RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591041.5

CAPNS1-212, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3

Gene CAPNS1, Length 812 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-212ENST00000591041 PRPSAP2O60256 369 aa23.73■■□□□ 1.39
CAPNS1-212ENST00000591041 TJP3O95049 919 aa23.73■■□□□ 1.39
CAPNS1-212ENST00000591041 PTPN9P43378 593 aa23.73■■□□□ 1.39
CAPNS1-212ENST00000591041 MAP3K7CLP57077 242 aa23.73■■□□□ 1.39
CAPNS1-212ENST00000591041 BOLA3Q53S33 107 aa23.73■■□□□ 1.39
CAPNS1-212ENST00000591041 SPOUT1Q5T280 376 aaKnown RBP23.73■■□□□ 1.39
CAPNS1-212ENST00000591041 WDR93Q6P2C0 686 aa23.73■■□□□ 1.39
CAPNS1-212ENST00000591041 CD300LGQ6UXG3 332 aa23.73■■□□□ 1.39
CAPNS1-212ENST00000591041 CLEC20AQ6ZU45 233 aa23.73■■□□□ 1.39
CAPNS1-212ENST00000591041 SCUBE3Q8IX30 993 aa23.73■■□□□ 1.39
CAPNS1-212ENST00000591041 IFT20Q8IY31 132 aa23.73■■□□□ 1.39
CAPNS1-212ENST00000591041 LRRN4CLQ8ND94 238 aa23.73■■□□□ 1.39
CAPNS1-212ENST00000591041 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP23.73■■□□□ 1.39
CAPNS1-212ENST00000591041 TBCBQ99426 244 aa23.73■■□□□ 1.39
CAPNS1-212ENST00000591041 TRIM7Q9C029 511 aa23.73■■□□□ 1.39
CAPNS1-212ENST00000591041 CSNK1G1Q9HCP0 422 aa23.73■■□□□ 1.39
CAPNS1-212ENST00000591041 AAASQ9NRG9 546 aa23.73■■□□□ 1.39
CAPNS1-212ENST00000591041 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP23.73■■□□□ 1.39
CAPNS1-212ENST00000591041 EFR3BQ9Y2G0 817 aa23.73■■□□□ 1.39
CAPNS1-212ENST00000591041 CCDC151A5D8V7 595 aa23.72■■□□□ 1.39
CAPNS1-212ENST00000591041 TRIM66O15016 1216 aa23.72■■□□□ 1.39
CAPNS1-212ENST00000591041 PAPSS1O43252 624 aaPredicted RBP23.72■■□□□ 1.39
CAPNS1-212ENST00000591041 PYGMP11217 842 aa23.72■■□□□ 1.39
CAPNS1-212ENST00000591041 TKTP29401 623 aaKnown RBP23.72■■□□□ 1.39
CAPNS1-212ENST00000591041 SLC11A1P49279 550 aa23.72■■□□□ 1.39
CAPNS1-212ENST00000591041 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP23.72■■□□□ 1.39
CAPNS1-212ENST00000591041 DHX34Q14147 1143 aaKnown RBP23.72■■□□□ 1.39
CAPNS1-212ENST00000591041 CTXN3Q4LDR2 81 aa23.72■■□□□ 1.39
CAPNS1-212ENST00000591041 FAM171A1Q5VUB5 890 aa23.72■■□□□ 1.39
CAPNS1-212ENST00000591041 FUT10Q6P4F1 479 aa23.72■■□□□ 1.39
CAPNS1-212ENST00000591041 VSTM1Q6UX27 236 aa23.72■■□□□ 1.39
CAPNS1-212ENST00000591041 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP23.72■■□□□ 1.39
CAPNS1-212ENST00000591041 CRIPAKQ8N1N5 446 aa23.72■■□□□ 1.39
CAPNS1-212ENST00000591041 SCML4Q8N228 414 aa23.72■■□□□ 1.39
CAPNS1-212ENST00000591041 NOA1Q8NC60 698 aaKnown RBP23.72■■□□□ 1.39
CAPNS1-212ENST00000591041 JOSD2Q8TAC2 188 aa23.72■■□□□ 1.39
CAPNS1-212ENST00000591041 TOP1MTQ969P6 601 aa23.72■■□□□ 1.39
CAPNS1-212ENST00000591041 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa23.72■■□□□ 1.39
CAPNS1-212ENST00000591041 RAB17Q9H0T7 212 aa23.72■■□□□ 1.39
CAPNS1-212ENST00000591041 DNAJB4Q9UDY4 337 aa23.72■■□□□ 1.39
CAPNS1-212ENST00000591041 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa23.72■■□□□ 1.39
CAPNS1-212ENST00000591041 F8VP50 259 aa23.71■■□□□ 1.39
CAPNS1-212ENST00000591041 CAPN9O14815 690 aa23.71■■□□□ 1.39
CAPNS1-212ENST00000591041 HCRTO43612 131 aa23.71■■□□□ 1.39
CAPNS1-212ENST00000591041 DAB1O75553 588 aa23.71■■□□□ 1.39
CAPNS1-212ENST00000591041 DGKIO75912 1065 aa23.71■■□□□ 1.39
CAPNS1-212ENST00000591041 UPP2O95045 317 aa23.71■■□□□ 1.39
