RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561431.1

LRRC28-222, Transcript of leucine rich repeat containing 28, human

TSL 3

Gene LRRC28, Length 754 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LRRC28-222	ENST00000561431	RPL17	P18621	184 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
LRRC28-222	ENST00000561431	SLC6A4	P31645	630 aa		4.74	□□□□□ -1.65
LRRC28-222	ENST00000561431	APOBEC3A	P31941	199 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
LRRC28-222	ENST00000561431	CASP2	P42575	452 aa		4.74	□□□□□ -1.65
LRRC28-222	ENST00000561431	TRAPPC10	P48553	1259 aa		4.74	□□□□□ -1.65
LRRC28-222	ENST00000561431	AMPH	P49418	695 aa		4.74	□□□□□ -1.65
LRRC28-222	ENST00000561431	RNASE9	P60153	205 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
LRRC28-222	ENST00000561431	ZNF844	Q08AG5	666 aa		4.74	□□□□□ -1.65
LRRC28-222	ENST00000561431	KIF22	Q14807	665 aa		4.74	□□□□□ -1.65
LRRC28-222	ENST00000561431	PRKD1	Q15139	912 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
LRRC28-222	ENST00000561431		Q6ZRM9	215 aa		4.74	□□□□□ -1.65
LRRC28-222	ENST00000561431	USP37	Q86T82	979 aa		4.74	□□□□□ -1.65
LRRC28-222	ENST00000561431	SRL	Q86TD4	932 aa		4.74	□□□□□ -1.65
LRRC28-222	ENST00000561431	PDSS2	Q86YH6	399 aa		4.74	□□□□□ -1.65
LRRC28-222	ENST00000561431	FAM186B	Q8IYM0	893 aa		4.74	□□□□□ -1.65
LRRC28-222	ENST00000561431	CCDC33	Q8N5R6	958 aa		4.74	□□□□□ -1.65
LRRC28-222	ENST00000561431	TEX19	Q8NA77	164 aa		4.74	□□□□□ -1.65
LRRC28-222	ENST00000561431	CPT1C	Q8TCG5	803 aa		4.74	□□□□□ -1.65
LRRC28-222	ENST00000561431	SCAMP4	Q969E2	229 aa		4.74	□□□□□ -1.65
LRRC28-222	ENST00000561431	LTV1	Q96GA3	475 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
LRRC28-222	ENST00000561431	CCDC138	Q96M89	665 aa		4.74	□□□□□ -1.65
LRRC28-222	ENST00000561431	TTC14	Q96N46	770 aa		4.74	□□□□□ -1.65
LRRC28-222	ENST00000561431	ELAC2	Q9BQ52	826 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
LRRC28-222	ENST00000561431	KLC2	Q9H0B6	622 aa		4.74	□□□□□ -1.65
LRRC28-222	ENST00000561431	CD248	Q9HCU0	757 aa		4.74	□□□□□ -1.65
LRRC28-222	ENST00000561431	PNPLA8	Q9NP80	782 aa		4.74	□□□□□ -1.65
LRRC28-222	ENST00000561431	CHST12	Q9NRB3	414 aa		4.74	□□□□□ -1.65
LRRC28-222	ENST00000561431	TRPM5	Q9NZQ8	1165 aa		4.74	□□□□□ -1.65
LRRC28-222	ENST00000561431	POLK	Q9UBT6	870 aa		4.74	□□□□□ -1.65
LRRC28-222	ENST00000561431	PHTF1	Q9UMS5	762 aa		4.74	□□□□□ -1.65
LRRC28-222	ENST00000561431	LZTS1	Q9Y250	596 aa		4.74	□□□□□ -1.65
LRRC28-222	ENST00000561431	MTO1	Q9Y2Z2	717 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
LRRC28-222	ENST00000561431	HS3ST3A1	Q9Y663	406 aa		4.74	□□□□□ -1.65
LRRC28-222	ENST00000561431	MAP2	P11137	1827 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
LRRC28-222	ENST00000561431	LY75	O60449	1722 aa		4.73	□□□□□ -1.65
LRRC28-222	ENST00000561431	BTN3A1	O00481	513 aa		4.73	□□□□□ -1.65
LRRC28-222	ENST00000561431	KPNA5	O15131	536 aa		4.73	□□□□□ -1.65
LRRC28-222	ENST00000561431	FRS3	O43559	492 aa		4.73	□□□□□ -1.65
LRRC28-222	ENST00000561431	UNC5C	O95185	931 aa		4.73	□□□□□ -1.65
LRRC28-222	ENST00000561431	CHEK2	O96017	543 aa		4.73	□□□□□ -1.65
LRRC28-222	ENST00000561431	GRP	P07492	148 aa		4.73	□□□□□ -1.65
LRRC28-222	ENST00000561431	SCP2	P22307	547 aa		4.73	□□□□□ -1.65
LRRC28-222	ENST00000561431	DEK	P35659	375 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
LRRC28-222	ENST00000561431	MMP14	P50281	582 aa		4.73	□□□□□ -1.65
LRRC28-222	ENST00000561431	SCNN1G	P51170	649 aa		4.73	□□□□□ -1.65
LRRC28-222	ENST00000561431	FMO1	Q01740	532 aa		4.73	□□□□□ -1.65
LRRC28-222	ENST00000561431	SATB1	Q01826	763 aa		4.73	□□□□□ -1.65
LRRC28-222	ENST00000561431	PIGF	Q07326	219 aa		4.73	□□□□□ -1.65
LRRC28-222	ENST00000561431	SLC13A2	Q13183	592 aa		4.73	□□□□□ -1.65
LRRC28-222	ENST00000561431	RAB32	Q13637	225 aa		4.73	□□□□□ -1.65
