415 861 aa11.72□□□□□ -0.53
UBXN8-209ENST00000620074 UBXN2BQ14CS0 331 aa11.72□□□□□ -0.53
UBXN8-209ENST00000620074 CAMK4Q16566 473 aa11.72□□□□□ -0.53
UBXN8-209ENST00000620074 PAQR9Q6ZVX9 377 aa11.72□□□□□ -0.53
UBXN8-209ENST00000620074 GPIHBP1Q8IV16 184 aa11.72□□□□□ -0.53
UBXN8-209ENST00000620074 PDZD8Q8NEN9 1154 aa11.72□□□□□ -0.53
UBXN8-209ENST00000620074 SLC2A14Q8TDB8 520 aa11.72□□□□□ -0.53
UBXN8-209ENST00000620074 OVCA2Q8WZ82 227 aa11.72□□□□□ -0.53
UBXN8-209ENST00000620074 LRRC3BQ96PB8 259 aa11.72□□□□□ -0.53
UBXN8-209ENST00000620074 TWNKQ96RR1 684 aa11.72□□□□□ -0.53
UBXN8-209ENST00000620074 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP11.72□□□□□ -0.53
UBXN8-209ENST00000620074 CLSTN2Q9H4D0 955 aa11.72□□□□□ -0.53
UBXN8-209ENST00000620074 C8orf33Q9H7E9 229 aaPredicted RBP11.72□□□□□ -0.53
UBXN8-209ENST00000620074 CSNK1G1Q9HCP0 422 aa11.72□□□□□ -0.53
UBXN8-209ENST00000620074 FAM49BQ9NUQ9 324 aa11.72□□□□□ -0.53
UBXN8-209ENST00000620074 COMMD8Q9NX08 183 aa11.72□□□□□ -0.53
UBXN8-209ENST00000620074 GCNT4Q9P109 453 aa11.72□□□□□ -0.53
UBXN8-209ENST00000620074 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa11.72□□□□□ -0.53
UBXN8-209ENST00000620074 CCL26Q9Y258 94 aa11.72□□□□□ -0.53
UBXN8-209ENST00000620074 MYH10P35580 1976 aa11.72□□□□□ -0.53
UBXN8-209ENST00000620074 CACNA1HO95180 2353 aa11.71□□□□□ -0.53
UBXN8-209ENST00000620074 FAM170BA6NMN3 283 aa11.71□□□□□ -0.53
UBXN8-209ENST00000620074 TNFRSF10BO14763 440 aa11.71□□□□□ -0.53
UBXN8-209ENST00000620074 P4HA2O15460 535 aa11.71□□□□□ -0.53
UBXN8-209ENST00000620074 LRRN2O75325 713 aa11.71□□□□□ -0.53
UBXN8-209ENST00000620074 DCNP07585 359 aaKnown RBP11.71□□□□□ -0.53
UBXN8-209ENST00000620074 FAM200BP0CF97 657 aa11.71□□□□□ -0.53
UBXN8-209ENST00000620074 TCF3P15923 654 aa11.71□□□□□ -0.53
UBXN8-209ENST00000620074 TARSP26639 723 aaKnown RBP11.71□□□□□ -0.53
UBXN8-209ENST00000620074 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP11.71□□□□□ -0.53
UBXN8-209ENST00000620074 SLC5A3P53794 718 aa11.71□□□□□ -0.53
UBXN8-209ENST00000620074 MARSP56192 900 aaKnown RBP11.71□□□□□ -0.53
UBXN8-209ENST00000620074 STX17P56962 302 aa11.71□□□□□ -0.53
UBXN8-209ENST00000620074 YWHAEP62258 255 aaKnown RBP11.71□□□□□ -0.53
UBXN8-209ENST00000620074 CETN1Q12798 172 aa11.71□□□□□ -0.53
UBXN8-209ENST00000620074 TAF10Q12962 218 aa11.71□□□□□ -0.53
UBXN8-209ENST00000620074 C12orf29Q8N999 325 aa11.71□□□□□ -0.53
UBXN8-209ENST00000620074 WHAMMQ8TF30 809 aa11.71□□□□□ -0.53
UBXN8-209ENST00000620074 FBXO32Q969P5 355 aa11.71□□□□□ -0.53
UBXN8-209ENST00000620074 GBP4Q96PP9 640 aa11.71□□□□□ -0.53
UBXN8-209ENST00000620074 KCNK16Q96T55 309 aa11.71□□□□□ -0.53
UBXN8-209ENST00000620074 HNRNPABQ99729 332 aaKnown RBP11.71□□□□□ -0.53
UBXN8-209ENST00000620074 SMOQ99835 787 aa11.71□□□□□ -0.53
UBXN8-209ENST00000620074 PNPLA8Q9NP80 782 aa11.71□□□□□ -0.53
UBXN8-209ENST00000620074 CISHQ9NSE2 258 aa11.71□□□□□ -0.53
UBXN8-209ENST00000620074 IL37Q9NZH6 218 aa11.71□□□□□ -0.53
UBXN8-209ENST00000620074 RWDD2AQ9UIY3 292 aa11.71□□□□□ -0.53
UBXN8-209ENST00000620074 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa11.71□□□□□ -0.53
UBXN8-209ENST00000620074 WDFY4Q6ZS81 3184 aa11.71□□□□□ -0.54
UBXN8-209ENST00000620074 F5P12259 2224 aa11.7□□□□□ -0.54
UBXN8-209ENST00000620074 FAM92AA1XBS5 289 aa11.7□□□□□ -0.54
