RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589497.5

GIPC1-210, Transcript of GIPC PDZ domain containing family member 1, humanhuman

TSL 5

Gene GIPC1, Length 853 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC1-210ENST00000589497 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP20■□□□□ 0.79
GIPC1-210ENST00000589497 EHBP1Q8NDI1 1231 aa20■□□□□ 0.79
GIPC1-210ENST00000589497 SCAMP5Q8TAC9 235 aa20■□□□□ 0.79
GIPC1-210ENST00000589497 TTC8Q8TAM2 541 aa20■□□□□ 0.79
GIPC1-210ENST00000589497 OVCA2Q8WZ82 227 aa20■□□□□ 0.79
GIPC1-210ENST00000589497 FAM3CQ92520 227 aa20■□□□□ 0.79
GIPC1-210ENST00000589497 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP20■□□□□ 0.79
GIPC1-210ENST00000589497 LRRC3BQ96PB8 259 aa20■□□□□ 0.79
GIPC1-210ENST00000589497 NACA2Q9H009 215 aa20■□□□□ 0.79
GIPC1-210ENST00000589497 CSNK1G1Q9HCP0 422 aa20■□□□□ 0.79
GIPC1-210ENST00000589497 GKN1Q9NS71 199 aa20■□□□□ 0.79
GIPC1-210ENST00000589497 TMEM30AQ9NV96 361 aa20■□□□□ 0.79
GIPC1-210ENST00000589497 CCL26Q9Y258 94 aa20■□□□□ 0.79
GIPC1-210ENST00000589497 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP19.99■□□□□ 0.79
GIPC1-210ENST00000589497 BEST1O76090 585 aa19.99■□□□□ 0.79
GIPC1-210ENST00000589497 MBD3O95983 291 aa19.99■□□□□ 0.79
GIPC1-210ENST00000589497 CD19P15391 556 aa19.99■□□□□ 0.79
GIPC1-210ENST00000589497 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP19.99■□□□□ 0.79
GIPC1-210ENST00000589497 RAD23BP54727 409 aa19.99■□□□□ 0.79
GIPC1-210ENST00000589497 DPCR1Q3MIW9 517 aa19.99■□□□□ 0.79
GIPC1-210ENST00000589497 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP19.99■□□□□ 0.79
GIPC1-210ENST00000589497 C1orf228Q6PIY5 440 aa19.99■□□□□ 0.79
GIPC1-210ENST00000589497 SASS6Q6UVJ0 657 aa19.99■□□□□ 0.79
GIPC1-210ENST00000589497 PJA1Q8NG27 643 aa19.99■□□□□ 0.79
GIPC1-210ENST00000589497 GPT2Q8TD30 523 aa19.99■□□□□ 0.79
GIPC1-210ENST00000589497 C8orf33Q9H7E9 229 aaPredicted RBP19.99■□□□□ 0.79
GIPC1-210ENST00000589497 LTB4R2Q9NPC1 389 aa19.99■□□□□ 0.79
GIPC1-210ENST00000589497 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa19.99■□□□□ 0.79
GIPC1-210ENST00000589497 TNFRSF10BO14763 440 aa19.98■□□□□ 0.79
GIPC1-210ENST00000589497 ACO1P21399 889 aaKnown RBP19.98■□□□□ 0.79
GIPC1-210ENST00000589497 HECTD3Q5T447 861 aa19.98■□□□□ 0.79
GIPC1-210ENST00000589497 CLEC20AQ6ZU45 233 aa19.98■□□□□ 0.79
GIPC1-210ENST00000589497 DTWD2Q8NBA8 298 aa19.98■□□□□ 0.79
GIPC1-210ENST00000589497 SLC4A11Q8NBS3 891 aa19.98■□□□□ 0.79
GIPC1-210ENST00000589497 ZMIZ2Q8NF64 920 aa19.98■□□□□ 0.79
GIPC1-210ENST00000589497 MSANTD3Q96H12 275 aa19.98■□□□□ 0.79
GIPC1-210ENST00000589497 SLC22A12Q96S37 553 aa19.98■□□□□ 0.79
GIPC1-210ENST00000589497 DUSP16Q9BY84 665 aa19.98■□□□□ 0.79
GIPC1-210ENST00000589497 OSBPL6Q9BZF3 934 aa19.98■□□□□ 0.79
GIPC1-210ENST00000589497 TLR8Q9NR97 1041 aaKnown RBP19.98■□□□□ 0.79
GIPC1-210ENST00000589497 GTSE1Q9NYZ3 720 aa19.98■□□□□ 0.79
GIPC1-210ENST00000589497 GCNT4Q9P109 453 aa19.98■□□□□ 0.79
GIPC1-210ENST00000589497 HESX1Q9UBX0 185 aa19.98■□□□□ 0.79
GIPC1-210ENST00000589497 KIAA1257Q9ULG3 409 aa19.98■□□□□ 0.79
GIPC1-210ENST00000589497 NDRG2Q9UN36 371 aaKnown RBP19.98■□□□□ 0.79
GIPC1-210ENST00000589497 NCANO14594 1321 aa19.98■□□□□ 0.79
GIPC1-210ENST00000589497 MBL2P11226 248 aaPredicted RBP19.97■□□□□ 0.79
GIPC1-210ENST00000589497 IFNAR2P48551 515 aa19.97■□□□□ 0.79
GIPC1-210ENST00000589497 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP19.97■□□□□ 0.79
