RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000594708.1

SMC5-AS1-201, Transcript of SMC5 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SMC5-AS1, Length 1,818 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC5-AS1-201ENST00000594708 PAPLNO95428 1278 aa20.63■□□□□ 0.89
SMC5-AS1-201ENST00000594708 TNFAIP3P21580 790 aa20.63■□□□□ 0.89
SMC5-AS1-201ENST00000594708 KCNA5P22460 613 aa20.63■□□□□ 0.89
SMC5-AS1-201ENST00000594708 NAA35Q5VZE5 725 aa20.63■□□□□ 0.89
SMC5-AS1-201ENST00000594708 GRASPQ7Z6J2 395 aaPredicted RBP20.63■□□□□ 0.89
SMC5-AS1-201ENST00000594708 ELMOD1Q8N336 334 aa20.63■□□□□ 0.89
SMC5-AS1-201ENST00000594708 CPA5Q8WXQ8 436 aa20.63■□□□□ 0.89
SMC5-AS1-201ENST00000594708 CORO1BQ9BR76 489 aa20.63■□□□□ 0.89
SMC5-AS1-201ENST00000594708 PIDD1Q9HB75 910 aa20.63■□□□□ 0.89
SMC5-AS1-201ENST00000594708 ZNF334Q9HCZ1 680 aaPredicted RBP20.63■□□□□ 0.89
SMC5-AS1-201ENST00000594708 ST7Q9NRC1 585 aa20.63■□□□□ 0.89
SMC5-AS1-201ENST00000594708 ZNHIT6Q9NWK9 470 aaKnown RBP20.63■□□□□ 0.89
SMC5-AS1-201ENST00000594708 CEP83Q9Y592 693 aa20.63■□□□□ 0.89
SMC5-AS1-201ENST00000594708 BZW2Q9Y6E2 419 aaKnown RBP20.63■□□□□ 0.89
SMC5-AS1-201ENST00000594708 CYP1A1P04798 512 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
SMC5-AS1-201ENST00000594708 CSH1P0DML2 217 aa20.62■□□□□ 0.89
SMC5-AS1-201ENST00000594708 CSH2P0DML3 217 aa20.62■□□□□ 0.89
SMC5-AS1-201ENST00000594708 CDH5P33151 784 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
SMC5-AS1-201ENST00000594708 NOMO3P69849 1222 aa20.62■□□□□ 0.89
SMC5-AS1-201ENST00000594708 NTHL1P78549 312 aa20.62■□□□□ 0.89
SMC5-AS1-201ENST00000594708 GPR149Q86SP6 731 aa20.62■□□□□ 0.89
SMC5-AS1-201ENST00000594708 ITIH5Q86UX2 942 aa20.62■□□□□ 0.89
SMC5-AS1-201ENST00000594708 TMEM35BQ8NCS4 154 aa20.62■□□□□ 0.89
SMC5-AS1-201ENST00000594708 ADAM7Q9H2U9 754 aa20.62■□□□□ 0.89
SMC5-AS1-201ENST00000594708 TJP2Q9UDY2 1190 aa20.62■□□□□ 0.89
SMC5-AS1-201ENST00000594708 ASB3Q9Y575 518 aa20.62■□□□□ 0.89
SMC5-AS1-201ENST00000594708 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP20.62■□□□□ 0.89
SMC5-AS1-201ENST00000594708 PDCLQ13371 301 aa20.62■□□□□ 0.89
SMC5-AS1-201ENST00000594708 TAF12Q16514 161 aa20.62■□□□□ 0.89
SMC5-AS1-201ENST00000594708 RAB41Q5JT25 222 aa20.62■□□□□ 0.89
SMC5-AS1-201ENST00000594708 TMC8Q8IU68 726 aa20.62■□□□□ 0.89
SMC5-AS1-201ENST00000594708 HLA-CQ95604 372 aa20.62■□□□□ 0.89
SMC5-AS1-201ENST00000594708 CEP295NLQ96MC4 621 aa20.62■□□□□ 0.89
SMC5-AS1-201ENST00000594708 CPXM1Q96SM3 734 aa20.62■□□□□ 0.89
SMC5-AS1-201ENST00000594708 LRRC3Q9BY71 257 aa20.62■□□□□ 0.89
SMC5-AS1-201ENST00000594708 PRDM6Q9NQX0 595 aa20.62■□□□□ 0.89
SMC5-AS1-201ENST00000594708 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
SMC5-AS1-201ENST00000594708 LSM8O95777 96 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
SMC5-AS1-201ENST00000594708 POU2F2P09086 479 aa20.61■□□□□ 0.89
SMC5-AS1-201ENST00000594708 UNGP13051 313 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
SMC5-AS1-201ENST00000594708 LCP1P13796 627 aa20.61■□□□□ 0.89
SMC5-AS1-201ENST00000594708 PTPN2P17706 415 aa20.61■□□□□ 0.89
SMC5-AS1-201ENST00000594708 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
SMC5-AS1-201ENST00000594708 TKTL1P51854 596 aa20.61■□□□□ 0.89
SMC5-AS1-201ENST00000594708 KIF11P52732 1056 aa20.61■□□□□ 0.89
SMC5-AS1-201ENST00000594708 ADIGQ0VDE8 80 aa20.61■□□□□ 0.89
SMC5-AS1-201ENST00000594708 SMRP1Q8NCR6 262 aa20.61■□□□□ 0.89
SMC5-AS1-201ENST00000594708 SLC30A5Q8TAD4 765 aa20.61■□□□□ 0.89
SMC5-AS1-201ENST00000594708 KCTD13Q8WZ19 329 aa20.61■□□□□ 0.89
