RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566452.1

BBS2-215, Transcript of Bardet-Biedl syndrome 2, human

TSL 2

Gene BBS2, Length 299 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BBS2-215	ENST00000566452	PIM1	P11309	404 aa	Predicted RBP	4.18	□□□□□ -1.74
BBS2-215	ENST00000566452	ALAS1	P13196	640 aa		4.18	□□□□□ -1.74
BBS2-215	ENST00000566452	ATP5J	P18859	108 aa		4.18	□□□□□ -1.74
BBS2-215	ENST00000566452	BTF3	P20290	206 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
BBS2-215	ENST00000566452	RAD52	P43351	418 aa		4.18	□□□□□ -1.74
BBS2-215	ENST00000566452	CPT1A	P50416	773 aa		4.18	□□□□□ -1.74
BBS2-215	ENST00000566452	TUB	P50607	506 aa		4.18	□□□□□ -1.74
BBS2-215	ENST00000566452	PNLIPRP1	P54315	467 aa		4.18	□□□□□ -1.74
BBS2-215	ENST00000566452	PRKAA2	P54646	552 aa		4.18	□□□□□ -1.74
BBS2-215	ENST00000566452	NR1H2	P55055	460 aa		4.18	□□□□□ -1.74
BBS2-215	ENST00000566452	WNT3	P56703	355 aa		4.18	□□□□□ -1.74
BBS2-215	ENST00000566452	CHRND	Q07001	517 aa		4.18	□□□□□ -1.74
BBS2-215	ENST00000566452	TOP3A	Q13472	1001 aa	Predicted RBP	4.18	□□□□□ -1.74
BBS2-215	ENST00000566452	SMAD4	Q13485	552 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
BBS2-215	ENST00000566452	CUL4B	Q13620	913 aa		4.18	□□□□□ -1.74
BBS2-215	ENST00000566452	SLC12A1	Q13621	1099 aa		4.18	□□□□□ -1.74
BBS2-215	ENST00000566452	DLGAP5	Q15398	846 aa		4.18	□□□□□ -1.74
BBS2-215	ENST00000566452	CCNG2	Q16589	344 aa		4.18	□□□□□ -1.74
BBS2-215	ENST00000566452	EEF1AKMT2	Q5JPI9	291 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
BBS2-215	ENST00000566452	FAM47A	Q5JRC9	791 aa		4.18	□□□□□ -1.74
BBS2-215	ENST00000566452	ATPAF1	Q5TC12	328 aa	Predicted RBP	4.18	□□□□□ -1.74
BBS2-215	ENST00000566452	TRIM68	Q6AZZ1	485 aa		4.18	□□□□□ -1.74
BBS2-215	ENST00000566452	KIAA0408	Q6ZU52	694 aa		4.18	□□□□□ -1.74
BBS2-215	ENST00000566452	USP49	Q70CQ1	688 aa		4.18	□□□□□ -1.74
BBS2-215	ENST00000566452	IRF2BP1	Q8IU81	584 aa		4.18	□□□□□ -1.74
BBS2-215	ENST00000566452	CCDC28A	Q8IWP9	274 aa		4.18	□□□□□ -1.74
BBS2-215	ENST00000566452	TTLL6	Q8N841	843 aa		4.18	□□□□□ -1.74
BBS2-215	ENST00000566452	OR6Y1	Q8NGX8	325 aa		4.18	□□□□□ -1.74
BBS2-215	ENST00000566452	SMARCC2	Q8TAQ2	1214 aa		4.18	□□□□□ -1.74
BBS2-215	ENST00000566452	MDM1	Q8TC05	714 aa		4.18	□□□□□ -1.74
BBS2-215	ENST00000566452	SLC7A6OS	Q96CW6	309 aa	Predicted RBP	4.18	□□□□□ -1.74
