RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000616502.4

EPHB4-210, Transcript of EPH receptor B4, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene EPHB4, Length 3,737 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB4-210ENST00000616502 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
EPHB4-210ENST00000616502 ANLNQ9NQW6 1124 aa14.95□□□□□ -0.02
EPHB4-210ENST00000616502 AGO2Q9UKV8 859 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
EPHB4-210ENST00000616502 NPTXRO95502 500 aa14.95□□□□□ -0.02
EPHB4-210ENST00000616502 ZBED1O96006 694 aa14.95□□□□□ -0.02
EPHB4-210ENST00000616502 TMEM191BP0C7N4 346 aa14.95□□□□□ -0.02
EPHB4-210ENST00000616502 TXNP10599 105 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
EPHB4-210ENST00000616502 VCPP55072 806 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
EPHB4-210ENST00000616502 SLC25A3Q00325 362 aa14.95□□□□□ -0.02
EPHB4-210ENST00000616502 KRT76Q01546 638 aa14.95□□□□□ -0.02
EPHB4-210ENST00000616502 GAD2Q05329 585 aa14.95□□□□□ -0.02
EPHB4-210ENST00000616502 USP4Q13107 963 aa14.95□□□□□ -0.02
EPHB4-210ENST00000616502 KBTBD12Q3ZCT8 623 aa14.95□□□□□ -0.02
EPHB4-210ENST00000616502 GALNT4Q8N4A0 578 aa14.95□□□□□ -0.02
EPHB4-210ENST00000616502 LRRN4Q8WUT4 740 aa14.95□□□□□ -0.02
EPHB4-210ENST00000616502 PRR11Q96HE9 360 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
EPHB4-210ENST00000616502 ZC3H7BQ9UGR2 993 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
EPHB4-210ENST00000616502 ADCY3O60266 1144 aa14.94□□□□□ -0.02
EPHB4-210ENST00000616502 CYTH1Q15438 398 aa14.94□□□□□ -0.02
EPHB4-210ENST00000616502 TCHHL1Q5QJ38 904 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
EPHB4-210ENST00000616502 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa14.94□□□□□ -0.02
EPHB4-210ENST00000616502 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
EPHB4-210ENST00000616502 PLEKHO2Q8TD55 490 aa14.94□□□□□ -0.02
EPHB4-210ENST00000616502 TRIM56Q9BRZ2 755 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
EPHB4-210ENST00000616502 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
EPHB4-210ENST00000616502 A6NHS1 94 aa14.94□□□□□ -0.02
EPHB4-210ENST00000616502 KRT38O76015 456 aa14.94□□□□□ -0.02
EPHB4-210ENST00000616502 CSPG5O95196 566 aa14.94□□□□□ -0.02
EPHB4-210ENST00000616502 PYGLP06737 847 aa14.94□□□□□ -0.02
EPHB4-210ENST00000616502 IREB2P48200 963 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
EPHB4-210ENST00000616502 CDH6P55285 790 aa14.94□□□□□ -0.02
EPHB4-210ENST00000616502 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
EPHB4-210ENST00000616502 SIX1Q15475 284 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
EPHB4-210ENST00000616502 TFDP3Q5H9I0 405 aa14.94□□□□□ -0.02
EPHB4-210ENST00000616502 IYDQ6PHW0 289 aa14.94□□□□□ -0.02
EPHB4-210ENST00000616502 TMPRSS6Q8IU80 811 aa14.94□□□□□ -0.02
EPHB4-210ENST00000616502 OPTNQ96CV9 577 aa14.94□□□□□ -0.02
EPHB4-210ENST00000616502 LRGUKQ96M69 825 aa14.94□□□□□ -0.02
EPHB4-210ENST00000616502 SPON1Q9HCB6 807 aa14.94□□□□□ -0.02
EPHB4-210ENST00000616502 GRAP2O75791 330 aa14.94□□□□□ -0.02
EPHB4-210ENST00000616502 KRT3P12035 628 aa14.94□□□□□ -0.02
EPHB4-210ENST00000616502 ANPEPP15144 967 aa14.94□□□□□ -0.02
EPHB4-210ENST00000616502 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
EPHB4-210ENST00000616502 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
EPHB4-210ENST00000616502 MAMLD1Q13495 774 aa14.94□□□□□ -0.02
EPHB4-210ENST00000616502 DNAL1Q4LDG9 190 aa14.94□□□□□ -0.02
EPHB4-210ENST00000616502 GPAT2Q6NUI2 795 aa14.94□□□□□ -0.02
