RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568331.5

SNAP23-216, Transcript of synaptosome associated protein 23, humanhuman

TSL 4

Gene SNAP23, Length 557 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP23-216ENST00000568331 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP22.32■■□□□ 1.16
SNAP23-216ENST00000568331 PIAS3Q9Y6X2 628 aa22.32■■□□□ 1.16
SNAP23-216ENST00000568331 COL4A3Q01955 1670 aa22.32■■□□□ 1.16
SNAP23-216ENST00000568331 PATJQ8NI35 1801 aa22.31■■□□□ 1.16
SNAP23-216ENST00000568331 KIF26AQ9ULI4 1882 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
SNAP23-216ENST00000568331 C2orf78A6NCI8 922 aa22.31■■□□□ 1.16
SNAP23-216ENST00000568331 PMM2O15305 246 aa22.31■■□□□ 1.16
SNAP23-216ENST00000568331 NCAM2O15394 837 aa22.31■■□□□ 1.16
SNAP23-216ENST00000568331 P4HA2O15460 535 aa22.31■■□□□ 1.16
SNAP23-216ENST00000568331 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
SNAP23-216ENST00000568331 LRMPQ12912 555 aa22.31■■□□□ 1.16
SNAP23-216ENST00000568331 CUL2Q13617 745 aa22.31■■□□□ 1.16
SNAP23-216ENST00000568331 TRIM59Q8IWR1 403 aa22.31■■□□□ 1.16
SNAP23-216ENST00000568331 CCDC105Q8IYK2 499 aa22.31■■□□□ 1.16
SNAP23-216ENST00000568331 MSANTD3Q96H12 275 aa22.31■■□□□ 1.16
SNAP23-216ENST00000568331 TMEM176AQ96HP8 235 aa22.31■■□□□ 1.16
SNAP23-216ENST00000568331 NT5C1BQ96P26 610 aa22.31■■□□□ 1.16
SNAP23-216ENST00000568331 SMOQ99835 787 aa22.31■■□□□ 1.16
SNAP23-216ENST00000568331 ARID3AQ99856 593 aa22.31■■□□□ 1.16
SNAP23-216ENST00000568331 OSBPL6Q9BZF3 934 aa22.31■■□□□ 1.16
SNAP23-216ENST00000568331 CSNK1G1Q9HCP0 422 aa22.31■■□□□ 1.16
SNAP23-216ENST00000568331 DACH1Q9UI36 760 aa22.31■■□□□ 1.16
SNAP23-216ENST00000568331 MYO16Q9Y6X6 1858 aa22.3■■□□□ 1.16
SNAP23-216ENST00000568331 ZNF840PA6NDX5 716 aa22.3■■□□□ 1.16
SNAP23-216ENST00000568331 ARNTLO00327 626 aa22.3■■□□□ 1.16
SNAP23-216ENST00000568331 AFPP02771 609 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
SNAP23-216ENST00000568331 SLC5A3P53794 718 aa22.3■■□□□ 1.16
SNAP23-216ENST00000568331 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
SNAP23-216ENST00000568331 MARSP56192 900 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
SNAP23-216ENST00000568331 KCNH2Q12809 1159 aa22.3■■□□□ 1.16
SNAP23-216ENST00000568331 SCAMP5Q8TAC9 235 aa22.3■■□□□ 1.16
SNAP23-216ENST00000568331 OVCA2Q8WZ82 227 aa22.3■■□□□ 1.16
SNAP23-216ENST00000568331 SLC22A12Q96S37 553 aa22.3■■□□□ 1.16
SNAP23-216ENST00000568331 FBXO44Q9H4M3 255 aa22.3■■□□□ 1.16
SNAP23-216ENST00000568331 C8orf33Q9H7E9 229 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
SNAP23-216ENST00000568331 GKN1Q9NS71 199 aa22.3■■□□□ 1.16
SNAP23-216ENST00000568331 GCNT4Q9P109 453 aa22.3■■□□□ 1.16
SNAP23-216ENST00000568331 TNFRSF10BO14763 440 aa22.29■■□□□ 1.16
SNAP23-216ENST00000568331 TCF15Q12870 199 aa22.29■■□□□ 1.16
SNAP23-216ENST00000568331 C1orf228Q6PIY5 440 aa22.29■■□□□ 1.16
SNAP23-216ENST00000568331 ZMIZ2Q8NF64 920 aa22.29■■□□□ 1.16
SNAP23-216ENST00000568331 FAM3CQ92520 227 aa22.29■■□□□ 1.16
SNAP23-216ENST00000568331 JAKMIP2Q96AA8 810 aa22.29■■□□□ 1.16
SNAP23-216ENST00000568331 NDRG2Q9UN36 371 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
SNAP23-216ENST00000568331 WDFY4Q6ZS81 3184 aa22.29■■□□□ 1.16
SNAP23-216ENST00000568331 MUC6Q6W4X9 2439 aa22.28■■□□□ 1.16
SNAP23-216ENST00000568331 BEST1O76090 585 aa22.28■■□□□ 1.16
SNAP23-216ENST00000568331 MAGEA9P43362 315 aa22.28■■□□□ 1.16
SNAP23-216ENST00000568331 RAD23BP54727 409 aa22.28■■□□□ 1.16
SNAP23-216ENST00000568331 NHLH1Q02575 133 aa22.28■■□□□ 1.16