LRRC28-222	ENST00000561431	RRP1B	Q14684	758 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
LRRC28-222	ENST00000561431	INO80D	Q53TQ3	878 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
LRRC28-222	ENST00000561431	LMBRD2	Q68DH5	695 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
LRRC28-222	ENST00000561431	CCDC89	Q8N998	374 aa		4.73	□□□□□ -1.65
LRRC28-222	ENST00000561431	TMIE	Q8NEW7	156 aa		4.73	□□□□□ -1.65
LRRC28-222	ENST00000561431	NUP133	Q8WUM0	1156 aa		4.73	□□□□□ -1.65
LRRC28-222	ENST00000561431	KBTBD7	Q8WVZ9	684 aa		4.73	□□□□□ -1.65
LRRC28-222	ENST00000561431	ANKS1A	Q92625	1134 aa		4.73	□□□□□ -1.65
LRRC28-222	ENST00000561431	MARS2	Q96GW9	593 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
LRRC28-222	ENST00000561431	DCLRE1C	Q96SD1	692 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
LRRC28-222	ENST00000561431	CDK5RAP1	Q96SZ6	601 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
LRRC28-222	ENST00000561431	PNKP	Q96T60	521 aa		4.73	□□□□□ -1.65
LRRC28-222	ENST00000561431	SMO	Q99835	787 aa		4.73	□□□□□ -1.65
LRRC28-222	ENST00000561431	NAA15	Q9BXJ9	866 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
LRRC28-222	ENST00000561431	CHMP4B	Q9H444	224 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
LRRC28-222	ENST00000561431	RNPEP	Q9H4A4	650 aa		4.73	□□□□□ -1.65
LRRC28-222	ENST00000561431	FAM30A	Q9NZY2	134 aa		4.73	□□□□□ -1.65
LRRC28-222	ENST00000561431	RNF181	Q9P0P0	153 aa		4.73	□□□□□ -1.65
LRRC28-222	ENST00000561431	AFF4	Q9UHB7	1163 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
LRRC28-222	ENST00000561431	TMX2	Q9Y320	296 aa		4.73	□□□□□ -1.65
LRRC28-222	ENST00000561431	SRCAP	Q6ZRS2	3230 aa		4.73	□□□□□ -1.65
LRRC28-222	ENST00000561431	COL3A1	P02461	1466 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
LRRC28-222	ENST00000561431	LEFTY2	O00292	366 aa		4.72	□□□□□ -1.65
LRRC28-222	ENST00000561431	FOXN3	O00409	490 aa	Predicted RBP	4.72	□□□□□ -1.65
LRRC28-222	ENST00000561431	POLRMT	O00411	1230 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
LRRC28-222	ENST00000561431	TCERG1	O14776	1098 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
LRRC28-222	ENST00000561431	PLSCR1	O15162	318 aa		4.72	□□□□□ -1.65
LRRC28-222	ENST00000561431	NPHP1	O15259	732 aa		4.72	□□□□□ -1.65
LRRC28-222	ENST00000561431	KIF20A	O95235	890 aa		4.72	□□□□□ -1.65
LRRC28-222	ENST00000561431	TH	P07101	528 aa		4.72	□□□□□ -1.65
LRRC28-222	ENST00000561431	HSP90AB1	P08238	724 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
LRRC28-222	ENST00000561431	EN2	P19622	333 aa	Predicted RBP	4.72	□□□□□ -1.65
LRRC28-222	ENST00000561431	PIK3CB	P42338	1070 aa		4.72	□□□□□ -1.65
LRRC28-222	ENST00000561431	TNNT2	P45379	298 aa	Predicted RBP	4.72	□□□□□ -1.65
LRRC28-222	ENST00000561431	SELENOP	P49908	381 aa		4.72	□□□□□ -1.65
LRRC28-222	ENST00000561431	RABGGTB	P53611	331 aa		4.72	□□□□□ -1.65
LRRC28-222	ENST00000561431	POU6F2	P78424	691 aa	Predicted RBP	4.72	□□□□□ -1.65
LRRC28-222	ENST00000561431	MORC3	Q14149	939 aa		4.72	□□□□□ -1.65
LRRC28-222	ENST00000561431	SIM2	Q14190	667 aa	Predicted RBP	4.72	□□□□□ -1.65
LRRC28-222	ENST00000561431	CDC37	Q16543	378 aa	Predicted RBP	4.72	□□□□□ -1.65
LRRC28-222	ENST00000561431	SPDYE7P	Q495Y7	208 aa		4.72	□□□□□ -1.65
LRRC28-222	ENST00000561431	NOMO2	Q5JPE7	1267 aa		4.72	□□□□□ -1.65
LRRC28-222	ENST00000561431	EMC10	Q5UCC4	262 aa		4.72	□□□□□ -1.65
LRRC28-222	ENST00000561431	LAYN	Q6UX15	382 aa		4.72	□□□□□ -1.65
LRRC28-222	ENST00000561431	MAMDC4	Q6UXC1	1216 aa		4.72	□□□□□ -1.65
LRRC28-222	ENST00000561431	RAB11FIP1	Q6WKZ4	1283 aa	Predicted RBP	4.72	□□□□□ -1.65
LRRC28-222	ENST00000561431	SLC30A10	Q6XR72	485 aa		4.72	□□□□□ -1.65
LRRC28-222	ENST00000561431	KRT77	Q7Z794	578 aa		4.72	□□□□□ -1.65
LRRC28-222	ENST00000561431	LIX1L	Q8IVB5	337 aa		4.72	□□□□□ -1.65
LRRC28-222	ENST00000561431	PALM2	Q8IXS6	379 aa		4.72	□□□□□ -1.65

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