GIPC1-210ENST00000589497 AMPD2Q01433 879 aa19.97■□□□□ 0.79
GIPC1-210ENST00000589497 MTF1Q14872 753 aa19.97■□□□□ 0.79
GIPC1-210ENST00000589497 PDGFRLQ15198 375 aa19.97■□□□□ 0.79
GIPC1-210ENST00000589497 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa19.97■□□□□ 0.79
GIPC1-210ENST00000589497 SGO2Q562F6 1265 aa19.97■□□□□ 0.79
GIPC1-210ENST00000589497 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP19.97■□□□□ 0.79
GIPC1-210ENST00000589497 TMEM270Q6UE05 265 aa19.97■□□□□ 0.79
GIPC1-210ENST00000589497 RRAGAQ7L523 313 aa19.97■□□□□ 0.79
GIPC1-210ENST00000589497 CCDC105Q8IYK2 499 aa19.97■□□□□ 0.79
GIPC1-210ENST00000589497 PRSS33Q8NF86 280 aa19.97■□□□□ 0.79
GIPC1-210ENST00000589497 SH3RF2Q8TEC5 729 aa19.97■□□□□ 0.79
GIPC1-210ENST00000589497 ATOH1Q92858 354 aaPredicted RBP19.97■□□□□ 0.79
GIPC1-210ENST00000589497 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP19.97■□□□□ 0.79
GIPC1-210ENST00000589497 THAP9Q9H5L6 903 aa19.97■□□□□ 0.79
GIPC1-210ENST00000589497 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP19.97■□□□□ 0.79
GIPC1-210ENST00000589497 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa19.97■□□□□ 0.79
GIPC1-210ENST00000589497 VDRP11473 427 aa19.96■□□□□ 0.79
GIPC1-210ENST00000589497 RUNX3Q13761 415 aa19.96■□□□□ 0.79
GIPC1-210ENST00000589497 ARHGAP17Q68EM7 881 aa19.96■□□□□ 0.79
GIPC1-210ENST00000589497 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP19.96■□□□□ 0.79
GIPC1-210ENST00000589497 EBF3Q9H4W6 596 aa19.96■□□□□ 0.79
GIPC1-210ENST00000589497 PNPLA8Q9NP80 782 aa19.96■□□□□ 0.79
GIPC1-210ENST00000589497 SMPD4Q9NXE4 827 aa19.96■□□□□ 0.79
GIPC1-210ENST00000589497 GMIPQ9P107 970 aa19.96■□□□□ 0.79
GIPC1-210ENST00000589497 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP19.96■□□□□ 0.79
GIPC1-210ENST00000589497 H0Y858 1186 aa19.95■□□□□ 0.78
GIPC1-210ENST00000589497 ARNTLO00327 626 aa19.95■□□□□ 0.78
GIPC1-210ENST00000589497 PES1O00541 588 aaKnown RBP19.95■□□□□ 0.78
GIPC1-210ENST00000589497 MAGEA9P43362 315 aa19.95■□□□□ 0.78
GIPC1-210ENST00000589497 SLC7A9P82251 487 aa19.95■□□□□ 0.78
GIPC1-210ENST00000589497 TNK2Q07912 1038 aa19.95■□□□□ 0.78
GIPC1-210ENST00000589497 NR1H3Q13133 447 aa19.95■□□□□ 0.78
GIPC1-210ENST00000589497 GBP6Q6ZN66 633 aa19.95■□□□□ 0.78
GIPC1-210ENST00000589497 RALGPS2Q86X27 583 aaPredicted RBP19.95■□□□□ 0.78
GIPC1-210ENST00000589497 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP19.95■□□□□ 0.78
GIPC1-210ENST00000589497 ANKRD52Q8NB46 1076 aa19.95■□□□□ 0.78
GIPC1-210ENST00000589497 OSCP1Q8WVF1 389 aa19.95■□□□□ 0.78
GIPC1-210ENST00000589497 EXOC4Q96A65 974 aa19.95■□□□□ 0.78
GIPC1-210ENST00000589497 FAM81BQ96LP2 452 aa19.95■□□□□ 0.78
GIPC1-210ENST00000589497 FAM83CQ9BQN1 747 aa19.95■□□□□ 0.78
GIPC1-210ENST00000589497 CRACR2AQ9BSW2 395 aa19.95■□□□□ 0.78
GIPC1-210ENST00000589497 RNF38Q9H0F5 515 aa19.95■□□□□ 0.78
GIPC1-210ENST00000589497 IL37Q9NZH6 218 aa19.95■□□□□ 0.78
GIPC1-210ENST00000589497 CPQQ9Y646 472 aa19.95■□□□□ 0.78
GIPC1-210ENST00000589497 PTPRDP23468 1912 aa19.95■□□□□ 0.78
GIPC1-210ENST00000589497 NUP210Q8TEM1 1887 aaPredicted RBP19.94■□□□□ 0.78
GIPC1-210ENST00000589497 SPECC1L-ADORA2AF8WAN1 911 aa19.94■□□□□ 0.78
GIPC1-210ENST00000589497 LEFTY2O00292 366 aa19.94■□□□□ 0.78
GIPC1-210ENST00000589497 PAEPP09466 180 aa19.94■□□□□ 0.78
GIPC1-210ENST00000589497 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP19.94■□□□□ 0.78
GIPC1-210ENST00000589497 TARSP26639 723 aaKnown RBP19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.2 ms