RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592483.5

CAPNS1-214, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5

Gene CAPNS1, Length 431 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-214ENST00000592483 ARHGEF19Q8IW93 802 aa25.1■■□□□ 1.61
CAPNS1-214ENST00000592483 KDF1Q8NAX2 398 aaPredicted RBP25.1■■□□□ 1.61
CAPNS1-214ENST00000592483 SLC7A14Q8TBB6 771 aa25.1■■□□□ 1.61
CAPNS1-214ENST00000592483 PIK3R5Q8WYR1 880 aa25.1■■□□□ 1.61
CAPNS1-214ENST00000592483 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP25.1■■□□□ 1.61
CAPNS1-214ENST00000592483 MCRS1Q96EZ8 462 aa25.1■■□□□ 1.61
CAPNS1-214ENST00000592483 TTPALQ9BTX7 342 aa25.1■■□□□ 1.61
CAPNS1-214ENST00000592483 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP25.1■■□□□ 1.61
CAPNS1-214ENST00000592483 DNAJC12Q9UKB3 198 aa25.1■■□□□ 1.61
CAPNS1-214ENST00000592483 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP25.1■■□□□ 1.61
CAPNS1-214ENST00000592483 A0A1W2PQJ5 194 aa25.09■■□□□ 1.61
CAPNS1-214ENST00000592483 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa25.09■■□□□ 1.61
CAPNS1-214ENST00000592483 NOL4O94818 638 aa25.09■■□□□ 1.61
CAPNS1-214ENST00000592483 WARSP23381 471 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
CAPNS1-214ENST00000592483 LHX1P48742 406 aa25.09■■□□□ 1.61
CAPNS1-214ENST00000592483 FNTBP49356 437 aa25.09■■□□□ 1.61
CAPNS1-214ENST00000592483 KLK7P49862 253 aa25.09■■□□□ 1.61
CAPNS1-214ENST00000592483 SRSF5Q13243 272 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
CAPNS1-214ENST00000592483 SOWAHAQ2M3V2 549 aa25.09■■□□□ 1.61
CAPNS1-214ENST00000592483 UNQ6494/PRO21346Q6UXR6 183 aa25.09■■□□□ 1.61
CAPNS1-214ENST00000592483 RTL10Q7L3V2 364 aa25.09■■□□□ 1.61
CAPNS1-214ENST00000592483 LONP2Q86WA8 852 aa25.09■■□□□ 1.61
CAPNS1-214ENST00000592483 ADGRF2Q8IZF7 708 aa25.09■■□□□ 1.61
CAPNS1-214ENST00000592483 FAM160A2Q8N612 972 aaPredicted RBP25.09■■□□□ 1.61
CAPNS1-214ENST00000592483 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP25.09■■□□□ 1.61
CAPNS1-214ENST00000592483 FAM3CQ92520 227 aa25.09■■□□□ 1.61
CAPNS1-214ENST00000592483 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
CAPNS1-214ENST00000592483 BRD9Q9H8M2 597 aa25.09■■□□□ 1.61
CAPNS1-214ENST00000592483 MYO6Q9UM54 1294 aa25.09■■□□□ 1.61
CAPNS1-214ENST00000592483 L1RE1Q9UN81 338 aa25.09■■□□□ 1.61
CAPNS1-214ENST00000592483 C1QTNF9BB2RNN3 333 aa25.08■■□□□ 1.61
CAPNS1-214ENST00000592483 TPM1P09493 284 aa25.08■■□□□ 1.61
CAPNS1-214ENST00000592483 C1QTNF9P0C862 333 aa25.08■■□□□ 1.61
CAPNS1-214ENST00000592483 INCA1Q0VD86 236 aa25.08■■□□□ 1.61
CAPNS1-214ENST00000592483 PSMD5Q16401 504 aa25.08■■□□□ 1.61
CAPNS1-214ENST00000592483 FAM171A1Q5VUB5 890 aa25.08■■□□□ 1.61
CAPNS1-214ENST00000592483 IQCEQ6IPM2 695 aa25.08■■□□□ 1.61
CAPNS1-214ENST00000592483 UNC93AQ86WB7 457 aa25.08■■□□□ 1.61
CAPNS1-214ENST00000592483 PDCL2Q8N4E4 241 aa25.08■■□□□ 1.61
CAPNS1-214ENST00000592483 STK33Q9BYT3 514 aa25.08■■□□□ 1.61
CAPNS1-214ENST00000592483 SMYD3Q9H7B4 428 aa25.08■■□□□ 1.61
CAPNS1-214ENST00000592483 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP25.08■■□□□ 1.61
CAPNS1-214ENST00000592483 KCNK5O95279 499 aa25.07■■□□□ 1.6
CAPNS1-214ENST00000592483 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP25.07■■□□□ 1.6
CAPNS1-214ENST00000592483 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP25.07■■□□□ 1.6
CAPNS1-214ENST00000592483 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa25.07■■□□□ 1.6
CAPNS1-214ENST00000592483 ANKS3Q6ZW76 656 aa25.07■■□□□ 1.6
CAPNS1-214ENST00000592483 RRAGAQ7L523 313 aa25.07■■□□□ 1.6
