RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000612229.4

PTPRT-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type T, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRT, Length 11,285 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRT-209ENST00000612229 CCT3P49368 545 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.25
PTPRT-209ENST00000612229 VBP1P61758 197 aa7.21□□□□□ -1.25
PTPRT-209ENST00000612229 BTKQ06187 659 aa7.21□□□□□ -1.25
PTPRT-209ENST00000612229 MTF1Q14872 753 aa7.21□□□□□ -1.25
PTPRT-209ENST00000612229 TXNRD1Q16881 649 aa7.21□□□□□ -1.25
PTPRT-209ENST00000612229 BNC2Q6ZN30 1099 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.25
PTPRT-209ENST00000612229 TTC30AQ86WT1 665 aa7.21□□□□□ -1.25
PTPRT-209ENST00000612229 TTC30BQ8N4P2 665 aa7.21□□□□□ -1.25
PTPRT-209ENST00000612229 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa7.21□□□□□ -1.25
PTPRT-209ENST00000612229 RSAD1Q9HA92 442 aa7.21□□□□□ -1.25
PTPRT-209ENST00000612229 UTYO14607 1347 aa7.21□□□□□ -1.25
PTPRT-209ENST00000612229 ADGRA2Q96PE1 1338 aa7.21□□□□□ -1.25
PTPRT-209ENST00000612229 ERVV-1B6SEH8 477 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRT-209ENST00000612229 CHI3L1P36222 383 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
PTPRT-209ENST00000612229 CDK8P49336 464 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRT-209ENST00000612229 SLC16A1P53985 500 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRT-209ENST00000612229 CACNA2D1P54289 1103 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRT-209ENST00000612229 PSME3P61289 254 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRT-209ENST00000612229 CDK17Q00537 523 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRT-209ENST00000612229 EXOC3L1Q86VI1 746 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRT-209ENST00000612229 SPICE1Q8N0Z3 855 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRT-209ENST00000612229 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
PTPRT-209ENST00000612229 DHX35Q9H5Z1 703 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
PTPRT-209ENST00000612229 VPS51Q9UID3 782 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRT-209ENST00000612229 PDK1Q15118 436 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRT-209ENST00000612229 MACC1Q6ZN28 852 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRT-209ENST00000612229 TMEM179Q6ZVK1 233 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRT-209ENST00000612229 PRKD2Q9BZL6 878 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRT-209ENST00000612229 GOLPH3Q9H4A6 298 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRT-209ENST00000612229 EXOSC4Q9NPD3 245 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
PTPRT-209ENST00000612229 CIDEBQ9UHD4 219 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRT-209ENST00000612229 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRT-209ENST00000612229 NR3C2P08235 984 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRT-209ENST00000612229 PTPN4P29074 926 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRT-209ENST00000612229 STAT3P40763 770 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRT-209ENST00000612229 DSTYKQ6XUX3 929 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRT-209ENST00000612229 ZNF248Q8NDW4 579 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRT-209ENST00000612229 C18orf8Q96DM3 657 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRT-209ENST00000612229 AIFM3Q96NN9 605 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRT-209ENST00000612229 MED15Q96RN5 788 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRT-209ENST00000612229 FEM1BQ9UK73 627 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRT-209ENST00000612229 C15orf41Q9Y2V0 281 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRT-209ENST00000612229 TPRKBQ9Y3C4 175 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRT-209ENST00000612229 PKP3Q9Y446 797 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRT-209ENST00000612229 CLTCL1P53675 1640 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRT-209ENST00000612229 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
PTPRT-209ENST00000612229 C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 394 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRT-209ENST00000612229 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
PTPRT-209ENST00000612229 PPP3CCP48454 512 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRT-209ENST00000612229 ATP12AP54707 1039 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRT-209ENST00000612229 TPI1P60174 286 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRT-209ENST00000612229 RPS6P62753 249 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
PTPRT-209ENST00000612229 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
PTPRT-209ENST00000612229 ZNF618Q5T7W0 954 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRT-209ENST00000612229 USPL1Q5W0Q7 1092 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRT-209ENST00000612229 SHC4Q6S5L8 630 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRT-209ENST00000612229 SPATA18Q8TC71 538 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRT-209ENST00000612229 ITCHQ96J02 903 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRT-209ENST00000612229 TMBIM4Q9HC24 238 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRT-209ENST00000612229 PHTF1Q9UMS5 762 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRT-209ENST00000612229 DFFAO00273 331 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRT-209ENST00000612229 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
PTPRT-209ENST00000612229 SCNN1DP51172 638 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRT-209ENST00000612229 GLYCTKQ8IVS8 523 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRT-209ENST00000612229 YAF2Q8IY57 180 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRT-209ENST00000612229 ENGASEQ8NFI3 743 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRT-209ENST00000612229 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
PTPRT-209ENST00000612229 FUT8Q9BYC5 575 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRT-209ENST00000612229 HDHD2Q9H0R4 259 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRT-209ENST00000612229 SMURF2Q9HAU4 748 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRT-209ENST00000612229 RAB6BQ9NRW1 208 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRT-209ENST00000612229 ANKRD6Q9Y2G4 727 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRT-209ENST00000612229 GUCY1A2P33402 732 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRT-209ENST00000612229 SLC29A2Q14542 456 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRT-209ENST00000612229 KCNT1Q5JUK3 1230 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRT-209ENST00000612229 HPS1Q92902 700 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRT-209ENST00000612229 SLC9A7Q96T83 725 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRT-209ENST00000612229 PCSK1NQ9UHG2 260 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRT-209ENST00000612229 SOAT2O75908 522 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRT-209ENST00000612229 VAV1P15498 845 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRT-209ENST00000612229 FMO5P49326 533 aa7.2□□□□□ -1.26
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PTPRT-209ENST00000612229 MAPK7Q13164 816 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRT-209ENST00000612229 AGAP9Q5VTM2 703 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRT-209ENST00000612229 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
PTPRT-209ENST00000612229 FAM196AQ6ZSG2 479 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRT-209ENST00000612229 PALB2Q86YC2 1186 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRT-209ENST00000612229 ZNF184Q99676 751 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
PTPRT-209ENST00000612229 ZDHHC9Q9Y397 364 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRT-209ENST00000612229 PALLDQ8WX93 1383 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRT-209ENST00000612229 ABCB11O95342 1321 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRT-209ENST00000612229 PSMD11O00231 422 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRT-209ENST00000612229 VPS4BO75351 444 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRT-209ENST00000612229 CLTBP09497 229 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRT-209ENST00000612229 ITGA8P53708 1063 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRT-209ENST00000612229 ADARP55265 1226 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
PTPRT-209ENST00000612229 ANKRD40Q6AI12 368 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRT-209ENST00000612229 B3GNT6Q6ZMB0 384 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRT-209ENST00000612229 CCDC81Q6ZN84 652 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRT-209ENST00000612229 LRRC74BQ6ZQY2 392 aa7.2□□□□□ -1.26
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