RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559359.1

PSME2-208, Transcript of proteasome activator subunit 2, human

TSL 2

Gene PSME2, Length 484 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PSME2-208	ENST00000559359	CLSTN1	O94985	981 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PSME2-208	ENST00000559359	F11	P03951	625 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PSME2-208	ENST00000559359	CMA1	P23946	247 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PSME2-208	ENST00000559359	CCNE1	P24864	410 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PSME2-208	ENST00000559359	PCSK1	P29120	753 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PSME2-208	ENST00000559359	LHX1	P48742	406 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PSME2-208	ENST00000559359	NDUFA8	P51970	172 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PSME2-208	ENST00000559359	KPNA1	P52294	538 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
PSME2-208	ENST00000559359	CSTF1	Q05048	431 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
PSME2-208	ENST00000559359	TNK2	Q07912	1038 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PSME2-208	ENST00000559359	USP4	Q13107	963 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PSME2-208	ENST00000559359	FZD5	Q13467	585 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PSME2-208	ENST00000559359	TXNDC8	Q6A555	127 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PSME2-208	ENST00000559359	MAB21L3	Q8N8X9	362 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PSME2-208	ENST00000559359	TTC16	Q8NEE8	873 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PSME2-208	ENST00000559359	PLEKHO2	Q8TD55	490 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PSME2-208	ENST00000559359	CSGALNACT1	Q8TDX6	532 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PSME2-208	ENST00000559359	FAM3C	Q92520	227 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PSME2-208	ENST00000559359	MYLPF	Q96A32	169 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PSME2-208	ENST00000559359	E2F7	Q96AV8	911 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PSME2-208	ENST00000559359	CLDN23	Q96B33	292 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PSME2-208	ENST00000559359	CNTNAP3B	Q96NU0	1288 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PSME2-208	ENST00000559359	NELL2	Q99435	816 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PSME2-208	ENST00000559359	CNTNAP3	Q9BZ76	1288 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PSME2-208	ENST00000559359	OSBPL6	Q9BZF3	934 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PSME2-208	ENST00000559359	CRTAC1	Q9NQ79	661 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PSME2-208	ENST00000559359	GTSE1	Q9NYZ3	720 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PSME2-208	ENST00000559359	CCL26	Q9Y258	94 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PSME2-208	ENST00000559359	MRPS17	Q9Y2R5	130 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
PSME2-208	ENST00000559359	NME7	Q9Y5B8	376 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PSME2-208	ENST00000559359	RIF1	Q5UIP0	2472 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
PSME2-208	ENST00000559359	MAN2B1	O00754	1011 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PSME2-208	ENST00000559359	CHAD	O15335	359 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PSME2-208	ENST00000559359	NCAM2	O15394	837 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PSME2-208	ENST00000559359	WARS	P23381	471 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
PSME2-208	ENST00000559359	BDNF	P23560	247 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PSME2-208	ENST00000559359	SYK	P43405	635 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PSME2-208	ENST00000559359	MYL6	P60660	151 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PSME2-208	ENST00000559359	SNRPF	P62306	86 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
PSME2-208	ENST00000559359	RPL10A	P62906	217 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
PSME2-208	ENST00000559359	FCHO2	Q0JRZ9	810 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PSME2-208	ENST00000559359	MTAP	Q13126	283 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PSME2-208	ENST00000559359	OXLD1	Q5BKU9	147 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PSME2-208	ENST00000559359	LIMS2	Q7Z4I7	341 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PSME2-208	ENST00000559359	CMTM8	Q8IZV2	173 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PSME2-208	ENST00000559359	ADSSL1	Q8N142	457 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PSME2-208	ENST00000559359	FSIP1	Q8NA03	581 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PSME2-208	ENST00000559359	BPIFB1	Q8TDL5	484 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PSME2-208	ENST00000559359	LMAN1L	Q9HAT1	526 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PSME2-208	ENST00000559359	TRPC7	Q9HCX4	862 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PSME2-208	ENST00000559359	ABCB6	Q9NP58	842 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PSME2-208	ENST00000559359	TRPV5	Q9NQA5	729 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PSME2-208	ENST00000559359	RBM12	Q9NTZ6	932 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