SMC5-AS1-201ENST00000594708 HSFY1Q96LI6 401 aa20.61■□□□□ 0.89
SMC5-AS1-201ENST00000594708 PANX2Q96RD6 677 aa20.61■□□□□ 0.89
SMC5-AS1-201ENST00000594708 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP20.61■□□□□ 0.89
SMC5-AS1-201ENST00000594708 LRRC4Q9HBW1 653 aa20.61■□□□□ 0.89
SMC5-AS1-201ENST00000594708 TAS2R14Q9NYV8 317 aa20.61■□□□□ 0.89
SMC5-AS1-201ENST00000594708 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa20.61■□□□□ 0.89
SMC5-AS1-201ENST00000594708 MYO16Q9Y6X6 1858 aa20.61■□□□□ 0.89
SMC5-AS1-201ENST00000594708 RHOP08100 348 aa20.6■□□□□ 0.89
SMC5-AS1-201ENST00000594708 ITIH3Q06033 890 aa20.6■□□□□ 0.89
SMC5-AS1-201ENST00000594708 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa20.6■□□□□ 0.89
SMC5-AS1-201ENST00000594708 PTPN20Q4JDL3 420 aa20.6■□□□□ 0.89
SMC5-AS1-201ENST00000594708 C2CD6Q53TS8 623 aa20.6■□□□□ 0.89
SMC5-AS1-201ENST00000594708 TRIM72Q6ZMU5 477 aa20.6■□□□□ 0.89
SMC5-AS1-201ENST00000594708 STK32AQ8WU08 396 aa20.6■□□□□ 0.89
SMC5-AS1-201ENST00000594708 NDRG1Q92597 394 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
SMC5-AS1-201ENST00000594708 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
SMC5-AS1-201ENST00000594708 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa20.6■□□□□ 0.89
SMC5-AS1-201ENST00000594708 MYRFLQ96LU7 910 aa20.6■□□□□ 0.89
SMC5-AS1-201ENST00000594708 SLC4A5Q9BY07 1137 aa20.6■□□□□ 0.89
SMC5-AS1-201ENST00000594708 IL37Q9NZH6 218 aa20.6■□□□□ 0.89
SMC5-AS1-201ENST00000594708 CD207Q9UJ71 328 aa20.6■□□□□ 0.89
SMC5-AS1-201ENST00000594708 E5RJQ4 531 aa20.6■□□□□ 0.89
SMC5-AS1-201ENST00000594708 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
SMC5-AS1-201ENST00000594708 YWHAQP27348 245 aa20.6■□□□□ 0.89
SMC5-AS1-201ENST00000594708 CCR2P41597 374 aa20.6■□□□□ 0.89
SMC5-AS1-201ENST00000594708 RPL34P49207 117 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
SMC5-AS1-201ENST00000594708 CES5AQ6NT32 575 aa20.6■□□□□ 0.89
SMC5-AS1-201ENST00000594708 CCDC186Q7Z3E2 898 aa20.6■□□□□ 0.89
SMC5-AS1-201ENST00000594708 DNAAF5Q86Y56 855 aa20.6■□□□□ 0.89
SMC5-AS1-201ENST00000594708 TTLL2Q9BWV7 592 aa20.6■□□□□ 0.89
SMC5-AS1-201ENST00000594708 IL21Q9HBE4 155 aa20.6■□□□□ 0.89
SMC5-AS1-201ENST00000594708 ASAH2Q9NR71 780 aa20.6■□□□□ 0.89
SMC5-AS1-201ENST00000594708 USP3Q9Y6I4 520 aa20.6■□□□□ 0.89
SMC5-AS1-201ENST00000594708 UNC80Q8N2C7 3258 aa20.59■□□□□ 0.89
SMC5-AS1-201ENST00000594708 TMCO5BA8MYB1 307 aa20.59■□□□□ 0.89
SMC5-AS1-201ENST00000594708 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa20.59■□□□□ 0.89
SMC5-AS1-201ENST00000594708 USP17L7P0C7H9 530 aa20.59■□□□□ 0.89
SMC5-AS1-201ENST00000594708 MYL4P12829 197 aa20.59■□□□□ 0.89
SMC5-AS1-201ENST00000594708 TAF10Q12962 218 aa20.59■□□□□ 0.89
SMC5-AS1-201ENST00000594708 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
SMC5-AS1-201ENST00000594708 TMEM110Q86TL2 294 aa20.59■□□□□ 0.89
SMC5-AS1-201ENST00000594708 FBXO32Q969P5 355 aa20.59■□□□□ 0.89
SMC5-AS1-201ENST00000594708 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
SMC5-AS1-201ENST00000594708 ULBP1Q9BZM6 244 aa20.59■□□□□ 0.89
SMC5-AS1-201ENST00000594708 MIS12Q9H081 205 aa20.59■□□□□ 0.89
SMC5-AS1-201ENST00000594708 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
SMC5-AS1-201ENST00000594708 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
SMC5-AS1-201ENST00000594708 A0A087X0T9 212 aa20.58■□□□□ 0.89
SMC5-AS1-201ENST00000594708 ERBB2P04626 1255 aa20.58■□□□□ 0.89
SMC5-AS1-201ENST00000594708 FAM228BP0C875 321 aa20.58■□□□□ 0.89
SMC5-AS1-201ENST00000594708 GJA1P17302 382 aa20.58■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.3 ms