EPHB4-210ENST00000616502 ANO5Q75V66 913 aa14.94□□□□□ -0.02
EPHB4-210ENST00000616502 NDNQ99608 321 aa14.94□□□□□ -0.02
EPHB4-210ENST00000616502 SEPT10Q9P0V9 454 aa14.94□□□□□ -0.02
EPHB4-210ENST00000616502 MROH7Q68CQ1 1323 aa14.94□□□□□ -0.02
EPHB4-210ENST00000616502 KBTBD13C9JR72 458 aa14.93□□□□□ -0.02
EPHB4-210ENST00000616502 CALB1P05937 261 aa14.93□□□□□ -0.02
EPHB4-210ENST00000616502 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP14.93□□□□□ -0.02
EPHB4-210ENST00000616502 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
EPHB4-210ENST00000616502 GNAZP19086 355 aa14.93□□□□□ -0.02
EPHB4-210ENST00000616502 CIITAP33076 1130 aa14.93□□□□□ -0.02
EPHB4-210ENST00000616502 NRLP54845 237 aa14.93□□□□□ -0.02
EPHB4-210ENST00000616502 HADHBP55084 474 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
EPHB4-210ENST00000616502 LBRQ14739 615 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
EPHB4-210ENST00000616502 TMEM63BQ5T3F8 832 aa14.93□□□□□ -0.02
EPHB4-210ENST00000616502 CD101Q93033 1021 aa14.93□□□□□ -0.02
EPHB4-210ENST00000616502 SRPK1Q96SB4 655 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
EPHB4-210ENST00000616502 VPS11Q9H270 941 aa14.93□□□□□ -0.02
EPHB4-210ENST00000616502 Q9H521 79 aa14.93□□□□□ -0.02
EPHB4-210ENST00000616502 ZNF212Q9UDV6 495 aa14.93□□□□□ -0.02
EPHB4-210ENST00000616502 MYO9BQ13459 2157 aa14.93□□□□□ -0.02
EPHB4-210ENST00000616502 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
EPHB4-210ENST00000616502 LYNP07948 512 aa14.93□□□□□ -0.02
EPHB4-210ENST00000616502 T-ENOLP0DO92 83 aa14.93□□□□□ -0.02
EPHB4-210ENST00000616502 FDX1P10109 184 aa14.93□□□□□ -0.02
EPHB4-210ENST00000616502 TCF4P15884 667 aa14.93□□□□□ -0.02
EPHB4-210ENST00000616502 CYP24A1Q07973 514 aa14.93□□□□□ -0.02
EPHB4-210ENST00000616502 AP1B1Q10567 949 aa14.93□□□□□ -0.02
EPHB4-210ENST00000616502 RBM15BQ8NDT2 890 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
EPHB4-210ENST00000616502 GSTCDQ8NEC7 633 aa14.93□□□□□ -0.02
EPHB4-210ENST00000616502 NLRP7Q8WX94 980 aa14.93□□□□□ -0.02
EPHB4-210ENST00000616502 GMLQ99445 158 aa14.93□□□□□ -0.02
EPHB4-210ENST00000616502 RIT2Q99578 217 aa14.93□□□□□ -0.02
EPHB4-210ENST00000616502 MIPEPQ99797 713 aa14.93□□□□□ -0.02
EPHB4-210ENST00000616502 ZNF711Q9Y462 761 aa14.93□□□□□ -0.02
EPHB4-210ENST00000616502 DNAH12Q6ZR08 3092 aa14.93□□□□□ -0.02
EPHB4-210ENST00000616502 KCNN4O15554 427 aa14.93□□□□□ -0.02
EPHB4-210ENST00000616502 AVILO75366 819 aa14.93□□□□□ -0.02
EPHB4-210ENST00000616502 FAM155BO75949 473 aa14.93□□□□□ -0.02
EPHB4-210ENST00000616502 CNGA3Q16281 694 aa14.93□□□□□ -0.02
EPHB4-210ENST00000616502 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa14.93□□□□□ -0.02
EPHB4-210ENST00000616502 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
EPHB4-210ENST00000616502 SLC9A9Q8IVB4 645 aa14.93□□□□□ -0.02
EPHB4-210ENST00000616502 DAW1Q8N136 415 aa14.93□□□□□ -0.02
EPHB4-210ENST00000616502 LMO3Q8TAP4 145 aa14.93□□□□□ -0.02
EPHB4-210ENST00000616502 HELQQ8TDG4 1101 aa14.93□□□□□ -0.02
EPHB4-210ENST00000616502 CLEC4DQ8WXI8 215 aa14.93□□□□□ -0.02
EPHB4-210ENST00000616502 BSNDQ8WZ55 320 aa14.93□□□□□ -0.02
EPHB4-210ENST00000616502 MPP4Q96JB8 637 aa14.93□□□□□ -0.02
EPHB4-210ENST00000616502 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
EPHB4-210ENST00000616502 SMYD2Q9NRG4 433 aa14.93□□□□□ -0.02
EPHB4-210ENST00000616502 WDR35Q9P2L0 1181 aa14.93□□□□□ -0.02
EPHB4-210ENST00000616502 FIS1Q9Y3D6 152 aa14.93□□□□□ -0.02
EPHB4-210ENST00000616502 TM9SF1O15321 606 aa14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.1 ms