CAPNS1-214ENST00000592483 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa25.07■■□□□ 1.6
CAPNS1-214ENST00000592483 SPEM1Q8N4L4 309 aa25.07■■□□□ 1.6
CAPNS1-214ENST00000592483 UBR7Q8N806 425 aa25.07■■□□□ 1.6
CAPNS1-214ENST00000592483 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP25.07■■□□□ 1.6
CAPNS1-214ENST00000592483 KREMEN1Q96MU8 473 aa25.07■■□□□ 1.6
CAPNS1-214ENST00000592483 TTYH3Q9C0H2 523 aa25.07■■□□□ 1.6
CAPNS1-214ENST00000592483 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP25.07■■□□□ 1.6
CAPNS1-214ENST00000592483 TRPV5Q9NQA5 729 aa25.07■■□□□ 1.6
CAPNS1-214ENST00000592483 FHOD1Q9Y613 1164 aa25.07■■□□□ 1.6
CAPNS1-214ENST00000592483 SDK1Q7Z5N4 2213 aa25.06■■□□□ 1.6
CAPNS1-214ENST00000592483 SOBPA7XYQ1 873 aa25.06■■□□□ 1.6
CAPNS1-214ENST00000592483 H7C4K7 107 aa25.06■■□□□ 1.6
CAPNS1-214ENST00000592483 I3L4J1 428 aa25.06■■□□□ 1.6
CAPNS1-214ENST00000592483 GABRDO14764 452 aa25.06■■□□□ 1.6
CAPNS1-214ENST00000592483 OAZ2O95190 189 aa25.06■■□□□ 1.6
CAPNS1-214ENST00000592483 YWHAHQ04917 246 aaPredicted RBP25.06■■□□□ 1.6
CAPNS1-214ENST00000592483 SF3A2Q15428 464 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
CAPNS1-214ENST00000592483 WSCD1Q658N2 575 aa25.06■■□□□ 1.6
CAPNS1-214ENST00000592483 OVOS1Q6IE37 1185 aa25.06■■□□□ 1.6
CAPNS1-214ENST00000592483 CEP57Q86XR8 500 aa25.06■■□□□ 1.6
CAPNS1-214ENST00000592483 THEM5Q8N1Q8 247 aa25.06■■□□□ 1.6
CAPNS1-214ENST00000592483 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP25.06■■□□□ 1.6
CAPNS1-214ENST00000592483 SHC3Q92529 594 aa25.06■■□□□ 1.6
CAPNS1-214ENST00000592483 IRF7Q92985 503 aa25.06■■□□□ 1.6
CAPNS1-214ENST00000592483 TRMT61BQ9BVS5 477 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
CAPNS1-214ENST00000592483 SNX25Q9H3E2 840 aa25.06■■□□□ 1.6
CAPNS1-214ENST00000592483 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP25.06■■□□□ 1.6
CAPNS1-214ENST00000592483 CISHQ9NSE2 258 aa25.06■■□□□ 1.6
CAPNS1-214ENST00000592483 GREB1Q4ZG55 1949 aa25.06■■□□□ 1.6
CAPNS1-214ENST00000592483 ADAM12O43184 909 aa25.05■■□□□ 1.6
CAPNS1-214ENST00000592483 PAPSS2O95340 614 aaPredicted RBP25.05■■□□□ 1.6
CAPNS1-214ENST00000592483 ZNF806P0C7X5 589 aa25.05■■□□□ 1.6
CAPNS1-214ENST00000592483 CHRNB1P11230 501 aa25.05■■□□□ 1.6
CAPNS1-214ENST00000592483 PCSK1P29120 753 aa25.05■■□□□ 1.6
CAPNS1-214ENST00000592483 TKTP29401 623 aaKnown RBP25.05■■□□□ 1.6
CAPNS1-214ENST00000592483 RAB33AQ14088 237 aa25.05■■□□□ 1.6
CAPNS1-214ENST00000592483 GAS6Q14393 721 aa25.05■■□□□ 1.6
CAPNS1-214ENST00000592483 STPG1Q5TH74 334 aa25.05■■□□□ 1.6
CAPNS1-214ENST00000592483 ZNF280DQ6N043 979 aa25.05■■□□□ 1.6
CAPNS1-214ENST00000592483 GJB7Q6PEY0 223 aa25.05■■□□□ 1.6
CAPNS1-214ENST00000592483 POTEHQ6S545 545 aa25.05■■□□□ 1.6
CAPNS1-214ENST00000592483 CEP68Q76N32 757 aa25.05■■□□□ 1.6
CAPNS1-214ENST00000592483 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa25.05■■□□□ 1.6
CAPNS1-214ENST00000592483 COL26A1Q96A83 441 aa25.05■■□□□ 1.6
CAPNS1-214ENST00000592483 SPAG5Q96R06 1193 aa25.05■■□□□ 1.6
CAPNS1-214ENST00000592483 SDCBP2Q9H190 292 aa25.05■■□□□ 1.6
CAPNS1-214ENST00000592483 CNTN6Q9UQ52 1028 aa25.05■■□□□ 1.6
CAPNS1-214ENST00000592483 TSC2P49815 1807 aa25.05■■□□□ 1.6
CAPNS1-214ENST00000592483 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa25.04■■□□□ 1.6
CAPNS1-214ENST00000592483 EPHB6O15197 1021 aa25.04■■□□□ 1.6
CAPNS1-214ENST00000592483 CILPO75339 1184 aa25.04■■□□□ 1.6
CAPNS1-214ENST00000592483 RHOP08100 348 aa25.04■■□□□ 1.6
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