UBXN8-209ENST00000620074 C2orf78A6NCI8 922 aa11.7□□□□□ -0.54
UBXN8-209ENST00000620074 ZNF840PA6NDX5 716 aa11.7□□□□□ -0.54
UBXN8-209ENST00000620074 SHISA7A6NL88 538 aa11.7□□□□□ -0.54
UBXN8-209ENST00000620074 OAS1P00973 400 aaKnown RBP11.7□□□□□ -0.54
UBXN8-209ENST00000620074 CCDC192P0DO97 292 aa11.7□□□□□ -0.54
UBXN8-209ENST00000620074 HDCP19113 662 aa11.7□□□□□ -0.54
UBXN8-209ENST00000620074 CD72P21854 359 aa11.7□□□□□ -0.54
UBXN8-209ENST00000620074 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP11.7□□□□□ -0.54
UBXN8-209ENST00000620074 ADORA2BP29275 332 aa11.7□□□□□ -0.54
UBXN8-209ENST00000620074 RPS9P46781 194 aaKnown RBP11.7□□□□□ -0.54
UBXN8-209ENST00000620074 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP11.7□□□□□ -0.54
UBXN8-209ENST00000620074 CUL2Q13617 745 aa11.7□□□□□ -0.54
UBXN8-209ENST00000620074 MTF1Q14872 753 aa11.7□□□□□ -0.54
UBXN8-209ENST00000620074 PDGFRLQ15198 375 aa11.7□□□□□ -0.54
UBXN8-209ENST00000620074 ANGPT1Q15389 498 aa11.7□□□□□ -0.54
UBXN8-209ENST00000620074 ZNF77Q15935 545 aa11.7□□□□□ -0.54
UBXN8-209ENST00000620074 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa11.7□□□□□ -0.54
UBXN8-209ENST00000620074 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP11.7□□□□□ -0.54
UBXN8-209ENST00000620074 RALGPS2Q86X27 583 aaPredicted RBP11.7□□□□□ -0.54
UBXN8-209ENST00000620074 TRIM59Q8IWR1 403 aa11.7□□□□□ -0.54
UBXN8-209ENST00000620074 KIAA1958Q8N8K9 716 aa11.7□□□□□ -0.54
UBXN8-209ENST00000620074 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP11.7□□□□□ -0.54
UBXN8-209ENST00000620074 MLKLQ8NB16 471 aa11.7□□□□□ -0.54
UBXN8-209ENST00000620074 ZMIZ2Q8NF64 920 aa11.7□□□□□ -0.54
UBXN8-209ENST00000620074 FAM3CQ92520 227 aa11.7□□□□□ -0.54
UBXN8-209ENST00000620074 TATDN2Q93075 761 aa11.7□□□□□ -0.54
UBXN8-209ENST00000620074 CLDN23Q96B33 292 aa11.7□□□□□ -0.54
UBXN8-209ENST00000620074 CYFIP2Q96F07 1278 aa11.7□□□□□ -0.54
UBXN8-209ENST00000620074 TMEM176AQ96HP8 235 aa11.7□□□□□ -0.54
UBXN8-209ENST00000620074 ZFYVE19Q96K21 471 aa11.7□□□□□ -0.54
UBXN8-209ENST00000620074 SLC22A12Q96S37 553 aa11.7□□□□□ -0.54
UBXN8-209ENST00000620074 ARID3AQ99856 593 aa11.7□□□□□ -0.54
UBXN8-209ENST00000620074 FAM83CQ9BQN1 747 aa11.7□□□□□ -0.54
UBXN8-209ENST00000620074 IER2Q9BTL4 223 aa11.7□□□□□ -0.54
UBXN8-209ENST00000620074 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP11.7□□□□□ -0.54
UBXN8-209ENST00000620074 NUP62CLQ9H1M0 184 aa11.7□□□□□ -0.54
UBXN8-209ENST00000620074 FBXO44Q9H4M3 255 aa11.7□□□□□ -0.54
UBXN8-209ENST00000620074 GKN1Q9NS71 199 aa11.7□□□□□ -0.54
UBXN8-209ENST00000620074 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP11.7□□□□□ -0.54
UBXN8-209ENST00000620074 MYO16Q9Y6X6 1858 aa11.7□□□□□ -0.54
UBXN8-209ENST00000620074 SPECC1L-ADORA2AF8WAN1 911 aa11.69□□□□□ -0.54
UBXN8-209ENST00000620074 H0Y858 1186 aa11.69□□□□□ -0.54
UBXN8-209ENST00000620074 OLFM2O95897 454 aa11.69□□□□□ -0.54
UBXN8-209ENST00000620074 CTHP32929 405 aa11.69□□□□□ -0.54
UBXN8-209ENST00000620074 TUBP50607 506 aa11.69□□□□□ -0.54
UBXN8-209ENST00000620074 MAP3K7CLP57077 242 aa11.69□□□□□ -0.54
UBXN8-209ENST00000620074 SLC7A9P82251 487 aa11.69□□□□□ -0.54
UBXN8-209ENST00000620074 ZNF394Q53GI3 561 aa11.69□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.9 ms