BBS2-215	ENST00000566452	RRP36	Q96EU6	259 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
BBS2-215	ENST00000566452	NEIL1	Q96FI4	390 aa	Predicted RBP	4.18	□□□□□ -1.74
BBS2-215	ENST00000566452	RSRC1	Q96IZ7	334 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
BBS2-215	ENST00000566452	COG8	Q96MW5	612 aa		4.18	□□□□□ -1.74
BBS2-215	ENST00000566452	CPEB1	Q9BZB8	566 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
BBS2-215	ENST00000566452	TINAGL1	Q9GZM7	467 aa	Predicted RBP	4.18	□□□□□ -1.74
BBS2-215	ENST00000566452	MS4A7	Q9GZW8	240 aa	Predicted RBP	4.18	□□□□□ -1.74
BBS2-215	ENST00000566452	TWSG1	Q9GZX9	223 aa		4.18	□□□□□ -1.74
BBS2-215	ENST00000566452	KATNBL1	Q9H079	304 aa		4.18	□□□□□ -1.74
BBS2-215	ENST00000566452	TAF1D	Q9H5J8	278 aa	Predicted RBP	4.18	□□□□□ -1.74
BBS2-215	ENST00000566452	NSUN3	Q9H649	340 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
BBS2-215	ENST00000566452	PRKRIP1	Q9H875	184 aa	Predicted RBP	4.18	□□□□□ -1.74
BBS2-215	ENST00000566452	PREB	Q9HCU5	417 aa		4.18	□□□□□ -1.74
BBS2-215	ENST00000566452	TMEM160	Q9NX00	188 aa		4.18	□□□□□ -1.74
BBS2-215	ENST00000566452	PI4KB	Q9UBF8	816 aa		4.18	□□□□□ -1.74
BBS2-215	ENST00000566452	CROT	Q9UKG9	612 aa		4.18	□□□□□ -1.74
BBS2-215	ENST00000566452	ZMYND8	Q9ULU4	1186 aa	Predicted RBP	4.18	□□□□□ -1.74
BBS2-215	ENST00000566452	CAPN11	Q9UMQ6	739 aa		4.18	□□□□□ -1.74
BBS2-215	ENST00000566452	NOL7	Q9UMY1	257 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
BBS2-215	ENST00000566452	ARHGAP26	Q9UNA1	814 aa		4.18	□□□□□ -1.74
BBS2-215	ENST00000566452	PLA2G2D	Q9UNK4	145 aa		4.18	□□□□□ -1.74
BBS2-215	ENST00000566452	CROCC2	H7BZ55	1655 aa		4.18	□□□□□ -1.74
BBS2-215	ENST00000566452	PTCH1	Q13635	1447 aa		4.18	□□□□□ -1.74
BBS2-215	ENST00000566452	NUP188	Q5SRE5	1749 aa		4.18	□□□□□ -1.74
BBS2-215	ENST00000566452	RALGAPB	Q86X10	1494 aa		4.18	□□□□□ -1.74
BBS2-215	ENST00000566452	KANK1	Q14678	1352 aa		4.17	□□□□□ -1.74
BBS2-215	ENST00000566452	DUOX2	Q9NRD8	1548 aa		4.17	□□□□□ -1.74
BBS2-215	ENST00000566452	PGPEP1L	A6NFU8	196 aa		4.17	□□□□□ -1.74
BBS2-215	ENST00000566452	AQP7P3	A6NL99	342 aa		4.17	□□□□□ -1.74
BBS2-215	ENST00000566452		M0QYG6	137 aa		4.17	□□□□□ -1.74
BBS2-215	ENST00000566452	RAB27B	O00194	218 aa		4.17	□□□□□ -1.74
BBS2-215	ENST00000566452	PCDH17	O14917	1159 aa		4.17	□□□□□ -1.74
BBS2-215	ENST00000566452	JUN	P05412	331 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
BBS2-215	ENST00000566452	CYP2C9	P11712	490 aa		4.17	□□□□□ -1.74