PSME2-208	ENST00000559359	HPSE	Q9Y251	543 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PSME2-208	ENST00000559359	COL4A2	P08572	1712 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PSME2-208	ENST00000559359	PHACTR2	O75167	634 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PSME2-208	ENST00000559359	TADA3	O75528	432 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PSME2-208	ENST00000559359	NOL4	O94818	638 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PSME2-208	ENST00000559359	IL2RA	P01589	272 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PSME2-208	ENST00000559359	RPN1	P04843	607 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
PSME2-208	ENST00000559359	CSH1	P0DML2	217 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PSME2-208	ENST00000559359	CSH2	P0DML3	217 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PSME2-208	ENST00000559359	GNL1	P36915	607 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
PSME2-208	ENST00000559359	TNNC1	P63316	161 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PSME2-208	ENST00000559359	CYP27A1	Q02318	531 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PSME2-208	ENST00000559359	POU4F2	Q12837	409 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PSME2-208	ENST00000559359	BIRC3	Q13489	604 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PSME2-208	ENST00000559359	TRPC3	Q13507	836 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PSME2-208	ENST00000559359	WDR72	Q3MJ13	1102 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PSME2-208	ENST00000559359	ARHGAP29	Q52LW3	1261 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PSME2-208	ENST00000559359	MDH1B	Q5I0G3	518 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PSME2-208	ENST00000559359	FAM171B	Q6P995	826 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PSME2-208	ENST00000559359	TXNDC11	Q6PKC3	985 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PSME2-208	ENST00000559359	DPH6	Q7L8W6	267 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PSME2-208	ENST00000559359	C12orf56	Q8IXR9	622 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PSME2-208	ENST00000559359	OR6B3	Q8NGW1	331 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PSME2-208	ENST00000559359	RIN3	Q8TB24	985 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PSME2-208	ENST00000559359	SPATA18	Q8TC71	538 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PSME2-208	ENST00000559359	MRPS31	Q92665	395 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
PSME2-208	ENST00000559359	USP13	Q92995	863 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
PSME2-208	ENST00000559359	SNX25	Q9H3E2	840 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PSME2-208	ENST00000559359	GOLPH3L	Q9H4A5	285 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PSME2-208	ENST00000559359	DPEP3	Q9H4B8	488 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PSME2-208	ENST00000559359	GKN1	Q9NS71	199 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PSME2-208	ENST00000559359	CGN	Q9P2M7	1197 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
PSME2-208	ENST00000559359	MAGEC2	Q9UBF1	373 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
PSME2-208	ENST00000559359	CDH9	Q9ULB4	789 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PSME2-208	ENST00000559359	MAPK8IP1	Q9UQF2	711 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PSME2-208	ENST00000559359	DYRK1B	Q9Y463	629 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PSME2-208	ENST00000559359	FAM186A	A6NE01	2351 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PSME2-208	ENST00000559359	LRRIQ3	A6PVS8	624 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
PSME2-208	ENST00000559359	SPECC1L-ADORA2A	F8WAN1	911 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PSME2-208	ENST00000559359	LMNA	P02545	664 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
PSME2-208	ENST00000559359	NR3C1	P04150	777 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PSME2-208	ENST00000559359	CHRNB1	P11230	501 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PSME2-208	ENST00000559359	AVPR1A	P37288	418 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PSME2-208	ENST00000559359	GRIK1	P39086	918 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PSME2-208	ENST00000559359	MAGEA9	P43362	315 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PSME2-208	ENST00000559359	RPS9	P46781	194 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
PSME2-208	ENST00000559359	RAP1GAP	P47736	663 aa		11.12	□□□□□ -0.63

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