CAPNS1-212ENST00000591041 GJB6O95452 261 aa23.71■■□□□ 1.39
CAPNS1-212ENST00000591041 GALTP07902 379 aa23.71■■□□□ 1.39
CAPNS1-212ENST00000591041 LAG3P18627 525 aa23.71■■□□□ 1.39
CAPNS1-212ENST00000591041 PTPN7P35236 360 aa23.71■■□□□ 1.39
CAPNS1-212ENST00000591041 GJC1P36383 396 aa23.71■■□□□ 1.39
CAPNS1-212ENST00000591041 TKTL1P51854 596 aa23.71■■□□□ 1.39
CAPNS1-212ENST00000591041 BCAR1P56945 870 aa23.71■■□□□ 1.39
CAPNS1-212ENST00000591041 YWHAZP63104 245 aaKnown RBP23.71■■□□□ 1.39
CAPNS1-212ENST00000591041 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP23.71■■□□□ 1.39
CAPNS1-212ENST00000591041 LMNB2Q03252 620 aa23.71■■□□□ 1.39
CAPNS1-212ENST00000591041 ADIGQ0VDE8 80 aa23.71■■□□□ 1.39
CAPNS1-212ENST00000591041 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP23.71■■□□□ 1.39
CAPNS1-212ENST00000591041 TMCO3Q6UWJ1 677 aa23.71■■□□□ 1.39
CAPNS1-212ENST00000591041 GRK7Q8WTQ7 553 aa23.71■■□□□ 1.39
CAPNS1-212ENST00000591041 FAM149B1Q96BN6 582 aa23.71■■□□□ 1.39
CAPNS1-212ENST00000591041 KRT12Q99456 494 aa23.71■■□□□ 1.39
CAPNS1-212ENST00000591041 PARD6BQ9BYG5 372 aa23.71■■□□□ 1.39
CAPNS1-212ENST00000591041 FRMD8P1Q9BZ68 369 aaPredicted RBP23.71■■□□□ 1.39
CAPNS1-212ENST00000591041 IL23AQ9NPF7 189 aa23.71■■□□□ 1.39
CAPNS1-212ENST00000591041 A0A0C4DFX4 3053 aa23.7■■□□□ 1.38
CAPNS1-212ENST00000591041 CLDN5O00501 218 aa23.7■■□□□ 1.38
CAPNS1-212ENST00000591041 FSCN2O14926 492 aa23.7■■□□□ 1.38
CAPNS1-212ENST00000591041 PHF2O75151 1096 aa23.7■■□□□ 1.38
CAPNS1-212ENST00000591041 FGFR3P22607 806 aa23.7■■□□□ 1.38
CAPNS1-212ENST00000591041 GBP1P32455 592 aa23.7■■□□□ 1.38
CAPNS1-212ENST00000591041 NOS2P35228 1153 aa23.7■■□□□ 1.38
CAPNS1-212ENST00000591041 DCAF12L1Q5VU92 463 aa23.7■■□□□ 1.38
CAPNS1-212ENST00000591041 STRADAQ7RTN6 431 aa23.7■■□□□ 1.38
CAPNS1-212ENST00000591041 CEP57Q86XR8 500 aa23.7■■□□□ 1.38
CAPNS1-212ENST00000591041 KLHL7Q8IXQ5 586 aa23.7■■□□□ 1.38
CAPNS1-212ENST00000591041 EMC1Q8N766 993 aa23.7■■□□□ 1.38
CAPNS1-212ENST00000591041 TTC13Q8NBP0 860 aa23.7■■□□□ 1.38
CAPNS1-212ENST00000591041 TEKT4Q8WW24 435 aa23.7■■□□□ 1.38
CAPNS1-212ENST00000591041 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP23.7■■□□□ 1.38
CAPNS1-212ENST00000591041 ZNF558Q96NG5 402 aa23.7■■□□□ 1.38
CAPNS1-212ENST00000591041 RTP3Q9BQQ7 232 aa23.7■■□□□ 1.38
CAPNS1-212ENST00000591041 TTPALQ9BTX7 342 aa23.7■■□□□ 1.38
CAPNS1-212ENST00000591041 AP1M1Q9BXS5 423 aa23.7■■□□□ 1.38
CAPNS1-212ENST00000591041 POPDC2Q9HBU9 364 aa23.7■■□□□ 1.38
CAPNS1-212ENST00000591041 STIM2Q9P246 746 aa23.7■■□□□ 1.38
CAPNS1-212ENST00000591041 TJP2Q9UDY2 1190 aa23.7■■□□□ 1.38
CAPNS1-212ENST00000591041 RAB21Q9UL25 225 aa23.7■■□□□ 1.38
CAPNS1-212ENST00000591041 USP18Q9UMW8 372 aa23.7■■□□□ 1.38
CAPNS1-212ENST00000591041 NR2E3Q9Y5X4 410 aa23.7■■□□□ 1.38
CAPNS1-212ENST00000591041 MICAL3Q7RTP6 2002 aa23.69■■□□□ 1.38
CAPNS1-212ENST00000591041 FAM187AA6NFU0 413 aa23.69■■□□□ 1.38
CAPNS1-212ENST00000591041 TULP2O00295 520 aa23.69■■□□□ 1.38
CAPNS1-212ENST00000591041 LRCH4O75427 683 aa23.69■■□□□ 1.38
CAPNS1-212ENST00000591041 ITGB1P05556 798 aa23.69■■□□□ 1.38
CAPNS1-212ENST00000591041 MATKP42679 507 aa23.69■■□□□ 1.38
CAPNS1-212ENST00000591041 MAGEA11P43364 429 aa23.69■■□□□ 1.38
CAPNS1-212ENST00000591041 MARCKSL1P49006 195 aa23.69■■□□□ 1.38
CAPNS1-212ENST00000591041 FNTAP49354 379 aa23.69■■□□□ 1.38
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