BBS2-215	ENST00000566452	JUP	P14923	745 aa		4.17	□□□□□ -1.74
BBS2-215	ENST00000566452	TPH1	P17752	444 aa		4.17	□□□□□ -1.74
BBS2-215	ENST00000566452	MST1	P26927	711 aa		4.17	□□□□□ -1.74
BBS2-215	ENST00000566452	SLC5A2	P31639	672 aa		4.17	□□□□□ -1.74
BBS2-215	ENST00000566452	VIPR2	P41587	438 aa		4.17	□□□□□ -1.74
BBS2-215	ENST00000566452	MCM2	P49736	904 aa		4.17	□□□□□ -1.74
BBS2-215	ENST00000566452	CCR5	P51681	352 aa		4.17	□□□□□ -1.74
BBS2-215	ENST00000566452	ZNF135	P52742	658 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
BBS2-215	ENST00000566452	SEC24C	P53992	1094 aa		4.17	□□□□□ -1.74
BBS2-215	ENST00000566452	PSMC1	P62191	440 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
BBS2-215	ENST00000566452	SCAP	Q12770	1279 aa		4.17	□□□□□ -1.74
BBS2-215	ENST00000566452	ADAM15	Q13444	863 aa		4.17	□□□□□ -1.74
BBS2-215	ENST00000566452	ARHGEF7	Q14155	803 aa		4.17	□□□□□ -1.74
BBS2-215	ENST00000566452	RTP5	Q14D33	572 aa		4.17	□□□□□ -1.74
BBS2-215	ENST00000566452	INSC	Q1MX18	579 aa		4.17	□□□□□ -1.74
BBS2-215	ENST00000566452	GAGE13	Q4V321	117 aa		4.17	□□□□□ -1.74
BBS2-215	ENST00000566452	AMOT	Q4VCS5	1084 aa		4.17	□□□□□ -1.74
BBS2-215	ENST00000566452	VWA3B	Q502W6	1294 aa		4.17	□□□□□ -1.74
BBS2-215	ENST00000566452	TMTC4	Q5T4D3	741 aa		4.17	□□□□□ -1.74
BBS2-215	ENST00000566452	FAXC	Q5TGI0	409 aa		4.17	□□□□□ -1.74
BBS2-215	ENST00000566452	KRT40	Q6A162	431 aa		4.17	□□□□□ -1.74
BBS2-215	ENST00000566452	RINL	Q6ZS11	566 aa		4.17	□□□□□ -1.74
BBS2-215	ENST00000566452	BBS12	Q6ZW61	710 aa		4.17	□□□□□ -1.74
BBS2-215	ENST00000566452	RAB11FIP2	Q7L804	512 aa		4.17	□□□□□ -1.74
BBS2-215	ENST00000566452	KRT27	Q7Z3Y8	459 aa		4.17	□□□□□ -1.74
BBS2-215	ENST00000566452	B3GNT8	Q7Z7M8	397 aa		4.17	□□□□□ -1.74
BBS2-215	ENST00000566452	NRSN1	Q8IZ57	195 aa		4.17	□□□□□ -1.74
BBS2-215	ENST00000566452	TMEM57	Q8N5G2	664 aa		4.17	□□□□□ -1.74
BBS2-215	ENST00000566452	ZMIZ2	Q8NF64	920 aa		4.17	□□□□□ -1.74
BBS2-215	ENST00000566452	ADAMTS15	Q8TE58	950 aa		4.17	□□□□□ -1.74
BBS2-215	ENST00000566452	SCAMP4	Q969E2	229 aa		4.17	□□□□□ -1.74
BBS2-215	ENST00000566452	MOGAT1	Q96PD6	335 aa		4.17	□□□□□ -1.74
BBS2-215	ENST00000566452	TWNK	Q96RR1	684 aa		4.17	□□□□□ -1.74
BBS2-215	ENST00000566452	GORASP1	Q9BQQ3	440 aa		4.17	□□□□□ -1.74
BBS2-215	ENST00000566452	SPATA5L1	Q9BVQ7	753 aa		4.17	□□□□□ -1.74

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