SNAP23-216ENST00000568331 MTF1Q14872 753 aa22.28■■□□□ 1.16
SNAP23-216ENST00000568331 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa22.28■■□□□ 1.16
SNAP23-216ENST00000568331 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
SNAP23-216ENST00000568331 CLEC20AQ6ZU45 233 aa22.28■■□□□ 1.16
SNAP23-216ENST00000568331 SLC4A11Q8NBS3 891 aa22.28■■□□□ 1.16
SNAP23-216ENST00000568331 TTC8Q8TAM2 541 aa22.28■■□□□ 1.16
SNAP23-216ENST00000568331 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
SNAP23-216ENST00000568331 GTSE1Q9NYZ3 720 aa22.28■■□□□ 1.16
SNAP23-216ENST00000568331 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
SNAP23-216ENST00000568331 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa22.28■■□□□ 1.16
SNAP23-216ENST00000568331 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
SNAP23-216ENST00000568331 H0Y858 1186 aa22.27■■□□□ 1.16
SNAP23-216ENST00000568331 TARSP26639 723 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
SNAP23-216ENST00000568331 SLC8A3P57103 927 aa22.27■■□□□ 1.16
SNAP23-216ENST00000568331 PDGFRLQ15198 375 aa22.27■■□□□ 1.16
SNAP23-216ENST00000568331 PPM1KQ8N3J5 372 aa22.27■■□□□ 1.16
SNAP23-216ENST00000568331 EHBP1Q8NDI1 1231 aa22.27■■□□□ 1.16
SNAP23-216ENST00000568331 SH3RF2Q8TEC5 729 aa22.27■■□□□ 1.16
SNAP23-216ENST00000568331 ATOH1Q92858 354 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
SNAP23-216ENST00000568331 DUSP16Q9BY84 665 aa22.27■■□□□ 1.16
SNAP23-216ENST00000568331 PNPLA8Q9NP80 782 aa22.27■■□□□ 1.16
SNAP23-216ENST00000568331 IL37Q9NZH6 218 aa22.27■■□□□ 1.16
SNAP23-216ENST00000568331 IFNAR2P48551 515 aa22.26■■□□□ 1.15
SNAP23-216ENST00000568331 TNK2Q07912 1038 aa22.26■■□□□ 1.15
SNAP23-216ENST00000568331 USP4Q13107 963 aa22.26■■□□□ 1.15
SNAP23-216ENST00000568331 RUNX3Q13761 415 aa22.26■■□□□ 1.15
SNAP23-216ENST00000568331 ZNF77Q15935 545 aa22.26■■□□□ 1.15
SNAP23-216ENST00000568331 HECTD3Q5T447 861 aa22.26■■□□□ 1.15
SNAP23-216ENST00000568331 RALGPS2Q86X27 583 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
SNAP23-216ENST00000568331 FAM83CQ9BQN1 747 aa22.26■■□□□ 1.15
SNAP23-216ENST00000568331 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
SNAP23-216ENST00000568331 GMIPQ9P107 970 aa22.26■■□□□ 1.15
SNAP23-216ENST00000568331 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa22.26■■□□□ 1.15
SNAP23-216ENST00000568331 SPECC1L-ADORA2AF8WAN1 911 aa22.25■■□□□ 1.15
SNAP23-216ENST00000568331 OAS1P00973 400 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
SNAP23-216ENST00000568331 MBL2P11226 248 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
SNAP23-216ENST00000568331 CD19P15391 556 aa22.25■■□□□ 1.15
SNAP23-216ENST00000568331 TCF3P15923 654 aa22.25■■□□□ 1.15
SNAP23-216ENST00000568331 ACO1P21399 889 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
SNAP23-216ENST00000568331 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
SNAP23-216ENST00000568331 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
SNAP23-216ENST00000568331 SOX9P48436 509 aa22.25■■□□□ 1.15
SNAP23-216ENST00000568331 SLC7A9P82251 487 aa22.25■■□□□ 1.15
SNAP23-216ENST00000568331 ANGPT1Q15389 498 aa22.25■■□□□ 1.15
SNAP23-216ENST00000568331 DPCR1Q3MIW9 517 aa22.25■■□□□ 1.15
SNAP23-216ENST00000568331 SGO2Q562F6 1265 aa22.25■■□□□ 1.15
SNAP23-216ENST00000568331 ARHGAP17Q68EM7 881 aa22.25■■□□□ 1.15
SNAP23-216ENST00000568331 TRIM68Q6AZZ1 485 aa22.25■■□□□ 1.15
SNAP23-216ENST00000568331 FAM114A1Q8IWE2 563 aa22.25■■□□□ 1.15
SNAP23-216ENST00000568331 NACA2Q9H009 215 aa22.25■■□□□ 1.15
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